Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00649380

Standard Name

VPS34 (Tetrahymena ortholog to yeast Vps34 and human PiK3c3 )

Aliases

PreTt09252 | 94.m00170 | 3677.m00078 | TtVPS34

Description

A class III phosphatidylinositol 3-kinase involved in the nuclear degradation events of Programmed nuclear death (PND)

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• phosphatidylinositol 3-kinase complex (IEA) | GO:0005942

Molecular Function

• obsolete inositol or phosphatidylinositol kinase activity (IEA) | GO:0004428
• phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor (IEA) | GO:0016773
• 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity (IEA) | GO:0016303

Biological Process

• phosphatidylinositol-mediated signaling (IEA) | GO:0048015
• phosphatidylinositol phosphorylation (IEA) | GO:0046854

Domains

• ( PF00792 ) Phosphoinositide 3-kinase C2 domain
• ( PF00454 ) Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase
• ( PF00613 ) Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%

TetraMine Data

TTHERM_00649380

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_17891.1	9.997093137033517e-262	phosphatidylinositol 3- and 4- kinase (906 aa)
Oxytricha	Contig7655.0.g67	1.9995317320402142e-140	Phosphatidylinositol 3- and 4- kinase
DictyBase	DDB_G0289601	6.001115222296727e-111	pikE on chromosome: 5 position 3005109 to 3008075
SGD	YLR240W	2.0006821221283624e-88	VPS34 Phosphatidylinositol 3-k inase responsible for the synt hesis of phosphatidylinositol 3-phosphate; forms membrane-as sociated signal transduction c omplex with Vps15p to regulate protein sorting; activated by the GTP-bound form of Gpa1p
WormBase	WBGene00006932	2.999277470785175e-69	locus:vps-34 Phosphatidylino sitol 3-kinase status:Confir med UniProt:Q9TXI6 protein _id:CCD61195.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_27893	5.166420632837861e-55

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:24280724: Akematsu T, Fukuda Y, Attiq R, Pearlman RE (2014) Role of class III phosphatidylinositol 3-kinase during programmed nuclear death of Tetrahymena thermophila. Autophagy 10(2):209-25

Sequences

>TTHERM_00649380(coding)
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>TTHERM_00649380(protein)
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TFTSYPIGQKEKEGKVEMIYKNGDDLRQDQLVMQIFNLMDGLLKGVGQDFRLMPYKVLAC
SKNDGFMEFVPNSTTIQDLLKGGKQFSQYLQNLAANPENPIYEEYKRLRMQNDEQGKLSN
IEYVSQKIMENYMLSCAGYSVMTYFLGVGDRHLENLMVDITGKFFHIDFGFILGQDPKPY
PPPLKLCRQMIEGMGGKDSKVYAEFRKKCVHAYIYLRKYAKLIVNLFHLMIDSGIKDMSI
EALEKLAEKFYLDFNDTQAELHFLNILDESETALFARVTDMIHKWATYWRA

>TTHERM_00649380(gene)
ATGAAAAAAGGACCAACAGAATATATTCAACATACTCTTTTAGATTAACTTCCAGTAAAG
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