Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00490560Standard Name
UDH3 (UvrD/REP-family DNA helicase 3)Aliases
PreTt08361 | 60.m00158Description
UvrD/REP helicase family proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Biological Process
- DNA repair (IEA) | GO:0006281
Domains
- ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
- ( TIGR01075 ) DNA helicase II
- ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
- ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
- ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
- ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
- ( PF02890 ) Borrelia family of unknown function
- ( TIGR02972 ) trimethylamine N-oxide reductase system, TorE
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00490560
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_19668.1 7.99824663097029e-79 UvrD/REP helicase (1047 aa)
Oxytricha Contig4754.0.g7 0.000005998506718272351 UvrD/REP helicase N-terminal d
omain
SGD YJL092W 0.00010003404299092957 SRS2 DNA helicase and DNA-depe
ndent ATPase involved in DNA r
epair, needed for proper timin
g of commitment to meiotic rec
ombination and transition from
Meiosis I to II; blocks trinu
cleotide repeat expansion; aff
ects genome stability
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00490560(coding)
ATGGAACTTGGTAATTAATAATAAAAGCATGGGTAGTAATAAAATAACATTTTAAAGTAT
ACAAATGAGTAGCTAGAATTCATTCATGCTCCTAAAAACAGAGATATTAAGATAACTGCT
TGTGCTGGTTCTGGAAAAACATAATGTGTGCTAGAGTTTACAAAGTAAGCATTAAAGGAG
GGATTTAATCCTAAAGAAATTTGCATAACAACTTTCAATATTTAAGCAAGCAATGATATG
AAAAAAAGAGCTATTGAGTTGATGGGAAAATTTTAGGCTGATTAAATTGAAATCCTTAAC
TTTGATAAAATAATAACAAAATTTTTTAAAATGATTTAAAAATCTAAAAGCTAAAAAGAA
TTGAACAAATAAAATTAGAAAGAAAATAAAAATTAACAATCGATTGAACTGACTTTGGCT
GAAAAATAATTTCAGCTATATCAAGACTTATAAGACGAATCTCTTAGCAAGCATATCTTC
GAAAGCTATAAACTGATCATATTTGACGAATTTTAAGATATCAACTAATTGCAGTATGAA
ATCTTAATGTTATTTAAGAGAATTGGAAAATCAATCATAGTCGTTGTTGGAGATGATCTT
TAGAATATATATGAGTTTAGAGGATCAGATTATAAATTTTTAAAGTCCTAAATTATTGAA
GATATTAATAAAGAAAACAAAAAATTTTATGGAAATGAGAACTTCAACATGTTGGAATAT
AATCTTACAACTAACTTTAGATGCTCCTCGAAAATCACTGCTTTCGCAAATGATATAATT
AGGTCATTCTAATATATTAATTAAAACCCAATGCAGAGTTTTGAAGATTTGAAATGTTAC
TAGAATAAAAAATGTGATATAAAGCCAACTCTTGAACCATATAAAAGTTATAACGATATG
TTCAAAGACATTTACAATTTTATAACATCCAAAGTGTAAAACGAAGGCTTTTCTTACTCA
GATATAGCAATAATAAGTGCAACAAGTTTTCCTTTAAGGTAAATAGAATTGAAATTAGAA
TAGCACAATTTTAACCAGCCTGAAAAAGAAATACCATTTTGGAGCTTCGTTGGCAAAAAC
AAAGATTTTGATTACAGTTTTGAATATAAAGGTAATAAAGTCACTTTATTAACAGCTCAT
AAGTCGAAAGGGTTGGAATGGAAAGCTTTATTTTTCATTGGAATAAATGATGATTAATTT
CCAGAGGTATTTATAAGATAAGTAGGAAACTACAATCAAAAAATTGAAGAGATGAGGCGT
TTATTTTATGTTGGATCAACAAGAGCAGCTTAAATTTTGAAATTGAGTTATTTTTCAAAC
AATAACAGAAAAGCTTGTAGGTTTTTAGGTGCAATTGATAAAAATAATATTTAATTTAAA
GGTTAAACTTAAATTGCTTAAGAAAAAAATACCACAAATGCTAATCAAAAATAACTGTTA
GATAAATAAGTGAGAGAAATATTTGAAGAGATGTGTAATCCTTAGTATATTGTTTAACTT
TAAAAAACTGAAAAGTTTCTTTAAGAAGAATAATTTTATTTAGAAGAAATTTAATACATT
CACAAGCCTATGTTTTCAAGAAATTAAATCTAAAAAATATTTTTCAATTAATCTGAAGAA
ATCCTTTTTTCTTACATTGAAACGTAATTTTCTTATCCTATAATGAATTTTCTAATTTTT
AAATAATTAATACTCAATTTAACATTTTATCAATAAATCTAATAAAATATTATTTATAAA
TGA>TTHERM_00490560(protein)
MELGNQQQKHGQQQNNILKYTNEQLEFIHAPKNRDIKITACAGSGKTQCVLEFTKQALKE
GFNPKEICITTFNIQASNDMKKRAIELMGKFQADQIEILNFDKIITKFFKMIQKSKSQKE
LNKQNQKENKNQQSIELTLAEKQFQLYQDLQDESLSKHIFESYKLIIFDEFQDINQLQYE
ILMLFKRIGKSIIVVVGDDLQNIYEFRGSDYKFLKSQIIEDINKENKKFYGNENFNMLEY
NLTTNFRCSSKITAFANDIIRSFQYINQNPMQSFEDLKCYQNKKCDIKPTLEPYKSYNDM
FKDIYNFITSKVQNEGFSYSDIAIISATSFPLRQIELKLEQHNFNQPEKEIPFWSFVGKN
KDFDYSFEYKGNKVTLLTAHKSKGLEWKALFFIGINDDQFPEVFIRQVGNYNQKIEEMRR
LFYVGSTRAAQILKLSYFSNNNRKACRFLGAIDKNNIQFKGQTQIAQEKNTTNANQKQLL
DKQVREIFEEMCNPQYIVQLQKTEKFLQEEQFYLEEIQYIHKPMFSRNQIQKIFFNQSEE
ILFSYIETQFSYPIMNFLIFKQLILNLTFYQQIQQNIIYK>TTHERM_00490560(gene)
TTTGTTTCGGAAATAGAGGAAGAAAATAATATAAATATGGAACTTGGTAATTAATAATAA
AAGCATGGGTAGTAATAAAATAACATTTTAAAGTATACAAATGAGTAGCTAGAATTCATT
CATGCTCCTAAAAACAGAGATATTAAGATAACTGCTTGTGCTGGTTCTGGAAAAACATAA
TGTGTGCTAGAGTTTACAAAGTAAGCATTAAAGGAGGGATTTAATCCTAAAGAAATTTGC
ATAACAACTTTCAATATTTAAGCAAGCAATGATATGAAAAAAAGAGCTATTGAGTTGATG
GGAAAATTTTAGGCTGATTAAATTGAAATCCTTAACTTTGATAAAATAATAACAAAATTT
TTTAAAATGATTTAAAAATCTAAAAGCTAAAAAGAATTGAACAAATAAAATTAGAAAGAA
AATAAAAATTAACAATCGATTGAACTGACTTTGGCTGAAAAATAATTTCAGCTATATCAA
GACTTATAAGACGAATCTCTTAGCAAGCATATCTTCGAAAGCTATAAACTGATCATATTT
GACGAATTTTAAGATATCAACTAATTGCAGTATGAAATCTTAATGTTATTTAAGAGAATT
GGAAAATCAATCATAGTCGTTGTTGGTATAAATAAAAATATTATTAAATTAATTAATTAA
TTAATTTTTTTGTGATTTTATAGGAGATGATCTTTAGAATATATATGAGTTTAGAGGATC
AGATTATAAATTTTTAAAGTCCTAAATTATTGAAGATATTAATAAAGAAAACAAAAAATT
TTATGGAAATGAGAACTTCAACATGTTGGAATATAATCTTACAACTAACTTTAGATGCTC
CTCGAAAATCACTGCTTTCGCAAATGATATAATTAGGTCATTCTAATATATTAATTAAAA
CCCAATGCAGAGTTTTGAAGGTAAAATTTAAAATAATTTTATATTTTAGAAATTGAATTA
AATAATAAATATAAAGATTTGAAATGTTACTAGAATAAAAAATGTGATATAAAGCCAACT
CTTGAACCATATAAAAGTTATAACGATATGTTCAAAGACATTTACAATTTTATAACATCC
AAAGTGTAAAACGAAGGCTTTTCTTACTCAGATATAGCAATAATAAGTGCAACAAGTTTT
CCTTTAAGGTAAATAGAATTGAAATTAGAATAGCACAATTTTAACCAGCCTGAAAAAGAA
ATACCATTTTGGAGCTTCGTTGGCAAAAACAAAGATTTTGATTACAGTTTTGAATATAAA
GGTAATAAAGTCACTTTATTAACAGCTCATAAGTCGAAAGGGTTGGAATGGAAAGCTTTA
TTTTTCATTGGAATAAATGATGATTAATTTCCAGAGGTATTTATAAGATAAGTAGGAAAC
TACAATCAAAAAATTGAAGAGATGAGGCGTTTATTTTATGTTGGATCAACAAGAGCAGCT
TAAATTTTGAAATTGAGTTATTTTTCAAACAATAACAGAAAAGTAATAAAATAAATAAAT
ACTATTTAATTTATCTATCTATTTATTTATTTATTTATCTATCTATTTATTTATTAATTT
TAAAATAATTTTAAGGCTTGTAGGTTTTTAGGTGCAATTGATAAAAATAATATTTAATTT
AAAGGTTAAACTTAAATTGCTTAAGAAAAAAATACCACAAATGCTAATCAAAAATAACTG
TTAGATAAATAAGTGAGAGAAATATTTGAAGAGATGTGTAATCCTTAGTATATTGTTTAA
CTTTAAAAAACTGAAAAGTTTCTTTAAGAAGAATAATTTTATTTAGAAGAAATTTAATAC
ATTCACAAGCCTATGTTTTCAAGAAATTAAATCTAAAAAATATTTTTCAATTAATCTGAA
GAAATCCTTTTTTCTTACATTGAAACGTAATTTTCTTATCCTATAATGAATTTTCTAATT
TTTAAATAATTAATACTCAATTTAACATTTTATCAATAAATCTAATAAAATATTATTTAT
AAATGA