Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00128650

Standard Name

UDH6 (UvrD/REP-family DNA helicase 6)

Aliases

PreTt09429 | 9.m00450 | 3699.m00158

Description

UvrD/REP-family DNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00036 ) EF hand
• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( TIGR01075 ) DNA helicase II
• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
• ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
• ( PF01443 ) Viral (Superfamily 1) RNA helicase
• ( PF07492 ) Neutral trehalase Ca2+ binding domain
• ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00128650

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19668.1	8.99652583192316e-145	UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD	YJL092W	0.00000005999527666938375	SRS2 DNA helicase and DNA-depe ndent ATPase involved in DNA r epair, needed for proper timin g of commitment to meiotic rec ombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinu cleotide repeat expansion; aff ects genome stability
Oxytricha	Contig14871.0.0.g77	0.000005000363240844623	UvrD-like helicase C-terminal domain

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00128650(coding)
ATGGAATAACAGGTTTCAGATGAGAATAGCTGTTAAGAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAAAAAAAAATAATTAATTCCTCAATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGTGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTCATTTATCGAATCAAGTATTTGATTGAATAAGGAATATGT
GCTAAATAAATACTACTAAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTATAGTAAGATGCAGAAGAAGTAAAAATGATGAATATAGATAAATTT
AATGCTGAAATTTATAACAAATATATAAAAGATAATGATAAAGATAATAACTTTAAATTA
GATATAAAAGAGTTAGGATATAAAGTTTAACAATTCTTAAGTACAAGAGAAGGAAATGAA
AAGGTTTTAAAGAAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATC
TAGTATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATAGTTATAGGAGAT
GAGGCTTAAAATATTTACAGCTTTAGAGATTCTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATA
AACTAAGATGTGCTAGAAATCTCAAAATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGTGTAAAT
TTTAGATGTTCAAGAAAAATCACATCATTTTGCAATTAAATTTTTGCAAACTAGAAGCAT
CTTGCAAGGCCTATGGATAGCTTAAAAAATGAAGAAGAGGAATGTTATTATCCTAAAATT
AGCCTTTATGGAGATTAAAATAAATAAGTGTATGATTTAATTTCAACTTTTAAAGGTTTA
ATATAGTAGGGGTATTAGTGGAGTGATTTGGCAGTACTTAGTCCTTCAAGAAAACCATTA
CTACACTTTTAGGAGTATTTAGAATAGCATTATTATATTTTTGGCCAAAAAATTCCTTAT
TCCCTAATATCCAGAAATATAGATAATCTTTTCACTTCTGATAATTTTGAATCTACTGAG
AAGTAAAATCACTTGACTTTGAGCACAATCCATTCTTCTAAGGGTTTGGAATGGAAGGTA
GTATTTATAATTGGAATTAATGATTTTAATTTTCCAGGAGCTTTCATCAAGTAGTTATAA
GTAGAAAAAAATATTTAAGAAAAGTTAAATGAGTGTAGAAGATTATTCTATGTAGCGTGC
ACTAGAGCTATGGAATAGCTAAAGTTTTGTTTCTTATAATATAAAGAAAAATATATATGT
AGGTTTTTCAGTGAAATTAATAAATAATATTACTAATCAGATCAAGATTTAAAAAAAGAA
GATTTTGCTTAAATCCAATCAAAATAAAAAAACTAAGTTTAACAAAGAAATTTATAAAAT
CCTTCCTAAAAAAAATCAACAATTGAAGCATTAGATATCAAAAATAAAATAGCTGATATC
ATACAAAATTTTGACATTAATGACTATGAAGTACTGAACAGTTTTCTATAAAAAATAAAA
CTTCTTAAATATTAAAGAGGGGAACATGTCACTTTCGACAATGAATAAATAAAATAAAAC
GCTCTTTAATAAGATTTGATTTGCTATCTTGAAATATTACTTTATAGAAGTGTTGTTGAA
AAATTCTTGTAAAGCTAGACAATTTAAAATGAAGATGCAGAGAAAATAATACTACGTACA
ATAAGTTGGAGTGGATATTAAAAGAGTTTTTATAATAGATACAAAGATTTCTTCAACTAA
TTAGATTTTCAAAAATTAGACAGCCTTGAGTCATTTATAGACAATTTCAAAGACTTTAAC
AAAATCGAAAAGAAATTAAATAGATTTGAAAATGAGAATTTATCGGATATGTACTCATCA
ATTTAAAAATTTTTAAAACAGTATAAGCTAAATTATAAAGATATTCATCATGCAACTGAA
ACTTATTTTTCAGATGATTTTGATAGGTAGAAATATTTTGACAGTTATTAACAATTTTCA
AATAAAGAATTGAAAACCTAAAATATTCTCAAAGACATTTATAATGTCAGTAAATTTAGT
TTAATTTCCTAAGGAATAAAGAGATCTTTATACAGAGATGATAGTAGTTTATTTCATAAT
GAGGATTTAACATTAAATATAGATAGATTTTTAAATGTCCTAGAATAATAATATGATTAG
AATAGGTTTGAAATAAAAAAGAAAATAAATTATGCTAATTTTTATGGGGTTATAGATTTA
ATAGCATTTGATAAATCTCTAGCTTATGCATGTATATTAAAAAAAATGAATTACAGGATA
CAAAATATTGTTTTCTATAATGTACTTCAAGATAATTGGATCATTTATTCGATAGAGTAA
TGGAATTAAGAAGAAGAATTCTTAAGATTTTTGTAAAAGAAAAAAGAAGATTACTAAAAA
GAGTAAGAAGAGAGTGAGGAGACTGATAATAATTTAGAGAAAGAGAAGTAATAGTAAGTA
AAAATCTAAGAGAAATCTTTGTAAAACTTATAAGTTCCTATTGAAGAATAAGAAAAAGAG
AATAATAGTAAGAATATTAATAATTATAGTCTACAAGAAAGTTAATAGGAAAAGAAAAAT
TAACTTATTTATCAAATTAATTGTCAATATTCTCAAAATTCAATTTAAAATTAAAGTTAA
AATTCTGATTAGACTGTATAAGAAAACAATCTTTAACATATGTACAAACAAAATGATTAA
TAAGGCAATATTGACATAGAAAATTAATTTAATTTTGGTAATTAAAGTAAGTAAAATGAT
AATTTAATACAAGTAGCTTTTGATAACTAAAAAATTAACCAAAATGAACCATTAGAAAAT
AAAAATAATTTATTTGGCAATTTTCAATAAATTAGAGATGACACCAAGAAAATTGAAGAG
CCTCGTTAATAATTAATTAATTTAAAAAATCATGTAGGAGAGAACTCTTAAGTTTTAGTA
AATAGCAATTAGAAAGGACTAAAAAAATCTAAAGTTGAAAACTAGAAAATTAATTTGAAC
TAAAAAAGGAAGAAAGAGAAGGATTAAGTTGATTATGAATAGTAGAAAATCAATTTTAAA
AAACAAAAAGTAGAATAAGGAGAGAAATCTATTTTCAATATCTAGATAATATTTTTAATA
ATTTACATATTATTTTAAATCATTAGAACTACATTAAAAAACAAGGAAATAAACTCATGA

>TTHERM_00128650(protein)
MEQQVSDENSCQENIALTDEQKKIINSSIDEDQRILACAGSGKTTTLIYRIKYLIEQGIC
AKQILLSTFNVEAANNLKIKAKQVLQQDAEEVKMMNIDKFNAEIYNKYIKDNDKDNNFKL
DIKELGYKVQQFLSTREGNEKVLKKYKYFFFDEFQDVNQIQYDILILFKKAGCKIIVIGD
EAQNIYSFRDSKLEFIQSKINQDVLEISKQEIKTYHLSVNFRCSRKITSFCNQIFANQKH
LARPMDSLKNEEEECYYPKISLYGDQNKQVYDLISTFKGLIQQGYQWSDLAVLSPSRKPL
LHFQEYLEQHYYIFGQKIPYSLISRNIDNLFTSDNFESTEKQNHLTLSTIHSSKGLEWKV
VFIIGINDFNFPGAFIKQLQVEKNIQEKLNECRRLFYVACTRAMEQLKFCFLQYKEKYIC
RFFSEINKQYYQSDQDLKKEDFAQIQSKQKNQVQQRNLQNPSQKKSTIEALDIKNKIADI
IQNFDINDYEVLNSFLQKIKLLKYQRGEHVTFDNEQIKQNALQQDLICYLEILLYRSVVE
KFLQSQTIQNEDAEKIILRTISWSGYQKSFYNRYKDFFNQLDFQKLDSLESFIDNFKDFN
KIEKKLNRFENENLSDMYSSIQKFLKQYKLNYKDIHHATETYFSDDFDRQKYFDSYQQFS
NKELKTQNILKDIYNVSKFSLISQGIKRSLYRDDSSLFHNEDLTLNIDRFLNVLEQQYDQ
NRFEIKKKINYANFYGVIDLIAFDKSLAYACILKKMNYRIQNIVFYNVLQDNWIIYSIEQ
WNQEEEFLRFLQKKKEDYQKEQEESEETDNNLEKEKQQQVKIQEKSLQNLQVPIEEQEKE
NNSKNINNYSLQESQQEKKNQLIYQINCQYSQNSIQNQSQNSDQTVQENNLQHMYKQNDQ
QGNIDIENQFNFGNQSKQNDNLIQVAFDNQKINQNEPLENKNNLFGNFQQIRDDTKKIEE
PRQQLINLKNHVGENSQVLVNSNQKGLKKSKVENQKINLNQKRKKEKDQVDYEQQKINFK
KQKVEQGEKSIFNIQIIFLIIYILFQIIRTTLKNKEINS

>TTHERM_00128650(gene)
ATGGAATAACAGGTTTCAGATGAGAATAGCTGTTAAGAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAAAAAAAAATAATTAATTCCTCAATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGTGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTCATTTATCGAATCAAGTATTTGATTGAATAAGGAATATGT
GCTAAATAAATACTACTAAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTATAGTAAGATGCAGAAGAAGTAAAAATGATGAATATAGATAAATTT
AATGCTGAAATTTATAACAAATATATAAAAGATAATGATAAAGATAATAACTTTAAATTA
GATATAAAAGAGTTAGGATATAAAGTTTAACAATTCTTAAGTACAAGAGAAGGAAATGAA
AAGGTTTTAAAGAAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATC
TAGTATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATAGTTATAGGTATT
GTTTGTTTTACTTCTACTTTCTTATTAAATTAAGCTAATTTCTAAAATTATTTTTTTTAG
CATTGTTTTAATATTTCTTATTTAAAATAGGAGATGAGGCTTAAAATATTTACAGCTTTA
GAGATTCTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATAAACTAAGATGTGCTAGAAATCTCAA
AATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGTGTAAATTTTAGATGTTCAAGAAAAATCACAT
CATTTTGCAATTAAATTTTTGCAAACTAGAAGCATCTTGCAAGGCCTATGGATAGCTTAA
AAAATGGTAAAGCTCACAAAGCTAAATTATTAAAATAATCATGTTTTTATTTTAATTTAA
ATTGTGTTCATATTTTAAATATTAAAGTTAATTAAATATACAAATTCTTTACATAATTAA
TTAATTAATTAATTAATCATCTTTTACTACTTTAGTTAAATTTAAAAATGTTCAACTTTT
TTTTATAAATAACAGAAGAAGAGGAATGTTATTATCCTAAAATTAGCCTTTATGGAGATT
AAAATAAATAAGTGTATGATTTAATTTCAACTTTTAAAGGTTTAATATAGTAGGGGTATT
AGTGGAGTGATTTGGCAGTACTTAGTCCTTCAAGAAAACCATTACTACACTTTTAGGAGT
ATTTAGAATAGCATTATTATATTTTTGGCCAAAAAATTCCTTATTCCCTAATATCCAGAA
ATATAGATAATCTTTTCACTTCTGATAATTTTGAATCTACTGAGAAGTAAAATCACTTGA
CTTTGAGCACAATCCATTCTTCTAAGGGTTTGGAATGGAAGGTAGTATTTATAATTGGAA
TTAATGATTTTAATTTTCCAGGAGCTTTCATCAAGTAGTTATAAGTAGAAAAAAATATTT
AAGAAAAGTTAAATGAGTGTAGAAGATTATTCTATGTAGCGTGCACTAGAGCTATGGAAT
AGCTAAAGTTTTGTTTCTTATAATATAAAGAAAAATATGTAAATTTTAGTTAGATAATAT
TTTCATACTATAATAAAATTTTTATTGTTAAGATATGTAGGTTTTTCAGTGAAATTAATA
AATAATATTACTAATCAGATCAAGATTTAAAAAAAGAAGATTTTGCTTAAATCCAATCAA
AATAAAAAAACTAAGTTTAACAAAGAAATTTATAAAATCCTTCCTAAAAAAAATCAACAA
TTGAAGCATTAGATATCAAAAATAAAATAGCTGATATCATACAAAATTTTGACATTAATG
ACTATGAAGTACTGAACAGTTTTCTATAAAAAATAAAACTTCTTAAATATTAAAGAGGGG
AACATGTCACTTTCGACAATGAATAAATAAAATAAAACGCTCTTTAATAAGATTTGATTT
GCTATCTTGAAATGTAAAATTTTATAAATTAATTTTCAGTAAAGATTATTTAATTATTTC
AAAATAAAATTTTAGCTAACTTTTTATATGTAATCGAATGAATATTTTTTATACTAAAAT
CCAGTGATAAGAAAATTATTTTTTAATTCATTTTTCATAAAGCACTTAGCAATTTTAAAA
AATATTCATCGCTATTTATTATCGAATTAATATTTAGAAATAAACATAATTTAATTAAAG
ATTATGTGTATATATAAAACTTATTTTCTGATATATTTTGATGAAAAATAGTATCTCATC
AAAATATTTATAAATTTTGCGTATTATTTCATCTTTTTATATTTTTCTAAAAAGGAGAGC
TTATATTTAAATTAATTTTTTATTTAGATTACTTTATAGAAGTGTTGTTGAAAAATTCTT
GTAAAGCTAGACAATTTAAAATGAAGATGCAGAGAAAATAATACTACGTACAATAAGTTG
GAGTGGATATTAAAAGAGTTTTTATAATAGATACAAAGATTTCTTCAACTAATTAGATTT
TCAAAAATTAGACAGCCTTGAGTCATTTATAGACAATTTCAAAGACTTTAACAAAATCGA
AAAGAAATTAAATAGATTTGAAAATGAGAATTTATCGGATATGTACTCATCAATTTAAAA
ATTTTTAAAACAGTATAAGCTAAATTATAAGTAATATGATTTATTCTAATCAAATAAAAA
TAAAATTTCTTTAATATTTAAAATAGAGATATTCATCATGCAACTGAAACTTATTTTTCA
GATGATTTTGATAGGTAGAAATATTTTGACAGTTATTAACAATTTTCAAATAAAGAATTG
AAAACCTAAAATATTCTCAAAGACATTTATAATGTCAGTAAATTTAGTTTAATTTCCTAA
GGAATAAAGAGATCTTTATACAGAGATGATAGTAGTTTATTTCATAATGAGGATTTAACA
TTAAATATAGATAGATTTTTAAATGTCCTAGAATAATAATATGATTAGAATAGGTTTGAA
ATAAAAAAGAAAATAAATTATGCTAATTTTTATGGGGTTATAGATTTAATAGCATTTGAT
AAAGTAAATTATTTATTTATTAATTAAGTTAGAAGTAAGCGATTGAATAAACATTTTTCT
AATAATTTAAATTTTAAGTAATAGGATAAAGGTGATATATTTTAATTTATCTATTATTAA
GGAGAGTCTGAATTAAGTATTTCTAAACAATAAATTATTTAAGTAAATATTTTCAATTAG
CTTCAGAATTTATAATCAAGCAAATTTACTTATATTAAAAAGTCTCTAGCTTATGCATGT
ATATTAAAAAAAATGAATTACAGGATACAAAATATTGTTTTCTATAATGTACTTCAAGAT
AATTGGATCATTTATTCGATAGAGTAATGGAATTAAGAAGAAGAATTCTTAAGATTTTTG
TAAAAGAAAAAAGAAGATTACTAAAAAGAGTAAGAAGAGAGTGAGGAGACTGATAATAAT
TTAGAGAAAGAGAAGTAATAGTAAGTAAAAATCTAAGAGAAATCTTTGTAAAACTTATAA
GTTCCTATTGAAGAATAAGAAAAAGAGAATAATAGTAAGAATATTAATAATTATAGTCTA
CAAGAAAGTTAATAGGAAAAGAAAAATTAACTTATTTATCAAATTAATTGTCAATATTCT
CAAAATTCAATTTAAAATTAAAGTTAAAATTCTGATTAGACTGTATAAGAAAACAATCTT
TAACATATGTACAAACAAAATGATTAATAAGGCAATATTGACATAGAAAATTAATTTAAT
TTTGGTAATTAAAGTAAGTAAAATGATAATTTAATACAAGTAGCTTTTGATAACTAAAAA
ATTAACCAAAATGAACCATTAGAAAATAAAAATAATTTATTTGGCAATTTTCAATAAATT
AGAGATGACACCAAGAAAATTGAAGAGCCTCGTTAATAATTAATTAATTTAAAAAATCAT
GTAGGAGAGAACTCTTAAGTTTTAGTAAATAGCAATTAGAAAGGACTAAAAAAATCTAAA
GTTGAAAACTAGAAAATTAATTTGAACTAAAAAAGGAAGAAAGAGAAGGATTAAGTTGAT
TATGAATAGTAGAAAATCAATTTTAAAAAACAAAAAGTAGAATAAGGAGAGAAATCTATT
TTCAATATCTAGATAATATTTTTAATAATTTACATATTATTTTAAATCATTAGAACTACA
TTAAAAAACAAGGTATTGTTAACAAACATATTTTTTTATTAAATTTTTTCTAATATAAAT
TAAAGGAAATAAACTCATGA