Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00128620

Standard Name

UDH4 (UvrD/REP-family DNA helicase 4)

Aliases

PreTt09426 | 9.m00447 | 3699.m00155

Description

UvrD/REP helicase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003
• DNA binding (IEA) | GO:0003677

Biological Process

• DNA repair (IEA) | GO:0006281

Domains

• ( PF04644 ) Motilin/ghrelin
• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( TIGR01075 ) DNA helicase II
• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
• ( TIGR00372 ) CRISPR-associated protein Cas4
• ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
• ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
• ( PF05153 ) Family of unknown function (DUF706)

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00128620

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19668.1	9.997093137033517e-262	UvrD/REP helicase (1047 aa)
SGD	YJL092W	0.00000005999527666938375	SRS2 DNA helicase and DNA-depe ndent ATPase involved in DNA r epair, needed for proper timin g of commitment to meiotic rec ombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinu cleotide repeat expansion; aff ects genome stability

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00128620(coding)
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TAAATAGATAAAAGCGAATTTCAAACTAACTAGGAAAATTCTAAAAATAAATAAAATTTA
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ATGGAATCATTTTAAATTTAAAACTATTAAAATGGATTTGAAAATCTTTAAATAGCTAAT
AATTCAAATTATCATTAAAAAAATGACATTTAATTTTTGAATTAACAATATAATAAGAAA
AATTATCATTTAGCTTCTCATGAAAATGATGAAATTAAAAACTTATAAAGTCATCCATTA
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>TTHERM_00128620(protein)
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>TTHERM_00128620(gene)
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ATTTTAATGA