Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01132860

Standard Name

TWI10 (Tetrahymena piWI 10)

Aliases

PreTt10920 | 248.m00033

Description

TWI10 piwi domain protein; Argonaute/Piwi family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF02170 ) PAZ domain
• ( PF02171 ) Piwi domain
• ( TIGR00081 ) phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_01132860

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_01387.1	3.998941839720987e-159	hypothetical protein (808 aa)
Oxytricha	Contig276.0.g87	1.9991517704232713e-32	Piwi domain
WormBase	WBGene00004178	1.999981404597394e-31	locus:prg-1 status:Confirmed UniProt:P90786 protein_id :CAA98113.1
DictyBase	DDB_G0271870	4.0006511639687014e-23	agnC on chromosome: 2 position 975850 to 979616
Stentor Coeruleus	SteCoe_1846	8.533047625744066e-17

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:19656801: Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32

Sequences

>TTHERM_01132860(coding)
ATGAATAAGTTATCAAAAAGACCTATTATATCATATGATCAAAGTAATTAACAGGAAGGT
AGCTTTTTAAAATAAGTCTAATTGAGAACTAATTTATTCTAAATGAGCAATACTATAAAT
ACAAAGAATGATGTTTAATAATAAATAATTATTTACCATTACAGTATAAAAATAATTCCT
TCTACTTGCATAAGAGTGAAAAAACTTTTATGGCAAGCTCGAGAACTGTTATAAAATGTA
TATGGTAGAAACTTTATCTCAAATCAAGAAATTTATTCTTTTAAAAAGGTTGAAGAAAAT
TAGAAAATATATATAGAAATTGAAAATATTATTTATTGCTTAAAAATATTCTATAGAAGA
GAGATAGAATTAAATTTAACAGAAAGCAATTAAATAAATTAAAATAAAACTTTATAAAAA
AAGATATCTAGTCTAGCAATATAAAGTATAAGCGCTATTTACAAATCAGTTTATAAATAA
TTTCAAAAAGACATTCTTAAACAGACTGGACTTGCTAAAAATGATTGCAAACAATTAGAC
CATTATAATTTTTAATGCTTTTTTAGAGAATAGATTAATTATAGAGCAAATTTAAATGAA
GCAATCTTGAGTGATTAAAATCTTAGCTCCTTGCTAAAAGATGTTAAGAATCAAAAGAAT
GTTGAAGATATTATTTTAGGAAAATATGTGAGGATGAAGCACTAATTAAACAAACTGTAT
TAAATATAAAGAATTGACTATACTAAGAATCCACTAAGTACATTCTATTGTGCGAAGTAT
AAGTAAAATATGACATTTTAGAAGTATTATAAGGAAAGGTACAACTTAGAAATAATAGAT
TTGAATTAGCCTTTGTTTGTTGTAAACATAAAAAAACAGTCAATTTAGCCTATCGATTAA
CATATTAAATATCAAGAAATTTATTTAATTCCAGAATTTTGTTTGATTTTTTTCCAACTA
AAACCTCAAAAATTCAACAAAATTAAACAAATTCAAGTTAATTTGAGATAAAAGATTTAT
TATCTAAAATTTTTATAAAAATTACAACACGAAACAGGAATATAAATTAGCAAAGAAAGT
TGCACTGTAAATGCATATGCATTAAATCCACCAAAATTAATTTTTTAAAAGAATAAAAAA
TTTATTGATTTAAAAAATTCTAAAACTAATTTTAATATATCCAACTAAATATTAAGTAAT
ATATCATTCAAAGAATGGATTTTTATATATCCAAAAAGTGATGCAAATTTGTGCTTATAA
TTATCATAATAAATTTAAGAATAAGGTCAAGTGCTAGGAATTAGAATTCCTCAACCAACT
ATGATATAAATGAAAAGGCACAATCTTTCAGATGGAATAAATTTATTGGAGAATTACTTT
TTAGTGAATTAAGTACCTTAATTTATTCTTTCTTATGTAAATTTTAACCATCCAAGACAA
TAAACTTTTTACTAAGAACTGAAATTATATTTGTATGCTACTGTAGCCATTGAGCACTAG
CATTTCAATGATGATTTTTCTTGCCATAAAAATAAAAATGCTGCTATTTCTTCTCTAATT
ATCTAAATTGCTTCTAAATTAGGATATCCTTTATGGTAAACACACATTCCTAATCAAATA
TTTAATAAAACAATGATCATAGCAATCGCAGTAGAGCAAAAAACACTCCATCTTAATAAA
TAATAGCAAATGATAGCAGTTGTTACCACAATAAGCAAGGATTTTACTTAAATGCACTCA
GAGATTTTTTTTAATGAGATATAAAATGGACCAATTTCAATACTCTCTAAAATTATTTTG
AGCTCTATAAAGAATTATGTTTTAAATACAAAACAACTTCCTGATTAAATAATAATATAT
AGATAAGGTTTAATAGAACCTTCCTTATAAATAGAAAAGGAATCTATTATAAATGGTTTT
AGGCTTTTTAAGGAAGATTATTAACCTAAATTTGCTTATTTTTGTGTTAGTTAATCCAAA
AAGCAATAGATTTTCTCTTAAAGTGACTAAAAGATGGATATCACCGGAAGTGTAATTCCT
TTGGTACAAAATAATTAAGTGAAATTTGAGTTTTTTCTTTGTTCTAAGATTATCTAAGAA
GGTTTTAGCATACCAACAAGATATTCATGCTTATATGATGATACTTTAATCTCATAAGAG
TAGCATTGGCAATTTACTTATTACTAATGCTTCAATTACTTTAATTTTCAAGGAGCATTA
AAGATACCAGCACAACTTAAATATGCTTGTAAGCTATTAAAATTTAGAAAATATGTTATG
GAAATTGATCCATCCAAAGACTTAAAGCAAAGCTTTTACTATATTTGA

>TTHERM_01132860(protein)
MNKLSKRPIISYDQSNQQEGSFLKQVQLRTNLFQMSNTINTKNDVQQQIIIYHYSIKIIP
STCIRVKKLLWQARELLQNVYGRNFISNQEIYSFKKVEENQKIYIEIENIIYCLKIFYRR
EIELNLTESNQINQNKTLQKKISSLAIQSISAIYKSVYKQFQKDILKQTGLAKNDCKQLD
HYNFQCFFREQINYRANLNEAILSDQNLSSLLKDVKNQKNVEDIILGKYVRMKHQLNKLY
QIQRIDYTKNPLSTFYCAKYKQNMTFQKYYKERYNLEIIDLNQPLFVVNIKKQSIQPIDQ
HIKYQEIYLIPEFCLIFFQLKPQKFNKIKQIQVNLRQKIYYLKFLQKLQHETGIQISKES
CTVNAYALNPPKLIFQKNKKFIDLKNSKTNFNISNQILSNISFKEWIFIYPKSDANLCLQ
LSQQIQEQGQVLGIRIPQPTMIQMKRHNLSDGINLLENYFLVNQVPQFILSYVNFNHPRQ
QTFYQELKLYLYATVAIEHQHFNDDFSCHKNKNAAISSLIIQIASKLGYPLWQTHIPNQI
FNKTMIIAIAVEQKTLHLNKQQQMIAVVTTISKDFTQMHSEIFFNEIQNGPISILSKIIL
SSIKNYVLNTKQLPDQIIIYRQGLIEPSLQIEKESIINGFRLFKEDYQPKFAYFCVSQSK
KQQIFSQSDQKMDITGSVIPLVQNNQVKFEFFLCSKIIQEGFSIPTRYSCLYDDTLISQE
QHWQFTYYQCFNYFNFQGALKIPAQLKYACKLLKFRKYVMEIDPSKDLKQSFYYI

>TTHERM_01132860(gene)
ATGAATAAGTTATCAAAAAGACCTATTATATCATATGATCAAAGTAATTAACAGGAAGGT
AGCTTTTTAAAATAAGTCTAATTGAGAACTAATTTATTCTAAATGAGCAATACTATAAAT
ACAAAGAATGATGTTTAATAATAAATAATTATTTACCATTACAGTATAAAAATAATTCCT
TCTACTTGCATAAGAGTGAAAAAACTTTTATGGCAAGCTCGAGAACTGTTATAAAATGTA
TATGGTAGAAACTTTATCTCAAATCAAGAAATTTATTCTTTTAAAAAGGTTGAAGAAAAT
TAGAAAATATATATAGAAATTGAAAATATTATTTATTGCTTAAAAATATTCTATAGAAGA
GAGATAGAATTAAATTTAACAGAAAGCAATTAAATAAATTAAAATAAAACTTTATAAAAA
AAGATATCTAGTCTAGCAATATAAAGTATAAGCGCTATTTACAAATCAGTTTATAAATAA
TTTCAAAAAGACATTCTTAAACAGACTGGACTTGCTAAAAATGATTGCAAACAATTAGAC
CATTATAATTTTTAATGCTTTTTTAGAGAATAGATTAATTATAGAGCAAATTTAAATGAA
GCAATCTTGAGTGATTAAAATCTTAGCTCCTTGCTAAAAGATGTTAAGAATCAAAAGAAT
GTTGAAGATATTATTTTAGGAAAATATGTGAGGATGAAGCACTAATTAAACAAACTGTAT
TAAATATAAAGAATTGACTATACTAAGAATCCACTAAGTACATTCTATTGTGCGAAGTAT
AAGTAAAATATGACATTTTAGAAGTATTATAAGGAAAGGTACAACTTAGAAATAATAGAT
TTGAATTAGCCTTTGTTTGTTGTAAACATAAAAAAACAGTCAATTTAGCCTATCGATTAA
CATATTAAATATCAAGAAATTTATTTAATTCCAGAATTTTGTTTGATTTTTTTCCAACTA
AAACCTCAAAAATTCAACAAAATTAAACAAATTCAAGTTAATTTGAGATAAAAGATTTAT
TATCTAAAATTTTTATAAAAATTACAACACGAAACAGGAATATAAATTAGCAAAGAAAGT
TGCACTGTAAATGCATATGCATTAAATCCACCAAAATTAATTTTTTAAAAGAATAAAAAA
TTTATTGATTTAAAAAATTCTAAAACTAATTTTAATATATCCAACTAAATATTAAGTAAT
ATATCATTCAAAGAATGGATTTTTATATATCCAAAAAGTGATGCAAATTTGTGCTTATAA
TTATCATAATAAATTTAAGAATAAGGTCAAGTGCTAGGAATTAGAATTCCTCAACCAACT
ATGATATAAATGAAAAGGCACAATCTTTCAGATGGAATAAATTTATTGGAGAATTACTTT
TTAGTGAATTAAGTACCTTAATTTATTCTTTCTTATGTAAATTTTAACCATCCAAGACAA
TAAACTTTTTACTAAGAACTGAAATTATATTTGTATGCTACTGTAGCCATTGAGCACTAG
CATTTCAATGATGATTTTTCTTGCCATAAAAATAAAAATGCTGCTATTTCTTCTCTAATT
ATCTAAATTGCTTCTAAATTAGGATATCCTTTATGGTAAACACACATTCCTAATCAAATA
TTTAATAAAACAATGATCATAGCAATCGCAGTAGAGCAAAAAACACTCCATCGTAAATTA
ATAAATTACATGAAAAAATTATTTAATTTTTAATTAATTCAATCAAGATTATTGATTAGT
TTTTAATTTAAAATAATTTTATAGTTAATAAATAATAGCAAATGATAGCAGTTGTTACCA
CAATAAGCAAGGATTTTACTTAAATGCACTCAGAGATTTTTTTTAATGAGATATAAAATG
GACCAATTTCAATACTCTCTAAAATTATTTTGAGCTCTATAAAGAATTATGTTTTAAATA
CAAAACAACTTCCTGATTAAATAATAATATATAGATAAGGTTTAATAGAACCTTCCTTAT
AAATAGAAAAGGAATCTATTATAAATGGTTTTAGGCTTTTTAAGGAAGATTATTAACCTA
AATTTGCTTATTTTTGTGTTAGTTAATCCAAAAAGCAATAGATTTTCTCTTAAAGTGACT
AAAAGATGGATATCACCGGAAGTGTAATTCCTTTGGTACAAAATAATTAAGTGAAATTTG
AGTTTTTTCTTTGTTCTAAGATTATCTAAGAAGGTTTTAGCATACCAACAAGATATTCAT
GCTTATATGATGATACTTTAATCTCATAAGAGTAGCATTGGCAATTTACTTATTACTAAT
GCTTCAATTACTTTAATTTTCAAGGAGCATTAAAGATACCAGCACAACTTAAATATGCTT
GTAAGCTATTAAAATTTAGAAAATATGTTATGGAAATTGATCCATCCAAAGACTTAAAGC
AAAGCTTTTACTATATTTGA