Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00471530Standard Name
VRS1 (valyl-tRNA synthetase 1)Aliases
PreTt22563 | 56.m00267 | 3686.m00110Description
VRS1 valyl-tRNA synthetase; valyl-tRNA synthetase family proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- cytoplasm (IEA) | GO:0005737
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- aminoacyl-tRNA ligase activity (IEA) | GO:0004812
- nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
Biological Process
- tRNA aminoacylation for protein translation (IEA) | GO:0006418
- translation (IEA) | GO:0006412
Domains
- ( PF08791 ) Viral envelope protein
- ( PF00750 ) arginyl-tRNA synthetase
- ( TIGR00422 ) valyl-tRNA synthetase
- ( PF08264 ) Anticodon-binding domain
- ( TIGR00395 ) leucyl-tRNA synthetase
- ( TIGR00396 ) leucyl-tRNA synthetase
- ( TIGR00392 ) isoleucine--tRNA ligase
- ( TIGR00398 ) methionyl-tRNA synthetase
- ( PF09334 ) tRNA synthetases class I (M)
- ( PF00133 ) tRNA synthetases class I (I,
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%
TetraMine Data
TTHERM_00471530
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Stentor Coeruleus SteCoe_21773 0 WormBase WBGene00006936 9.997093137033517e-262 locus:vars-2 Valine--tRNA li
gase status:Confirmed UniP
rot:Q9U1Q4 protein_id:CAB604
28.1
Tetrahymena borealis EI9_11287.1 9.997093137033517e-262 valyl-tRNA synthetase (1037 aa
)
DictyBase DDB_G0277733 9.997093137033517e-262 valS1 on chromosome: 2 positio
n 8402743 to 8406060
Oxytricha Contig2447.0.g21 9.997093137033517e-262 tRNA synthetases class I (I, L
, M and V)
SGD YGR094W 9.997093137033517e-262 VAS1 Mitochondrial and cytopla
smic valyl-tRNA synthetase
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00471530(coding)
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TACAATAAAGCCTACTAAGCATATTAAGCTTAGCCTGCAGCTAATAAGAAAGTAGCTAGT
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CATCCCAAGGATCCTAGATACAAAGATATCATTGGAAAGGAGCTCATCCATCCTTTCATC
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GGTGCTGTCAAGATTACTCCTGCTCATGATCCTAACGATTACAGATGTGGTTTACGTCAC
AATTTACCTTAAATTAACATTTTAGACGATAATGGTTTGATTAACGAAAATGGTGGACCC
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GAAATGTGCCGTATTGTTGAATAAGGAGAATTAAAAATACATCCTCAAGGTGAATTCGAA
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GAAGAACTTTATCAAAAGTTCCCTGCTTTCCAAGAAAAAGGTGAATCTATTTGCATCAAC
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GTTAGTCCTTAATGTTATGCTGTTTTACTTGGAGATAACACTGCTCACCTTTCTAATTTA
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TAAAACGAAGCTAGCGTTCCTGCTGGTTGCATTCCAAATGCAGTTGGAGGTCATCTTATT
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AAGTTAGCTGAAGCTTAAAAGTCTCTTGATGATGCTATTAAGAAAACCAAAATTCCTAAC
TATGAAACAAAAGTTCCTGAAAATATTAAGCAGGCAAACAAAGAAAAAATCGATACCATT
ACTTAGAACGTTAAACTTTTACAAGATATTATTAAAATTTTAAAGAGCTTTTGA>TTHERM_00471530(protein)
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AIKQKRNYEAMLKAYEPKSVEQHWMRFWESKKYFHANPQNVLNGSKKPYVMVIPPPNVTG
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REAFVSKVWEWKEKHGNQITKQLRRVGGSLDWDRFHFTMDDQLSLAVKEAFCILFEKGLI
YRSNRLVNWSCALKTAISDVEVNHERIEEPITRTITGHDGKYEFGVLIHFSYKLKEDPSK
EIIVATTRIETMLGDVAVAVHPKDPRYKDIIGKELIHPFIPDRKMIVIADEELVDMNFGT
GAVKITPAHDPNDYRCGLRHNLPQINILDDNGLINENGGPYKGLKRFDCRNKIIEDLKTI
GSFKDKTKNPMSIGFCSRSGDVIEPMLRPQWYISCTEISKEMCRIVEQGELKIHPQGEFE
SNWFQFMRNPQDWCISRQLWWGHRIPAYQYRVKGTSTSSDGTVTTNWVVGRTEDEALERA
AKNLGVSKDQIELIQDEDVLDTWFSSALFPFSTMGWPNQTDDLQAFYPNSILETGWDILF
FWVARMVMMGLLLLNKLPFKDVFLHPMIRDSQGEKMSKSKGNVIDPLEIIDGCNLQTLIQ
KIQEGNLDKKEMNRAVQLKSKEYPEGFPECGSDALRYGLLAYMQQPRSINLDIKQIIGYR
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NVTIAFQNFWRDNLCDIYLEAIKPIIYGTDEAQKNQTINTLFFVLESGLRLLHPMMPFLS
EELYQKFPAFQEKGESICINAYPVENPTFDNQSLEADFNIINSIAKTIRSLIANVNLPKN
VSPQCYAVLLGDNTAHLSNLITSQAKLISTLAKTSSIEIKQNEASVPAGCIPNAVGGHLI
AYVNVKEYIDVITEITRQDKKLAEAQKSLDDAIKKTKIPNYETKVPENIKQANKEKIDTI
TQNVKLLQDIIKILKSF>TTHERM_00471530(gene)
ATGGATATTTTTGCACAAGAAGATATGAATAGATTAACACTTTTCAAATACTTTAGCACT
TACAATAAAGTAAAAAAATAATTACTTTTTCCTGTTCTTTTCCATTTAAATTCAAATCAT
TTACTGATTAAATTAGCTATTGATTAAGATATGGAAATTATTTGAATTTTGTCATTTTTA
TTACTTGTTTACTCAAATAACTCATAAAATTTTTATTCTGATATGCGGCAACATGAAATT
ATTATAAATTTTGTTTTAGAATATTCTGAAATTTAAATATTTAAAATAATAAAGGCCTAC
TAAGCATATTAAGCTTAGCCTGCAGCTAATAAGAAAGTAGCTAGTTATCTTGTTTAGGAT
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AGATTTTGGGAGTCTAAAAAATACTTCCATGCTAATCCTTAAAATGTATTGAATGGATCA
AAAAAACCTTACGTTATGGTTATCCCTCCTCCTAATGTTACTGGTTATTTACATATTGGT
CATGGTTTGACTACTGCTGTTGAAGATTCTATCATCAGAAGGTATATTATTTATTTTTCT
CAAATGTTTTTTGGTTATTAAGTTATATTTATTATTTAATAATCAGAAAGAGAATGTTAG
GTTTTGAAACTTTATACTTACCTGGTGTTGATCATGCAGGTATTGCCACACATTCAGTAG
TTGAAAAGAAACTCTTAAAAGAAGAAAATAAGACTAGATTCTAAATTGGTCGTGAAGCTT
TCGTTTCAAAGGTTTGGGAATGGAAGGAAAAGTAATTTATTTTGAAATACAAAATTCTAT
TTAAATTTATCAAAGAATGAGATAGGATAAATCAAATAAGAGAATTAATTTAATAAAAAC
ATTCTTTATTTATTTTTATATTAAAGCTGTTTTAAATTTTTTAATGATTTTTTTTAAACT
TATTTTTATGGAAATTAAGGCATGGTAACTAAATTACAAAGTAATTAAGAAGAGTAGGTG
GTAGTTTAGATTGGGATAGATTCCACTTCACCATGGATGATCAACTTAGTTTAGCAGTTA
AGGAAGCTTTTTGCATCTTATTTGAAAAGGGTTTAATCTACAGAAGTAACAGATTAGTTA
ACTGGAGTTGTGCTCTTAAAACAGCTATCAGTGATGTTGAAGTCAATCATGAAAGAATTG
AAGAACCCATTACCAGAACCATTACTGGCCATGATGGAAAATACGAATTTGGTGTTCTCA
TTCACTTCTCATATAAGTTAAAAGAAGATCCTTCTAAGGAAATCATCGTTGCTACCACCC
GTATTGAAACAATGTTGGGTGATGTTGCTGTTGGTATTAATTTATATTAGATAAATGCAA
TCTTTTTATGATAATCATATTTCTAAAAGTTATATTTTATTAACGGCTTTATTTAAAAAT
AACATTTAGCTGTCCATCCCAAGGATCCTAGATACAAAGATATCATTGGAAAGGAGCTCA
TCCATCCTTTCATCCCTGACAGAAAGATGATTGTCATTGCTGATGAAGAATTGGTTGATA
TGAATTTCGGTACAGGTGCTGTCAAGATTACTCCTGCTCATGATCCTAACGATTACAGAT
GTGGTTTACGTCACAATTTACCTTAAGTAATTACTCTATCAAATAGATTAAAATATAAAA
GCTTTTTATTAAAAGATTAACATTTTAGACGATAATGGTTTGATTAACGAAAATGGTGGA
CCCTACAAAGGATTAAAGAGATTCGACTGCAGAAATAAAATTATTGAAGATTTGAAGACT
ATCGGATCTTTCAAGGATAAGACCAAGAATCCTATGTCTATCGGTTTTTGCTCTCGTTCC
GGAGATGTTATCGAACCTATGCTTAGACCTCAATGGTACATAAGCTGCACTGAAATTTCA
AAGGAAATGTGCCGTATTGTTGAATAAGGAGAATTAAAAATACATCCTCAAGGTGAATTC
GAAAGTAATTGGTTCTAATTTATGAGAAATCCTCAAGATTGGTGTATTTCTCGTTAACTC
TGGTGGGGTCACAGAATTCCTGCTTATTAATACAGAGTAATATAATATTTAATTTAAAAT
ACAATAATAACAATAAATAAAATTTTAGGTGAAAGGAACTTCTACATCTAGCGATGGTAC
TGTTACTACTAACTGGGTAGTAGGAAGAACTGAGGATGAAGCTTTAGAACGTGCTGCTAA
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TTGGTTCTCAAGTGCTCTTTTCCCTTTCTCTACTATGGGATGGCCTAATTAAACTGATGA
TTTGTAAGCATTTTATCCTAACTCTATCCTTGAAACAGGTTGGGACATTCTTTTCTTCTG
GGTAGCTCGTATGGTTATGATGGGTCTCCTATTACTTAATAAGCTTCCTTTCAAGGATGT
CTTCCTTCATCCTATGATTAGAGACTCTCAAGGTGAAAAGATGTCTAAATCAAAGGGTAA
TGTCATTGACCCTCTAGAAATTATTGATGGTTGCAATCTTCAAACTTTGATTCAAAAGAT
TTAGGAAGGCAATTTGGACAAGAAAGAAATGAACAGAGCTGTCTAACTAAAGTCAAAGGA
ATACCCTGAAGGTTTCCCTGAATGTGGAAGTGATGCATTACGTTATGGTTTATTGGCATA
CATGCAACAACCTAGATCCATCAATCTTGATATCAAATAAATTATTGGATATAGAGAATT
CTGCAACAAGGTAAAATAAATAAATAATTAAATTAATACGATTGATAGAATGATTGCTTT
AATCCGTTTTTTATATTTTCGTAGATTTGGTAGAGTGCCAAGTTTGGTCTTATGTATATT
CCCAGAGACTTCAAGTATAATAGATCATTCGAATATGATTAACTCCTCTTCATCAATAAG
TGGATTCTTTCAAGATTTAACAAAGCTGTTAAAGACGTTAACCAATATTTTGATAATTAT
GACTTTGGTAATGTTACTATTGCCTTCTAGAATTTCTGGAGAGACAATCTTTGTGATATC
TATCTTGAAGCCATTAAGCCTATTATTTATGGAACAGATGAAGCTTAAAAGAACCAAACT
ATCAATACTTTATTCTTCGTTCTTGAATCTGGTTTAAGATTACTCCATCCCATGATGCCT
TTCTTGAGTGAAGAACTTTATCAAAAGTTCCCTGCTTTCCAAGAAAAAGGTGAATCTATT
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TTCAACATTATTAATTCTATTGCTAAAACAATTCGTTCTCTTATTGCTAACGTTAATCTT
CCTAAAAATGTTAGTCCTTAATGTTATGCTGTTTTACTTGGAGATAACACTGCTCACCTT
TCTAATTTAATTACTTCATAAGCTAAGCTTATCAGCACTCTTGCAAAAACCTCATCTGTA
AAAATATTTTTTTAAAAAAAGATTTTCTTAAAATGTATTTAAACTTATTAATATAGATTG
AAATTAAGTAAAACGAAGCTAGCGTTCCTGCTGGTTGCATTCCAAATGCAGTTGGAGGTC
ATCTTATTGCATACGTTAATGTGAAAGAATATATCGATGTTATCACTGAAGTAAATTTTG
GATTAAATTAATGTTTTAACTGTAAATTTAAAAAAATATAAAATAGATAACAAGATAAGA
TAAGAAGTTAGCTGAAGCTTAAAAGTCTCTTGATGATGCTATTAAGAAAACCAAAATTCC
TAACTATGAAACAAAAGTTCCTGAAAATATTAAGCAGGCAAACAAAGAAAAAATCGATAC
CATTACTTAGAACGTTAAACTTTTACAAGATATTATTAAAATTTTAAAGAGCTTTTGA