Gene Model Identifier
TTHERM_00146330
Standard Name
UPFL1
Aliases
PreTt26840 | 11.m00537 | 3702.m00259 | UPF1b
Description
One of two paralogs of UPF1.
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Cellular Component Biological Process
( PF00580 ) UvrD/REP helicase
( PF00096 ) Zinc finger, C2H2 type
( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
( TIGR00376 ) DNA helicase, putative
( PF07198 ) Protein of unknown function (DUF1410)
( TIGR00959 ) signal recognition particle protein
( PF04699 ) ARP2/3 complex 16 kDa subunit
( TIGR01447 ) exodeoxyribonuclease V, alpha subunit
( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
( TIGR03158 ) CRISPR-associated helicase, Cyano-type
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00146330
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_04650.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1221 aa)
DictyBase DDB_G0288923 7.99705442073232e-89 upf1 on chromosome: 5 position
Oxytricha Contig17825.0.g106 3.0008725323024365e-87 RNA helicase (UPF2 interacting
WormBase WBGene00004880 6.000861789407751e-87 locus:smg-2 Regulator of non
SGD YMR080C 6.000861789407751e-87 NAM7 ATP-dependent RNA helicas
Stentor Coeruleus SteCoe_3983 4.906094730649281e-35
No Data fetched for General Information
Ref:28402567 : Tian M, Yang W, Zhang J, Dang H, Lu X, Fu C, Miao W (2017) Nonsense-mediated mRNA decay in Tetrahymena is EJC independent and requires a protozoa-specific nuclease. Nucleic acids research 45(11):6848-6863Ref:SUPR000377
>TTHERM_00146330(coding)ATG AAA GGA AAC TAG CAA AAT CGT CAT CTT GTT TGG CAA AAA GTA TCT GAA ATC AAA GGC TTC TAG GTT TTA TGC TTG GAT TGC AGA GTT TTT TTC GAT AAC TAA AGA AAT CCA AAT AAC TCT AAT AAT TCA AGT AGT ATT GTT TCG CAC TTA ATC TAA TCA AAG CAT AAC AAG GTT CAG TTA CTT ATC AAT TCA GGC ATA GCA GTT TAA AAG CAT ATT GTT TGC TCA TCA TGT AAA TTA GGG GAT GTT TTT AAA CTT TAA ATT TAT GAT TAT CCT CAA GGT ATT CTA CTG CTT TGT AAT GAG TGT TCT TTT AAA TTT ATA AAT TAA ACT AAA TTT AAA TAA GAT TCT GAG GTT AAG CAC TCA ACA GTT ATC TAA TAA AAT GAA ATC AAT TCC ATT CTT TTT GAT GCA AAG AGG GTT TAA TTA AAT CCA GAT ATT CTA CAG ATA AAC TAA AAT AAA AAA TCT AAA GTT TAA TAC ATC AGA AAA GTT GAT GTA GTA GAA GCA AAT GCT GGA CCA CAA AAT ATT AGT TAA GCT TAA TAA TAA AAA TCA ACA AAT AAT TTA AAT TAA AAT CCC TAA TTA ATC GGA TCA GAT AAA ATA TAA AAT AAA AAT TAA AAT GCA TCT CAA GAG TAA AAA ATT GAA AAA CTT TTA AAA ATT TAA TGC TTA GAT TGC AAA TAA TAT TTT GAC AAC TAA AAA ATA AAT GGG TCT CTC AAA ACA AGC ATC ATT AAG CAT CTT ACT AAA TAG AAT CAT AAT AGA ATT ACC TGT ATA TTA AAC TAA AAT TAA TAA AAA AAT ATT ACT CCA GAT TGC TAT AAA TGC AAG AAA AGA AAT GTT TTC GAT TTA ACA ATA TGT AAA GTT AAT AAT GAA TAG TAT TTA CTA TGC TCT TAA TGT TTA AAT AAA AGC AAC GGC AGT TTA TTT ACT AAT GAT CCA AAT ATA GCT ATG AAA TTG GTC AGC ACT TTT CCA AAT GAA CCA CTT ATT ACT AAT TAT TCA ATT AAT TCT ACT TTC CTT GAT CAA TTA ACG AAG AGC GAT TAA CCT AAA TAA ATT TAA TCA GAT TAA ACC TAA TTA AAT TAG TAA TCT ATC CCA CAA AAT ATT TAA ATA GGC TTA AAT AAT AAT AAT AAT TAA CTT TTA GTC AGT AAT AAC AGT AAT AAC GAA GAT ACA TAA GTA AAG TGC CTT TAG TGT AAT AAT ATA TTT TAA AAC TAA AGA AAC AAG CAT GAC AGT GTA ACT CAA ATA GTC AAA CAT TTA AAA AAG TGT TCC CAC AAT AAA ATA GAA ATA TAA GAA AAG GCA AGA AAA ACT TCT TTT TCT ACA TTT AAA TGC CTA TCA TGC AAT TAA AAC AAC ATT TTT GTT CTA TTT ATT GTA GAA ATT GAA TCA TTT TAC TTT GTT TTA TGT AAC TAA TGT ATA AAT AGT AAG ATG ATT CAA TTT TAA GGT AAA GAC TCA CAA TCA ATT GAA AAA TGT AAG AAG TCT GCT ATT GTG TAA AAT GGA TCA ATA AAT ACT TTA TTG ATG AAC CTG ACC ATC AAA AAA AAA GAA TAC TAT CCA GTA AAC AAT GAG CAC AAA AAT TAA CCT GAC TAA AAC TAA ATA GAA TAA GAT AAT AAT GAT GAT GAT TAT GAT TTT TGC CTA AAT GGA GGT AAT GAC AAT CAA GTT TAA GTA GGT ATG TTG AAT GAC CCT AAA ACC TAA AAT ATC AAT AAT TAA GAT AGA AAT TTT GAC TAG TCT CGC AAT CTC CAA TCA ATC CAA GTT AAT TCT AGA GAG GAA AAA AAA ATT GAA ATA TTT AAA AAT GTT GAA GCT TAT TAA CAT TTT TTT AAA AAG ATC TTA AAT TAA GAA TAA TAT GAA ATA TCT AAG TAG ATA TAA TAA AGT GTT TTA ACA ACT AAA GCA CTT ATC TTA TCA GAA AAT CAG TTG TAA ATA TAA GTT TCC TCC AAC CAT CTA TTA AAA TAG GGT AAA GAA TTA AAA ATT AAA TGG GGT AAT TTT AAA TCC AAA TTT TAT GTA GAG AGT ATT GAT GAT CAT AAA ATC GTT ATT AAA ATT TAA GAT TCT AAT AAA TCT TTA AGT CGT TTC AAA GTA GGA AAT GTA GTA GAA AAT GTT TAA ATA AAA TTA ATC AAT CCT AAA TAG ATT TTT GAA AGA ATA CTG TAG GGA ATT AAC AAA TTT TCA AGT CTA GAA GAA TCT TTG TAA AAA AAA ATA CTT GGT TAA TTT GAA AAG GAT GAT AAA TCT ATT AAA AGT GAT GAT TCA TTA GAA ATA ATT GAC GAA TAA GCT CAA TAA GAT ATA GCT TAG CTA AAT TAA AGT TAG CTG TAA GCA ATT TAG TCA TCT CTC TCA AAA AAT ATT TCG CTG ATT TAA GGT CCT CCA GGA ACA GGA AAA ACT GAA ACA GCA GCT CAG CTA GTT TTA GAA ATA TGG TAT AAA ATT AAC AAA AAT TAA CAA AAC GAA AAG ATT TTA GTT TGT GCT CCA TCA AAC TTA GCT GCA GAT AAC ATT TCA GAT AGG ATT CAT GCA TAA AAT AGA GAA ATA AAA GTA ATA AGA ATA GTT TCT TAA GCT AGG TAA AGA GTA AAA GTT TCA TAT TAA TTT CAA GAT ATA GTT CTG CAT AAA GTA CTA AAG AAA GAA GGT TTC TTT AAT AAA AAT AGT GTA TTG AAA AGA GCA AAA TAA TTA ATT GAA AAT GCT GAC GTC ATT TGT ACT ACT TGC ATT AAT TCT GTA GAT AAG TTT ATA AAA GGT ATT AGT TTT TCA ACA GTA GTA ATA GAT GAA GCA AAC TAG GCA ATA GAA CCA GAA ACA ATA ATA CCT CTT TAG CAT TAA GCT AAA AAA TTA ATT TTG ATA GGT GAT CAT AAA TAA TTG CCA CCC ATC ATC TTA AGC ATT TAA GCT TCA AAA GAT GGG TTA AAA AGA AGT TTA TTT TCA AGA CTT GTT TAA GCT GGT CTT ATC CCT TAA TTT TTA TCA ATT CAG TAT AGG ATG CAT CCA GAA ATA AGA AAG TTA GCA TCT TCT ATA TTC TAT CAA AAC TAG CTT AAA GAT GGA GTT AAT GAA TAA GAT AGA ACT CCT ACT CCG AAG TTC AAT TGG CTA AAT AAT AAA ATT CCT ATC TAA TTT TAT GAT GTC TAA GGT TAA GAA ATT ACT TTG TAA GAT GGT AAA AGT TTT ATA AAC GAA GAA GAA GCA AAG CTT GTA AAA AGT TTA GTT TCT TAG CTT ATA TAA GCA GGT GTT AAA GAT AAT GAT ATT GGG ATA ATA ACG CCT TAT TTA TCT TAA TCT AAT TAT ATA AGT TAA TTA ATA AAA AAT AGC AAT ATT TTA ATT GAT ACA ACA TAC AGT TTC TAA GGA CAA GAA AGA GAC TAC ATA ATA ATT TCA TGT GTA AGG ATC AAT AAT TTT TAA AAC TTA GGA ATT TTA AGG ACA CCA TAG CTG ATT AAC GTA TCT ATA ACA AGA GCT AAG AGA GGT TTA CTA ATA GTT GGA AAC AAG AAA CAT GTG AGT TAT TCA AGA TGG TGG AAA CAA ATC ATT GAT TAT TTG GAT AAA TTA AAA CTT ATT TAA GAA ATT AAA AAA GAG CCT ATC GAA AAT ATT TAT TCT ATT GAG AAC AAT AAA ATC ATA AAT AAA ATT GAT GAA AGG CTA TGC TTC CAT AAA AAA AGT TGA >TTHERM_00146330(protein)M K G N Q Q N R H L V W Q K V S E I K G F Q V L C L D C R V F F D N Q R N P N N S N N S S S I V S H L I Q S K H N K V Q L L I N S G I A V Q K H I V C S S C K L G D V F K L Q I Y D Y P Q G I L L L C N E C S F K F I N Q T K F K Q D S E V K H S T V I Q Q N E I N S I L F D A K R V Q L N P D I L Q I N Q N K K S K V Q Y I R K V D V V E A N A G P Q N I S Q A Q Q Q K S T N N L N Q N P Q L I G S D K I Q N K N Q N A S Q E Q K I E K L L K I Q C L D C K Q Y F D N Q K I N G S L K T S I I K H L T K Q N H N R I T C I L N Q N Q Q K N I T P D C Y K C K K R N V F D L T I C K V N N E Q Y L L C S Q C L N K S N G S L F T N D P N I A M K L V S T F P N E P L I T N Y S I N S T F L D Q L T K S D Q P K Q I Q S D Q T Q L N Q Q S I P Q N I Q I G L N N N N N Q L L V S N N S N N E D T Q V K C L Q C N N I F Q N Q R N K H D S V T Q I V K H L K K C S H N K I E I Q E K A R K T S F S T F K C L S C N Q N N I F V L F I V E I E S F Y F V L C N Q C I N S K M I Q F Q G K D S Q S I E K C K K S A I V Q N G S I N T L L M N L T I K K K E Y Y P V N N E H K N Q P D Q N Q I E Q D N N D D D Y D F C L N G G N D N Q V Q V G M L N D P K T Q N I N N Q D R N F D Q S R N L Q S I Q V N S R E E K K I E I F K N V E A Y Q H F F K K I L N Q E Q Y E I S K Q I Q Q S V L T T K A L I L S E N Q L Q I Q V S S N H L L K Q G K E L K I K W G N F K S K F Y V E S I D D H K I V I K I Q D S N K S L S R F K V G N V V E N V Q I K L I N P K Q I F E R I L Q G I N K F S S L E E S L Q K K I L G Q F E K D D K S I K S D D S L E I I D E Q A Q Q D I A Q L N Q S Q L Q A I Q S S L S K N I S L I Q G P P G T G K T E T A A Q L V L E I W Y K I N K N Q Q N E K I L V C A P S N L A A D N I S D R I H A Q N R E I K V I R I V S Q A R Q R V K V S Y Q F Q D I V L H K V L K K E G F F N K N S V L K R A K Q L I E N A D V I C T T C I N S V D K F I K G I S F S T V V I D E A N Q A I E P E T I I P L Q H Q A K K L I L I G D H K Q L P P I I L S I Q A S K D G L K R S L F S R L V Q A G L I P Q F L S I Q Y R M H P E I R K L A S S I F Y Q N Q L K D G V N E Q D R T P T P K F N W L N N K I P I Q F Y D V Q G Q E I T L Q D G K S F I N E E E A K L V K S L V S Q L I Q A G V K D N D I G I I T P Y L S Q S N Y I S Q L I K N S N I L I D T T Y S F Q G Q E R D Y I I I S C V R I N N F Q N L G I L R T P Q L I N V S I T R A K R G L L I V G N K K H V S Y S R W W K Q I I D Y L D K L K L I Q E I K K E P I E N I Y S I E N N K I I N K I D E R L C F H K K S >TTHERM_00146330(gene)ATG AAA GGA AAC TAG CAA AAT CGT CAT CTT GTT TGG CAA AAA GTA TCT GAA ATC AAA GGC TTC TAG GTT TTA TGC TTG GAT TGC AGA GTT TTT TTC GAT AAC TAA AGA AAT CCA AAT AAC TCT AAT AAT TCA AGT AGT ATT GTT TCG CAC TTA ATC TAA TCA AAG CAT AAC AAG GTT CAG TTA CTT ATC AAT TCA GGC ATA GCA GTT TAA AAG CAT ATT GTT TGC TCA TCA TGT AAA TTA GGG GAT GTT TTT AAA CTT TAA ATT TAT GAT TAT CCT CAA GGT ATT CTA CTG CTT TGT AAT GAG TGT TCT TTT AAA TTT ATA AAT TAA ACT AAA TTT AAA TAA GAT TCT GAG GTT AAG CAC TCA ACA GTT ATC TAA TAA AAT GAA ATC AAT TCC ATT CTT TTT GAT GCA AAG AGG GTT TAA TTA AAT CCA GAT ATT CTA CAG ATA AAC TAA AAT AAA AAA TCT AAA GTT TAA TAC ATC AGA AAA GTT GAT GTA GTA GAA GCA AAT GCT GGA CCA CAA AAT ATT AGT TAA GCT TAA TAA TAA AAA TCA ACA AAT AAT TTA AAT TAA AAT CCC TAA TTA ATC GGA TCA GAT AAA ATA TAA AAT AAA AAT TAA AAT GCA TCT CAA GAG TAA AAA ATT GAA AAA CTT TTA AAA ATT TAA TGC TTA GAT TGC AAA TAA TAT TTT GAC AAC TAA AAA ATA AAT GGG TCT CTC AAA ACA AGC ATC ATT AAG CAT CTT ACT AAA TAG AAT CAT AAT AGA ATT ACC TGT ATA TTA AAC TAA AAT TAA TAA AAA AAT ATT ACT CCA GAT TGC TAT AAA TGC AAG AAA AGA AAT GTT TTC GAT TTA ACA ATA TGT AAA GTT AAT AAT GAA TAG TAT TTA CTA TGC TCT TAA TGT TTA AAT AAA AGC AAC GGC AGT TTA TTT ACT AAT GAT CCA AAT ATA GCT ATG AAA TTG GTC AGC ACT TTT CCA AAT GAA CCA CTT ATT ACT AAT TAT TCA ATT AAT TCT ACT TTC CTT GAT CAA TTA ACG AAG AGC GAT TAA CCT AAA TAA ATT TAA TCA GAT TAA ACC TAA TTA AAT TAG TAA TCT ATC CCA CAA AAT ATT TAA ATA GGC TTA AAT AAT AAT AAT AAT TAA CTT TTA GTC AGT AAT AAC AGT AAT AAC GAA GAT ACA TAA GTA AAG TGC CTT TAG TGT AAT AAT ATA TTT TAA AAC TAA AGA AAC AAG CAT GAC AGT GTA ACT CAA ATA GTC AAA CAT TTA AAA AAG TGT TCC CAC AAT AAA ATA GAA ATA TAA GAA AAG GCA AGA AAA ACT TCT TTT TCT ACA TTT AAA TGC CTA TCA TGC AAT TAA AAC AAC ATT TTT GTT CTA TTT ATT GTA GAA ATT GAA TCA TTT TAC TTT GTT TTA TGT AAC TAA TGT ATA AAT AGT AAG ATG ATT CAA TTT TAA GGT AAA GAC TCA CAA TCA ATT GAA AAA TGT AAG AAG TCT GCT ATT GTG TAA AAT GGA TCA ATA AAT ACT TTA TTG ATG AAC CTG ACC ATC AAA AAA AAA GAA TAC TAT CCA GTA AAC AAT GAG CAC AAA AAT TAA CCT GAC TAA AAC TAA ATA GGT ATT ATA TAT TAA AAT AAA ATA AAT TAT TAA AAA ATA TTT TTT ATC AAC TAG AAT AAG ATA ATA ATG ATG ATG ATT ATG ATT TTT GCC TAA ATG GAG GTA ATG ACA ATC AAG TTT AAG TAG GTA TGT TGA ATG ACC CTA AAA CCT AAA ATA TCA ATA ATT AAG ATA GAA ATT TTG ACT AGT CTC GCA ATC TCC AAT CAA TCC AAG TTA ATT CTA GAG AGG AAA AAA AAA TTG AAA TAT TTA AAA ATG TTG AAG CTT ATT AAC ATT TTT TTA AAA AGA TCT TAA ATT AAG AAT AAT ATG AAA TAT CTA AGT AGA TAT AAT AAA GTG TTT TAA CAA CTA AAG CAC TTA TCT TAT CAG AAA ATC AGT AAA ATA AAT TCA AAG ATT AAT AAT ATT TTA TTG TTA TTT CTA TTA AAA TTT AGG TTG TAA ATA TAA GTT TCC TCC AAC CAT CTA TTA AAA TAG GGT AAA GAA TTA AAA ATT AAA TGG GGT AAT TTT AAA TCC AAA TTT TAT GTA GAG AGT ATT GAT GAT CAT AAA ATC GTT ATT AAA ATT TAA GAT TCT AAT AAA TCT TTA AGT CGT TTC AAA GTA GGA AAT GTA GTA GAA AAT GTT TAA ATA AAA TTA ATC AAT CCT AAA TAG ATT TTT GAA AGA ATA CTG TAG GGA ATT AAC AAA TTT TCA AGT CTA GAA GAA TCT TTG TAA AAA AAA ATA CTT GGT TAA TTT GAA AAG GAT GAT AAA TCT ATT AAA AGT GAT GAT TCA TTA GAA ATA ATT GAC GAA TAA GCT CAA TAA GAT ATA GCT TAG CTA AAT TAA AGT TAG CTG TAA GCA ATT TAG TCA TCT CTC TCA AAA AAT ATT TCG CTG ATT TAA GGT CCT CCA GGA ACA GGA AAA ACT GAA ACA GCA GCT CAG CTA GTT TTA GAA ATA TGG TAT AAA ATT AAC AAA AAT TAA CAA AAC GAA AAG ATT TTA GTT TGT GCT CCA TCA AAC TTA GCT GCA GAT AAC ATT TCA GAT AGG ATT CAT GCA TAA AAT AGA GAA ATA AAA GTA ATA AGA ATA GTT TCT TAA GCT AGG TAA AGA GTA AAA GTT TCA TAT TAA TTT CAA GAT ATA GTT CTG CAT AAA GTA CTA AAG AAA GAA GGT TTC TTT AAT AAA AAT AGT GTA TTG AAA AGA GCA AAA TAA TTA ATT GAA AAT GCT GAC GTC ATT TGT ACT ACT TGC ATT AAT TCT GTA GAT AAG TTT ATA AAA GGT ATT AGT TTT TCA ACA GTA GTA ATA GAT GAA GCA AAC TAG GCA ATA GAA CCA GAA ACA ATA ATA CCT CTT TAG CAT TAA GCT AAA AAA TTA ATT TTG ATA GGT GAT CAT AAA TAA TTG CCA CCC ATC ATC TTA AGC ATT TAA GCT TCA AAA GAT GGG TTA AAA AGA AGT TTA TTT TCA AGA CTT GTT TAA GCT GGT CTT ATC CCT TAA TTT TTA TCA ATT CAG TAT AGG ATG CAT CCA GAA ATA AGA AAG TTA GCA TCT TCT ATA TTC TAT CAA AAC TAG CTT AAA GAT GGA GTT AAT GAA TAA GAT AGA ACT CCT ACT CCG AAG TTC AAT TGG CTA AAT AAT AAA ATT CCT ATC TAA TTT TAT GAT GTC TAA GGT TAA GAA ATT ACT TTG TAA GAT GGT AAA AGT TTT ATA AAC GAA GAA GAA GCA AAG CTT GTA AAA AGT TTA GTT TCT TAG CTT ATA TAA GCA GGT GTT AAA GAT AAT GAT ATT GGG ATA ATA ACG CCT TAT TTA TCT TAA TCT AAT TAT ATA AGT TAA TTA ATA AAA AAT AGC AAT ATT TTA ATT GAT ACA ACA TAC AGT TTC TAA GGA CAA GAA AGA GAC TAC ATA ATA ATT TCA TGT GTA AGG ATC AAT AAT TTT TAA AAC TTA GGA ATT TTA AGG ACA CCA TAG CTG ATT AAC GTA TCT ATA ACA AGA GCT AAG AGA GGT TTA CTA ATA GTT GGA AAC AAG AAA CAT GTG AGT TAT TCA AGA TGG TGG AAA CAA ATC ATT GAT TAT TTG GAT AAA TTA AAA CTT ATT TAA GAA ATT AAA AAA GAG CCT ATC GAA AAT ATT TAT TCT ATT GAG AAC AAT AAA ATC ATA AAT AAA ATT GAT GAA AGG CTA TGC TTC CAT AAA AAA AGT TGA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
