Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00529620
Standard Name
XPB1 (homolog of Xeroderma Pigmentosum type B protein 1)
Aliases
PreTt04631 | 67.m00146 | 3684.m00016
Description
DNA repair helicase Rad25; DNA repair helicase rad25 family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
Domains
( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
( TIGR00603 ) DNA repair helicase rad25
( PF00176 ) SNF2 family N-terminal domain
( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%
TetraMine Data
TTHERM_00529620
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_13686.1 9.997093137033517e-262 DNA repair helicase rad25 fami
ly protein (831 aa)
DictyBase DDB_G0278729 2.0005528695435914e-146 repB on chromosome: 3 position
1389108 to 1391685
Oxytricha Contig5586.0.g36 4.9990774786573115e-144 Helicase conserved C-terminal
domain
WormBase WBGene00013441 7.998494937295598e-144 status:Partially_confirmed U
niProt:Q95PZ4 protein_id:CAC
70144.1
SGD YIL143C 3.0004885828297914e-109 SSL2 Component of the holoenzy
me form of RNA polymerase tran
scription factor TFIIH, has DN
A-dependent ATPase/helicase ac
tivity and is required, with R
ad3p, for unwinding promoter D
NA; involved in DNA repair; ho
molog of human ERCC3
Stentor Coeruleus SteCoe_9056 8.628801156620959e-60
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:23884606 : Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79
Sequences
>TTHERM_00529620(coding)ATG GCT GAT AAA AAG GTT AAT CCA AAA TCT AGA GAA TAA AGT AAA AGA TTA AAG TCA AAC TCA TAA AAA TAA AAT TAA AAT GGC AAA TAA TAA AAG AAT GAA GAA GGA GAT GAT GGC TTA TTT GGC TAA AAA TAA GGA AAA GCA CAA GTA GAA GGA AAT TAA TTT CAA TAA TTT TAT GAT TAC TCT ACT CTA GAA TTA AAA GAT GAT TAC AGA GAA AGA CCT ATT TTG ATA TGT CCA GAT GGA ATA ATA TTT TTA GAA ACT TTT AAT CCT CTT TAC AGG GTT GCC TAT TAA TTT TTA ATT TCT ATT GGA GAG CCT GTG TAA AGA CCT CTC TCA ATG CAT AAA TTT ACC TTG ACT AAG TAT TCA CTT TAT ACT GCG ATG GTT TTA TAG TAT GAA CCT AAA GAT ATA ATT CTG TGT CTC GAA AAG CTT AGT AAG AAC AAA AAA ATT CCT AAA GAA GTA GAA AGA TAT ATT ACT GAA AAT ACA TAA AAC TAT GGA GCT GCT AGA CTA TTT TTA GAC GAC AGT AGT TAT TAC TTA GAT ATA GAT TCT TAG GTA TGG ACA AGT ATA ATA GAA AGA AAT CCA CAT ATA AAA GAC CTA GTT TCA CAA ACA TAA TTT AAC TTT GAT AAT ATT ATA AAC TAA AAT AAA GAA TTG AGG GAT ATT TAA AAA GAT CTG CAA AGC TTC TTT TAA AAT ATA AAA ACA GAA AAC AAT TAA TAA TCT TCA AAA AAA AAC TAG AAA ATG ATT GTT GAA GAT GAG CAA GAT GAT GGA ATT CCA GAT AAA AAA AAT AAA TTA ATG AAA AAC GGT GAT AGC AGT ATT GCT AAT TAT GAT GAC GAA GAT GAA GAA GAT TCT GAT GAT GGT GAT GAT GAT TTT GTT TAT AAT TTC ATA ATG AAT AAT AAA ACA AAA CGG TCT TTT AAA CGT ATT TAA ATT ATT GGA GAT CAT TTT GAG GTT ACT AAA GCT GTT ATT AAC TGT AGT GTT CCT CTG ATT TAA GAA TAT GAT TTC GAA AAC AAA AGC TTC AAA TAA CTA GAA ATT GAA TTA AAG CCA AAA ATA AAG GTG AGA TAT TAC CAA GAA AGA GCT TTA AAA AAT ATA TTT ATA TAG AAG AAA GCT CGT TCT GGA TTG ATA ATT CTT CCT TGT GGT GCA GGG AAA ACA ATT GTT GGA GTT ATT GCT ATC GAA AGG ATA AAA TAA AGT ACA GTA ATT ATT TGT GAC TCT GAT GTT TCT GTG GAT TAA TGG AGA GAT GAA CTT GAG AGA TGG ACT ACA ATT AAT AAA AAC AAA ATA GTT AGA TTA ACT GGT AGA ATA GTG GAT GAA TGG CCT ACT AGA ACT ACA GAT GAG CCT ATT ATT GTG ATT ACA ACA TAT TAT ATG CTT GTA AAA AAG CGT GAA GAT CTT CCT CCA ACT TAA ATT GCT TAA AAG AGC AAA AAG AGA TAA TAC ATA GAC TCA ATG AAG GAA AGA AAA TGG GGA GTT TGT GTG ATT GAT GAA GTG CAT AAA TTG CCA GCA AAT ACT TTT TAA AAT GTA CTT AAG CAG TAT AAA TTC CAC TTT AAA CTA GGT CTC ACT GCT ACT CCT TAC AGA GAA GAT GAA AAG ATT ATT AAT TTA TTT TAT ATG ATA GGA CCT AAG TTG TAT GAA GAA AAT TGG TAT GAT TTA GTT AGT TAA GGA TTT TTA GCT AAA CCC TAC TGT GTA GAA ATT AGA TGT GAA ATG TCG TAG CTC TGG ATG AGC GAG TAT AAT AAG AAA GAT TTA AAG ACA GGT AAA AAT TAC TAC AGA GGG CCA TAA AGA GAG TTA ATA CAT ACA AGT AAC CCA AGA AAA TTT AAG ACT CTT GAG TAT CTC ATA AAA GTT CAT GAA GAA AGA GGA GAT AAA ATT CTA GTT TTT TGT GAT AGA CCA ATG ATA ATA GAT TAT TAT GGA AAT ATT TTA AAA TAT CCA GTT ATA TAT GGA GAT GTA TCA CAA GAT GAG AGA AAG AAA ATA TTT AAT CTA TTT AAA GTT TCA AAC TAG ATA AAT ACA ATA TTT CTT TCC AGA GTT GGA GAT ACA GCA ATA GAT TTG CCT CAG GCT AAC GTT GGT ATC TAA ATT GGA ATG CAT TTT AAA AGT AGG AGA TAA GAA GTT TAG AGG TTA GGT AGA ATC ATG AGA GCT AAA GAA AAC TAT GAT GGT TAA TAT AAT GCT TTT TGG TAT ACA TTA GTT TCA AAA GGA ACT GAT GAA ACT TCC TAC TGT TTA GCA AGG CAA AAA TGT TTA ATA AAT TAA GGT TTC AAA TAT GAA ATT ATT GAT GAA AAA GAT TTA CCA TAT AGT TAA AAT CCT TAA AAG TTT AAG TGG ATG TCT TAA TTA GAT GAG TCA GAT TAT CTT TAC ACA TTA TTA ATG AAT TCT GAA CAA AAT CAG CAA AAT GGC AAA ATG TCA AGT GAA GAA GAA AGC TCG AGT GGT GAT AGC TCA GGA TCA GAT TCT GAA GAA TCA GAA GGA CAT TTT AAT ATC ACT ACA AAA GCT GCA AAC CCT TTA TAA AAT CTA GCA CTT TAC AAA GAA ACA TAG CTT AAT AAA TAC TGA >TTHERM_00529620(protein)M A D K K V N P K S R E Q S K R L K S N S Q K Q N Q N G K Q Q K N E E G D D G L F G Q K Q G K A Q V E G N Q F Q Q F Y D Y S T L E L K D D Y R E R P I L I C P D G I I F L E T F N P L Y R V A Y Q F L I S I G E P V Q R P L S M H K F T L T K Y S L Y T A M V L Q Y E P K D I I L C L E K L S K N K K I P K E V E R Y I T E N T Q N Y G A A R L F L D D S S Y Y L D I D S Q V W T S I I E R N P H I K D L V S Q T Q F N F D N I I N Q N K E L R D I Q K D L Q S F F Q N I K T E N N Q Q S S K K N Q K M I V E D E Q D D G I P D K K N K L M K N G D S S I A N Y D D E D E E D S D D G D D D F V Y N F I M N N K T K R S F K R I Q I I G D H F E V T K A V I N C S V P L I Q E Y D F E N K S F K Q L E I E L K P K I K V R Y Y Q E R A L K N I F I Q K K A R S G L I I L P C G A G K T I V G V I A I E R I K Q S T V I I C D S D V S V D Q W R D E L E R W T T I N K N K I V R L T G R I V D E W P T R T T D E P I I V I T T Y Y M L V K K R E D L P P T Q I A Q K S K K R Q Y I D S M K E R K W G V C V I D E V H K L P A N T F Q N V L K Q Y K F H F K L G L T A T P Y R E D E K I I N L F Y M I G P K L Y E E N W Y D L V S Q G F L A K P Y C V E I R C E M S Q L W M S E Y N K K D L K T G K N Y Y R G P Q R E L I H T S N P R K F K T L E Y L I K V H E E R G D K I L V F C D R P M I I D Y Y G N I L K Y P V I Y G D V S Q D E R K K I F N L F K V S N Q I N T I F L S R V G D T A I D L P Q A N V G I Q I G M H F K S R R Q E V Q R L G R I M R A K E N Y D G Q Y N A F W Y T L V S K G T D E T S Y C L A R Q K C L I N Q G F K Y E I I D E K D L P Y S Q N P Q K F K W M S Q L D E S D Y L Y T L L M N S E Q N Q Q N G K M S S E E E S S S G D S S G S D S E E S E G H F N I T T K A A N P L Q N L A L Y K E T Q L N K Y >TTHERM_00529620(gene)ATG GCT GAT AAA AAG GTT AAT CCA AAA TCT AGA GAA TAA AGT AAA AGA TTA AAG TCA AAC TCA TAA AAA TAA AAT TAA AAT GGC AAA TAA TAA AAG AAT GAA GAA GGA GAT GAT GGC TTA TTT GGC TAA AAA TAA GGA AAA GCA CAA GTA GAA GGA AAT TAA TTT CAA TAA TTT TAT GAT TAC TCT ACT CTA GAA TTA AAA GAT GAT TAC AGA GAA AGA CCT ATT TTG ATA TGT CCA GAT GGA ATA ATA TTT TTA GAA ACT TTT AAT CCT CTT TAC AGG GTT GCC TAT TAA TTT TTA ATT TCT ATT GGA GAG CCT GTG TAA AGA CCT CTC TCA ATG CAT AAA TTT ACC TTG ACT AAG TAT TCA CTT TAT ACT GCG ATG GTT TTA TAG TAT GAA CCT AAA GAT ATA ATT CTG TGT CTC GAA AAG CTT AGT AAG AAC AAA AAA ATT CCT AAA GAA GTA GAA AGA TAT ATT ACT GAA AAT ACA TAA AAC TAT GGA GCT GCT AGA CTA TTT TTA GAC GAC AGT AGT TAT TAC TTA GAT ATA GAT TCT TAG GTA TGG ACA AGT ATA ATA GAA AGA AAT CCA CAT ATA AAA GAC CTA GTT TCA CAA ACA TAA TTT AAC TTT GAT AAT ATT ATA AAC TAA AAT AAA GAA TTG AGG GAT ATT TAA AAA GAT CTG CAA AGC TTC TTT TAA AAT ATA AAA ACA GAA AAC AAT TAA TAA TCT TCA AAA AAA AAC TAG AAA ATG ATT GTT GAA GAT GAG CAA GAT GAT GGA ATT CCA GAT AAA AAA AAT AAA TTA ATG AAA AAC GGT GAT AGC AGT ATT GCT AAT TAT GAT GAC GAA GAT GAA GAA GAT TCT GAT GAT GGT GAT GAT GAT TTT GTT TAT AAT TTC ATA ATG AAT AAT AAA ACA AAA CGG TCT TTT AAA CGT ATT TAA ATT ATT GGA GAT CAT TTT GAG GTT ACT AAA GCT GTT ATT AAC TGT AGT GTT CCT CTG ATT TAA GAA TAT GAT TTC GAA AAC AAA AGC TTC AAA TAA CTA GAA ATT GAA TTA AAG CCA AAA ATA AAG GTG AGA TAT TAC CAA GAA AGA GCT TTA AAA AAT ATA TTT ATA TAG AAG AAA GCT CGT TCT GGA TTG ATA ATT CTT CCT TGT GGT GCA GGG AAA ACA ATT GTT GGA GTT ATT GCT ATC GAA AGG ATA AAA TAA AGT ACA GTA ATT ATT TGT GAC TCT GAT GTT TCT GTG GAT TAA TGG AGA GAT GAA CTT GAG AGA TGG ACT ACA ATT AAT AAA AAC AAA ATA GTT AGA TTA ACT GGT AGA ATA GTG GAT GAA TGG CCT ACT AGA ACT ACA GAT GAG CCT ATT ATT GTG ATT ACA ACA TAT TAT ATG CTT GTA AAA AAG CGT GAA GAT CTT CCT CCA ACT TAA ATT GCT TAA AAG AGC AAA AAG AGA TAA TAC ATA GAC TCA ATG AAG GAA AGA AAA TGG GGA GTT TGT GTG ATT GAT GAA GTG CAT AAA TTG CCA GCA AAT ACT TTT TAA AAT GTA CTT AAG CAG TAT AAA TTC CAC TTT AAA CTA GGT CTC ACT GCT ACT CCT TAC AGA GAA GAT GAA AAG ATT ATT AAT TTA TTT TAT ATG ATA GGA CCT AAG TTG TAT GAA GAA AAT TGG TAT GAT TTA GTT AGT TAA GGA TTT TTA GCT AAA CCC TAC TGT GTA GAA ATT AGA TGT GAA ATG TCG TAG CTC TGG ATG AGC GAG TAT AAT AAG AAA GAT TTA AAG ACA GGT AAA AAT TAC TAC AGA GGG CCA TAA AGA GAG TTA ATA CAT ACA AGT AAC CCA AGA AAA TTT AAG ACT CTT GAG TAT CTC ATA AAA GTT CAT GAA GAA AGA GGA GAT AAA ATT CTA GTT TTT TGT GAT AGA CCA ATG ATA ATA GAT TAT TAT GGA AAT ATT TTA AAA TAT CCA GTT ATA TAT GGA GAT GTA TCA CAA GAT GAG AGA AAG AAA ATA TTT AAT CTA TTT AAA GTT TCA AAC TAG ATA AAT ACA ATA TTT CTT TCC AGA GTT GGA GAT ACA GCA ATA GAT TTG CCT CAG GCT AAC GTT GGT ATC TAA ATT GGA ATG CAT TTT AAA AGT AGG AGA TAA GAA GTT TAG AGG TTA GGT AGA ATC ATG AGA GCT AAA GAA AAC TAT GAT GGT TAA TAT AAT GCT TTT TGG TAT ACA TTA GTT TCA AAA GGA ACT GAT GAA ACT TCC TAC TGT TTA GCA AGG CAA AAA TGT TTA ATA AAT TAA GGT TTC AAA TAT GAA ATT ATT GAT GAA AAA GAT TTA CCA TAT AGT TAA AAT CCT TAA AAG TTT AAG TGG ATG TCT TAA TTA GAT GAG TCA GAT TAT CTT TAC ACA TTA TTA ATG AAT TCT GAA CAA AAT CAG CAA AAT GGC AAA ATG TCA AGT GAA GAA GAA AGC TCG AGT GGT GAT AGC TCA GGA TCA GAT TCT GAA GAA TCA GAA GGA CAT TTT AAT ATC ACT ACA AAA GCT GCA AAC CCT TTA TAA AAT CTA GCA CTT TAC AAA GAA ACA TAG CTT AAT AAA TAC TGA