Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00600450

Standard Name

TWI7 (Tetrahymena Piwi 7)

Aliases

PreTt22108 | 83.m00177 | 3685.m00069

Description

Argonaute-Piwi family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Genome Browser (Micronucleus)

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Gene Ontology Annotations

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Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00600450

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14909.19.997093137033517e-262piwi domain-containing protein
(808 aa)
OxytrichaContig276.0.g875.001369568193564e-73Piwi domain
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4008116 to 4011078
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UniProt:P90786 protein_id
:CAA98113.1
Stentor CoeruleusSteCoe_50147.281290178321643e-33

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:19656801: Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32

Sequences

>TTHERM_00600450(coding)
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TCTGCATAAAACAAGGATAAGACTACTCCAAATTATAAGAAGGGTAATAAAGTAACTTAA
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ATAAATAGCCTATATTATATTTGA


>TTHERM_00600450(protein)
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SVASKIALQIASKLGKRIWSVETPVGINQNTMIVGIETSMKKIRNQQVIGVVASINKDFN
KFYSQVDFRNGNDIKLPTLSKIISSAIEAYSKNTKTVPEEIIIYRQGLGEGQIQYSHQLE
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FEFFMAAQNCNSGVCTPTKYTCLFNNTNLKEDQFWQLTYFQTFNYYNWQGPIRVPAVMKY
AEKLAKFTSETLEGVANNELINSLYYI


>TTHERM_00600450(gene)
ATGATAACTTAGTTACCAAAAAGACCTAACAAATCCTCTTCTTCTACAATTGCTAAAATT
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ACCTCAACCCTTGAAGTATATAAAGGTATCACTTTCAAGGTAAGTCCTACTTAATAAGGT
TTATATCTCAATAGTGATTATCTTTGTAGAATTTTAAGAAAAGAAACAGCCCAATAATAC
TTAACTGCAAGACATGATATAGAAGGATAGTCAGTACTTACTAAATATAATAATTATCGG
ACATATATAATTGACAGGGTAGATTATAGTAAGAATCCTAGATCAACTTTCTTGTATAGA
AAAACAAACTTATAAATTAGTTACGCAGAGTACTACTTTCAAAACTATCAAATTGAAATT
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ATTCTAAAAATTTAGGAGATATTTTTGATACCTGAATTATGCTATATGACAGGACTCACT
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TTTTTCTAAGTTAATAGGAAAATAAGTGAGAAATTCTATCAACAGTTATATAATGAAAGA
GTACAAATTTCAAATCCACCCTCAGGTACTATTGTAGCTTCTGAATTAACTCAGAATAAT
TTTGAATTTTTCATGGCTGCTTAAAATTGTAACTCAGGAGTCTGTACACCAACTAAATAT
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CAAACTTTTAATTACTATAATTGGTAAGGACCTATTAGGGTACCTGCTGTCATGAAGTAT
GCAGAAAAATTAGCTAAATTTACTAGTGAAACTCTTGAAGGCGTTGCAAATAACGAGTTA
ATAAATAGCCTATATTATATTTGA