Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00339640
Standard Name
VMA1 (Vacuolar Membrane Atpase)
Aliases
PreTt06105 | 34.m00342 | 3689.m00136
Description
VMA1 vacuolar H+-ATPase A subunit; V-type ATPase- A subunit family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component proton-transporting two-sector ATPase complex (IEA ) | GO:0016469 proton-transporting two-sector ATPase complex, catalytic domain (IEA ) | GO:0033178 Molecular Function hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances (IEA ) | GO:0016820 proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (IEA ) | GO:0046961 proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (IEA ) | GO:0046933 Biological Process
Domains
( TIGR01026 ) ATPase FliI/YscN family
( PF00306 ) ATP synthase ab C terminal
( TIGR01040 ) V-type ATPase, B subunit
( TIGR01042 ) V-type ATPase, A subunit
( TIGR01039 ) ATP synthase F1, beta subunit
( TIGR00962 ) ATP synthase F1, alpha subunit
( TIGR01041 ) ATP synthase archaeal, B subunit
( TIGR01043 ) ATP synthase archaeal, A subunit
( TIGR00767 ) transcription termination factor Rho
( TIGR02545 ) flagellar protein export ATPase FliI
( TIGR03305 ) alternate F1F0 ATPase, F1 subunit
( TIGR03324 ) alternate F1F0 ATPase, F1 subunit
( PF02874 ) ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel
( PF00006 ) ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding
( TIGR02546 ) type III secretion apparatus H+-transporting
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.1%
TetraMine Data
TTHERM_00339640
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_10999 0
WormBase WBGene00013025 9.997093137033517e-262 locus:vha-13 V-type proton A
TPase catalytic subunit A st
atus:Confirmed UniProt:Q9XW9
2 protein_id:CAA22076.1
Tetrahymena borealis EI9_15093.1 9.997093137033517e-262 V-type ATPase, A subunit prote
in (618 aa)
DictyBase DDB_G0287127 9.997093137033517e-262 vatA on chromosome: 4 position
5370324 to 5372643
Oxytricha Contig19301.0.g14 9.997093137033517e-262 ATP synthase alpha/beta family
, nucleotide-binding domain
SGD YDL185W 4.001709789838121e-126 VMA1 Subunit A of the eight-su
bunit V1 peripheral membrane d
omain of the vacuolar H+-ATPas
e; protein precursor undergoes
self-catalyzed splicing to yi
eld the extein Tfp1p and the i
ntein Vde (PI-SceI), which is
a site-specific endonuclease
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00339640(coding)ATG GCT TAA AGA AAA ACT GCT TTA GAA GAA ATT GCC GAA AAG GAA TCC AAC TTC GGT AAA ATT TTC AAG GTC GCC GGT CCT CTG GTC GTT GCT GAA CAA ATG GTT GGT GCT AAG ATG TAC GAA TTG GTT AAA GTC GGT TGG AAT AAA TTG GTC GGT GAA ATT ATC AAG CTC GAT GGT GAC ACT GCA TCT ATT CAA TGT TAC GAA GAT ACT TAT GGT TTG ACT GTT GGT GAT CCA GTC ATG AGA ACT AAA GAA CCT CTT TCA GTC GAA CTT GGT CCT GGT ATT TTG AAT GGT ATT TTT GAC GGT ATC TAA AGA CCT CTT GGT TCT ATT GCT TAG GTT TCA GGT TCA GCT TTC ATC CCT AGA GGT GTT GAT GTC CCT ATT TTA GAT GGA GAT AAG TAA TGG CAT TTT ATT CCT AGA CCT GAT ATT AAG GTT GGC TCT AAG CTT ACT GGT GGT GAT ATC TTC GGT CAC TGT CAC GAA AAC AAC TTG TTC TGT AAG CAC AAC ATT ATG CTT CCT CCC AAG GGT AAG GGT CAC GTC ACT TAC ATT GCT CCT GAA GGC TAA TAC ACC ATC CAT GAA AAA GTT TTA GAA CTC GAA ATT GAT GGC AAG AAG ACT TCT TAC AAA ATG TCT CAC TTC TGG CCT GTC AGA TAA GCT CGT CCC GTT TTA GAA AGA CTC TAA GGT AAT GTT CCT CTT CTT ACT GGT CAA AGA GTT TTG GAT GCT CTT TTC CCT TCA GTC TTG GGT GGT ACT TGC GCT ATT CCT GGT GCT TTT GGT TGC GGT AAA ACT TGT ATT TCT TAA GCC TTA TCT AAA TAC TCT AAC TCC GAA GTC ATC GTT TAC GTC GGT TGT GGT GAA AGA GGT AAC GAA ATG GCT GAA GTA CTT ACT GAT TTC CCT GAA TTG AAA ACT GAA ATT AAT GGT AAG AAA GAA TCT ATT ATG CAA CGT ACT TGT TTG GTC GCT AAT ACA TCT AAC ATG CCT GTC GCT GCC AGA GAA GCT TCT ATT TAC ACT GGT ATT ACT CTT GCT GAA TAC TTC AGA GAT ATG GGT TAC AAC GTT AGT ATG ATG GCT GAC TCA ACT TCT CGT TGG GCT GAA GCC TTG AGA GAA ATT TCT GGT CGT CTT GCT TAG ATG CCT GCT GAA TAA GGT TAT CCT GCT TAT CTT GCC AAT AAG CTT GCC TTC TTC TAC GAA AGA GCT GGT CGT GTC AAA TGT TAG GGT TCT CCC AAC AGA GAA GGT TCT ATT ACA ATT GTC GGT GCC GTC TCT CCT CCT GGT GGT GAT TTC ACT GAT CCA GTT ACA GTC TCT ACT CTT GCT ATC GTA CAA GTT TTC TGG GGT CTC GAT AAG AAA TTA GCT CAA CGT AAA CAT TTC CCT TCA GTC GAC TGG AAC AAA TCT ACA TCC AAC TAC GAA AGA CAA TTA GAT CCT TAC TTC AAC AAC TTC GAT CCT GAT TTC TCT AAT TTA CGT ACT TCT ATT AAA AAA ATC TTA TAA GAA GAA AAT GAA TTG AAT GAA ATC GTC CAA TTG GTC GGT AAG GAC TCT CTT TCT GAA GAT TAA AAG CTT ACC TTA GAA GTC GCT AGA GTT ATT AGA GAA GAT TTC TTA CAA TAA AAC GCT TTC TCA GAT TAT GAT TAC ATG TGT CCC TTA GAA AAG ACT ATT GGT ATG ATG AGA GGT ATT TTC ACT TAC TAC GAC AAT GCT AGA AGA ACC ATT GTT GAA TCT TCT GGT GAA ACC AAG ATT AAC TGG AAC GAA ATT CTC TTC CAA ACC AAG CCT CTC TTC CTC TAA CTT ACT GAT ATG AAG AGA CTT GAC CCT AAA AAA CCT AAA TAA GAA GTC AAT CAA TAT TTC AGT AAA TAC GTT GAA GAT GTC AAT CTT GCT TTC AGA AAA ATC AAT GAC CGT TGA >TTHERM_00339640(protein)M A Q R K T A L E E I A E K E S N F G K I F K V A G P L V V A E Q M V G A K M Y E L V K V G W N K L V G E I I K L D G D T A S I Q C Y E D T Y G L T V G D P V M R T K E P L S V E L G P G I L N G I F D G I Q R P L G S I A Q V S G S A F I P R G V D V P I L D G D K Q W H F I P R P D I K V G S K L T G G D I F G H C H E N N L F C K H N I M L P P K G K G H V T Y I A P E G Q Y T I H E K V L E L E I D G K K T S Y K M S H F W P V R Q A R P V L E R L Q G N V P L L T G Q R V L D A L F P S V L G G T C A I P G A F G C G K T C I S Q A L S K Y S N S E V I V Y V G C G E R G N E M A E V L T D F P E L K T E I N G K K E S I M Q R T C L V A N T S N M P V A A R E A S I Y T G I T L A E Y F R D M G Y N V S M M A D S T S R W A E A L R E I S G R L A Q M P A E Q G Y P A Y L A N K L A F F Y E R A G R V K C Q G S P N R E G S I T I V G A V S P P G G D F T D P V T V S T L A I V Q V F W G L D K K L A Q R K H F P S V D W N K S T S N Y E R Q L D P Y F N N F D P D F S N L R T S I K K I L Q E E N E L N E I V Q L V G K D S L S E D Q K L T L E V A R V I R E D F L Q Q N A F S D Y D Y M C P L E K T I G M M R G I F T Y Y D N A R R T I V E S S G E T K I N W N E I L F Q T K P L F L Q L T D M K R L D P K K P K Q E V N Q Y F S K Y V E D V N L A F R K I N D R >TTHERM_00339640(gene)ATG GCT TAA AGA AAA ACT GCT TTA GAA GAA ATT GCC GAA AAG GAA TCC AAC TTC GGT AAA ATT TTC AAG GTC GCC GGT CCT CGT AAG CTA TTT TCT TTC AAG AAA TAT TAT AGT AAT AGG GTT TAG GAG AGT GCA AAA ATT AAG AAA GTA AAG TAG CAG TTG AGT GAG CAA ATC TAC ACA GGA TGA TTT TAC CTA ACA TTG AAT GCA TTT ATT TGT ATT ATA CAA TTT AGA CTG CCA ATC CTA ATT AGT GTC TAA TGT TTC TTT CTT TTT TAT GAT ATG CAG AAT ATG TTT GAA GAC CAA AAT AGG ATA TGC TGA TTA ATA TTT ACA TAA TAG CAT CTA AAT CTA ATT GAT TAC CAC TCT ACA TAG TGC TTC AGT TCT TAA TTT TGA TTT GCT TCA CAA TTG CTC CTA AAA GAA AAA TAA AAT CCT CTT CTA AAT CCT TTA AAT ATT CCA TTC GAA AAC TTT TTA TAA AAA ATA TAT TAA ATT TCA TAA TAA TTT TAT AAA ATA GTG GTC GTT GCT GAA CAA ATG GTT GGT GCT AAG ATG TAC GAA TTG GTA AGA AAT TGT TTA ATT TAG ATT TTA AGA ATT AAT TAC TTT TAA CCA AAA TTA CTC ACT TTA ATG TTA ATC AAA AAT GAA AGC ATG CTA AAT ATT ATT TTA TAT ACA ATT ATA GGT TAA AGT CGG TTG GAA TAA ATT GGT CGG TGA AAT TAT CAA GCT CGA TGG TGA CAC TGC ATC TAT TCA ATG TTA CGA AGA TAC TTG TAA GAA GAA GAA AAA ATA CTT TTC ATC AGA AAA GTG ATA TTA AAT GAA ATT AAT TAA TTA AAT CTT AAA TAA AAA TAG ATG GTT TGA CTG TTG GTG ATC CAG TCA TGA GAA CTA AAG AAC CTC TTT CAG TCG AAC TTG GTC CTG GTA AAT AAA TTA CAA ATT CAT TTA TTA TAA TAC CAA CTT GAT TTA TTG AAG TAT CAA TTA TCC AAA ATA GAC CAA AAT ATA TAA AAA TTA ATT GAT CCA ATT ACA ATA TGC GCA TCC AAT TAT ATA AAT AAT TAT CCA ATT TAG ATT AAA AAA AGA CGA TAA GCA ATA AAA TTA ACC AAT AAA TAG ACT TAA AAA TAA ATG AAT CAT TTA TTT ATT TTT CAA TAA GCG ATT GTT TTT TAG GAA ATA TTA AAT AAA TAG TAA GTC ATT TTT TTA TAG AGG ACT TCA AAA AAT ATA TTG GTT TTT TCT GAT TTG CAA ATA ATA AAA TTT AAG GTT AGC AGC TAA GCT AAG ATA AGC CAA ATA GAT TCA ATT TTA ATT ATT AAA AAG ATA CAC GCA TTT TAA TCT TGA AAA AGC AAA TAT TAT ATT GTG CAA ATT TGT TTA TTT TAT AAA AAA TTA AGA AAA TTA ATA AAT AAA TAA ATA AAA GTT GGG TAG ATT TTA AGA TAG TGA ATT AAT AAA TAA ATT ATT TAA TAA ACA AAT TAG AAG GAT TTT GAT TTG TTT GCG AAA ACA TCT AGA ATA ATT TAC TAT TTA ATA ATC ATC AAG ATA TAT TCT ATA CCT AGC TTT TCA TTA TTT TCT TTA AAA AAT AAG ACA TTA GCA CAA ATA ATG GAT TGA TTG ATA ATA CAA ACA ACT TCA ATT TCA TTT TCC AAG CAA ACA AAA ATA CTT TGT CAT TCT TTT TAA TAA TTT TTA TAT TTT TAC AAC AAA ACA GGT ATT TTG AAT GGT ATT TTT GAC GGT ATC TAA AGA CCT CTT GGT TCT ATT GCT TAG GTT TCA GGT TCA GCT TTC ATC CCT AGA GGT GTT GAT GTC CCT ATT TTA GAT GGA GAT AAG TAA TGG CAT TTT ATT CCT AGA CCT GAT ATT AAG GTT GGC TCT AAG CTT ACT GGT GGT GAT ATC TTC GGT CAC TGT CAC GAA AAC AAC TTG TTC TGT AAG CAC AAC ATT ATG CTT CCT CCC AAG GGT AAG GGT CAC GTC ACT TAC ATT GCT CCT GAA GGC TAA TAC ACC ATC CAT GAA AAA GTT TTA GAA CTC GAA ATT GAT GGC AAG AAG ACT TCT TAC AAA ATG TCT CAC TTC TGG CCT GTC AGA TAA GCT CGT CCC GTT TTA GAA AGA CTC TAA GGG TAA CTT ACC TTT TAT TTA TGA AAT AAA CTA AAT TTA AAT ATT TTT TAA TTT AAT TCT AAA TAG TAA TGT TCC TCT TCT TAC TGG TCA AAG AGT TTT GGA TGC TCT TTT CCC TTC AGT CTT GGG TGG TAC TTG CGC TAT TCC TGG TGC TTT TGG TTG CGG TAA AAC TTG TAT TTC TTA AGC CTT ATC TAA ATA CTC TAA CTC CGA AGT CAT CGT TTA CGT CGG TTG TGG TGA AAG AGG TAA CGA AAT GGC TGA AGT ACT TAC TGA TTT CCC TGA ATT GAA AAC TGA AAT TAA TGG TAA GAA AGA ATC TAT TAT GCA ACG TAC TTG TTT GGT CGC TAA TAC ATC TAA CAT GCC TGT CGC TGC CAG AGA AGC TTC TAT TTA CAC TGG TAT TAC TCT TGC TGA ATA CTT CAG AGA TAT GGG TTA CAA CGT TAG TAT GAT GGC TGA CTC AAC TTC TCG TTG GGC TGA AGC CTT GAG AGA AAT TTC TGG TCG TCT TGC TTA GAT GCC TGC TGA ATA AGG TTA TCC TGC TTA TCT TGC CAA TAA GCT TGC CTT CTT CTA CGA AAG AGC TGG TCG TGT CAA ATG TTA GGG TTC TCC CAA CAG AGA AGG TTC TAT TAC AAT TGT CGG TGC CGT CTC TCC TCC TGG TGG TGA TTT CAC TGA TCC AGT TAC AGT CTC TAC TCT TGC TAT CGT ACA AGT TTT CTG GGG TCT CGA TAA GAA ATT AGC TCA ACG TAA ACA TTT CCC TTC AGT CGA CTG GAA CAA ATC TAC ATC CAA CTA CGA AAG GTA TTT ATC ATT TAT TTA TCT TTT ATA ACA TAA ATA TTA ATT GAC TGA ATC TTA TTA AAA ATA GAC AAT TAG ATC CTT ACT TCA ACA ACT TCG ATC CTG ATT TCT CTA ATT TAC GTA CTT CTA TTA AAA AAA TCT TAT AAG AAG AAA ATG AAT TGA ATG AAA TCG TCC AAT TGG TCG GTA AGG ACT CTC TTT CTG AAG ATT AAA AGC TTA CCT TAG AAG TCG CTA GAG TTA TTA GAG AAG ATT TCT TAC AAT AAA ACG CTT TCT CAG ATT ATG ATT ACA TGT GTC CCT TAG AAA AGA CTA TTG GTA TGA TGA GAG GTA TTT TCA CTT ACT ACG ACA ATG CTA GAA GAA CCA TTG TTG AAT CTT CTG GTG AAA CCA AGA TTA ACT GGA ACG AAA TTC TCT TCC AAA CCA AGC CTC TCT TCC TCT AAC TTA CTG ATA TGA AGA GAC TTG TAA TTT ACT AAT TCA TTA ATT AAT TTA AAA ATT TTT TAA TTT ATT TAA TTT AAC TAA TAA AAT AGG ACC CTA AAA AAC CTA AAT AAG AAG TCA ATC AAT ATT TCA GTA AAT ACG TTG AAG ATG TCA ATC TTG CTT TCA GAA AAA TCA ATG ACC GTT GA