Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00674500
Standard Name
UDH8 (UvrD/REP-family DNA helicase 8)
Aliases
PreTt10990 | 101.m00145 | REP14
Description
UDH8 UvrD/REP helicase family protein; UvrD/REP-family DNA helicase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.8%
TetraMine Data
TTHERM_00674500
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_19668.1 2.998990600740728e-62 UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD YOL095C 0.0000009995106777214876 HMI1 Mitochondrial inner membr
ane localized ATP-dependent DN
A helicase, required for the m
aintenance of the mitochondria
l genome; not required for mit
ochondrial transcription; has
homology to E. coli helicase u
vrD
Oxytricha Contig981.0.0.g23 0.000030009396760408108 UvrD/REP helicase N-terminal d
omain
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:23884606 : Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79
Sequences
>TTHERM_00674500(coding)ATG TAG TAA CTC AAG AGT GAT TTA GAT CGT TTT ACT GAC GAT TAA AAG AAG TTT ATT TTA TCT CCA AAA AAT GTA GAT ATC AAA GTC AAT GCT TGC GCT GGA TCT GGA AAA ACT GAA TGC ATT CTT TAA TTT GTA AAA TAG GCT AGA TTG AGT GGA ATT AAT TAT AAG CAA ATT TGC ATT ACT ACG TTT AAC ATC TAA GCA ATA AAT GAT ATA CAT AAA AGA GCA GTC GAT TTA TTT GGT GAA GAA TTA GCT GAT GAG ATA GAA ATT AAA AAC TTT GAT AAA TTA ATA ACT AAA TCT TAT GAA TCA ATC AAA ACT TTA TAA AAT CCT TAA CAA AAA GAT ATT TTT ACA GAA GAG GTA GAT ATT ACC TTA GTT GAA AAA TAA TTT GAG CTA GTG AAC ATG GAT TAC TAA AAT TTA GGT AAG GAT GAT AAA ATG TAA ATC TTT GGC GCA TAT AAA ATA ATT ATT TTT GAT GAA TTT TAA GAT ATT AAT GAA CTT TAA TAC AGC TTT TTA TTG CTA TTC AAA AAA TAT GGA GGA TCA AAC ATC GTT GTA GTT GGA GAT GCA TCG CGA TTA TTC AAA AAT ATA AGC AAA GAA TCA TAT TCT AAG GAT GAA AAT GTT ATA ATA GAA GAA GAT GAT GAC AAA TTC TAT GAA GAG AAA TAA AAT AAT AAA AAA TTT TCA TAT AGA ATT AGT GAT TTT TTT GAT AAT TTA AGC AAT ATT TAG TAT ATC AAT CAT CTA AAA TAA TCC TAA TAA TAT CTT AAA GAT ATT TAT GTC AGC GAA ATA GAA ATA TTC AAT AAA TAG CAT ACT CTT AGC GAA TAA TAG ATA CAA TTG ATA TTT TCA GAA TAG TAA CAA AAC TTG CTA TTC AAT TAC ATA TAA ATA ATT CTT TTA GAA AAA AGT AAG AAA TAA GTT TAG CTC ACT AAA GAA GCT TAC TAT TTA TAG AAA ATA AAA TAG AAA ATA TAA AAT TTA TAA GAA CAT AAT TAC CTA TAA AAT ATG CTT AAA TTA TTC AAA GAC AAT AAT TAA TCT TTA GAG AGA AAT CAA AAA GAG CTT TAT GAA GCT ATT TAT AAA GCA TGT ATC TTT TTA GAA GTA AAA AAA TCA AAT TAG TTT AAA TAT ATT TTC TAC CAA GAT CCC TAT AAA GAA TAA GAA AAA ATC ATA AAC TGC TTA AAG AAA ATG TTG GAT ACT TGT TTT AAA AAG TAA GAT TAT TAA GAT CTC CTT ATT TAA GAT TAT ATT GAA AAA GAT AAA TTT TAT GAT TAT GAA ACC TTC TCA AGT AAA GAC ACA ATC TAT GAA ATC ATA TAA TCT TTT GAA AAA CAA ACA GTT GGA AAA TAA GTT ATG CTA ACA GTT TTA GGG AAA ATA TCT ATC CTT AAA GTA AAA TAT TAG AGA GAT ATT AAA AAT ATA TTA TTC TAC AAT CCG ATA TAA GGA ACG TCT GTC AAA TAC TCT CTA TCT AAT TGG AAT TTT CAT GAT CAA TTT ATT TCA TAT ATG GAA GAT ATT ATA AAA TAA GAA AGT GAT TAA AAT AAC TTG AAT TAA TGT TCA AGT TAA TCC TTT TAA AAT GTA TCA AAT ATT TAG AAA AAA AAA GAT GAA TAG AAT TCT AGT ATC AAT ATA AAA TTA AAT TAA ATT CAG CAG GAA ATA AGT TCG TCT AAA TTT AAA GAT TAG GTT TAA AAT AAA AAC AAT TTA ATC ATA GAC TTA GAA TAA TCA CCA ACC GTT TTA GAT TAT AAC TAA AAA AAG GGG AAA TTA ATA CAT GCT GCT CCA TTT TAA TAA GAA CCT GGT CTT TCT AAA AGG CTT CAT TTT GAA CAG GAT GAA TCT TTC GGT TTA AGA AAC TGA >TTHERM_00674500(protein)M Q Q L K S D L D R F T D D Q K K F I L S P K N V D I K V N A C A G S G K T E C I L Q F V K Q A R L S G I N Y K Q I C I T T F N I Q A I N D I H K R A V D L F G E E L A D E I E I K N F D K L I T K S Y E S I K T L Q N P Q Q K D I F T E E V D I T L V E K Q F E L V N M D Y Q N L G K D D K M Q I F G A Y K I I I F D E F Q D I N E L Q Y S F L L L F K K Y G G S N I V V V G D A S R L F K N I S K E S Y S K D E N V I I E E D D D K F Y E E K Q N N K K F S Y R I S D F F D N L S N I Q Y I N H L K Q S Q Q Y L K D I Y V S E I E I F N K Q H T L S E Q Q I Q L I F S E Q Q Q N L L F N Y I Q I I L L E K S K K Q V Q L T K E A Y Y L Q K I K Q K I Q N L Q E H N Y L Q N M L K L F K D N N Q S L E R N Q K E L Y E A I Y K A C I F L E V K K S N Q F K Y I F Y Q D P Y K E Q E K I I N C L K K M L D T C F K K Q D Y Q D L L I Q D Y I E K D K F Y D Y E T F S S K D T I Y E I I Q S F E K Q T V G K Q V M L T V L G K I S I L K V K Y Q R D I K N I L F Y N P I Q G T S V K Y S L S N W N F H D Q F I S Y M E D I I K Q E S D Q N N L N Q C S S Q S F Q N V S N I Q K K K D E Q N S S I N I K L N Q I Q Q E I S S S K F K D Q V Q N K N N L I I D L E Q S P T V L D Y N Q K K G K L I H A A P F Q Q E P G L S K R L H F E Q D E S F G L R N >TTHERM_00674500(gene)ATG TAG TAA CTC AAG AGT GAT TTA GAT CGT TTT ACT GAC GAT TAA AAG AAG TTT ATT TTA TCT CCA AAA AAT GTA GAT ATC AAA GTC AAT GCT TGC GCT GGA TCT GGA AAA ACT GAA TGC ATT CTT TAA TTT GTA AAA TAG GCT AGA TTG AGT GGA ATT AAT TAT AAG CAA ATT TGC ATT ACT ACG TTT AAC ATC TAA GCA ATA AAT GAT ATA CAT AAA AGA GCA GTC GAT TTA TTT GGT GAA GAA TTA GCT GAT GAG ATA GAA ATT AAA AAC TTT GAT AAA TTA ATA ACT AAA TCT TAT GAA TCA ATC AAA ACT TTA TAA AAT CCT TAA CAA AAA GAT ATT TTT ACA GAA GAG GTA GAT ATT ACC TTA GTT GAA AAA TAA TTT GAG CTA GTG AAC ATG GAT TAC TAA AAT TTA GGT AAG GAT GAT AAA ATG TAA ATC TTT GGC GCA TAT AAA ATA ATT ATT TTT GAT GAA TTT TAA GAT ATT AAT GAA CTT TAA TAC AGC TTT TTA TTG CTA TTC AAA AAA TAT GGA GGA TCA AAC ATC GTT GTA GTT GGT AAT TAA TAA ATT TAT TTA TTA ACT CAT TTG AAA TTT ATT CTT AAT TAT TTA ATT TAT TAA TTA GGA GAT GTA TTT TAA AAT ATT TAT CAA TTT AGA GGA TCA GAT TAA AAA TAT TTG AGT AAT CAA ATT AAT CAA GAC ATT CAA AGT ATA AAC TAA AAT TTG AAA AAG AGG GAT TAA AAA ATT ATA GAT CTT AGT TTA TCT ATA AAC TTT AGA TGT TCC TAG GAA ATA ACT TTT TTT GCA AAT GAA ATA ATT AAA TGC TAA AAT GAG AAT TCA AAT TTA ATG AAA TCC TTT TAA GGT AAA TTT ATT TTT TCT TTC TTT TTC GCA ACA AAT TTT AGA AAT CTC ATC ATA TTT TTA GAG TTG AAT AAT TCA AAC AAT GAA ATT AAG AAG AAG TAG ATT CCT TTT TTA GAA GGT TTT ATG AGT AAT AAA GAT TAA TTT AAA AGT ATT GTC AAA TCA ATA AAT ACT TAC ATT GAA GAA GGA TAT TCA TAT GAC GAT ATA GCT ATA ATT AGT CCA ATT TAA GCA TCT CTT AAG GAA ATA GAG TAC CTT ATT GAA GAA CAA AAT CAT AAA ATA AAA TAA AAC CCA GAC AAA AAT AAA GAT AAA AAG ATA ATA CCT TAT TAC AGT GTA ATA GGA GAT AGT TCT AAT TTT GAT TGT AAG CAT CAA TTT AAA TAA AAA AAT AAA ATT TCG CTG TCA ACT GTC CAT AGA GCA AAA GGA TTA GAA TGG AAA ATA GTA TTC TTT ATT GGA TTG AAT GAT GAT GTA ATT CCT ATG TCA TTT TTA AGA TAA GGT GAC TTG AAA TAG AAA ATG GAA GAA ATG AGG CGT CTA TTT TAT GTT GGA TGC ACA AGA TCT GCA GAA ATA CTG AAA ATG TTC TAT TTT TGT AAT AAT TAA AGA AAA GTA ATT TCT TAT TTC TTT AAA AAA AAA TAT TAT AAC AAC TTA TTA AAA TTT TTA GGC ATC GCG ATT ATT CAA AAA TAT AAG CAA AGA ATC ATA TTC TAA GGA TGA AAA TGT TAT AAT AGA AGA AGA TGA TGA CAA ATT CTA TGA AGA GAA ATA AAA TAA TAA AAA ATT TTC ATA TAG AAT TAG TGA TTT TTT TGA TAA TTT AAG CAA TAT TTA GTA TAT CAA TCA TCT AAA ATA ATC CTA ATA ATA TCT TAA AGA TAT TTA TGT CAG CGA AAT AGA AAT ATT CAA TAA ATA GCA TAC TCT TAG CGA ATA ATA GAT ACA ATT GAT ATT TTC AGA ATA GTA ACA AAA CTT GCT ATT CAA TTA CAT ATA AAT GTA AAT TTT TAT TCT TTC TTT ACT CTA TTT TTA TTT TAT TAT AAT CTA TAC ATT TTT AAC TGA TTT TTA ATC ACA TAC ATT TGA GAT TAA TTG AAA GAT ATT ATT TAT AAA TTC TAT AGA AAT TCA TCC AAA AAT ATT TAA ATT TTT GAA TTT TGC AAT CAA AAA GTT AAT TAA TTT TAA AAA TAC TAA ATT ACT CTA ATT AAG TGC ACC CCA AAA AAA CAC TTC GAA TTT TTA AGA TAT ATT AAA AAA AGT TTT TAA AAA AGG CTA AAA TTA ATT AAA AAT TTA ATA AAA AAA TCA TAT AGA TTG ATA TAA ATT AAA ATT TAA ATA AAT ATT ATT AAT GAA ATT CTA TTA GAA AAT TAT TTA TTT TTT TTG TAA ATA ATT TTC AAG CAC ATT AGC CAT TCA AAA AAA TAG TGA TTT CAA TTC ACT AAA TTT TTG AAT GGC ATT TGG CTA TAC CTT AAA ATA TTA TAA GTT CAT TCT TTG ATT AAT ATT TTA AGT AAA CAC TTA AAA AAT ATA ATA AGA TTT ACT CTC ATA ATT GAA AAT TAT AAA AAT TTA TTT TAT TTA TTT ATC ATA TTA ATG ATT AAA AAT TAA ATA ATA TAA AGC ATG CTT TTT AGA ATT CTT TTA GAA AAA AGT AAG AAA TAA GTT TAG CTC ACT AAA GAA GCT TAC TAT TTA TAG AAA ATA AAA TAG AAA ATA TAA AAT TTA TAA GAA CAT AAT TAC CTA TAA AAT ATG CTT AAA TTA TTC AAA GAC AAT AAT TAA TCT TTA GAG AGA AAT CAA AAA GAG CTT TAT GAA GCT ATT TAT AAA GCA TGT ATC TTT TTA GAA GTA AAA AAA TCA AAT TAG TTT AAA TAT ATT TTC TAC CAA GAT CCC TAT AAA GAA TAA GAA AAA ATC ATA AAC TGC TTA AAG AAA ATG TTG GAT ACT TGT TTT AAA AAG TAA GAT TAT TAA GAT CTC CTT ATT TAA GAT TAT ATT GAA AAA GAT AAA TTT TAT GAT TAT GAA ACC TTC TCA AGT AAA GAC ACA ATC TAT GAA ATC ATA TAA TCT TTT GAA AAA CAA ACA GTT GGA AAA TAA GTT ATG CTA ACA GTA TTT ATT TAT TTA TTC GAT TTT TGT TTG ATT TAC TTA TTA ATT AAT TCA TTC ATT TAA TTT TCT TTT ACT TTA AAA GGT TTT AGG GAA AAT ATC TAT CCT TAA AGT AAA ATA TTA GAG AGA TAT TAA AAA TAT ATT ATT CTA CAA TCC GAT ATA AGG AAC GTC TGT CAA ATA CTC TCT ATC TAA TTG GAA TTT TCA TGA TCA ATT TAT TTC ATA TAT GGA AGA TAT TAT AAA ATA AGA AAG TGA TTA AAA TAA CTT GAA TTA ATG TTC AAG TTA ATC CTT TTA AAA TGT ATC AAA TAT TTA GAA AAA AAA AGA TGA ATA GAA TTC TAG TAT CAA TAT AAA ATT AAA TTA AAT TCA GCA GGA AAT AAG TTC GTC TAA ATT TAA AGA TTA GGT TTA AAA TAA AAA CAA TTT AAT CAT AGA CTT AGA ATA ATC ACC AAC CGT TTT AGA TTA TAA CTA AAA AAA GGG GAA ATT AAT ACA TGC TGC TCC ATT TTA ATA AGA ACC TGG TCT TTC TAA AAG GCT TCA TTT TGA ACA GGA TGA ATC TTT CGG TTT AAG AAA CTG A