Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00128640

Standard Name

UDH5 (UvrD/REP-family DNA helicase 5)

Aliases

PreTt09428 | 9.m00449 | 3699.m00157

Description

UvrD/REP-family DNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF07813 ) LTXXQ motif
• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
• ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
• ( TIGR01952 ) NusA family KH domain protein,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00128640

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19668.1	5.997537942519205e-151	UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD	YJL092W	0.000000019990673443141236	SRS2 DNA helicase and DNA-depe ndent ATPase involved in DNA r epair, needed for proper timin g of commitment to meiotic rec ombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinu cleotide repeat expansion; aff ects genome stability
Oxytricha	Contig14871.0.0.g77	0.00000039992052383199455	UvrD-like helicase C-terminal domain

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00128640(coding)
ATGGAATAAAAAGTTTCAGATAACAATAGCTTTTAATAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAATAAAAAATAATTTATTCGAATATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGCGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTAATTTATCGAATCGAGTATTTGATTAAATAAGGAATACCT
GCAAGCTAAATATTACTGAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTACATTAAGATGAAGTAGAAGAAAAAAATATAATGAACATAGACAAA
TTTACTGCTGATATTTATAAGAATTATATAAAAGATAATGATAAAAACTTTAAATTAGAT
GTAAAAGAATTTGGATATAAAGTTAAAAATTACTTAAGTACAATAGAAGGAGAATAAAAG
GTTTTAAAGTAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATCTAG
TATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATTGTTATAGGAGATGAG
GCTTAAAATATTTACAGCTTTAGAGATACTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATAAAT
TAAGATATACTAAAAATCTCATAATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGCATAAATTTT
AGATGTTCAAGCAAAATCACAAAATTCTGCAATTAAATTTTTGCAAACACGTAGCATTTT
GCAAAACCTATGTAAAGCTTAAAAGAAGCGGACTAAGTGAAATTTTATCCTAAAATTAGA
CTTTATAAAAATTCAGATGAGTTAGTAAATGATATAATTATACAACTTCAAAATTTAATA
AATATCTATTAGTGGAGTGATTTGGCAATACTTAGTCCTACAAGAAAACCATTAATACAT
TTTTAGGAAATTTTAGAAAAGCATAATTCTACTTTATAACAGATAATTCCCTATTCCTTA
AGATTCAGAGATATGAATAATGTTTTCACTTGTGATAATTCTGATGCTACTGAGGAGTAA
AAGAACTTGACTTTGAGCACGATTCATGCTTCTAAGGGTTTAGAATGGAAAGTAGTATTT
ATAATCGGAATTAATGATTCAAATTTTCCAGGAGTTTTCATCAACTATTTATAAGAAGAA
AACGAAATTTAAGAAAAGTTAAGCGAGTGCAGAAGATTATTCTACGTAGCTTGTACTAGA
GCTAAGGAATAATTAAGCTTTTCTTTCATAAAATAAAAAGGAAAATATATATGTAGATTT
TTCAGTGAAATTAATGAAGAATAATATGAATGCTAAGATACAAATTTTAAAAGAGAACAT
ATAGCTTAAATCCAATCAAAAAAATCAAATTTTAAACCATTAAATATCAAGAACAACATA
GCTGATATCATACAAAATTTTGACTTTAATGACTATGAAGTAGTGAACAGTTTTCTATAA
AAAATATAACTTGTTAATAAAGAAACAGGAAAAGAGGCCACTTACAACAGTTAAAAAATA
AGATAAAACGCTCTTTAATAAGATTTGATTTGTTATCTTGACATATTACTTTATAGATGT
GTTACCGAAAAATACTTATAAAGCTAGAAAATTTTAAATGAAGATGCTGAGAAAATACTA
TGTACAATAAATTGGAAAGGAAAATCAAAGGTTGTTTATAATAAATTTATAGAATTCTTC
AACAAAAAAAGTTTAATAGATTTAGAAATATTGAACAGCCAGGAGTAATTTATAAACTGT
TTAAACAATCATTACAGTAACAAGTAGCAATTTGATCAAAATGAAATTAAAATTTTACAA
GAAATGCGTACATAAATTAAATCATTTTTAGAAAAAAATAAACTAAAATATGAAGATATT
TGCCATGCAACTGAGAGTCACTCGTTGGATTATTTTCCTGAAGATTTTATGGATAAGTAG
AAATATGTTGACAGTTATTTAAAATTTTCAGATAAAACATAGAAAACAGAAAATATTATC
AAAGATGTTTATAATGTGAGTAAATGCCATTTAATTTCCTAAGGAATAAGGAGATCATTG
TACAGAGATGATATTGAATTACTTTAACCTTGGAATTTAAAATTAAATATCAATAGATTT
TTAAAAAGTCTCAATTTAAAATATGATAAGAATAGGTTTGAAATAAAAAAGAAAGTAGAA
TATGATAGTTTAAATGGAGTTATAGATTTAATAGCATTTGATAAAGATAAAGGTGATATA
ATTTAATTTATCTATCATTAAGGAAAGTCTAAATTAAGCATTTCTAAAGAATAAATTATT
CAATCTCTAGTTTATGCATACATATTAAAAAAGAAAAGTTACAGTATAAAAAATATTGTT
TTCTATAATGTACTTAATGAAGATTTGATCACTTATTCGATAGATTAATGGAATTAAGAA
GAAGAATTCTTAAGATTTTTGTAAAAGAAAAAAGAAGATTACTAAAAAGAGTAAGAAGAG
ACTGATGATAATTTAGAGGAAGAAGAAGATTAATAGGAATTAGAAATCTAGGAGAATACT
TTGTAAAACTTATACACTTCTATTGAAGAAGAACAAGAAGATGAAAAAGAAGAAAAAGAG
AATAATAGTAAGAAAATTAATAATTATAACCTATAAGAAAGTTAATAGGTATAGAAAAAT
TAACTTCCTTATCAATTTAATAATCTATATTCTAGAAGTTCAACTTAAAATTTAAGTTAA
AATTCTGTTTAGACAGTATAAGAAAATAATCTTTAATGTAAGTACAATTAAAATGATTAA
GAAGATAATGTTGAGATCGAAAATTAATTAATTTATGGTAATTAAAGTGATTAAAATGAG
AATTTAATACAAAAAGCTTTAGATAACTAAAAAATTAACTAAAATGAGCCATTAGAAAAT
CAAAATAATTTAGTTAGCAATATTCAATAAAATAGAGATAACTCCAAGAAAATTGAAGAG
CCTTGTTAATTATTATTTAATTTAAAGAATCATGAAGATGAGAACTCTTAAATTGAAAAC
AAAATGAGTAATTTAAACTCAAAAAGGAAGAGAGAGAAGAATTAAGTTGAATATGAATAG
TAGAAAATCAATTTAAAAAAACAAAAAGTAGAATTAAAAGAGAAAGCTATCAATGTCTAG
ATTATATTTTTTATAATTTATATATTAATTTAAGTCTTTTAAACTTCATTACAATACAAG
GTAATTATTTTTAACAAATAAATTTTTAATTTAATTTTGTTTAATGTAAATTAAAGGCAA
TAAACTCATGAAGAATCAAAAAATGTGGCTAAGAATACAAATCAAAAGCCAAAATTATTT
TTTTCTTTAATAAAATTAGTTAATATATTTCTGTGTTAAATTAATGTTTTAATTCTTATT
TTCTATGATTTGTCAGCATATTGTAAAATTAATATTTAAATAAGCATTTTAAAGTTTAAG
AGTTGTGCATCACCTTCGATTGAAAATTTTTTATATTTAAATTTAATTTCCATATATTTT
TTATAAAATAGACTTAATTACATTGTTACATTGTAAAAAATTTAATATTTTTCTTTCAAA
GTAAAGATAATTTTAATTTTAATTGTCAATTTTAAAAAGCTTACTGTATATTTAAGATTT
AAAAATATGAAATTATTTGCTTAACTAAATATCATTTTTTTATGGAAAAAAAAAGATTCA
TGCTTGTCTTAATCATTTATACCATATCCTCACATTTTATTTAATACATTTTTCAATAGA
ATTTTATTCAAAAAATGTATTCTAAATTTATAAAATGTAATAGAAATTGAATGA

>TTHERM_00128640(protein)
MEQKVSDNNSFQQNIALTDEQQKIIYSNIDEDQRILACAGSGKTTTLIYRIEYLIKQGIP
ASQILLSTFNVEAANNLKIKAKQVLHQDEVEEKNIMNIDKFTADIYKNYIKDNDKNFKLD
VKEFGYKVKNYLSTIEGEQKVLKQYKYFFFDEFQDVNQIQYDILILFKKAGCKIIVIGDE
AQNIYSFRDTKLEFIQSKINQDILKISQQEIKTYHLSINFRCSSKITKFCNQIFANTQHF
AKPMQSLKEADQVKFYPKIRLYKNSDELVNDIIIQLQNLINIYQWSDLAILSPTRKPLIH
FQEILEKHNSTLQQIIPYSLRFRDMNNVFTCDNSDATEEQKNLTLSTIHASKGLEWKVVF
IIGINDSNFPGVFINYLQEENEIQEKLSECRRLFYVACTRAKEQLSFSFIKQKGKYICRF
FSEINEEQYECQDTNFKREHIAQIQSKKSNFKPLNIKNNIADIIQNFDFNDYEVVNSFLQ
KIQLVNKETGKEATYNSQKIRQNALQQDLICYLDILLYRCVTEKYLQSQKILNEDAEKIL
CTINWKGKSKVVYNKFIEFFNKKSLIDLEILNSQEQFINCLNNHYSNKQQFDQNEIKILQ
EMRTQIKSFLEKNKLKYEDICHATESHSLDYFPEDFMDKQKYVDSYLKFSDKTQKTENII
KDVYNVSKCHLISQGIRRSLYRDDIELLQPWNLKLNINRFLKSLNLKYDKNRFEIKKKVE
YDSLNGVIDLIAFDKDKGDIIQFIYHQGKSKLSISKEQIIQSLVYAYILKKKSYSIKNIV
FYNVLNEDLITYSIDQWNQEEEFLRFLQKKKEDYQKEQEETDDNLEEEEDQQELEIQENT
LQNLYTSIEEEQEDEKEEKENNSKKINNYNLQESQQVQKNQLPYQFNNLYSRSSTQNLSQ
NSVQTVQENNLQCKYNQNDQEDNVEIENQLIYGNQSDQNENLIQKALDNQKINQNEPLEN
QNNLVSNIQQNRDNSKKIEEPCQLLFNLKNHEDENSQIENKMSNLNSKRKREKNQVEYEQ
QKINLKKQKVELKEKAINVQIIFFIIYILIQVFQTSLQYKVIIFNKQIFNLILFNVNQRQ
QTHEESKNVAKNTNQKPKLFFSLIKLVNIFLCQINVLILIFYDLSAYCKINIQISILKFK
SCASPSIENFLYLNLISIYFLQNRLNYIVTLQKIQYFSFKVKIILILIVNFKKLTVYLRF
KNMKLFAQLNIIFLWKKKDSCLSQSFIPYPHILFNTFFNRILFKKCILNLQNVIEIE

>TTHERM_00128640(gene)
ATGGAATAAAAAGTTTCAGATAACAATAGCTTTTAATAAAACATAGCATTAACTGATGAA
TAATAAAAAATAATTTATTCGAATATCGATGAAGATCAAAGAATTTTAGCATGCGCAGGT
TCAGGTAAAACAACTACACTAATTTATCGAATCGAGTATTTGATTAAATAAGGAATACCT
GCAAGCTAAATATTACTGAGTACTTTTAATGTTGAAGCTGCTAATAACTTAAAAATAAAA
GCAAAACAAGTGTTACATTAAGATGAAGTAGAAGAAAAAAATATAATGAACATAGACAAA
TTTACTGCTGATATTTATAAGAATTATATAAAAGATAATGATAAAAACTTTAAATTAGAT
GTAAAAGAATTTGGATATAAAGTTAAAAATTACTTAAGTACAATAGAAGGAGAATAAAAG
GTTTTAAAGTAATATAAATACTTTTTTTTTGATGAGTTTTAAGATGTAAATCAAATCTAG
TATGACATCCTAATTCTTTTCAAAAAAGCAGGATGCAAAATTATTGTTATAGGTATTGTT
TGTTTAACTTCTACTATTTATTTAATTAAATCAACCTAATTTTTAAAATTATTTTTTTAG
GATTTTTTATAAATATCTTATTTAAACTAGGAGATGAGGCTTAAAATATTTACAGCTTTA
GAGATACTAAATTAGAATTTATTCAAAGCAAAATAAATTAAGATATACTAAAAATCTCAT
AATAGGAAATAAAAACATATCACCTTAGCATAAATTTTAGATGTTCAAGCAAAATCACAA
AATTCTGCAATTAAATTTTTGCAAACACGTAGCATTTTGCAAAACCTATGTAAAGCTTAA
AAGAAGGTATAGATCACAAAACTAAATAAATAAATAAAAATCATTTTATTATTTTAATTT
AAATTTTTTTTATATTTTAAATATTAAAGCGAATTAAATAAACAAATTCTTTACATAATT
AAATGATTAATAATCTTTTAATACTTTAGCTACATGTAAACATGTTCAAATTTTTTAAAA
AAATAGCGGACTAAGTGAAATTTTATCCTAAAATTAGACTTTATAAAAATTCAGATGAGT
TAGTAAATGATATAATTATACAACTTCAAAATTTAATAAATATCTATTAGTGGAGTGATT
TGGCAATACTTAGTCCTACAAGAAAACCATTAATACATTTTTAGGAAATTTTAGAAAAGC
ATAATTCTACTTTATAACAGATAATTCCCTATTCCTTAAGATTCAGAGATATGAATAATG
TTTTCACTTGTGATAATTCTGATGCTACTGAGGAGTAAAAGAACTTGACTTTGAGCACGA
TTCATGCTTCTAAGGGTTTAGAATGGAAAGTAGTATTTATAATCGGAATTAATGATTCAA
ATTTTCCAGGAGTTTTCATCAACTATTTATAAGAAGAAAACGAAATTTAAGAAAAGTTAA
GCGAGTGCAGAAGATTATTCTACGTAGCTTGTACTAGAGCTAAGGAATAATTAAGCTTTT
CTTTCATAAAATAAAAAGGAAAATATGTAAACTTTAGATAATATTTACATGCAATAATAA
TATTTTAATTATTAAGATATGTAGATTTTTCAGTGAAATTAATGAAGAATAATATGAATG
CTAAGATACAAATTTTAAAAGAGAACATATAGCTTAAATCCAATCAAAAAGTAAAATCTA
AATTAAAAAAATAAATTTAAATTATTTTTCTAAAATAGAATCAAATTTTAAACCATTAAA
TATCAAGAACAACATAGCTGATATCATACAAAATTTTGACTTTAATGACTATGAAGTAGT
GAACAGTTTTCTATAAAAAATATAACTTGTTAATAAAGAAACAGGAAAAGAGGCCACTTA
CAACAGTTAAAAAATAAGATAAAACGCTCTTTAATAAGATTTGATTTGTTATCTTGACAT
GTAAAATTTAATAAATTAATTTTCAGTAAAGATAAATTAATAATATCAAAATAAAATACT
AACTTACTTTTTATATAAACTTAAATTCCGCGCTTTTTCTACAAGACCAGCCATTTAACA
CTTAATAAATAAAAATATAAAAATATTTAATTAATCTTATTTGGTTATTCAACCTTTTTA
TATTTATCATAATAAAAATGAGAACTTACATTTACATTTATTTTTTATTTAGATTACTTT
ATAGATGTGTTACCGAAAAATACTTATAAAGCTAGAAAATTTTAAATGAAGATGCTGAGA
AAATACTATGTACAATAAATTGGAAAGGAAAATCAAAGGTTGTTTATAATAAATTTATAG
AATTCTTCAACAAAAAAAGTTTAATAGATTTAGAAATATTGAACAGCCAGGAGTAATTTA
TAAACTGTTTAAACAATCATTACAGTAACAAGTAGCAATTTGATCAAAATGAAATTAAAA
TTTTACAAGAAATGCGTACATAAATTAAATCATTTTTAGAAAAAAATAAACTAAAATATG
AGTAATATGATTTATTTTAATCAAATATAAATAAAGTATCTTTAATATTTAAAATAGAGA
TATTTGCCATGCAACTGAGAGTCACTCGTTGGATTATTTTCCTGAAGATTTTATGGATAA
GTAGAAATATGTTGACAGTTATTTAAAATTTTCAGATAAAACATAGAAAACAGAAAATAT
TATCAAAGATGTTTATAATGTGAGTAAATGCCATTTAATTTCCTAAGGAATAAGGAGATC
ATTGTACAGAGATGATATTGAATTACTTTAACCTTGGAATTTAAAATTAAATATCAATAG
ATTTTTAAAAAGTCTCAATTTAAAATATGATAAGAATAGGTTTGAAATAAAAAAGAAAGT
AGAATATGATAGTTTAAATGGAGTTATAGATTTAATAGCATTTGATAAAGTAAATTATTT
ATTTATTTATTAATATAGTGAGTGATTGAATGAATAATTTTTTTTTTATAATATAAATTT
TAAAATAAATTATAATAGGATAAAGGTGATATAATTTAATTTATCTATCATTAAGGAAAG
TCTAAATTAAGCATTTCTAAAGAATAAATTATTCAAGTAAACATTTTCAATTAGCTTCAT
AATTTATATTCAAGCAAATTTATTTATATCAAAAAGTCTCTAGTTTATGCATACATATTA
AAAAAGAAAAGTTACAGTATAAAAAATATTGTTTTCTATAATGTACTTAATGAAGATTTG
ATCACTTATTCGATAGATTAATGGAATTAAGAAGAAGAATTCTTAAGATTTTTGTAAAAG
AAAAAAGAAGATTACTAAAAAGAGTAAGAAGAGACTGATGATAATTTAGAGGAAGAAGAA
GATTAATAGGAATTAGAAATCTAGGAGAATACTTTGTAAAACTTATACACTTCTATTGAA
GAAGAACAAGAAGATGAAAAAGAAGAAAAAGAGAATAATAGTAAGAAAATTAATAATTAT
AACCTATAAGAAAGTTAATAGGTATAGAAAAATTAACTTCCTTATCAATTTAATAATCTA
TATTCTAGAAGTTCAACTTAAAATTTAAGTTAAAATTCTGTTTAGACAGTATAAGAAAAT
AATCTTTAATGTAAGTACAATTAAAATGATTAAGAAGATAATGTTGAGATCGAAAATTAA
TTAATTTATGGTAATTAAAGTGATTAAAATGAGAATTTAATACAAAAAGCTTTAGATAAC
TAAAAAATTAACTAAAATGAGCCATTAGAAAATCAAAATAATTTAGTTAGCAATATTCAA
TAAAATAGAGATAACTCCAAGAAAATTGAAGAGCCTTGTTAATTATTATTTAATTTAAAG
AATCATGAAGATGAGAACTCTTAAATTGAAAACAAAATGAGTAATTTAAACTCAAAAAGG
AAGAGAGAGAAGAATTAAGTTGAATATGAATAGTAGAAAATCAATTTAAAAAAACAAAAA
GTAGAATTAAAAGAGAAAGCTATCAATGTCTAGATTATATTTTTTATAATTTATATATTA
ATTTAAGTCTTTTAAACTTCATTACAATACAAGGTAATTATTTTTAACAAATAAATTTTT
AATTTAATTTTGTTTAATGTAAATTAAAGGCAATAAACTCATGAAGAATCAAAAAATGTG
GCTAAGAATACAAATCAAAAGCCAAAATTATTTTTTTCTTTAATAAAATTAGTTAATATA
TTTCTGTGTTAAATTAATGTTTTAATTCTTATTTTCTATGATTTGTCAGCATATTGTAAA
ATTAATATTTAAATAAGCATTTTAAAGTTTAAGAGTTGTGCATCACCTTCGATTGAAAAT
TTTTTATATTTAAATTTAATTTCCATATATTTTTTATAAAATAGACTTAATTACATTGTT
ACATTGTAAAAAATTTAATATTTTTCTTTCAAAGTAAAGATAATTTTAATTTTAATTGTC
AATTTTAAAAAGCTTACTGTATATTTAAGATTTAAAAATATGAAATTATTTGCTTAACTA
AATATCATTTTTTTATGGAAAAAAAAAGATTCATGCTTGTCTTAATCATTTATACCATAT
CCTCACATTTTATTTAATACATTTTTCAATAGAATTTTATTCAAAAAATGTATTCTAAAT
TTATAAAATGTAATAGAAATTGAATGA