Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00471530

Standard Name

VRS1 (valyl-tRNA synthetase 1)

Aliases

PreTt22563 | 56.m00267 | 3686.m00110

Description

VRS1 valyl-tRNA synthetase; valyl-tRNA synthetase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cytoplasm (IEA) | GO:0005737

Molecular Function

• aminoacyl-tRNA ligase activity (IEA) | GO:0004812
• nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
• ATP binding (IEA) | GO:0005524

Biological Process

• tRNA aminoacylation for protein translation (IEA) | GO:0006418
• translation (IEA) | GO:0006412

Domains

• ( PF08791 ) Viral envelope protein
• ( PF00750 ) arginyl-tRNA synthetase
• ( TIGR00422 ) valyl-tRNA synthetase
• ( PF08264 ) Anticodon-binding domain
• ( TIGR00395 ) leucyl-tRNA synthetase
• ( TIGR00396 ) leucyl-tRNA synthetase
• ( TIGR00392 ) isoleucine--tRNA ligase
• ( TIGR00398 ) methionyl-tRNA synthetase
• ( PF09334 ) tRNA synthetases class I (M)
• ( PF00133 ) tRNA synthetases class I (I,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00471530

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_21773	0
WormBase	WBGene00006936	9.997093137033517e-262	locus:vars-2 Valine--tRNA li gase status:Confirmed UniP rot:Q9U1Q4 protein_id:CAB604 28.1
Tetrahymena borealis	EI9_11287.1	9.997093137033517e-262	valyl-tRNA synthetase (1037 aa )
DictyBase	DDB_G0277733	9.997093137033517e-262	valS1 on chromosome: 2 positio n 8402743 to 8406060
Oxytricha	Contig2447.0.g21	9.997093137033517e-262	tRNA synthetases class I (I, L , M and V)
SGD	YGR094W	9.997093137033517e-262	VAS1 Mitochondrial and cytopla smic valyl-tRNA synthetase

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00471530(coding)
ATGGATATTTTTGCACAAGAAGATATGAATAGATTAACACTTTTCAAATACTTTAGCACT
TACAATAAAGCCTACTAAGCATATTAAGCTTAGCCTGCAGCTAATAAGAAAGTAGCTAGT
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CATTCAGTAGTTGAAAAGAAACTCTTAAAAGAAGAAAATAAGACTAGATTCTAAATTGGT
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AATGTTACTATTGCCTTCTAGAATTTCTGGAGAGACAATCTTTGTGATATCTATCTTGAA
GCCATTAAGCCTATTATTTATGGAACAGATGAAGCTTAAAAGAACCAAACTATCAATACT
TTATTCTTCGTTCTTGAATCTGGTTTAAGATTACTCCATCCCATGATGCCTTTCTTGAGT
GAAGAACTTTATCAAAAGTTCCCTGCTTTCCAAGAAAAAGGTGAATCTATTTGCATCAAC
GCCTATCCAGTTGAAAATCCTACCTTCGACAATCAATCTCTTGAAGCTGACTTCAACATT
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GTTAGTCCTTAATGTTATGCTGTTTTACTTGGAGATAACACTGCTCACCTTTCTAATTTA
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GCATACGTTAATGTGAAAGAATATATCGATGTTATCACTGAAATAACAAGATAAGATAAG
AAGTTAGCTGAAGCTTAAAAGTCTCTTGATGATGCTATTAAGAAAACCAAAATTCCTAAC
TATGAAACAAAAGTTCCTGAAAATATTAAGCAGGCAAACAAAGAAAAAATCGATACCATT
ACTTAGAACGTTAAACTTTTACAAGATATTATTAAAATTTTAAAGAGCTTTTGA

>TTHERM_00471530(protein)
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AIKQKRNYEAMLKAYEPKSVEQHWMRFWESKKYFHANPQNVLNGSKKPYVMVIPPPNVTG
YLHIGHGLTTAVEDSIIRRKRMLGFETLYLPGVDHAGIATHSVVEKKLLKEENKTRFQIG
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YRSNRLVNWSCALKTAISDVEVNHERIEEPITRTITGHDGKYEFGVLIHFSYKLKEDPSK
EIIVATTRIETMLGDVAVAVHPKDPRYKDIIGKELIHPFIPDRKMIVIADEELVDMNFGT
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GSFKDKTKNPMSIGFCSRSGDVIEPMLRPQWYISCTEISKEMCRIVEQGELKIHPQGEFE
SNWFQFMRNPQDWCISRQLWWGHRIPAYQYRVKGTSTSSDGTVTTNWVVGRTEDEALERA
AKNLGVSKDQIELIQDEDVLDTWFSSALFPFSTMGWPNQTDDLQAFYPNSILETGWDILF
FWVARMVMMGLLLLNKLPFKDVFLHPMIRDSQGEKMSKSKGNVIDPLEIIDGCNLQTLIQ
KIQEGNLDKKEMNRAVQLKSKEYPEGFPECGSDALRYGLLAYMQQPRSINLDIKQIIGYR
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EELYQKFPAFQEKGESICINAYPVENPTFDNQSLEADFNIINSIAKTIRSLIANVNLPKN
VSPQCYAVLLGDNTAHLSNLITSQAKLISTLAKTSSIEIKQNEASVPAGCIPNAVGGHLI
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TQNVKLLQDIIKILKSF

>TTHERM_00471530(gene)
ATGGATATTTTTGCACAAGAAGATATGAATAGATTAACACTTTTCAAATACTTTAGCACT
TACAATAAAGTAAAAAAATAATTACTTTTTCCTGTTCTTTTCCATTTAAATTCAAATCAT
TTACTGATTAAATTAGCTATTGATTAAGATATGGAAATTATTTGAATTTTGTCATTTTTA
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ATTATAAATTTTGTTTTAGAATATTCTGAAATTTAAATATTTAAAATAATAAAGGCCTAC
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AGATTTTGGGAGTCTAAAAAATACTTCCATGCTAATCCTTAAAATGTATTGAATGGATCA
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CAAATGTTTTTTGGTTATTAAGTTATATTTATTATTTAATAATCAGAAAGAGAATGTTAG
GTTTTGAAACTTTATACTTACCTGGTGTTGATCATGCAGGTATTGCCACACATTCAGTAG
TTGAAAAGAAACTCTTAAAAGAAGAAAATAAGACTAGATTCTAAATTGGTCGTGAAGCTT
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TTAAATTTATCAAAGAATGAGATAGGATAAATCAAATAAGAGAATTAATTTAATAAAAAC
ATTCTTTATTTATTTTTATATTAAAGCTGTTTTAAATTTTTTAATGATTTTTTTTAAACT
TATTTTTATGGAAATTAAGGCATGGTAACTAAATTACAAAGTAATTAAGAAGAGTAGGTG
GTAGTTTAGATTGGGATAGATTCCACTTCACCATGGATGATCAACTTAGTTTAGCAGTTA
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AAGAACCCATTACCAGAACCATTACTGGCCATGATGGAAAATACGAATTTGGTGTTCTCA
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GTATTGAAACAATGTTGGGTGATGTTGCTGTTGGTATTAATTTATATTAGATAAATGCAA
TCTTTTTATGATAATCATATTTCTAAAAGTTATATTTTATTAACGGCTTTATTTAAAAAT
AACATTTAGCTGTCCATCCCAAGGATCCTAGATACAAAGATATCATTGGAAAGGAGCTCA
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TGAATTTCGGTACAGGTGCTGTCAAGATTACTCCTGCTCATGATCCTAACGATTACAGAT
GTGGTTTACGTCACAATTTACCTTAAGTAATTACTCTATCAAATAGATTAAAATATAAAA
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GGAGATGTTATCGAACCTATGCTTAGACCTCAATGGTACATAAGCTGCACTGAAATTTCA
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ATACCCTGAAGGTTTCCCTGAATGTGGAAGTGATGCATTACGTTATGGTTTATTGGCATA
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AATCCGTTTTTTATATTTTCGTAGATTTGGTAGAGTGCCAAGTTTGGTCTTATGTATATT
CCCAGAGACTTCAAGTATAATAGATCATTCGAATATGATTAACTCCTCTTCATCAATAAG
TGGATTCTTTCAAGATTTAACAAAGCTGTTAAAGACGTTAACCAATATTTTGATAATTAT
GACTTTGGTAATGTTACTATTGCCTTCTAGAATTTCTGGAGAGACAATCTTTGTGATATC
TATCTTGAAGCCATTAAGCCTATTATTTATGGAACAGATGAAGCTTAAAAGAACCAAACT
ATCAATACTTTATTCTTCGTTCTTGAATCTGGTTTAAGATTACTCCATCCCATGATGCCT
TTCTTGAGTGAAGAACTTTATCAAAAGTTCCCTGCTTTCCAAGAAAAAGGTGAATCTATT
TGCATCAACGCCTATCCAGTTGAAAATCCTACCTTCGACAATCAATCTCTTGAAGCTGAC
TTCAACATTATTAATTCTATTGCTAAAACAATTCGTTCTCTTATTGCTAACGTTAATCTT
CCTAAAAATGTTAGTCCTTAATGTTATGCTGTTTTACTTGGAGATAACACTGCTCACCTT
TCTAATTTAATTACTTCATAAGCTAAGCTTATCAGCACTCTTGCAAAAACCTCATCTGTA
AAAATATTTTTTTAAAAAAAGATTTTCTTAAAATGTATTTAAACTTATTAATATAGATTG
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ATCTTATTGCATACGTTAATGTGAAAGAATATATCGATGTTATCACTGAAGTAAATTTTG
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TAAGAAGTTAGCTGAAGCTTAAAAGTCTCTTGATGATGCTATTAAGAAAACCAAAATTCC
TAACTATGAAACAAAAGTTCCTGAAAATATTAAGCAGGCAAACAAAGAAAAAATCGATAC
CATTACTTAGAACGTTAAACTTTTACAAGATATTATTAAAATTTTAAAGAGCTTTTGA