Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00888060Standard Name
UDH11 (UvrD/REP-family DNA helicase 11)Aliases
PreTt23316 | 158.m00072Description
UvrD/REP helicase family proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Biological Process
- DNA repair (IEA) | GO:0006281
Domains
- ( PF00580 ) UvrD/REP helicase
- ( TIGR01075 ) DNA helicase II
- ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
- ( TIGR01074 ) ATP-dependent DNA helicase Rep
- ( TIGR01073 ) ATP-dependent DNA helicase PcrA
- ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
- ( PF03205 ) Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00888060
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_19668.1 7.002185723491005e-79 UvrD/REP helicase (1047 aa)
Oxytricha Contig18155.0.g48 0.00000008001913847069386 UvrD/REP helicase N-terminal d
omain
SGD YOL095C 0.0000007001298633766835 HMI1 Mitochondrial inner membr
ane localized ATP-dependent DN
A helicase, required for the m
aintenance of the mitochondria
l genome; not required for mit
ochondrial transcription; has
homology to E. coli helicase u
vrD
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00888060(coding)
ATGGAAGATAAAAATATCAAGAATAAATCATTTGAATATACTTAGTAGTAAAAAGAGTTT
ATTTATGCATCTAAAAGAAGAGATATCAAGGTAACTGCTTGCGCTGGATCTGGAAAAACT
TAATGTGTTCTTATGTATGTAAAAGAGGCCATAGATGAAGGATTTGATCCTTCTGCTATC
TGTATCACAACTTTTAATATTTAAGCCAGCAATGATATGAAAAAGAGAGCAGTATAGTTA
ATAGGAAAAGACAAAGCTGATAAAATCGAAATCACTAATATTGATAAGCTAATTACTAAG
CTCTTTAATAGTATTTAGAGAGCAAAAAAACAAAAAGATAATGAAAAATAAAAAAATGAA
ATTGAAAAAGAATTATTAATAGATATCACTTTAGTTGAAAAACAAAGCTAAGTTTATGAA
GATTTGTAAGATTTGTCTCTTAGTAAAGAGATTTTTGAAAAGTACAAAATTATTATTTTC
GATGAATTTTAAGACATAAACTAATTATAATATGACATATTTATGCTCTTTAAAAAAATT
GGAGAATCAATTTTGGTAGTCGTTGGAGATGATGCTTAGAATATTTACGAGTTCAGAGGA
TCAAATTATGAATTCTTGAGATCTAAAGTAATTGAAGATGTAAACAGAGAAAACAAAAGA
ATTTATGGCAGTGAAGATTACACCATGCTTGACATTAAGCTCACAACTAATTTTAGATGC
TCTTCAAAGATTACTAAGTTTGCAAATGACATTATTAAATCTTTTAATATTATCTAGTAA
AATACAATGTAGAGCTATGAAGACTTAGAGGGATACAAAAACGAGAAAAGCTAGGTAAAA
CCAACCCTGGAATCATATAAAAGCTATAATGATTAGTTTAATAGTATTTTAACTTAAATA
TAAACTTTCATAAACTAAGGTTATAGTTATGAGGATATTGCTATTATTTGCCCTAAAGGA
TCACTCTTGAGAGATATAGAATACAAATTAGAAAAGCATAATAGTTTTAAATCAGATTAA
ATACCTTTTTGGAGTTTCATAGGAAAAAATAATGATTTTGATTTTAAATATGAATACAAA
GGAAATAAAGTTACTTTATTGACTATACACAAATCTAAGGGATTAGAATGGAAAGTTTTG
TTTTTCGTCGGACTAAATGATGATTAATTTCCAAAGGCTTTTTTGAAATAAAAAAATAAC
TAGGATCGTTAAATAGAAGAAATGACACGTTTGTTCTATGTTGGATCAACAAGAGCAGCT
AAAATTCTTAATATGAGTTACTTTTCATATCCTTAGAGATGTGCTTGCAGATTTTTGAGC
AAAATAAACGAAAATTACATGGAATTTAAAGGAGATATTGCTATTTTTGATGGAAAATAA
TGCAACCCAATTTTGTCATCTATTTTAAAAAGCTAAGATTCGAATTATAATAATGTTAAT
AATTCAGGTAAATAAATAAGTGAAATTTTTGAAGAAATGAGCAATGCTTAACACTTAAAA
GAACTAGAGTTTTCTTAAAAAAAATATCTTTAAGAAAAATATTTTGAGCTAGAAGAAGTA
TACAAAGTACATGAACAAATGTTTACTAAATAATAAATATAAAACTTCTTTTTCCATTAA
TCAGTAGAGTTATTGTTTACTTACTTAGAAACAATTACTTTATGGATTATGTAACATGAA
GTCAAAATAGAGTCTAGATCGTTAATTCTAAATGAATAGAAAATTTAAATAGATTAGCTA
TCTGCAAATTCAAAAAAGCTTTAAATCTCTGAATTATAAATTTAATCTTTTAAAAATGCA
TTCATATAATTTTTAAAAATTGATAAAAAAACAAATCAAAGTGAAGAACTAATTGAAGCT
TTTTTCAAAGTTTCTCTTTTATATGAAATTTCAAAAAGTAAAAATCAGATCTATAAATAT
CTTTATAAAAAGAACATTTTTTCTTCTTTGACTAAAACTCCAATTATAGAATGCTTAGAT
CTATTTGTTAAGTATGTGAAGACATAAGAAAGTGAGGAAATTCTTATATTAGATAAGATA
TAAGATAAATCTGATTTTGATCCTGATAGAACTTTTGATTATTTTACTATATCAGGCAAA
GAAACTCTTTATGAAATCAGTTAATCATTCAAAAAAACTAAGAAAATACAAAAACAAGTT
ATGTTAACAGTTTTAGCCAAAATTTCAATATTGAAGAAGAAATATGGTAAAGATATCAAA
AAAGTCAAGTTTTATAATCCTATAAAAGGAACGGTTTTTTCAGTTTTGATAAAAGATTGG
TAACTTCATTCAGACTTTATAGATTTTATGGAGAAATTTAATGAAAAACTTAAAAACCCT
TAGTAAACAAATTGA>TTHERM_00888060(protein)
MEDKNIKNKSFEYTQQQKEFIYASKRRDIKVTACAGSGKTQCVLMYVKEAIDEGFDPSAI
CITTFNIQASNDMKKRAVQLIGKDKADKIEITNIDKLITKLFNSIQRAKKQKDNEKQKNE
IEKELLIDITLVEKQSQVYEDLQDLSLSKEIFEKYKIIIFDEFQDINQLQYDIFMLFKKI
GESILVVVGDDAQNIYEFRGSNYEFLRSKVIEDVNRENKRIYGSEDYTMLDIKLTTNFRC
SSKITKFANDIIKSFNIIQQNTMQSYEDLEGYKNEKSQVKPTLESYKSYNDQFNSILTQI
QTFINQGYSYEDIAIICPKGSLLRDIEYKLEKHNSFKSDQIPFWSFIGKNNDFDFKYEYK
GNKVTLLTIHKSKGLEWKVLFFVGLNDDQFPKAFLKQKNNQDRQIEEMTRLFYVGSTRAA
KILNMSYFSYPQRCACRFLSKINENYMEFKGDIAIFDGKQCNPILSSILKSQDSNYNNVN
NSGKQISEIFEEMSNAQHLKELEFSQKKYLQEKYFELEEVYKVHEQMFTKQQIQNFFFHQ
SVELLFTYLETITLWIMQHEVKIESRSLILNEQKIQIDQLSANSKKLQISELQIQSFKNA
FIQFLKIDKKTNQSEELIEAFFKVSLLYEISKSKNQIYKYLYKKNIFSSLTKTPIIECLD
LFVKYVKTQESEEILILDKIQDKSDFDPDRTFDYFTISGKETLYEISQSFKKTKKIQKQV
MLTVLAKISILKKKYGKDIKKVKFYNPIKGTVFSVLIKDWQLHSDFIDFMEKFNEKLKNP
QQTN>TTHERM_00888060(gene)
ATGGAAGATAAAAATATCAAGAATAAATCATTTGAATATACTTAGTAGTAAAAAGAGTTT
ATTTATGCATCTAAAAGAAGAGATATCAAGGTAACTGCTTGCGCTGGATCTGGAAAAACT
TAATGTGTTCTTATGTATGTAAAAGAGGCCATAGATGAAGGATTTGATCCTTCTGCTATC
TGTATCACAACTTTTAATATTTAAGCCAGCAATGATATGAAAAAGAGAGCAGTATAGTTA
ATAGGAAAAGACAAAGCTGATAAAATCGAAATCACTAATATTGATAAGCTAATTACTAAG
CTCTTTAATAGTATTTAGAGAGCAAAAAAACAAAAAGATAATGAAAAATAAAAAAATGAA
ATTGAAAAAGAATTATTAATAGATATCACTTTAGTTGAAAAACAAAGCTAAGTTTATGAA
GATTTGTAAGATTTGTCTCTTAGTAAAGAGATTTTTGAAAAGTACAAAATTATTATTTTC
GATGAATTTTAAGACATAAACTAATTATAATATGACATATTTATGCTCTTTAAAAAAATT
GGAGAATCAATTTTGGTAGTCGTTGGTATTATTCTATTTATTTTAGTTACATCAATAATT
GACTTAAACTTTAAATGAAAAATAGGAGATGATGCTTAGAATATTTACGAGTTCAGAGGA
TCAAATTATGAATTCTTGAGATCTAAAGTAATTGAAGATGTAAACAGAGAAAACAAAAGA
ATTTATGGCAGTGAAGATTACACCATGCTTGACATTAAGCTCACAACTAATTTTAGATGC
TCTTCAAAGATTACTAAGTTTGCAAATGACATTATTAAATCTTTTAATATTATCTAGTAA
AATACAATGTAGAGCTATGAAGGTAAATTTATTTTCTAGATTAAAAACTAATTTAATTCA
ATTCACAAAAGACTTAGAGGGATACAAAAACGAGAAAAGCTAGGTAAAACCAACCCTGGA
ATCATATAAAAGCTATAATGATTAGTTTAATAGTATTTTAACTTAAATATAAACTTTCAT
AAACTAAGGTTATAGTTATGAGGATATTGCTATTATTTGCCCTAAAGGATCACTCTTGAG
AGATATAGAATACAAATTAGAAAAGCATAATAGTTTTAAATCAGATTAAATACCTTTTTG
GAGTTTCATAGGAAAAAATAATGATTTTGATTTTAAATATGAATACAAAGGAAATAAAGT
TACTTTATTGACTATACACAAATCTAAGGGATTAGAATGGAAAGTTTTGTTTTTCGTCGG
ACTAAATGATGATTAATTTCCAAAGGCTTTTTTGAAATAAAAAAATAACTAGGATCGTTA
AATAGAAGAAATGACACGTTTGTTCTATGTTGGATCAACAAGAGCAGCTAAAATTCTTAA
TATGAGTTACTTTTCATATCCTTAGAGATGTGTAATAAATAATTCTATTTTACAATTTTA
CTCACTCACTTATTATATAAAAATTAGGCTTGCAGATTTTTGAGCAAAATAAACGAAAAT
TACATGGAATTTAAAGGAGATATTGCTATTTTTGATGGAAAATAATGCAACCCAATTTTG
TCATCTATTTTAAAAAGCTAAGATTCGAATTATAATAATGTTAATAATGTAAAATAATCT
AATTTAAATTATTGGATAAAAATCATAATAAAATTATTAGTCAGGTAAATAAATAAGTGA
AATTTTTGAAGAAATGAGCAATGCTTAACACTTAAAAGAACTAGAGTTTTCTTAAAAAAA
ATATCTTTAAGAAAAATATTTTGAGCTAGAAGAAGTATACAAAGTACATGAACAAATGTT
TACTAAATAATAAATATAAAACTTCTTTTTCCATTAATCAGTAGAGTTATTGTTTACTTA
CTTAGAAACGTAATTCATTAAATTATTAATTTCTTCTATCTTTAGATTTTATAAATTTAA
TTCACCGCAATTCCATTTATCTTCTCTCATCCTTTTATGCCACTAATATAAATTTATAAA
TTAAAATGCTAACTTGGATATTCCATTTTTTTAGATCAAACTAATTAGTCTATTATTAAT
GCTATTAATATTATATTCTTAGTTTATTTGCTATTATTGCTAATTCATATTTAAATACTT
TTTTAATTTTTTTTCACTAAAATATTTCTAAACAAATTATTATATTTTTTTGTTAATAAA
TTATATTTTCTTCATTTTTAAATTTTTTATTAGTATTTTTGAAAAATTAAGTTTTTCCTG
TGATCTTAAATATTTTAAATTGGAAAAAATCAAACATTTTTGATTGAATGAGGAAGGAAA
TAAGGTATTTTTCATTAATTTTGAAATCAAAAAATTTAATTTTAATTATTCATAAAATGC
TTATATTAAATTTAAAAAATAGAATTACTTTATGGATTATGTAACATGAAGTCAAAATAG
AGTCTAGATCGTTAATTCTAAATGAATAGAAAATTTAAATAGATTAGCTATCTGCAAATT
CAAAAAAGCTTTAAATCTCTGAATTATAAATTTAATCTTTTAAAAATGCATTCATATAAT
TTTTAAAAATTGATAAAAAAACAAATCAAAGTGAAGAACTAATTGAAGCTTTTTTCAAAG
TTTCTCTTTTATATGAAATTTCAAAAAGTAAAAATCAGATCTATAAATATCTTTATAAAA
AGAACATTTTTTCTTCTTTGACTAAAACTCCAATTATAGAATGCTTAGATCTATTTGTTA
AGTATGTGAAGACATAAGAAAGTGAGGAAATTCTTATATTAGATAAGATATAAGATAAAT
CTGATTTTGATCCTGATAGAACTTTTGATTATTTTACTATATCAGGCAAAGAAACTCTTT
ATGAAATCAGTTAATCATTCAAAAAAACTAAGAAAATACAAAAACAAGTTATGTTAACAG
TATAAAATTAAATATTAAATGATATATTTTTTACTAATTTAATTTATTTATTTAAAAAAG
GTTTTAGCCAAAATTTCAATATTGAAGAAGAAATATGGTAAAGATATCAAAAAAGTCAAG
TTTTATAATCCTATAAAAGGAACGGTTTTTTCAGTTTTGATAAAAGATTGGTAACTTCAT
TCAGACTTTATAGATTTTATGGAGAAATTTAATGAAAAACTTAAAAACCCTTAGTAAACA
AATTGA