Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00529860
Standard Name
VMA2 (Vacuolar Membrane Atpase)
Aliases
PreTt04655 | 67.m00170 | 3684.m00040
Description
VMA2 vacuolar V-type H(+)-ATPase B subunit; V-type ATPase- B subunit family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component proton-transporting two-sector ATPase complex (IEA ) | GO:0016469 proton-transporting two-sector ATPase complex, catalytic domain (IEA ) | GO:0033178 Molecular Function hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances (IEA ) | GO:0016820 proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (IEA ) | GO:0046961 proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (IEA ) | GO:0046933 Biological Process
Domains
( TIGR01031 ) ribosomal protein L32
( TIGR01026 ) ATPase FliI/YscN family
( PF00306 ) ATP synthase ab C terminal
( TIGR01040 ) V-type ATPase, B subunit
( TIGR01042 ) V-type ATPase, A subunit
( TIGR01039 ) ATP synthase F1, beta subunit
( TIGR00962 ) ATP synthase F1, alpha subunit
( TIGR01041 ) ATP synthase archaeal, B subunit
( TIGR01043 ) ATP synthase archaeal, A subunit
( TIGR02545 ) flagellar protein export ATPase FliI
( TIGR03305 ) alternate F1F0 ATPase, F1 subunit
( TIGR03324 ) alternate F1F0 ATPase, F1 subunit
( PF02874 ) ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel
( PF00006 ) ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding
( TIGR02546 ) type III secretion apparatus H+-transporting
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.2%
TetraMine Data
TTHERM_00529860
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_3075 0
WormBase WBGene00006921 9.997093137033517e-262 locus:vha-12 Probable V-type
proton ATPase subunit B sta
tus:Confirmed UniProt:Q19626
protein_id:CCD69755.1
Tetrahymena borealis EI9_13666.1 9.997093137033517e-262 V-type ATPase, B subunit prote
in (498 aa)
DictyBase DDB_G0277401 9.997093137033517e-262 vatB on chromosome: 2 position
8008207 to 8010029
Oxytricha Contig908.1.g93 9.997093137033517e-262 ATP synthase alpha/beta family
, nucleotide-binding domain
SGD YBR127C 9.997093137033517e-262 VMA2 Subunit B of the eight-su
bunit V1 peripheral membrane d
omain of the vacuolar H+-ATPas
e (V-ATPase), an electrogenic
proton pump found throughout t
he endomembrane system; contai
ns nucleotide binding sites; a
lso detected in the cytoplasm
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00529860(coding)ATG TCT TCT GAT CCT ATA GCT GCT AAG ATT CAC GCA GCC GCA GCA TCT AGA GAT TAT AAT GTT GCT CCT CGT GCT GAT TAC AGA ACA GTT TGC AAA GTC GAT GGT CCT TTG GTT ATC CTC GAT AAT GTC AAA TTC CCC AAG TTT GCT GAA ATC GTT AAC GTT TGC TTA GCC GAT GGT ACA ATC CGT AAA GGT TAG GTT CTC GAA ATC AGT GGT AAA AAG GCC GTC GTT TAG ATC TTT GAA GGT ACT GAT GGT ATC GAT AGT TTA TAT ACT CAC TGT GAA TTC ACT GGT GAA ACT TTA TAA ATG CCC ATT GCC GAA GAA ATG TTA GGT AGA GTC TTC AAT GGT TCT GGT ACT CCT ATT GAC AAG GGT CCA CCT GTT TTG GCT GAA AAA TTC TAA AGT ATT AAT GGT CAA CCC ATT AAT CCT TAC TCC AGA GTT TAT CCC AAG GAA ATG ATT CAA ACT GGT ATT TCT GCT ATC GAT TGT ATG ACT TCT ATT GCT AGA GGT TAA AAG ATT CCT CTT TTC TCT GCT AAC GGT CTT CCC CAT AAT GAA ATT GGT GCT TAA ATC GTG CGT TAA GCT TCT TTG GTT AAG GGT AAG GAT GTT TTA GAT CAC TCC GAA GAA AAC TTC GCC GTC GTT TTC GGT GCT ATG GGT GTT AAT ATG GAA GTC GCT CGT TTC TTC AGA TAA GAT TTC GAA TCT AAC GGT TCC ATG GAA AAG GTT ATT CTT TTC CTT AAT CTT GCT AAT GAT CCC ACT ATC GAA CGT ATC ATT ACT CCT CGT CTT TCT TTG ACC GCT GCC GAA TAT TTA GCT TAC GAA AGA GAA ATG CAC GTC TTG GTT ATC TTA ACT GAT ATG TCA TAA TAT GCT GAT TCT TTG AGA GAA GTT TCA GCT GCC AGA GAA GAA GTC CCT GGT AGA AGA TCT TAT CCT GGT TAT TTA TAT ACT GAT TTA TCA ACA ATC TAC GAA AGA GCC GGT AGA GTC GAA GGT GTT AAT GGT TCC ATC ACT TAA ATT CCC ATT CTT ACC ATG CCT TCT GAT GAT ATT ACC CAT CCT ATT CCC GAT TTG ACT GGT TAT ATT ACT GAA GGT TAA ATC TTC ATT GAT CGT TAA TTA CAT AAT AAG TAA ATT TAT CCT CCC ATC AAT GTC TTA CCT TCT CTT TCT CGT CTC ATG AAG TCT GCT ATT GGT ATT GAT GAT CAC GGT AAG GTC ATG ACC AGA GTT GAT CAC CCT GAT GTC TCC AAC GAA CTC TAT GCT GCT TAT GCT ATT GGT AAG GAT ACT GCT GCA ATG AAG GCT GTC GTC GGT GAA GAA GCT CTT AAT GAA GAA GAT CAC CTT TAT CTT GAA TTC TTA AAG AAT TTC GAA TCT AAA TAT ATT TCT CAA GTA ATA AAT AAG ATT AAA TTA GAA AAC AAA TTT TTT ATA TTT TTA ATA TAA TTT AGG GTC AAT ACG AAT CTA GAA CTA TCT TCT AAA CCT TAA ACA AAG CTT GGG AAT TAC TCA GAA TTT TCC CTC CAG AGA AGC TAA AAA AGA TTA AAC AAT CAA CCA AGG ATT TGT ACT ACG CTA AAA GGG GTG AAG AAG AAG ATA ACT GAT TAC TAA TTT TAT ATA AGT TTT TTA ACG TTT ATC ATA TCA GAG TAT TAA ATA TAA ATT TAT TAT ACA GTA ATT TTT AGT AAG CAA AGC AAG TAA GCA AGT ATC TAT CTA TAT CAT AGT ATT ATT CAT CCT TTC AAA TTC AAC AAA TTA AAA AGT TCA TTC ACT TGT TTA TTT AGT TCA TAT TTT TTA TGA >TTHERM_00529860(protein)M S S D P I A A K I H A A A A S R D Y N V A P R A D Y R T V C K V D G P L V I L D N V K F P K F A E I V N V C L A D G T I R K G Q V L E I S G K K A V V Q I F E G T D G I D S L Y T H C E F T G E T L Q M P I A E E M L G R V F N G S G T P I D K G P P V L A E K F Q S I N G Q P I N P Y S R V Y P K E M I Q T G I S A I D C M T S I A R G Q K I P L F S A N G L P H N E I G A Q I V R Q A S L V K G K D V L D H S E E N F A V V F G A M G V N M E V A R F F R Q D F E S N G S M E K V I L F L N L A N D P T I E R I I T P R L S L T A A E Y L A Y E R E M H V L V I L T D M S Q Y A D S L R E V S A A R E E V P G R R S Y P G Y L Y T D L S T I Y E R A G R V E G V N G S I T Q I P I L T M P S D D I T H P I P D L T G Y I T E G Q I F I D R Q L H N K Q I Y P P I N V L P S L S R L M K S A I G I D D H G K V M T R V D H P D V S N E L Y A A Y A I G K D T A A M K A V V G E E A L N E E D H L Y L E F L K N F E S K Y I S Q V I N K I K L E N K F F I F L I Q F R V N T N L E L S S K P Q T K L G N Y S E F S L Q R S Q K R L N N Q P R I C T T L K G V K K K I T D Y Q F Y I S F L T F I I S E Y Q I Q I Y Y T V I F S K Q S K Q A S I Y L Y H S I I H P F K F N K L K S S F T C L F S S Y F L >TTHERM_00529860(gene)ATG TCT TCT GAT CCT ATA GCT GCT AAG ATT CAC GCA GCC GCA GCA TCT AGA GAT TAT AAT GTT GCT CCT CGT GCT GAT TAC AGA ACA GTT TGC AAA GTC GAT GGT CCT TTG GTT ATC CTC GAT AAT GTC AAA TTC CCC AAG TAA ATC ATA TAT CAA TTT CAA CAA TTA ATA AAT ACT ACT ATG CAA ATA GAG ATA ATA AAA TAG GTT CAT TTT TCA TTC TAT GGA AAT AAT TTT TCA TAT TTT ACA TAC AAA ATC AAA TTC CAA TTT TTT GTT AAT GAT ACT ACT GTA TCA ATC CTA ATA AAA AAT TAT GAA TAT AAT GGA TGG CAT TAG TTT CCC AAA GAA GTT CCA AAT AGC ATA TAA AAA AAT GTT AAG AAC ATT AAT TAT TAG AGC AGC ACA AAT CAA ATA AAC AAC TTT TTT CAA AGC AAA TAG TTG AAT GCA AAA AAT AAA AAT TTA GTA ATA GAT AGA TTC AGT ATA AAG AGT AGA ACA GAT AAA ATA TAT AAA AAT ATA GAT AGA TAG TTA GAT TGT TTT GCT TGA TGG TGA TTC AAT CAA CTT TAT AGA TTT AAG AAT GAA CTT ATT TTT TAA CTT TTA ATG TAG CTT TTA CTT ATT TTA ATT TTT GTA TCA AAA AGG TTT GCT GAA ATC GTT AAC GTT TGC TTA GCC GAT GGT ACA ATC CGT AAA GGT TAG GTT CTC GAA ATC AGT GGT AAA AAG GCC GTC GTT TAG GTA AAT AGT ATT TAA AAA GAA AGG CAA CAA AAA GGA TTA CTA AAA AAG TTG CTT TGC CAT AAA AAT AAA TGC ATT AAA CTA ATC ATA TTT TTA ATA AAA TTA AAG ATC TTT GAA GGT ACT GAT GGT ATC GAT AGT TTA TAT ACT CAC TGT GAA TTC ACT GGT GAA ACT TTA TAA ATG CCC ATT GCC GAA GAA ATG TTA GGT AGA GTC TTC AAT GGT TCT GGT ACT CCT ATT GAC AAG GGT CCA CCT GTT TTG GCT GAA AAA TTC TAA AGT ATT AAT GGT CAA CCC ATT AAT CCT TAC TCC AGA GTT TAT CCC AAG GAA ATG ATT CAA ACT GGT ATT TCT GCT ATC GAT TGT ATG ACT TCT ATT GCT AGA GGT TAA AAG ATT CCT CTT TTC TCT GCT AAC GGT CTT CCC CAT AAT GAA ATT GGT GCT TAA ATC GTG CGT TAA GCT TCT TTG GTT AAG GGT AAG GAT GTT TTA GAT CAC TCC GAA GAA AAC TTC GCC GTC GTT TTC GGT GCT ATG GGT GTT AAT ATG GAA GTC GCT CGT TTC TTC AGA TAA GAT TTC GAA TCT AAC GGT TCC ATG GAA AAG GTT ATT CTT TTC CTT AAT CTT GCT AAT GAT CCC ACT ATC GAA CGT ATC ATT ACT CCT CGT CTT TCT TTG ACC GCT GCC GAG TAA TTA ACA TAC AAT AAA TAT ATT AAT CTA ATT TTT AGA AAT GAC TTT AAA ATA AGA TAC AAA TAA ACA CAC ACA CAT ATA AAT TAA TAT AAG ATT AAG TGC ATA ATT AAT TAT TTC TTT CTT TCT TGA TCT CCC TCC CAA TCA AAA TAG CTT AGC TTA TTA AAA ATT TAA TAA CTA TCT TGT CCT GTA TAT TTA ATT AAC ACT TAA TCT TTC AAT AAT TAA AAC TTT ATA ATC TGC ATT TTT CTG CCT TTC TAA ACT AAA ATC AGG CAA CTA ACT ACT AAT AAA AAA TAA ATA AAC AAA AAA TAA ATT AGT CAG AAG GAT GGT TAA AAT TTT TTA TTT TTT AGA TAT TTT TTA ATA AAA AAT TAG CTT ATT GAT TAT TAT TTA AGA TAT GAA TAA AAG GCA AAT AGT GTT TAT GAA AGA AAA AGC AAT ATA AAA AAT TTT AAT TTA ACA TCG CAC TTT TAA ATA AAA ATA AAA AAT TAT TTT ATT GAT AAA AAT CTT TTG AAA ATA TCA ATA ATA ATA AAT TAT TTA AAA ATT AAT AGA TAT TTA GCT TAC GAA AGA GAA ATG CAC GTC TTG GTT ATC TTA ACT GAT ATG TCA TAA TAT GCT GAT TCT TTG AGA GAA GTT TCA GCT GCC AGA GAA GAA GTC CCT GGT AGA AGA TCT TAT CCT GGT TAT TTA TAT ACT GAT TTA TCA ACA ATC TAC GAA AGA GCC GGT AGA GTC GAA GGT GTT AAT GGT TCC ATC ACT TAA ATT CCC ATT CTT ACC ATG CCT TCT GAT GAT ATT ACC CAT CCT ATT CCC GAT TTG ACT GGT TAT ATT ACT GAA GGT TAA ATC TTC ATT GAT CGT TAA TTA CAT AAT AAG TAA ATT TAT CCT CCC ATC AAT GTC TTA CCT TCT CTT TCT CGT CTC ATG AAG TCT GCT ATT GGT ATT GAT GAT CAC GGT AAG GTC ATG ACC AGA GTT GAT CAC CCT GAT GTC TCC AAC GAA CTC TAT GCT GCT TAT GCT ATT GGT AAG GAT ACT GCT GCA ATG AAG GCT GTC GTC GGT GAA GAA GCT CTT AAT GAA GAA GAT CAC CTT TAT CTT GAA TTC TTA AAG AAT TTC GAA TCT AAA TAT ATT TCT CAA GTA ATA AAT AAG ATT AAA TTA GAA AAC AAA TTT TTT ATA TTT TTA ATA TAA TTT AGG GTC AAT ACG AAT CTA GAA CTA TCT TCT AAA CCT TAA ACA AAG CTT GGG AAT TAC TCA GAA TTT TCC CTC CAG AGA AGC TAA AAA AGA TTA AAC AAT CAA CCA AGG ATT TGT ACT ACG CTA AAA GGG GTG AAG AAG AAG ATA ACT GAT TAC TAA TTT TAT ATA AGT TTT TTA ACG TTT ATC ATA TCA GAG TAT TAA ATA TAA ATT TAT TAT ACA GTA ATT TTT AGT AAG CAA AGC AAG TAA GCA AGT ATC TAT CTA TAT CAT AGT ATT ATT CAT CCT TTC AAA TTC AAC AAA TTA AAA AGT TCA TTC ACT TGT TTA TTT AGT TCA TAT TTT TTA TGA