Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00490560

Standard Name

UDH3 (UvrD/REP-family DNA helicase 3)

Aliases

PreTt08361 | 60.m00158

Description

UDH3 UvrD/REP family helicase; UvrD/REP helicase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• DNA binding (IEA) | GO:0003677
• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003

Biological Process

• DNA repair (IEA) | GO:0006281

Domains

• ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
• ( TIGR01075 ) DNA helicase II
• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
• ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
• ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
• ( PF02890 ) Borrelia family of unknown function
• ( TIGR02972 ) trimethylamine N-oxide reductase system, TorE

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00490560

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19668.1	7.99824663097029e-79	UvrD/REP helicase (1047 aa)
Oxytricha	Contig4754.0.g7	0.000005998506718272351	UvrD/REP helicase N-terminal d omain
SGD	YJL092W	0.00010003404299092957	SRS2 DNA helicase and DNA-depe ndent ATPase involved in DNA r epair, needed for proper timin g of commitment to meiotic rec ombination and transition from Meiosis I to II; blocks trinu cleotide repeat expansion; aff ects genome stability

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00490560(coding)
ATGGAACTTGGTAATTAATAATAAAAGCATGGGTAGTAATAAAATAACATTTTAAAGTAT
ACAAATGAGTAGCTAGAATTCATTCATGCTCCTAAAAACAGAGATATTAAGATAACTGCT
TGTGCTGGTTCTGGAAAAACATAATGTGTGCTAGAGTTTACAAAGTAAGCATTAAAGGAG
GGATTTAATCCTAAAGAAATTTGCATAACAACTTTCAATATTTAAGCAAGCAATGATATG
AAAAAAAGAGCTATTGAGTTGATGGGAAAATTTTAGGCTGATTAAATTGAAATCCTTAAC
TTTGATAAAATAATAACAAAATTTTTTAAAATGATTTAAAAATCTAAAAGCTAAAAAGAA
TTGAACAAATAAAATTAGAAAGAAAATAAAAATTAACAATCGATTGAACTGACTTTGGCT
GAAAAATAATTTCAGCTATATCAAGACTTATAAGACGAATCTCTTAGCAAGCATATCTTC
GAAAGCTATAAACTGATCATATTTGACGAATTTTAAGATATCAACTAATTGCAGTATGAA
ATCTTAATGTTATTTAAGAGAATTGGAAAATCAATCATAGTCGTTGTTGGAGATGATCTT
TAGAATATATATGAGTTTAGAGGATCAGATTATAAATTTTTAAAGTCCTAAATTATTGAA
GATATTAATAAAGAAAACAAAAAATTTTATGGAAATGAGAACTTCAACATGTTGGAATAT
AATCTTACAACTAACTTTAGATGCTCCTCGAAAATCACTGCTTTCGCAAATGATATAATT
AGGTCATTCTAATATATTAATTAAAACCCAATGCAGAGTTTTGAAGATTTGAAATGTTAC
TAGAATAAAAAATGTGATATAAAGCCAACTCTTGAACCATATAAAAGTTATAACGATATG
TTCAAAGACATTTACAATTTTATAACATCCAAAGTGTAAAACGAAGGCTTTTCTTACTCA
GATATAGCAATAATAAGTGCAACAAGTTTTCCTTTAAGGTAAATAGAATTGAAATTAGAA
TAGCACAATTTTAACCAGCCTGAAAAAGAAATACCATTTTGGAGCTTCGTTGGCAAAAAC
AAAGATTTTGATTACAGTTTTGAATATAAAGGTAATAAAGTCACTTTATTAACAGCTCAT
AAGTCGAAAGGGTTGGAATGGAAAGCTTTATTTTTCATTGGAATAAATGATGATTAATTT
CCAGAGGTATTTATAAGATAAGTAGGAAACTACAATCAAAAAATTGAAGAGATGAGGCGT
TTATTTTATGTTGGATCAACAAGAGCAGCTTAAATTTTGAAATTGAGTTATTTTTCAAAC
AATAACAGAAAAGCTTGTAGGTTTTTAGGTGCAATTGATAAAAATAATATTTAATTTAAA
GGTTAAACTTAAATTGCTTAAGAAAAAAATACCACAAATGCTAATCAAAAATAACTGTTA
GATAAATAAGTGAGAGAAATATTTGAAGAGATGTGTAATCCTTAGTATATTGTTTAACTT
TAAAAAACTGAAAAGTTTCTTTAAGAAGAATAATTTTATTTAGAAGAAATTTAATACATT
CACAAGCCTATGTTTTCAAGAAATTAAATCTAAAAAATATTTTTCAATTAATCTGAAGAA
ATCCTTTTTTCTTACATTGAAACGTAATTTTCTTATCCTATAATGAATTTTCTAATTTTT
AAATAATTAATACTCAATTTAACATTTTATCAATAAATCTAATAAAATATTATTTATAAA
TGA

>TTHERM_00490560(protein)
MELGNQQQKHGQQQNNILKYTNEQLEFIHAPKNRDIKITACAGSGKTQCVLEFTKQALKE
GFNPKEICITTFNIQASNDMKKRAIELMGKFQADQIEILNFDKIITKFFKMIQKSKSQKE
LNKQNQKENKNQQSIELTLAEKQFQLYQDLQDESLSKHIFESYKLIIFDEFQDINQLQYE
ILMLFKRIGKSIIVVVGDDLQNIYEFRGSDYKFLKSQIIEDINKENKKFYGNENFNMLEY
NLTTNFRCSSKITAFANDIIRSFQYINQNPMQSFEDLKCYQNKKCDIKPTLEPYKSYNDM
FKDIYNFITSKVQNEGFSYSDIAIISATSFPLRQIELKLEQHNFNQPEKEIPFWSFVGKN
KDFDYSFEYKGNKVTLLTAHKSKGLEWKALFFIGINDDQFPEVFIRQVGNYNQKIEEMRR
LFYVGSTRAAQILKLSYFSNNNRKACRFLGAIDKNNIQFKGQTQIAQEKNTTNANQKQLL
DKQVREIFEEMCNPQYIVQLQKTEKFLQEEQFYLEEIQYIHKPMFSRNQIQKIFFNQSEE
ILFSYIETQFSYPIMNFLIFKQLILNLTFYQQIQQNIIYK

>TTHERM_00490560(gene)
ATGGAACTTGGTAATTAATAATAAAAGCATGGGTAGTAATAAAATAACATTTTAAAGTAT
ACAAATGAGTAGCTAGAATTCATTCATGCTCCTAAAAACAGAGATATTAAGATAACTGCT
TGTGCTGGTTCTGGAAAAACATAATGTGTGCTAGAGTTTACAAAGTAAGCATTAAAGGAG
GGATTTAATCCTAAAGAAATTTGCATAACAACTTTCAATATTTAAGCAAGCAATGATATG
AAAAAAAGAGCTATTGAGTTGATGGGAAAATTTTAGGCTGATTAAATTGAAATCCTTAAC
TTTGATAAAATAATAACAAAATTTTTTAAAATGATTTAAAAATCTAAAAGCTAAAAAGAA
TTGAACAAATAAAATTAGAAAGAAAATAAAAATTAACAATCGATTGAACTGACTTTGGCT
GAAAAATAATTTCAGCTATATCAAGACTTATAAGACGAATCTCTTAGCAAGCATATCTTC
GAAAGCTATAAACTGATCATATTTGACGAATTTTAAGATATCAACTAATTGCAGTATGAA
ATCTTAATGTTATTTAAGAGAATTGGAAAATCAATCATAGTCGTTGTTGGTATAAATAAA
AATATTATTAAATTAATTAATTAATTAATTTTTTTGTGATTTTATAGGAGATGATCTTTA
GAATATATATGAGTTTAGAGGATCAGATTATAAATTTTTAAAGTCCTAAATTATTGAAGA
TATTAATAAAGAAAACAAAAAATTTTATGGAAATGAGAACTTCAACATGTTGGAATATAA
TCTTACAACTAACTTTAGATGCTCCTCGAAAATCACTGCTTTCGCAAATGATATAATTAG
GTCATTCTAATATATTAATTAAAACCCAATGCAGAGTTTTGAAGGTAAAATTTAAAATAA
TTTTATATTTTAGAAATTGAATTAAATAATAAATATAAAGATTTGAAATGTTACTAGAAT
AAAAAATGTGATATAAAGCCAACTCTTGAACCATATAAAAGTTATAACGATATGTTCAAA
GACATTTACAATTTTATAACATCCAAAGTGTAAAACGAAGGCTTTTCTTACTCAGATATA
GCAATAATAAGTGCAACAAGTTTTCCTTTAAGGTAAATAGAATTGAAATTAGAATAGCAC
AATTTTAACCAGCCTGAAAAAGAAATACCATTTTGGAGCTTCGTTGGCAAAAACAAAGAT
TTTGATTACAGTTTTGAATATAAAGGTAATAAAGTCACTTTATTAACAGCTCATAAGTCG
AAAGGGTTGGAATGGAAAGCTTTATTTTTCATTGGAATAAATGATGATTAATTTCCAGAG
GTATTTATAAGATAAGTAGGAAACTACAATCAAAAAATTGAAGAGATGAGGCGTTTATTT
TATGTTGGATCAACAAGAGCAGCTTAAATTTTGAAATTGAGTTATTTTTCAAACAATAAC
AGAAAAGTAATAAAATAAATAAATACTATTTAATTTATCTATCTATTTATTTATTTATTT
ATCTATCTATTTATTTATTAATTTTAAAATAATTTTAAGGCTTGTAGGTTTTTAGGTGCA
ATTGATAAAAATAATATTTAATTTAAAGGTTAAACTTAAATTGCTTAAGAAAAAAATACC
ACAAATGCTAATCAAAAATAACTGTTAGATAAATAAGTGAGAGAAATATTTGAAGAGATG
TGTAATCCTTAGTATATTGTTTAACTTTAAAAAACTGAAAAGTTTCTTTAAGAAGAATAA
TTTTATTTAGAAGAAATTTAATACATTCACAAGCCTATGTTTTCAAGAAATTAAATCTAA
AAAATATTTTTCAATTAATCTGAAGAAATCCTTTTTTCTTACATTGAAACGTAATTTTCT
TATCCTATAATGAATTTTCTAATTTTTAAATAATTAATACTCAATTTAACATTTTATCAA
TAAATCTAATAAAATATTATTTATAAATGA