Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_000160559Standard Name
XPF1 (homolog of Xeroderma Pigmentosum group F-complementing protein 1)Aliases
NoneDescription
14-3-3 protein 6Genome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%
TetraMine Data
TTHERM_000160559
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_05314.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1229 aa)
SGD YPL022W 5.002276765025871e-34 RAD1 Single-stranded DNA endon
uclease (with Rad10p), cleaves
single-stranded DNA during nu
cleotide excision repair and d
ouble-strand break repair; sub
unit of Nucleotide Excision Re
pair Factor 1 (NEF1); homolog
of human XPF protein
DictyBase DDB_G0284419 9.99967697349061e-30 xpf on chromosome: 4 position
1971161 to 1974139
Oxytricha Contig829.1.g135 1.9996410647472548e-29 hypothetical protein
WormBase WBGene00008140 4.998394530072393e-19 locus:xpf-1 status:Partially
_confirmed UniProt:G5EBZ1
protein_id:CAA93766.2
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_000160559(coding)
ATGAGCGAATCTATTAATTAGGATAATATTTAAAATAACAATCAGATTATCAAAAATGAA
GTAGATGATGAAGATTTAATGTAATAAAATATTTTAAACTAGCCTGAAGAGAGCAAGTTA
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GAAAACTAGCTTTCTTACTAAGAGCAGCAAAATTTCAATAACAAATAACCAAAAACAAAC
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GATTAGTATATCTAAGCAAATTAAGATGATGACAAATATATTCCAACCTAAAAACGATTA
TTTGAGCAAATTAAAAATAGCAACGAAGAAGAAAATTGA>TTHERM_000160559(protein)
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SSKRSEIYSKGGIFSISEIVLLFDLLSGSIIHSERITGFIINKIQSVRNHQENLVWLCTL
LKTNNPSSIILGISECEQTLASRGLENIMRWFYLPRCFVWNMIRAEVQSDILKQPNQCEH
LDTFVDMNKRMRNIDNCIKVIIILILKELKSKRNASDTTELPIFNQEEFLNSHQYILEDK
IKSNKFYLKAFMNNTQYFKDAFEFKQLQKDLFQLNCVSFYKKLLYIDQNSNEDSFINRTA
TDKSTQKVIKELFENAQKRVYEIQKSDETLELPLLESQLNNSDRDSFQFRQKFNLNGYFD
ASLLQNTGKNVEQLQNDADKDLAEQNDLKRASLNSIEMADENLKGKTSSQENSQNGLNSQ
GFLDRSADQINLTQSIQMTSIKENIKEDETFEESKNENQLLKQDMLDVEDKHLNENSQDK
FMQQMEFMRNIINQDSISLAQDMPKVGLKQNIFEDFDTDNKDAIKFELNQKVKLNLDIDP
KFRCLNVILNEINEKYQNAMPINGDKFLIWIHTNDKQRVSSIQEYIQNTFLKNDPSNKLS
LMKKFRQFLEEQTHRRHSYLKELIKRKKNQILEEKKECENVLLEQLFKELEYFQQIIEFE
QLELNKNQNNQLNPDDNILFGSQRQLNQENKQKLDEMEKEEQKKIKENSQEDSKKQSQND
QNLEIASDEEKNNIKKIRKSDRMLADNEKELLEVKKRKLQIDEKLQKRFKMIDVNSMNVN
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SKDIAVERKSVETPDLVNSLRNGRLYQQLLAMSKNYKKCYLLIEFSEQMPFSLESINYNN
ENQLSYQEQQNFNNKQPKTNTITFYLPLLVSQFDNVKIIWSKGPIYTSKIFQMLKQNQLE
PNPSELLKEQEKKEKKESTIDQYIQANQDDDKYIPTQKRLFEQIKNSNEEEN>TTHERM_000160559(gene)
ATGAGCGAATCTATTAATTAGGATAATATTTAAAATAACAATCAGATTATCAAAAATGAA
GTAGATGATGAAGATTTAATGTAATAAAATATTTTAAACTAGCCTGAAGAGAGCAAGTTA
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GGACCACAAACAGTCTTTTTTTTGCTTAATTTTGATGAAAGGGATAGCCTAAAATCTGAA
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TTGATCAGACAGGATTCGTTTAGTTTTTGTCTAAATAAATTATGAAAAACTTCGAATTTA
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GAAAGAAAAAAATGAGATGCTAAGCAGTATTGATGAGCCAGTATTAAGAGTAAAAAATAT
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TTAAAGTTATACCTATTTAATTAACTACTGGAGATTATATATTATCAAAAGATATAGCTG
TAGAAAGAAAATCAGTGGAAACTCCAGATTTAGTAAACAGTTTAAGAAACGGTAGACTTT
ATTAGCAGCTATTGGCAATGTCTAAAAATTATAAGAAATGTTACTTACTTATAGAATTTT
CAGAATAAATGCCTTTTAGCTTAGAGTCAATTAATTACAATAATGAAAACTAGCTTTCTT
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TGCCTCTCCTCGTCTCTTAATTCGATAATGTTAAAATAATTTGGTCGAAAGGTCCTATTT
ACACTTCTAAAATATTCTAAATGCTCAAATAAAATTAACTTGAGCCAAATCCTTCAGAAC
TACTTAAAGAATAAGAGAAGAAAGAAAAGAAGGAATCTACAATAGATTAGTATATCTAAG
CAAATTAAGATGATGACAAATATATTCCAACCTAAAAACGATTATTTGAGCAAATTAAAA
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