Gene Model Identifier
TTHERM_00726300
Standard Name
UPF1
Aliases
PreTt21895 | 117.m00147
Description
An RNA helicase essential for nonsense-mediated mRNA decay (NMD)
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Cellular Component Molecular Function Biological Process nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay (IEA ) | GO:0000184
( PF00004 ) ATPase, AAA family
( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
( TIGR00376 ) DNA helicase, putative
( TIGR01563 ) phage head-tail adaptor, putative
( TIGR01447 ) exodeoxyribonuclease V, alpha subunit
( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00726300
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_17483 0
WormBase WBGene00004880 9.997093137033517e-262 locus:smg-2 Regulator of non
Tetrahymena borealis EI9_04617.1 9.997093137033517e-262 phage head-tail adaptor, famil
DictyBase DDB_G0288923 9.997093137033517e-262 upf1 on chromosome: 5 position
Oxytricha Contig17825.0.g106 9.997093137033517e-262 RNA helicase (UPF2 interacting
SGD YMR080C 9.997093137033517e-262 NAM7 ATP-dependent RNA helicas
No Data fetched for General Information
Ref:22184018 : Lu XY, Xiong J, Yuan DX, Miao W (2011) [Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila]. Dong wu xue yan jiu = Zoological research 32(6):605-10
>TTHERM_00726300(coding)ATG AGT TAG AAT AAG TAA AAG AGA AAA GTT GAT TCA AGT AGT GAA GGT GAA GAG AGT GAA GAT GAT TCT ACA GAA TAA AAT TAA GAT AAT GAA TCC ACA TAA TAA GGA GGA GAA AAT GAA GAT GAA GTA TTT GAT ATT GAT TTT AAA AAT TTA CCC TCA CAC GCA TGC GAA TAT TGT GGT GTC CAT AAT AAG AAT AGT GTT ATA AAG TGT CTA AAT AAA GAT TGC AAC AAA TGG TTT TGC AAT GGT AAA CAA TAA GGT TAG GGA GCA TCT CAT ATT ATT ATG CAT TTA GTT AAA TCT AAA CAC AAA GAA ATT TAG GTA CAC CCT GAG AAC TAA AAC TCA GAT ACT ACT ATT GAA TGT TAC ATT TGT GAG AAT AAA AAT ATA TAC TTA TTA GGT TTA GTT CAC TTA AAA AAT TAA GAA GAT CAA GGT TTG ATT ATT TGT AGA CAA CCT TGC TTG AAT CTA AAA AAG TAT AAT GAG ATG TAA TGG GAA ATT GAA AAA TGG AAT CCT TTA ATT GAT GAA AAG ATG ATT GTT TCT TGG TTA GCT TCA CCA CCA AGC GCC AAG CAA ATG GAA AAA GGG TTT AAA GTT TCT TAG AAG CAA ATT TAC GAG TAC GAG GAG TAA ATT AAA ACT AAC CCC AAT TTT AAA TTA GCA TAA GGT GCT GCT TAA AGT TAA GTC AAG AAA CTA AAA CCA GTG TTA TTG CGT TAT AAA ACT GGT AAA TAG TAT TTC TAA ACA TTC TAC AAC TTA ATT GAA GCT GAG GCT AAC TAT GAC AAA GCT TTA AAG GAA AAT CTT CAT TAC AAC AGC ATT ACT GTT AAG TGG GAT ATT TCT TTA AAG AGT AGA AAA GTG GCT CAA TTT GTA TTG CCT TAG GGA GAA GAT AAT GAA TTC AAC CTT TTG AGT GGT TCT GAA TTA AAG ATC ACC TAC AAA AAG AAT AAG AAA GAT GAA GAA TGG TCT GCC AAG GGT ACT ATA ACT AAA GTC GGA AAT AAT GAT GAA GTC TTT GTT GAA CTA AGT CAT AAT GTA AAA GAT ACC CCA CCA TCA GGA AAG GGA TAC ACA ATA GAA TTT GTA TGG AAA CAT ACT GCT GTT AAG CGT ATT AAA AAA GGT ATT AAG AAA TTC TGG TAA GAT GAA AAA TGC ATT AGC TCG TTC TTA TAC TTT TAA ATT CTT GGT CAT TAG AAC GAA GAA CAG TAA ACA CCT ACT TTG GAT ATA CAA CTT CCT AAG CAT TAT TCT TTA CCC AAA ATG CCT GAG CTC AAC TAT TAT TAA GTT GAA GCA GTT AAA AAG GCT CTT CAA TAA CCT CTT TGC TTG ATT TAA GGT CCT CCA GGT ACT GGT AAA ACT TTT ACA AGT ACA GCA ATC ATT TAC CAT CTA GTA AAG AAC ATT TAA AAG AGC GGA TAG AGA GGC CAG GTT TTA GTC TGT GCT CCT TCT AAC ATC GTT GTA GAT TAA CTA GCA GAA AGA ATA CAC TAG GCT GGT ATC AAG GTA GTT AGA ATG TGC TCT CGT TCT AGA GAA ATG ATT TCA TCA TCA GTA GAA TTC TTA ACT TTG CAC AAT CAA GTA AGA AGT TTA GAT TTC GAT GAA TAC AAA GAA ATG TAA AAG TTA CTC GAG CTT AAA GAA GAT TAA GGT GAG TTA GAC CAT GAT GAT GAA GAC AAA TAT TAT AGT TTA AAA AGA TAA GGT GAA AAG GAA ATT TTG AGA AAT GCG GAA GTT ATT TGT TCG ACT TGT ATA TCA TCA GCA GAC CCA AGA TTG AAG GAT ATT AGA TTC AAG CAT GTT CTA ATT GAT GAA GCT ACA TAA GCT ATT GAA CCA GAA TGT TTG TTA CCT ATG TTG AAA GGA GCT AAG CAT GTC ATT TTA GTA GGA GAT CAT AGA TAA TTG GGT CCT GTT GTT ACT TGC AGA GAT ACT GCA AAG GCT GGT TTG AAT AAA AGT CTT TTT GAA AGA ATG GTT AGT ATG GGT ATT AGA CCA ATT AGA TTG TAA GTT TAG TAC AGA ATG CAT CCT GAT CTC TCT ATT TTC CCT TCA AAT ACT TTC TAT GAA GGA ACT TTG TAA AAT GGT GTA ACT TTC AAC GAT AGA CAA TTC CAT GGT GAA TTC CCG TGG CCT AAT AAA AAT AAA CCT TTG ATG TTT TTA AAT TCC TGT GGT GTT GAA GAA ATA TCT TCA AGT GGT ACC AGT TAC TTA AAT AGA TAA GAA ACT GCC TTA ATT GAA GAT ATT GTA TTC AGA TTA ATA AAA GCT AAG GTA AAA CCT GAA TAA ATA GGT ATC ATC ACT CCT TAT AAA GGT TAA AGA TTC TAT ATT GGC GAT TAC TTA AGT AAG AAC GGA CGT TTG AAC CAT GTC TTA TAT AGA TAA ATA GAA ATT GCC TCT GTT GAT GGA TTT TAA GGA AGA GAA AAA GAT TAT ATA ATT ATT TCT TGT GTA AGA AGC AAT GAG TGC TAA GGT ATT GGT TTT TTA ACA GAC CCA CGT CGT CTT AAC GTA GCT ATT ACA AGA GCT AGA TAC GGA CTT ATT ATT GTC GGT AAT GCT AAG GTA CTT GCA AGA GAT AAT CTT TGG AAC AAT CTT CTC AAT CAT ATG AAA GAA AAC AAG GTT TTG GTT GAT GGA ACA CTA AAT GAT CTA AGA CAA TGC ACA TTA AAG TTC AGA TAA CCT CAA AAA TAT GTA CCT GAA AGA TCA GAA TTT TAA GAT AAC AAT AAT GAC AAT GAT GAT GCC AGG TCA ACA GTT AGT TAC AAA ATA GAT AAC ATA AAC AAC TTT GAT CTT GAG TTG CCT ATT GGA TTT GGA TTT AGA AAC AGT GAG TTT GGA TTT AAC AAA ATG CCC TAA ACA GAA TAG TTC AGA AAG ATT CAA AAA GAT TAA ACT CTC AAT ATG GTA AAG AAT TAT GGA ACT TAG CTT TAC AAT AAC TAG AAT AAT TAA GAG ATT TTC TTC TTT GGT TAG GAC AGA GAA TAA AAC TAT TAT GAT ATT CCA AGC TAA CAA AAA AAT AAT GTT CAG CCT AAT TAG TTT AGA AAC AAT GGA GGC TTT ACT AAT TTG AAT CCA AAT TCT AAT AAT TAG AAT GAT TTC AAT GGA AGA AAT AGA GAT GAC TAC AAT AAT TAA GAT GAA TAA GCT GAA GAT CAA GAA GAT GAT AAC TAT ACA AAT GGT GGT GAT GAA ATT TAC ACA GAA AAG CAA AAC GAT TAC AAC AAT CCA ATA ATC TAG AAG TCA TAA CCA AAA GAT AAC TCC TAG AAC AGC AAA TCA ACT TCT TTT GGA GGT ATC GGT ACA TTC AGT ATA GGT GCT TAG AAA TAT AGT TAG TTT GAT TTA GAT TTA CCT GAT GAA TTT AAA TGA >TTHERM_00726300(protein)M S Q N K Q K R K V D S S S E G E E S E D D S T E Q N Q D N E S T Q Q G G E N E D E V F D I D F K N L P S H A C E Y C G V H N K N S V I K C L N K D C N K W F C N G K Q Q G Q G A S H I I M H L V K S K H K E I Q V H P E N Q N S D T T I E C Y I C E N K N I Y L L G L V H L K N Q E D Q G L I I C R Q P C L N L K K Y N E M Q W E I E K W N P L I D E K M I V S W L A S P P S A K Q M E K G F K V S Q K Q I Y E Y E E Q I K T N P N F K L A Q G A A Q S Q V K K L K P V L L R Y K T G K Q Y F Q T F Y N L I E A E A N Y D K A L K E N L H Y N S I T V K W D I S L K S R K V A Q F V L P Q G E D N E F N L L S G S E L K I T Y K K N K K D E E W S A K G T I T K V G N N D E V F V E L S H N V K D T P P S G K G Y T I E F V W K H T A V K R I K K G I K K F W Q D E K C I S S F L Y F Q I L G H Q N E E Q Q T P T L D I Q L P K H Y S L P K M P E L N Y Y Q V E A V K K A L Q Q P L C L I Q G P P G T G K T F T S T A I I Y H L V K N I Q K S G Q R G Q V L V C A P S N I V V D Q L A E R I H Q A G I K V V R M C S R S R E M I S S S V E F L T L H N Q V R S L D F D E Y K E M Q K L L E L K E D Q G E L D H D D E D K Y Y S L K R Q G E K E I L R N A E V I C S T C I S S A D P R L K D I R F K H V L I D E A T Q A I E P E C L L P M L K G A K H V I L V G D H R Q L G P V V T C R D T A K A G L N K S L F E R M V S M G I R P I R L Q V Q Y R M H P D L S I F P S N T F Y E G T L Q N G V T F N D R Q F H G E F P W P N K N K P L M F L N S C G V E E I S S S G T S Y L N R Q E T A L I E D I V F R L I K A K V K P E Q I G I I T P Y K G Q R F Y I G D Y L S K N G R L N H V L Y R Q I E I A S V D G F Q G R E K D Y I I I S C V R S N E C Q G I G F L T D P R R L N V A I T R A R Y G L I I V G N A K V L A R D N L W N N L L N H M K E N K V L V D G T L N D L R Q C T L K F R Q P Q K Y V P E R S E F Q D N N N D N D D A R S T V S Y K I D N I N N F D L E L P I G F G F R N S E F G F N K M P Q T E Q F R K I Q K D Q T L N M V K N Y G T Q L Y N N Q N N Q E I F F F G Q D R E Q N Y Y D I P S Q Q K N N V Q P N Q F R N N G G F T N L N P N S N N Q N D F N G R N R D D Y N N Q D E Q A E D Q E D D N Y T N G G D E I Y T E K Q N D Y N N P I I Q K S Q P K D N S Q N S K S T S F G G I G T F S I G A Q K Y S Q F D L D L P D E F K >TTHERM_00726300(gene)ATG AGT TAG AAT AAG TAA AAG AGA AAA GTT GAT TCA AGT AGT GAA GGT GAA GAG AGT GAA GAT GAT TCT ACA GAA TAA AAT TAA GAT AAT GAA TCC ACA TAA TAA GGA GGA GTA TAT ATT TAT GCT TAA TTT CAT TTA TTA TTA CTT CGA ATT AAA TAT CGA AGA ATA TTT TTA AAT CTA ACT TTT AAA AAA AGG AAA ATG AAG ATG AAG TAT TTG ATA TTG ATT TTA AAA ATT TAC CCT CAC ACG CAT GCG AGT ATG TTA ATG AAA TAA AAT ATT GGT TTT TGA TTA AAT TAA ATA ATA TAA AAT TAA AGA TAT TGT GGT GTC CAT AAT AAG AAT AGT GTT ATA AAG TGT CTA AAT AAA GAT TGC AAC AAA GTA AAT ATT AAA TTT TAG CCT TAT AGA TTG TTT TAA ATA TTT TTT ATA AAA ATA AAT CAT TAG TGG TTT TGC AAT GGT AAA CAA TAA GGT TAG GGA GCA TCT CAT ATT ATT ATG CAT TTA GTT AAA TCT AAA CAC AAA GTA TGT TTG TTG ATT ATT AAA TAG CAA ATA TCA ATT TAT CTT TAG ATT TAA AAA TGT TTT AGA GCA AAA GAT AAA ATT GGC TAA AAA AGT AGA ATA TTA ATT TTC ATT TAT CTA AAA TTA GGA AAT TTA GGT ACA CCC TGA GAA CTA AAA CTC AGA TAC TAC TAT TGA ATG TTA CAT TTG TGA GAA TAA AAA TAT ATA CTT ATT AGG TTT AGT TCA CTT AAA AAA TTA AGA AGA TCA AGT AAT AAT TTA GCT TTG TTA GTT TTA TTT TAA AAT TTT CGA AAA ATA AAC AAC TTT AAT TGT TTT CCA AAA TGA ATG TTA AAA TAG GGT TTG ATT ATT TGT AGA CAA CCT TGC TTG AAT CTA AAA AAG TAT AAT GAG ATG TAA TGG GAA ATT GAA AAA TGG AAT CCT TTA ATT GAT GAA AAG ATG ATT GTT TCT TGG TTA GCT TCA CCA CCA AGC GCC AAG CAA ATG GAA AAA GGG TTT AAA GTT TCT TAG AAG CAA ATT TAC GAG TAC GAG GAG TAA ATT AAA ACT AAC CCC AAT TTT AAA GTA AAT CTA TTG AAA AAA ATC TTC AAA ATT TAA TTT ATT GCT TTT TAA ATC TTC AAA TTT AGT TAG CAT AAG GTG CTG CTT AAA GTT AAG TCA AGA AAC TAA AAC CAG TGT TAT TGC GTT ATA AAA CTG GTA AAT AGT ATT TCT AAA CAT TCT ACA ACT TAA TTG AAG CTG AGG CTA ACT ATG ACA AAG CTT TAA AGG AAA ATC TTC ATT ACA ACA GCA TTA CTG TTA AGT AAA TCT TTG TTA TTT TTT TAA ATT ATA TTG AAT CTC ATT TCG TGT GCG TTT AAT AGG TGG GAT ATT TCT TTA AAG AGT AGA AAA GTG GCT CAA TTT GTA TTG CCT TAG GGA GAA GAT AAT GAA TTC AAC CTT TTG AGT GGT TCT GAA TTA AAG ATC ACC TAC AAA AAG AAT AAG AAA GAT GAA GAA TGG TCT GCC AAG GGT ACT ATA ACT AAA GTC GGA AAT AAT GAT GAA GTC TTT GTT GAA CTA AGT CAT AAT GTA AAA GAT ACC CCA CCA TCA GGA AAG GGA TAC ACA ATA GAA TTT GTA TGG AAA CAT ACT GCT GTT AAG CGT ATT AAA AAA GGT ATT AAG AAA TTC TGG TAA GAT GAA AAA TGC ATT AGC TCG TTC TTA TAC TTT TAA ATT CTT GGT CAT TAG AAC GAA GAA CAG TAA ACA CCT ACT TTG GAT ATA CAA CTT CCT AAG CAT TAT TCT TTA CCC AAA ATG CCT GAG CTC AAC TAT TAT TAA GTT GAA GCA GTT AAA AAG TAA ATG CTT TAT TTG ATG ATT CTA GTT TCT ATT GAT ATT TTT TAA TAA AAG GGC TCT TCA ATA ACC TCT TTG CTT GAT TTA AGG TCC TCC AGG TAC TGG TAA AAC TTT TAC AAG TAC AGC AAT CAT TTA CCA TCT AGT AAA GAA CAT TTA AAA GAG CGG ATA GAG AGG CCA GGT TTT AGT CTG TGC TCC TTC TAA CAT CGT TGT AGA TTA ACT AGC AGA AAG AAT ACA CTA GGC TGG TAT CAA GGT AGT TAG AAT GTG CTC TCG TTC TAG AGA AAT GAT TTC ATC ATC AGT AGA ATT CTT AAC TTT GCA CAA TCA AGT AAA ATA TTA TTT ATC GCG AAT ATA GCT ATT TGA TTT AAA GAG CTA TTT TAG AAT ATT TAA CTA ATA AAC TAA ACA TTA ATA GGT AAG AAG TTT AGA TTT CGA TGA ATA CAA AGA AAT GTA AAA GTT ACT CGA GCT TAA AGA AGA TTA AGG TGA GTT AGA CCA TGA TGA TGA AGA CAA ATA TTA TAG TTT AAA AAG ATA AGG TGA AAA GGA AAT TTT GGT AAA TAT TTT ATT ATT TCT AAA GAG AAA CTA AAA AAC TTT TAA AAT AAA GAG AAA TGC GGA AGT TAT TTG TTC GAC TTG TAT ATC ATC AGC AGA CCC AAG ATT GAA GGA TAT TAG ATT CAA GCA TGT TCT AAT TGA TGA AGC TAC ATA AGC TAT TGA ACC AGA ATG TTT GTT ACC TAT GTT GAA AGG AGC TAA GCA TGT AGA TTT AAA AAT ACT TTA TTC ATC CAT CTT ATT AAT TAA TTA TGT AAT TAG GTC ATT TTA GTA GGA GAT CAT AGA TAA TTG GGT CCT GTT GTT ACT TGC AGA GAT ACT GCA AAG GCT GGT TTG AAT AAA AGT CTT TTT GAA AGA ATG GTT AGT ATG GGT ATT AGA CCA ATT AGA TTG TAA GTT TAG TAC AGA ATG CAT CCT GAT CTC TCT ATT TTC CCT TCA AAT ACT TTC TAT GAA GGA ACT TTG TAA AAT GGT GTA ACT TTC AAC GAT AGA CAA TTC CAT GGT GAA TTC CCG TGG CCT AAT AAA AGT ATA TAA TAA TAA TTT AAA AGA AAT AAA AGT AAT AAA TAA GCT TTT TTT AAA AAA AGA TAA ACC TTT GAT GTT TTT AAA TTC CTG TGG TGT TGA AGA AAT ATC TTC AAG TGG TAC CAG TTA CTT AAA TAG ATA AGA AAC TGC CTT AAT TGA AGA TAT TGT ATT CAG ATT AAT AAA AGC TAA GGT AAA ACC TGA ATA AAT AGG TAT CAT CAC TCC TTA TAA AGG TTA AAG ATT CTA TAT TGG CGA TTA CTT AAG TAA GAA CGG ACG TTT GAA CCA TGT CTT ATA TAG ATA AAT AGA AGT AAA ATC TTA AAA TTT TTA ATT CTA TAT TAA AAA AAT CCT CAA TTT AAA TTA TTA AAG ATT GCC TCT GTT GAT GGA TTT TAA GGA AGA GAA AAA GAT TAT ATA ATT ATT TCT TGT GTA AGA AGC AAT GAG TGC TAA GGT ATT GGT TTT TTA ACA GAC CCA CGT CGT CTT AAC GTA GCT ATT ACA AGA GCT AGG TAA AAA TTA TTT AAA TTA AAA AAA TCA TTA ATT TTT ATT TCT AAA TAA AAG ATA CGG ACT TAT TAT TGT CGG TAA TGC TAA GGT ACT TGC AAG AGA TAA TCT TTG GAA CAA TCT TCT CAA TCA TAT GAA AGA AAA CAA GGT TTT GGT TGA TGG AAC ACT AAA TGA TCT AAG ACA ATG CAC ATT AAA GTT CAG ATA ACC TCA AAA ATA TGT ACC TGA AAG ATC AGA ATT TTA AGA TAA CAA TAA TGA CAA TGA TGA TGC CAG GTC AAC AGT TAG TTA CAA AAT AGG TAA TTT CAC AAC AAC AAA AAA CAA AAA AGG TTA ATT AAT ATA ATA AAA TAT AAA AAG ATA ACA TAA ACA ACT TTG ATC TTG AGT TGC CTA TTG GAT TTG GAT TTA GAA ACA GTG AGT TTG GAT TTA ACA AAA TGC CCT AAA CAG AAT AGT TCA GAA AGA TTC AAA AAG GTA AAT TTA AAT TTA AAA AGA AAT AAA ATC AAA ATA AAA TAT AAA AAT GAT AAA TAA TTA AAT TAT AAA ACA CTC TAG ATT AAA CTC TCA ATA TGG TAA AGA ATT ATG GAA CTT AGC TTT ACA ATA ACT AGA ATA ATT AAG AGA TTT TCT TCT TTG GTT AGG ACA GAG AAT AAA ACT ATT ATG ATA TTC CAA GCT AAC AAA AAA ATA ATG TTC AGC CTA ATT AGT TTA GAA ACA ATG GAG GCT TTA CTA ATT TGA ATC CAA ATT CTA ATA ATT AGA ATG ATT TCA ATG GAA GAA ATA GAG ATG ACT ACA ATA ATT AAG ATG AAT AAG CTG AAG ATC AAG AAG ATG ATA ACT ATA CAA ATG GTG GTG ATG AAA TTT ACA CAG AAA AGC AAA ACG ATT ACA ACA ATC CAA TAA TCT AGA AGT CAT AAC CAA AAG ATA ACT CCT AGA ACA GCA AAT CAA CTT CTT TTG GAG GTA TCG GTA CAT TCA GTA TAG GTG CTT AGA AAT ATA GTT AGT TTG ATT TAG ATT TAC CTG ATG AAT TTA AAT GA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
