Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00864890
Standard Name
UDH12 (UvrD/REP-family DNA helicase 12)
Aliases
PreTt29119 | 154.m00077 | 3751.m00423 | REP4
Description
UDH12 UvrD/REP helicase family protein; UvrD/REP helicase family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00864890
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_19668.1 9.997093137033517e-262 UvrD/REP helicase (1047 aa)
Oxytricha Contig981.0.0.g23 0.000000009996807949091551 UvrD/REP helicase N-terminal d
omain
SGD YJL092W 0.0000007001298633766835 SRS2 DNA helicase and DNA-depe
ndent ATPase involved in DNA r
epair, needed for proper timin
g of commitment to meiotic rec
ombination and transition from
Meiosis I to II; blocks trinu
cleotide repeat expansion; aff
ects genome stability
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:23884606 : Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79
Sequences
>TTHERM_00864890(coding)ATG CTG AAT AAC TAA AAT GAT TAT AAA GTT ATT AAA TAC AAA AAT AAA TTT GGT GAG GAT TGC GAA CTA AGG CCA AGT GAA GAG TAA TTG AAA ATT ATT ACA TCA GAA TTA AGG CAA GAT CAA AAG ATT ATT GCG TGT GCT GGT TCT GGA AAA ACT ACT ACT TTA GTT GCT AGA CTT AAA TAT TTG ATA GAT CAC GGT GTT TCA CCT GAA TCA ATC ATC ATT AGT ACT TTC AAT GTA GAA GCT GGA AGA AAT ATT CAA AGT AGA GCG ATG GAA TTG ATT GGA GAA TAA TCT GCT AAA AAA TTA GAT ATT GGA AAT ATT GAT AAA ATA GCT TTC CGT CTT TAT TTT TAA TAT ATA AAA AAT AGC TAA AAT GCT TAG TTT AAG CAG TTT GGG CTT AGT GTG AAA GAG TAT TGT TAT GAA TTA TTT AAG TTT TTA TAA ACA AGA GAT GGA ATA AAA TAT GTT TTA GAC AGA TAT AAA TAT TTC TTT TTT GAT GAG TTT TAA GAT GTT AAT TAA CTA CAA TAT GAT ATA TTG ATG CTA TTT AAA AAG CAT GGA TGC TTC TTA GTT GTT ATA GGG GAT GAT GCT TAA AAT ATA TAT GGA TGG AGA GAT TCG AGA ATA GAT ATT ATA TAA ACA AGA ATC GAT GAG GAT ATT AAA AAG TTT TAG GGA GCT CAC ATT AAA ACA TAT ATG CTT TCT ACT AAC TAT AGA TGC TCA AAA CCT ATC ACT TTA TTT TCT AAT TCT ATT ATA GCT ACT TCT AAA AAT TTG ATT TAA AAA AGT ATG AGA TAT TTA GTC AAA GAA GAA GGA GTG ATT GAA CTT AAA CCA TAC TTG TAA TGC TTT AAA GGA TTA TAT AAT TAG AAT GAA GAA ATA ATC TCT CAG ATA AAA AGT AAA CTT AAA AGA TAT TAA CTA AAA GAT ATA GCT ATA TTA TGC TCA ACA AAT TAG CCA CTC AAG TTT TTT GAA GAG GCT CTT GAA AAG CAT AAC GAA AAA AGC AGT TTA AAA CTG AAT TAT ATG AGT ATG ATA GGC AAT AAC TCC AGT ATT TAT GGA GGT AAA ACC AAC TAA AGC GAA CTA TTA AAA TAA GAT AGA ATT ACT TTA AGC ACT ATA CAT AGG GCA AAA GGT CTC GAA TGG AAA GTG GTA TTT TTC ATT GGT GTA AAT GAT GAG TTT TTT CCT AAT AAC TTC CTA AGA GAT CCT TCC AAC TCT CTT ACC AGA TTA GAA GAA TGT AGA AGA TTG TTT TAT GTA GGA GCT ACA AGA GCC ATA AAT GAA CTT TAT TTC GCT ATG GTT AAA AAT AAT AAA TGT CAT AAA GTA TGT AGA TTT TTT AGT GGA ATC AAT GCA GAA TTA TAT GAA AGA GAT ATA GAT ATT ACA GAT AAT GAT ATG ATA GTC GAA GAA GAA AAT ATA AAA AAG GAT TTT GAA AGA GAT GTC TAA GTG ACT AAA ATC ATA GAG CAG ATG GAC CAC AAA GAT TTA AGT GAA GCT GAT TAA TTT TTA TAA AAT GTG GAG GAA TTA GAA ATT CGT TAA ATA CAT CCA AAG AGC AAT TTA AAT GAA TCT GAA ATA AGA AAT AAT AAC TTG TTT GTA GAT TTA GGT TTA TAT ATC GAC TTG CTA ATA TAA AGA ACT CTT GCA GAA TAG CTC AAT GCT GAA AAC GGT TAC TCT TAT GAA TAT GCT TAG ATA GTT CTA TTT TCT ATT TTT TGG AGA TCA GAT AAG GCA GAA TTT ATT TCA AAA TAT AGC ACT TTT TTT AAC AAT AAA ATG CTT GAT TTC TCC GAT ATT GAA GAT GAA GAG GAT TTC ATA GAG GCA TTC AAT TTA TTC TAT AAA TTT GGA AAA GTA GAT AGA ATT TAG TAA AAC ATA AAA CTC AAT GGA TTT GAA ATT TAA ACC CTT AGT ACT ATT TAC TAA ATA TTG AAA GAG TAT ACA CAA AAA TAC AAT ATA GAA TAC AGT GTT ATC ACT CAC TAA GTC GAG GAA TTA AAT GCC ATA GCT AAA GAG TAT TTT CCT GAA GAT TAT AAT AAA GAA CCT TAT ATG AAT AGT TAT AAA AAG TTT ATG AAT CCT TAA TTA AAA TGT AAC AAT ATA CTT TTT GAT ATT TAT TAA GTC AGT AAA TGT GGT CAG TTA TTT GAT ATG ACT AGG AGA GTC CTT TAT AGG AAT GAT TTT TAA ACT CTG AAC CCT AAA AAT ATT TAA GAT AAC TTG AAT AAT TTT GTA AAA TAC CTT TAA TCT TTT AAC TAT GAG AAG ATA AAA GTA AAA TCA GTC ATA ACT CAT GGC TTA AAC TTA AAA GGA GAA ATA GAT TTA CTA GCA GAT GAT ACA ATA TAT GAA ATA AAG GCT TCT TAG TTT TAA TCT ATC TCA AAG GAG TAT ATT CTC TAA GTA AAT ACT AAT TTT TTT CTT TTT ATT TTT TAG TTT TTA AAT TTA CTT TTT TAG GTT TTA GCC TAT GCA GCT TTG CTT AGG GTT GCA CAA AAT GTA GAA GTC AAT CAT ATT GTA TTT TAT AAC CCT TTA ATT GGA AAG ATA TAT AAA TAT AGT ATC TCT AAT TGG CCT TAT GCT TAG TAA TAC ATT AAA TTC TTA ACT GAT AAA TCA CTG TAA CTA GCT AAT TCA AAG AAA AAA GTA CTT GAA CAA AGT GAG GCT GAA GAA AAA TAA CAA CTA GTT AAC TTG AAT CAA AAT AAA GCA AAT AAT TCT CAG TAA AAT AAT AAC TAA GAT AAG ACC TAG GAC ACA AAT AGT CAA ACT ACT AAT TTT AAT GAA ATT GGT GAT TTA ATT TAG TAA AAA CTT CAG GAG GAA AAA TTA TAG TCG AAG CCA TTA TTT AAT GTA TCT GAA TTC AGC TAA CCA TAA AAC AGG CCA AGA TCT CTA TTT ACA AAA CAA ACT GTT TCA ATA AAA TCA TCA ACT GAA TAA AAA AGC ACA AGC ACT GTA TCT GGA TAT AGA AAT TAG GTT CCA GAT TAG GGA GAA AAC AAA AAG CCA AAA AAT GTT TAT AGA GAC TTT AAG AAA TTT GTA AAG AAT GAA TAA ATT GCA TTA TTA AAA TAA AAT ATA AAA TAA ACT AAA ATA ATT GTA GAA AGT GAT CAA AGC TCT GAA AAC GAT GAC ATA GAA GAA TAT TCT TCT CTT AAT ATC AAA AAA ATT AGC AAA AAT TAA ATT TCT AGT TCT AAT CTA TAA AAA AAT GTA CTT CCG AAA TCT ACT CAG AAT ATT TTA TCA TAA TTA GAT GAT ATT GAA GAA GTT TCT TCC AAA TTT ATA TAA ATA GAC TGA >TTHERM_00864890(protein)M L N N Q N D Y K V I K Y K N K F G E D C E L R P S E E Q L K I I T S E L R Q D Q K I I A C A G S G K T T T L V A R L K Y L I D H G V S P E S I I I S T F N V E A G R N I Q S R A M E L I G E Q S A K K L D I G N I D K I A F R L Y F Q Y I K N S Q N A Q F K Q F G L S V K E Y C Y E L F K F L Q T R D G I K Y V L D R Y K Y F F F D E F Q D V N Q L Q Y D I L M L F K K H G C F L V V I G D D A Q N I Y G W R D S R I D I I Q T R I D E D I K K F Q G A H I K T Y M L S T N Y R C S K P I T L F S N S I I A T S K N L I Q K S M R Y L V K E E G V I E L K P Y L Q C F K G L Y N Q N E E I I S Q I K S K L K R Y Q L K D I A I L C S T N Q P L K F F E E A L E K H N E K S S L K L N Y M S M I G N N S S I Y G G K T N Q S E L L K Q D R I T L S T I H R A K G L E W K V V F F I G V N D E F F P N N F L R D P S N S L T R L E E C R R L F Y V G A T R A I N E L Y F A M V K N N K C H K V C R F F S G I N A E L Y E R D I D I T D N D M I V E E E N I K K D F E R D V Q V T K I I E Q M D H K D L S E A D Q F L Q N V E E L E I R Q I H P K S N L N E S E I R N N N L F V D L G L Y I D L L I Q R T L A E Q L N A E N G Y S Y E Y A Q I V L F S I F W R S D K A E F I S K Y S T F F N N K M L D F S D I E D E E D F I E A F N L F Y K F G K V D R I Q Q N I K L N G F E I Q T L S T I Y Q I L K E Y T Q K Y N I E Y S V I T H Q V E E L N A I A K E Y F P E D Y N K E P Y M N S Y K K F M N P Q L K C N N I L F D I Y Q V S K C G Q L F D M T R R V L Y R N D F Q T L N P K N I Q D N L N N F V K Y L Q S F N Y E K I K V K S V I T H G L N L K G E I D L L A D D T I Y E I K A S Q F Q S I S K E Y I L Q V N T N F F L F I F Q F L N L L F Q V L A Y A A L L R V A Q N V E V N H I V F Y N P L I G K I Y K Y S I S N W P Y A Q Q Y I K F L T D K S L Q L A N S K K K V L E Q S E A E E K Q Q L V N L N Q N K A N N S Q Q N N N Q D K T Q D T N S Q T T N F N E I G D L I Q Q K L Q E E K L Q S K P L F N V S E F S Q P Q N R P R S L F T K Q T V S I K S S T E Q K S T S T V S G Y R N Q V P D Q G E N K K P K N V Y R D F K K F V K N E Q I A L L K Q N I K Q T K I I V E S D Q S S E N D D I E E Y S S L N I K K I S K N Q I S S S N L Q K N V L P K S T Q N I L S Q L D D I E E V S S K F I Q I D >TTHERM_00864890(gene)ATG CTG AAT AAC TAA AAT GAT TAT AAA GTT ATT AAA TAC AAA AAT AAA TTT GGT GAG GAT TGC GAA CTA AGG CCA AGT GAA GAG TAA TTG AAA ATT ATT ACA TCA GAA TTA AGG CAA GAT CAA AAG ATT ATT GCG TGT GCT GGT TCT GGA AAA ACT ACT ACT TTA GTT GCT AGA CTT AAA TAT TTG ATA GAT CAC GGT GTT TCA CCT GAA TCA ATC ATC ATT AGT ACT TTC AAT GTA GAA GCT GGA AGA AAT ATT CAA AGT AGA GCG ATG GAA TTG ATT GGA GAA TAA TCT GCT AAA AAA TTA GAT ATT GGA AAT ATT GAT AAA ATA GCT TTC CGT CTT TAT TTT TAA TAT ATA AAA AAT AGC TAA AAT GCT TAG TTT AAG CAG TTT GGG CTT AGT GTG AAA GAG TAT TGT TAT GAA TTA TTT AAG TTT TTA TAA ACA AGA GAT GGA ATA AAA TAT GTT TTA GAC AGA TAT AAA TAT TTC TTT TTT GAT GAG TTT TAA GAT GTT AAT TAA CTA CAA TAT GAT ATA TTG ATG CTA TTT AAA AAG CAT GGA TGC TTC TTA GTT GTT ATA GGT AAA TTA ATC ATT AAA AAG TCT TAA AAT ATC TCA TTT ATA TTT TGA AGA TAA AAG AAC AAG CAT AAA ATA ATA TAT TCT AAA TAA ATA AAA GTG TTT AAT TAA TTA ATT GTT TTA TTA GGG GAT GAT GCT TAA AAT ATA TAT GGA TGG AGA GAT TCG AGA ATA GAT ATT ATA TAA ACA AGA ATC GAT GAG GAT ATT AAA AAG TTT TAG GGA GCT CAC ATT AAA ACA TAT ATG CTT TCT ACT AAC TAT AGA TGC TCA AAA CCT ATC ACT TTA TTT TCT AAT TCT ATT ATA GCT ACT TCT AAA AAT TTG ATT TAA AAA AGT ATG AGA TAT TTA GTC AAA GAA GAA GGT AAA TAA TAT CTA TTA GTT GAG TAG AAT TAA AAA AAT AAA ACC CTT TTT TAA TTA ATA ATA GGA GTG ATT GAA CTT AAA CCA TAC TTG TAA TGC TTT AAA GGA TTA TAT AAT TAG AAT GAA GAA ATA ATC TCT CAG ATA AAA AGT AAA CTT AAA AGA TAT TAA CTA AAA GAT ATA GCT ATA TTA TGC TCA ACA AAT TAG CCA CTC AAG TTT TTT GAA GAG GCT CTT GAA AAG CAT AAC GAA AAA AGC AGT TTA AAA CTG AAT TAT ATG AGT ATG ATA GGC AAT AAC TCC AGT ATT TAT GGA GGT AAA ACC AAC TAA AGC GAA CTA TTA AAA TAA GAT AGA ATT ACT TTA AGC ACT ATA CAT AGG GCA AAA GGT CTC GAA TGG AAA GTG GTA TTT TTC ATT GGT GTA AAT GAT GAG TTT TTT CCT AAT AAC TTC CTA AGA GAT CCT TCC AAC TCT CTT ACC AGA TTA GAA GAA TGT AGA AGA TTG TTT TAT GTA GGA GCT ACA AGA GCC ATA AAT GAA CTT TAT TTC GCT ATG GTT AAA AAT AAT AAA TGT CAT AAA GTA AAA GCA TAA TAA ATT AAT TAT TTA AAA AGC ATT CAT TCA AAA AAA TAA ATA TAA ATA AAA AGG TAT GTA GAT TTT TTA GTG GAA TCA ATG CAG AAT TAT ATG AAA GAG ATA TAG ATA TTA CAG ATA ATG ATA TGA TAG TCG AAG AAG GTA TCT AAT ATT TCA TTT TTT TAT GTT TTA AAG AGA CAT TTA AAG TTT AAC TTT TAG ATT TTA AAA TGA AAT AAT CTA ATT TAA TTT AAT TAA TTT TGA AAA AAA TTT CCA AAA AAT TAT TAA CTT TTA TGA AGA AAA TAT AAA AAA GGA TTT TGA AAG AGA TGT CTA AGT GAC TAA AAT CAT AGA GCA GAT GGA CCA CAA AGA TTT AAG TGA AGC TGA TTA ATT TTT ATA AAA TGT GGA GGA ATT AGA AAT TCG TTA AAT ACA TCC AAA GAG CAA TTT AAA TGA ATC TGA AAT AAG AAA TAA TAA CTT GTT TGT AGA TTT AGG TTT ATA TAT CGA CTT GTA GTT TAT CTT TAT TGT TAT ATA TTT TTG ATT TCT TTC TAT TAT AAA ATT TAG GCT AAT ATA AAG AAC TCT TGC AGA ATA GCT CAA TGC TGA AAA CGG TTA CTC TTA TGA ATA TGC TTA GAT AGT TCT ATT TTC TAT TTT TTG GAG ATC AGA TAA GGC AGA ATT TAT TTC AAA ATA TAG CAC TTT TTT TAA CAA TAA AAT GCT TGA TTT CTC CGA TAT TGA AGA TGA AGA GGA TTT CAT AGA GGC ATT CAA TTT ATT CTA TAA ATT TGG AAA AGT AGA TAG AAT TTA GTA AAA CAT AAA ACT CAA TGG ATT TGA AAT TTA AAC CCT TAG TAC TAT TTA CTA AAT ATT GAA AGA GTA TAC ACA AAA ATA CAA TAT AGA ATA CAG GTA GGA TTT TAT TTG AAT TAA TTT ATT TTT ATT ACT TTT TAA TGT TAT TTT TAT TTA GTG TTA TCA CTC ACT AAG TCG AGG AAT TAA ATG CCA TAG CTA AAG AGT ATT TTC CTG AAG ATT ATA ATA AAG AAC CTT ATA TGA ATA GTT ATA AAA AGT TTA TGA ATC CTT AAT TAA AAT GTA ACA ATA TAC TTT TTG ATA TTT ATT AAG TCA GTA AAT GTG GTC AGT TAT TTG ATA TGA CTA GGA GAG TCC TTT ATA GGA ATG ATT TTT AAA CTC TGA ACC CTA AAA ATA TTT AAG ATA ACT TGA ATA ATT TTG TAA AAT ACC TTT AAT CTT TTA ACT ATG AGA AGA TAA AAG TAA AAT CAG TCA TAA CTC ATG GCT TAA ACT TAA AAG GAG AAA TAG ATT TAC TAG CAG ATG ATA CAA TAT ATG AAA TAA AGG CTT CTT AGT TTT AAT CTA TCT CAA AGG AGT ATA TTC TCT AAG TAA ATA CTA ATT TTT TTC TTT TTA TTT TTT AGT TTT TAA ATT TAC TTT TTT AGG TTT TAG CCT ATG CAG CTT TGC TTA GGG TTG CAC AAA ATG TAG AAG TCA ATC ATA TTG TAT TTT ATA ACC CTT TAA TTG GAA AGA TAT ATA AAT ATA GTA TCT CTA ATT GGC CTT ATG CTT AGT AAT ACA TTA AAT TCT TAA CTG ATA AAT CAC TGT AAC TAG CTA ATT CAA AGA AAA AAG TAC TTG AAC AAA GTG AGG CTG AAG AAA AAT AAC AAC TAG TTA ACT TGA ATC AAA ATA AAG CAA ATA ATT CTC AGT AAA ATA ATA ACT AAG ATA AGA CCT AGG ACA CAA ATA GTC AAA CTA CTA ATT TTA ATG AAA TTG GTG ATT TAA TTT AGT AAA AAC TTC AGG AGG AAA AAT TAT AGT CGA AGC CAT TAT TTA ATG TAT CTG AAT TCA GCT AAC CAT AAA ACA GGC CAA GAT CTC TAT TTA CAA AAC AAA CTG TTT CAA TAA AAT CAT CAA CTG AAT AAA AAA GCA CAA GCA CTG TAT CTG GAT ATA GAA ATT AGG TTC CAG ATT AGG GAG AAA ACA AAA AGC CAA AAA ATG TTT ATA GAG ACT TTA AGA AAT TTG TAA AGA ATG AAT AAA TTG CAT TAT TAA AAT AAA ATA TAA AAT AAA CTA AAA TAA TTG TAG AAA GTG ATC AAA GCT CTG AAA ACG ATG ACA TAG AAG AAT ATT CTT CTC TTA ATA TCA AAA AAA TTA GCA AAA ATT AAA TTT CTA GTT CTA ATC TAT AAA AAA ATG TAC TTC CGA AAT CTA CTC AGA ATA TTT TAT CAT AAT TAG ATG ATA TTG AAG AAG TTT CTT CCA AAT TTA TAT AAA TAG ACT GA