Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00449120
Standard Name
TWI8 (Tetrahymena piWI 8)
Aliases
PreTt15430 | 52.m00208 | 3811.m00965 | DQ855965
Description
TWI8 piwi domain protein; Argonaute/Piwi family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%
TetraMine Data
TTHERM_00449120
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_14988.1 9.997093137033517e-262 piwi domain-containing protein
(847 aa)
Oxytricha Contig1484.1.g65 6.998463833652622e-61 Piwi domain
WormBase WBGene00004178 9.999142814001536e-47 locus:prg-1 status:Confirmed
UniProt:P90786 protein_id
:CAA98113.1
DictyBase DDB_G0271870 3.998479955315009e-46 agnC on chromosome: 2 position
975850 to 979616
Stentor Coeruleus SteCoe_5014 5.900090541597061e-29
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:28053272 : Farley BM, Collins K (2017) Transgenerational function of Tetrahymena Piwi protein Twi8p at distinctive noncoding RNA loci. RNA (New York, N.Y.) 23(4):530-545Ref:19656801 : Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32
Sequences
>TTHERM_00449120(coding)ATG TAA TAA ATA GAA ACT AAA ATA TAT CCG TTA ACA TTA GAA AGA TAT AAG AAT TGG CAA GTA AAT AAA TAA ATT AAT TAA TAT TTA TTA TAA AAT AAA AAT CTT TGT TAA TAA TAA TTA ATA GAA AAA CAG CGA AAA AAT TAA ATG GAT CAA GGA AGT TTA AGA GGT GAA AGT GAA CAA GGA TCT TCG AGC CAG CAG AAG GAA CAG AAA CTT TAA TTA GCA AGA AGA CCC AAG TTA GAT TAC AAT TAG CAG TCT AAG TCA CTT ATG CTC CTC ACA AAT TAT TTA AAA TTA GAA TTA AAT AAA AGT ATT GAG GAA ATC TAC TTA CTA AGA GTG GAT TTT TAT CCT AGA ATT GAA GCT GAT AAT AGA GTT TTG AGA GAT AAA TTA TTG AGT GTC AGC AGA GCT TAG TTA AAG GAA TGT TTG GGA GGG CAT TAT TTA ATT AAT GCT CAA TAG ATC TTT TCT GTC GAA AAG CCT AAT TTT AAT AAA GAA ACA TCA ATC TCA ATA ACT TTT CAG AAA ACT GAT TAC CAA GTT AAC TTG AAA ATC ACA AAG GTA TTT AGA TTA GAG GAT TTG AAC AAT GAA AAT TAA AGA AAA AGC TAA TTC CCT CTC CTT TTC TTT AAT GTC ATG GTA AAG AAT ATA CTC AAA GGA TTA AAT TTC TTT GAA TTT GGA AAG AAT ACA AAA TAT TTT GAA CCC TCA GCT GAG TAT CAT TCA AAA ATA GAA GGT ACT AAT TTA ATA GTT TAC AAG GGA TGG AAT ACT CCT TTT GAA AAT TGT AGT GAC GGC CTA CTT ATG AAG CTG GAT ATT TAA CAT AAA GTT GCC AGA AGA GAA AAT GCT TTG AAT TAC ATA AAT TTA ATT TAT AAA AAC AAT AAT GAT GCA TCT AAA GAG TAA AAG CGT AAG TTA GTT TGT GAA AAG TTG CAA GGA CAA ACT GTA ATG GCT AAT TAT GGC AAC TTT AAG CAA TTT AAA GTT CAT GAT GTA ATT TTT GAT AAA AAT TGC AAA GAA TTA AAA GTA TCA GAT CCT ATT TTA GAT CCT AAT TCC AAA GAA TCA TAG CTA CCA ATA GAA CCA CCT ACT CTG CAA TAA CCT AAT CCT GAT TCA GAT TTA ACA ATT TAT GAC TAC TAC TAT AAA AAA TAT GGT CTT AAA ATT AAA TAT GAT AAA TAA CCT CTT CTT TTA GTT TAT GAA AAG AAA CTT AAG AGA TTC CTC TAT TTC GTT CCT GAA TTA TGC TTA CTC ACA GGT ATA CCA GAT GAG CTC AAT GAT TAT TAA AAG AGA GAA TTG ATT ACC TGT ACC AAA CAA AAA CCA TAA GAA TTA TAC AAT ATG GTG ACA TAA TTT ATA GAT AAA ATA GTG AAT GTC AAT ACC ACA GAA GGT TAG CTA AAT ACA TAA TCT ATA TCT GAG CAG CTA GGT ATC AAC TTC AGC AAC CAT CCT CAT GTT ATC TAA GCC AAA CAA ATT GCA TAT CCT ACC ATC ACA TTT GGT GGT CCT AAA AAG GAT GCC CCA CGC TAA ACA ATC GAA GAT AAC AGC GCT TCT CAA TTT AGT ATG AAA TAC CCT GTT TAT AGC TCA GGC AAT CAG CTC TCC ATA GCT CTA CTT CAC TTT AAA GAT TTC AAC ACA ATG GAT CTT TTT TAA AAT TGG ATT AAA ATT TAG AAG GAG CTA AGA ATT GAA GTT AAA AAA CCA CAA GAA TTC AAT TTA GGT GAT TTC AAT AAT AAG GCT ATG TAA GAA ATT GAG CAT GTC ATC CGT AGA GAA ATC AAG AAA GAA AAA TTT GAC ATC GTT GCT ATA GTT GCT CCT AAT AAA TTC TCT ACA GTT CAA AAT TAT AGT AAA ATA AAA AAG TTG TGC ACA ATC ACA TAA CAA ATA AAA TCC TAA TAC ATT CGT TAG CAA TCT CTA GAC TCA AAG CAG TCT TAC AAT GTC TGC TCA GCA ATT CTA AGT TAA ATG GCT GCA AAA TGC GGA ACT ACT TTG TGG GTG GTA AAT CCT CCT AAT GGT ATA CCA GAC AAC ACA ATG ATT ATT GGA ACA AGT GTA TAA AAG GTA TTT ATT AAT GGA CAA CCT CAA TTT GTT ATT GGC TTT GTA GCT TCT CAA GAT AAA AAT GTT AGT CGT TTC TAT AGT CGT GCC ACA TTT TAA AAG TTA AAT AAA GAT AAT ATT GAA AAA ATC AGC ACT TTT ATT GTT GAC GCC ATT AAG TAG TAC TTT GTT TAA AAT AAA TTT GTA CCT GAA AAT ATC ATT TAT TTG CGT GAA AAC ATT GCT GAT TAA GGC ATT CAA AAA TAC TTG AGT ACA GAA ATA AAA GAA GTG CTT AAG TCA TTT ACA GTA CTT TCC CCT TAG TAT AAA CCA AAG CTC TGT GTA GTT TTG TTA GAA TGT CGT CAT GGT GTT CGT GTA TTG CAT TAG CTA GGA GAA GGA CCT AAT AAA GAA CTT GTA AAT CCT CCT CCA GGC ACT ATC ATT GAT TCT TCT ATT ACC AGC AAG TAT CAT TAT GAT TTC TAT ATG ATA TCC TAA AAC GTA AAA CAA GGA ACT GCT ACC CCA GTC CAC TAT AAA GTA ATC TAT GAC ACA ACT GAA TTC CCA GAA GGG AGA TTG TAA GAG TTG CTA TAC AGT TAA TGC TTC AAT TAC GTT AAC TGG AGT GGT AGT ATA AAA TAT CCT GCC CAA ATT TAA TAT GCA AAG AAA CTA GCA AAA ATG GTC GGA ACT TTT ATT TAA GAA GAA GTA TCA GAA AAG CTT TTC AAT TCA AGA TTT TAT ATT TGA >TTHERM_00449120(protein)M Q Q I E T K I Y P L T L E R Y K N W Q V N K Q I N Q Y L L Q N K N L C Q Q Q L I E K Q R K N Q M D Q G S L R G E S E Q G S S S Q Q K E Q K L Q L A R R P K L D Y N Q Q S K S L M L L T N Y L K L E L N K S I E E I Y L L R V D F Y P R I E A D N R V L R D K L L S V S R A Q L K E C L G G H Y L I N A Q Q I F S V E K P N F N K E T S I S I T F Q K T D Y Q V N L K I T K V F R L E D L N N E N Q R K S Q F P L L F F N V M V K N I L K G L N F F E F G K N T K Y F E P S A E Y H S K I E G T N L I V Y K G W N T P F E N C S D G L L M K L D I Q H K V A R R E N A L N Y I N L I Y K N N N D A S K E Q K R K L V C E K L Q G Q T V M A N Y G N F K Q F K V H D V I F D K N C K E L K V S D P I L D P N S K E S Q L P I E P P T L Q Q P N P D S D L T I Y D Y Y Y K K Y G L K I K Y D K Q P L L L V Y E K K L K R F L Y F V P E L C L L T G I P D E L N D Y Q K R E L I T C T K Q K P Q E L Y N M V T Q F I D K I V N V N T T E G Q L N T Q S I S E Q L G I N F S N H P H V I Q A K Q I A Y P T I T F G G P K K D A P R Q T I E D N S A S Q F S M K Y P V Y S S G N Q L S I A L L H F K D F N T M D L F Q N W I K I Q K E L R I E V K K P Q E F N L G D F N N K A M Q E I E H V I R R E I K K E K F D I V A I V A P N K F S T V Q N Y S K I K K L C T I T Q Q I K S Q Y I R Q Q S L D S K Q S Y N V C S A I L S Q M A A K C G T T L W V V N P P N G I P D N T M I I G T S V Q K V F I N G Q P Q F V I G F V A S Q D K N V S R F Y S R A T F Q K L N K D N I E K I S T F I V D A I K Q Y F V Q N K F V P E N I I Y L R E N I A D Q G I Q K Y L S T E I K E V L K S F T V L S P Q Y K P K L C V V L L E C R H G V R V L H Q L G E G P N K E L V N P P P G T I I D S S I T S K Y H Y D F Y M I S Q N V K Q G T A T P V H Y K V I Y D T T E F P E G R L Q E L L Y S Q C F N Y V N W S G S I K Y P A Q I Q Y A K K L A K M V G T F I Q E E V S E K L F N S R F Y I >TTHERM_00449120(gene)ATG TAA TAA ATA GAA ACT AAA ATA TAT CCG TTA ACA TTA GAA AGA TAT AAG AAT TGG CAA GTA AAT AAA TAA ATT AAT TAA TAT TTA TTA TAA AAT AAA AAT CTT TGT TAA TAA TAA TTA ATA GAA AAA CAG CGA AAA AAT TAA ATG GAT CAA GGA AGT TTA AGA GGT GAA AGT GAA CAA GGA TCT TCG AGC CAG CAG AAG GAA CAG AAA GTA ATT GAA TTT ATA TGC AAT AAA GAA TAG TAT AAT TAA GCT ATT GAT GGA TGA CAG TCA ATT TTT TGA TGA GAA ATA GAT CCA CTT CTT ATC ATA CTA TTA TAT CAT TAT TAT ATA ATT GGC AAT ATT AAT ATG TAA AAA ACC AAT ATT TTC TTA AAA TAA TAA GCT TTA ATT AGC AAG AAG ACC CAA GTT AGA TTA CAA TTA GCA GTC TAA GTC ACT TAT GCT CCT CAC AAA TTA TTT AAA ATT AGA ATT AAA TAA AAG TAT TGA GGA AAT CTA CTT ACT AAG AGT GGA TTT TTA TCC TAG AAT TGA AGC TGA TAA TAG AGT TTT GAG AGA TAA ATT ATT GAG TGT CAG CAG AGC TTA GTT AAA GGA ATG TTT GGG AGG GCA TTA TTT AAT TAA TGC TCA ATA GAT CTT TTC TGT CGA AAA GCC TAA TTT TAA TAA AGA AAC ATC AAT CTC AAT AAC TTT TCA GAA AAC TGA TTA CCA AGT TAA CTT GAA AAT CAC AAA GGT ATT TAC CAA ATA ACC ATG CAA TAT TTT AGA ATA AAA TTG ATT TTT CCC AGA TTG TCT TAC AAA TAA AAT TTA AAG AAG CAG AAA TTC CAT AAA ATG CAG AGT TAG ATT TAT AAA TAA CTT AAA TAT GAG ACA AAC ACA GTC AGT CTC ATA ATT ATG TGA AAT AAT TTT TTT ATA AAT AGT TTA GAT TTT ACT ATT AGA TTA GAT CAA ATG TGT GTG ATA CGT GGG GAT TAA ACT TTA TTA TAA ACT ACC AGC CTT CTT CAA AGC AAA TAG TTT TTA ATT ATT TAA TTT GTT AGT TGA TTG TAA AAA TAC TAA AAT TTA GTT AGA AAA AAA TAA AGA AAT CAA TAT TTA AAG CAG ATT TTA TTT TTA CGA AAT AAA GAT AAA AAG GAA TAA ATA ATA AAA TAA ATA AAT TTA GCT ATC AAA GTT AAT TAA ATC TGA ATT ACT AAA AAT TTT TAT TAA AAT TAA ATT TAA TTT AAA AAT TTT TAC TAC TAT AAA AAA TTT AGG TAT TTA GAT TAG AGG ATT TGA ACA ATG AAA ATT AAA GAA AAA GCT AAT TCC CTC TCC TTT TCT TTA ATG TCA TGG TAA AGA ATA TAC TCA AAG GAT TAA ATT TCT TTG AAT TTG GAA AGA ATA CAA AAT ATT TTG AAC CCT CAG CTG AGT ATC ATT CAA AAA TAG AAG GTA CTA ATT TAA TAG TTT ACA AGG GAT GGA ATA CTC CTT TTG AAA ATT GTA GTG ACG GCC TAC TTA TGA AGC TGG ATA TTT AAC ATA AAG TTG CCA GAA GAG AAA ATG CTT TGA ATT ACA TAA ATT TAA TTT ATA AAA ACA ATA ATG ATG CAT CTA AAG AGT AAA AGC GTA AGT TAG TTT GTG AAA AGT TGC AAG GAC AAA CTG TAA TGG CTA ATT ATG GCA ACT TTA AGC AAT TTA AAG TTC ATG ATG TAA TTT TTG ATA AAA ATT GCA AAG AAT TAA AAG TAT CAG ATC CTA TTT TAG ATC CTA ATT CCA AAG AAT CAT AGC TAC CAA TAG AAC CAC CTA CTC TGC AAT AAC CTA ATC CTG ATT CAG ATT TAA CAA TTT ATG ACT ACT ACT ATA AAA AAT ATG GTC TTA AAA TTA AAT ATG ATA AAT AAC CTC TTC TTT TAG TTT ATG AAA AGA AAC TTA AGA GAT TCC TCT ATT TCG TTC CTG AAT TAT GCT TAC TCA CAG GTA TAC CAG ATG AGC TCA ATG ATT ATT AAA AGA GAG AAT TGA TTA CCT GTA CCA AAC AAA AAC CAT AAG AAT TAT ACA ATA TGG TGA CAT AAT TTA TAG ATA AAA TAG TGA ATG TCA ATA CCA CAG AAG GTT AGC TAA ATA CAT AAT CTA TAT CTG AGC AGC TAG GTA TCA ACT TCA GCA ACC ATC CTC ATG TTA TCT AAG CCA AAC AAA TTG CAT ATC CTA CCA TCA CAT TTG GTG GTC CTA AAA AGG ATG CCC CAC GCT AAA CAA TCG AAG ATA ACA GCG CTT CTC AAT TTA GTA TGA AAT ACC CTG TTT ATA GCT CAG GCA ATC AGC TCT CCA TAG CTC TAC TTC ACT TTA AAG ATT TCA ACA CAA TGG ATC TTT TTT AAG TAA AAT TTA TTA ATT AAA GTT AAG CTT TCA ATA AAC AAA TAG CTT TTT TAT TTA TAT GAT TGA ATT TTT TAA TTA ATT AAT TAA AAT GGA ATT GAT TGG CTA GTG TAA ACA AAC TAG ATA AAT AAA TAT AAT ATT TTC CTT TAA TTT TTT ACC AAT TAA TTC TTT TGT CTC AAA ATT AAA TAA AAA ATT ATA TTT TGG CGT CTT ATT TTT TCT TAA TTA AAT CTT ACT AAA ATC TTT TAT TTT AAA AAT GAA AGA ATT GGA TTA AAA TTT AGA AGG AGC TAA GAA TTG AAG TTA AAA AAC CAC AAG AAT TCA ATT TAG GTG ATT TCA ATA ATA AGG CTA TGT AAG AAA TTG AGC ATG TCA TCC GTA GAG AAA TCA AGA AAG AAA AAT TTG ACA TCG TTG CTA TAG TTG CTC CTA ATA AAT TCT CTA CAG TTC AAA ATT ATA GTA AAA TAA AAA AGT TGT GCA CAA TCA CAT AAC AAA TAA AAT CCT AAT ACA TTC GTT AGC AAT CTC TAG ACT CAA AGC AGT CTT ACA ATG TCT GCT CAG CAA TTC TAA GTT AAA TGG CTG CAA AAT GCG GAA CTA CTT TGT GGG TGG TAA ATC CTC CTA ATG GTA TAC CAG ACA ACA CAA TGA TTA TTG GAA CAA GTG TAT AAA AGG TAT TTA TTA ATG GAC AAC CTC AAT TTG TTA TTG GCT TTG TAG CTT CTC AAG ATA AAA ATG TTA GTC GTT TCT ATA GTC GTG CCA CAT TTT AAA AGT TAA ATA AAG ATA ATA TTG AAA AAA TCA GCA CTT TTA TTG TTG ACG CCA TTA AGT AGT ACT TTG TTT AAA ATA AAT TTG TAC CTG AAA ATA TCA TTT ATT TGC GTG AAA ACA TTG CTG ATT AAG GCA TTC AAA AAT ACT TGA GTA CAG AAA TAA AAG AAG TGC TTA AGT CAT TTA CAG TAC TTT CCC CTT AGT ATA AAC CAA AGC TCT GTG TAG TTT TGT TAG AAT GTC GTC ATG GTG TTC GTG TAT TGC ATT AGC TAG GAG AAG GAC CTA ATA AAG AAC TTG TAA ATC CTC CTC CAG GCA CTA TCA TTG ATT CTT CTA TTA CCA GCA AGT ATC ATT ATG ATT TCT ATA TGA TAT CCT AAA ACG TAA AAC AAG GAA CTG CTA CCC CAG TCC ACT ATA AAG TAA TCT ATG ACA CAA CTG AAT TCC CAG AAG GGA GAT TGT AAG AGT TGC TAT ACA GTT AAT GCT TCA ATT ACG TTA ACT GGA GTG GTA GTA TAA AAT ATC CTG CCC AAA TTT AAT ATG CAA AGA AAC TAG CAA AAA TGG TCG GAA CTT TTA TTT AAG AAG AAG TAT CAG AAA AGC TTT TCA ATT CAA GAT TTT ATA TTT GA