Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00649380Standard Name
VPS34 (Tetrahymena ortholog to yeast Vps34 and human PiK3c3 )Aliases
PreTt09252 | 94.m00170 | 3677.m00078 | TtVPS34Description
A class III phosphatidylinositol 3-kinase involved in the nuclear degradation events of Programmed nuclear death (PND)Genome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- phosphatidylinositol 3-kinase complex (IEA) | GO:0005942
Molecular Function
- phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor (IEA) | GO:0016773
- 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity (IEA) | GO:0016303
- obsolete inositol or phosphatidylinositol kinase activity (IEA) | GO:0004428
Biological Process
- phosphatidylinositol-mediated signaling (IEA) | GO:0048015
- phosphatidylinositol phosphorylation (IEA) | GO:0046854
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%
TetraMine Data
TTHERM_00649380
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_17891.1 9.997093137033517e-262 phosphatidylinositol 3- and 4-
kinase (906 aa)
Oxytricha Contig7655.0.g67 1.9995317320402142e-140 Phosphatidylinositol 3- and 4-
kinase
DictyBase DDB_G0289601 6.001115222296727e-111 pikE on chromosome: 5 position
3005109 to 3008075
SGD YLR240W 2.0006821221283624e-88 VPS34 Phosphatidylinositol 3-k
inase responsible for the synt
hesis of phosphatidylinositol
3-phosphate; forms membrane-as
sociated signal transduction c
omplex with Vps15p to regulate
protein sorting; activated by
the GTP-bound form of Gpa1p
WormBase WBGene00006932 2.999277470785175e-69 locus:vps-34 Phosphatidylino
sitol 3-kinase status:Confir
med UniProt:Q9TXI6 protein
_id:CCD61195.1
Stentor Coeruleus SteCoe_27893 5.166420632837861e-55
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:24280724: Akematsu T, Fukuda Y, Attiq R, Pearlman RE (2014) Role of class III phosphatidylinositol 3-kinase during programmed nuclear death of Tetrahymena thermophila. Autophagy 10(2):209-25
Sequences
>TTHERM_00649380(coding)
ATGAAAAAAGGACCAACAGAATATATTCAACATACTCTTTTAGATTAACTTCCAGTAAAG
TTTAAAATATGCTGCATTAATGATTAAAAAAAAGTCTTGAGATACTTTTTTAATGACGAA
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GAAAAAAAAATATAGCCAGCATAGCAAACACTATTTATTGATAGGATGCTTTTTGAATAG
AATATTATTTTTAATTATAAGTACAAAGATTTGAGTTATAATTCTATTATTGCAATTACA
TTATGGTGTTCCCAAAAAAATAAAGATGAAAAAAAACCTTTGGGATGCACAACTATAAGT
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AAGTAGATCAATTTCTCACATTAAAAAACAGAATAGGCCTTTACAAATGTAAATAAATTT
CCATAAAAGACTGGCTCATCTATCCATAGAAACTAACTTAAAGAATAGCTTGATCTTTAA
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GAAATAAACAATTCTTAATCTAATTCATCAACAAATTCCAATCAATAATCACTTACTGGT
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CTGCATTTCTTGAATATTTTAGATGAAAGTGAAACAGCTCTTTTTGCTAGAGTTACAGAT
ATGATTCATAAATGGGCCACTTATTGGAGAGCTTGA>TTHERM_00649380(protein)
MKKGPTEYIQHTLLDQLPVKFKICCINDQKKVLRYFFNDEDGSSKLENLEAMVTAQLVVN
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PQKTGSSIHRNQLKEQLDLQKIYAFQKIPSAFLEIDFPNFETLVLYQEPEYIIDNDLSSK
EINNSQSNSSTNSNQQSLTGGKSSKFFIQEVDFSECVVTSDFDYENRKDDLIQEQTALII
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NWDNQKELNEAKKLLKIWAKCSYGDALHLLSSSFCANEFYNKKYKKPQDTAIYIRKYACE
QLEKEQTSTICSILLQLTQALRYEPFDYQKSHLAQFLVKKACENTEIATLFYWYLLVECD
KEMDLKEKAKLSSTNQKVQEWFNQVFERMNEELEEKCEENHQVLSLQSEFRQKLRQIVAS
MAKKDRTQKIEIIKKKLASEEFKRPNFKEHPFCLNPNLMIVESIHQQSTVFKSAMAPIKM
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IEYVSQKIMENYMLSCAGYSVMTYFLGVGDRHLENLMVDITGKFFHIDFGFILGQDPKPY
PPPLKLCRQMIEGMGGKDSKVYAEFRKKCVHAYIYLRKYAKLIVNLFHLMIDSGIKDMSI
EALEKLAEKFYLDFNDTQAELHFLNILDESETALFARVTDMIHKWATYWRA>TTHERM_00649380(gene)
ATGAAAAAAGGACCAACAGAATATATTCAACATACTCTTTTAGATTAACTTCCAGTAAAG
TTTAAAATATGCTGCATTAATGATTAAAAAAAAGTCTTGAGGTAATTTATAATTTTAGTA
AAATCATTAATCTTAATATAAAGCCAATTTATTATTCTAAAATAAAGAAAATTACGAAAT
AAAACTCAGTTTAAAAATTATTTTACCCAAAAAATTTGTTAAACTAATTTAATTTTTTCG
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AAAATAGATACTTTTTTAATGACGAAGATGGTAGCAGTAAATTAGAAAATTTGGAAGCAA
TGGTAACAGCTTAATTAGTTGTAAATGAAAAAAAAATATAGCCAGCATAGCAAACACTAT
TTATTGATAGGATGCTTTTTGAATAGAATATTATTTTTAATTATAAGTACAAAGATTTGA
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TGATGAATTTTTATGTCAAAAACTTTTCAATTTTATGATTAAAATTAAAAATTATTTTTA
TTTTTTTTGTAATTAAATTTTATTTTATTTTATTTTAGATACTCTTTGGTTTAGAATCCT
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TGTTCAATTCTATTGTAGCTTACACAAGCTTTAAGATATGAACCTTTTGATTATTAAAAA
AGTCATCTTGCTTAATTTTTAGTAAAAAAGGCATGCGAAAACACAGAAATAGCTACACTG
TTTTATTGGTAATTAAATTGTTTACTTAATTTAAATCTTGATATTATTTATTCTTTATAT
ATGCTAATAATCTAATTAATTTTAGCTTACAGCTTAACAGAAAAATTATTTATAATTTAA
TTAAGGTATCTTTTAGTCGAATGTGATAAAGAAATGGACTTAAAAGAAAAAGCAAAACTT
AGTTCTACTAACTAAAAAGTGTAGGAATGGTTTAATTAAGTATTTGAAAGGATGAATGAA
GAATTGGAGGAAAAATGTGAAGAAAACCATTAAGTTTTAAGTCTTTAGTCAGAATTTAGA
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TTTTGTTTAAACCCAAATTTAATGATTGTAGAATCAATTCATTAGCAATCAACTGTTTTT
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TAAAATTTGAAATAATTTTACATTACACATAAATATCAATTATTTATCAATCATCTTTTA
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CCTAAAAAATAATGAATAATGCTTAAAATAATTAAAATACTAATCCATAAAATACAAATA
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GAGAATAACTACCCTTATAAATTCAGTTTTTATAATGAAAATATATCTTAAAAAGTCTTT
TATAACCCAATATCAAAAATAAAACAAAAGATATTTTGTCATATTTTATATTTAAAAAGA
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GCATGTTCAAAAAACGATGGATTTATGGAATTCGTGCCTAATTCTACTACTATTTAGGAT
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AGTAATATAGAATATGTCAGTCAAAAAATAATGGAAAATTATATGCTCAGTTGCGCAGGT
TATAGTGTAATGACTTATTTCTTAGGTGTGGGTGATCGTCACTTAGAAAATTTGATGGTT
GATATTACAGGAAAATTTTTCCATATTGATTTTGGGTTTATTCTAGGACAAGATCCTAAA
CCTTACCCACCACCTTTGAAATTATGTAGATAAATGATCGAAGGTATGGGAGGAAAGGAT
AGTAAAGTTTATGCAGAATTTAGAAAGAAATGTGTACATGCTTACATATATTTAAGAAAA
TATGCTAAATTGATTGTAAATTTATTCCATTTAATGATAGACTCAGGTATTAAGGATATG
AGTATTGAAGCACTCGAAAAGTTAGCTGAGAAATTTTACTTGGATTTCAACGATACTCAA
GCAGAGCTGCATTTCTTGAATATTTTAGATGAAAGTGAAACAGCTCTTTTTGCTAGAGTT
ACAGATATGATTCATAAATGGGCCACTTATTGGAGAGCTTGA