Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000160559

Standard Name

XPF1 (homolog of Xeroderma Pigmentosum group F-complementing protein 1)

Aliases

None

Description

14-3-3 protein 6

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

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Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_000160559

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05314.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1229 aa)
SGD	YPL022W	5.002276765025871e-34	RAD1 Single-stranded DNA endon uclease (with Rad10p), cleaves single-stranded DNA during nu cleotide excision repair and d ouble-strand break repair; sub unit of Nucleotide Excision Re pair Factor 1 (NEF1); homolog of human XPF protein
DictyBase	DDB_G0284419	9.99967697349061e-30	xpf on chromosome: 4 position 1971161 to 1974139
Oxytricha	Contig829.1.g135	1.9996410647472548e-29	hypothetical protein
WormBase	WBGene00008140	4.998394530072393e-19	locus:xpf-1 status:Partially _confirmed UniProt:G5EBZ1 protein_id:CAA93766.2

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_000160559(coding)
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GATTAGTATATCTAAGCAAATTAAGATGATGACAAATATATTCCAACCTAAAAACGATTA
TTTGAGCAAATTAAAAATAGCAACGAAGAAGAAAATTGA

>TTHERM_000160559(protein)
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MSQGTGVYKVIGEYLDTFQQGPQTVFFLLNFDERDSLKSEINEIQYYCKQHKIVDVTNMI
SSKRSEIYSKGGIFSISEIVLLFDLLSGSIIHSERITGFIINKIQSVRNHQENLVWLCTL
LKTNNPSSIILGISECEQTLASRGLENIMRWFYLPRCFVWNMIRAEVQSDILKQPNQCEH
LDTFVDMNKRMRNIDNCIKVIIILILKELKSKRNASDTTELPIFNQEEFLNSHQYILEDK
IKSNKFYLKAFMNNTQYFKDAFEFKQLQKDLFQLNCVSFYKKLLYIDQNSNEDSFINRTA
TDKSTQKVIKELFENAQKRVYEIQKSDETLELPLLESQLNNSDRDSFQFRQKFNLNGYFD
ASLLQNTGKNVEQLQNDADKDLAEQNDLKRASLNSIEMADENLKGKTSSQENSQNGLNSQ
GFLDRSADQINLTQSIQMTSIKENIKEDETFEESKNENQLLKQDMLDVEDKHLNENSQDK
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QLELNKNQNNQLNPDDNILFGSQRQLNQENKQKLDEMEKEEQKKIKENSQEDSKKQSQND
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VLRVKNITKKANTRIGGSMLQVQPAVIIDKREFRSDLPSILFHEGFKVIPIQLTTGDYIL
SKDIAVERKSVETPDLVNSLRNGRLYQQLLAMSKNYKKCYLLIEFSEQMPFSLESINYNN
ENQLSYQEQQNFNNKQPKTNTITFYLPLLVSQFDNVKIIWSKGPIYTSKIFQMLKQNQLE
PNPSELLKEQEKKEKKESTIDQYIQANQDDDKYIPTQKRLFEQIKNSNEEEN

>TTHERM_000160559(gene)
ATGAGCGAATCTATTAATTAGGATAATATTTAAAATAACAATCAGATTATCAAAAATGAA
GTAGATGATGAAGATTTAATGTAATAAAATATTTTAAACTAGCCTGAAGAGAGCAAGTTA
GATTATTTCGATTTGATACAAAAGGACCTTATTTATAGTCCTACTGGAGGGTTGTTAATT
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