Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01132860

Standard Name

TWI10 (Tetrahymena piWI 10)

Aliases

PreTt10920 | 248.m00033

Description

Argonaute/Piwi family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF02170 ) PAZ domain
  • ( PF02171 ) Piwi domain
  • ( TIGR00081 ) phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_01132860

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_01387.13.998941839720987e-159hypothetical protein (808 aa)
OxytrichaContig276.0.g871.9991517704232713e-32Piwi domain
WormBaseWBGene000041781.999981404597394e-31locus:prg-1 status:Confirmed
UniProt:P90786 protein_id
:CAA98113.1
DictyBaseDDB_G02718704.0006511639687014e-23agnC on chromosome: 2 position
975850 to 979616
Stentor CoeruleusSteCoe_18468.533047625744066e-17

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:19656801: Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32

Sequences 

>TTHERM_01132860(coding)
ATGAATAAGTTATCAAAAAGACCTATTATATCATATGATCAAAGTAATTAACAGGAAGGT
AGCTTTTTAAAATAAGTCTAATTGAGAACTAATTTATTCTAAATGAGCAATACTATAAAT
ACAAAGAATGATGTTTAATAATAAATAATTATTTACCATTACAGTATAAAAATAATTCCT
TCTACTTGCATAAGAGTGAAAAAACTTTTATGGCAAGCTCGAGAACTGTTATAAAATGTA
TATGGTAGAAACTTTATCTCAAATCAAGAAATTTATTCTTTTAAAAAGGTTGAAGAAAAT
TAGAAAATATATATAGAAATTGAAAATATTATTTATTGCTTAAAAATATTCTATAGAAGA
GAGATAGAATTAAATTTAACAGAAAGCAATTAAATAAATTAAAATAAAACTTTATAAAAA
AAGATATCTAGTCTAGCAATATAAAGTATAAGCGCTATTTACAAATCAGTTTATAAATAA
TTTCAAAAAGACATTCTTAAACAGACTGGACTTGCTAAAAATGATTGCAAACAATTAGAC
CATTATAATTTTTAATGCTTTTTTAGAGAATAGATTAATTATAGAGCAAATTTAAATGAA
GCAATCTTGAGTGATTAAAATCTTAGCTCCTTGCTAAAAGATGTTAAGAATCAAAAGAAT
GTTGAAGATATTATTTTAGGAAAATATGTGAGGATGAAGCACTAATTAAACAAACTGTAT
TAAATATAAAGAATTGACTATACTAAGAATCCACTAAGTACATTCTATTGTGCGAAGTAT
AAGTAAAATATGACATTTTAGAAGTATTATAAGGAAAGGTACAACTTAGAAATAATAGAT
TTGAATTAGCCTTTGTTTGTTGTAAACATAAAAAAACAGTCAATTTAGCCTATCGATTAA
CATATTAAATATCAAGAAATTTATTTAATTCCAGAATTTTGTTTGATTTTTTTCCAACTA
AAACCTCAAAAATTCAACAAAATTAAACAAATTCAAGTTAATTTGAGATAAAAGATTTAT
TATCTAAAATTTTTATAAAAATTACAACACGAAACAGGAATATAAATTAGCAAAGAAAGT
TGCACTGTAAATGCATATGCATTAAATCCACCAAAATTAATTTTTTAAAAGAATAAAAAA
TTTATTGATTTAAAAAATTCTAAAACTAATTTTAATATATCCAACTAAATATTAAGTAAT
ATATCATTCAAAGAATGGATTTTTATATATCCAAAAAGTGATGCAAATTTGTGCTTATAA
TTATCATAATAAATTTAAGAATAAGGTCAAGTGCTAGGAATTAGAATTCCTCAACCAACT
ATGATATAAATGAAAAGGCACAATCTTTCAGATGGAATAAATTTATTGGAGAATTACTTT
TTAGTGAATTAAGTACCTTAATTTATTCTTTCTTATGTAAATTTTAACCATCCAAGACAA
TAAACTTTTTACTAAGAACTGAAATTATATTTGTATGCTACTGTAGCCATTGAGCACTAG
CATTTCAATGATGATTTTTCTTGCCATAAAAATAAAAATGCTGCTATTTCTTCTCTAATT
ATCTAAATTGCTTCTAAATTAGGATATCCTTTATGGTAAACACACATTCCTAATCAAATA
TTTAATAAAACAATGATCATAGCAATCGCAGTAGAGCAAAAAACACTCCATCTTAATAAA
TAATAGCAAATGATAGCAGTTGTTACCACAATAAGCAAGGATTTTACTTAAATGCACTCA
GAGATTTTTTTTAATGAGATATAAAATGGACCAATTTCAATACTCTCTAAAATTATTTTG
AGCTCTATAAAGAATTATGTTTTAAATACAAAACAACTTCCTGATTAAATAATAATATAT
AGATAAGGTTTAATAGAACCTTCCTTATAAATAGAAAAGGAATCTATTATAAATGGTTTT
AGGCTTTTTAAGGAAGATTATTAACCTAAATTTGCTTATTTTTGTGTTAGTTAATCCAAA
AAGCAATAGATTTTCTCTTAAAGTGACTAAAAGATGGATATCACCGGAAGTGTAATTCCT
TTGGTACAAAATAATTAAGTGAAATTTGAGTTTTTTCTTTGTTCTAAGATTATCTAAGAA
GGTTTTAGCATACCAACAAGATATTCATGCTTATATGATGATACTTTAATCTCATAAGAG
TAGCATTGGCAATTTACTTATTACTAATGCTTCAATTACTTTAATTTTCAAGGAGCATTA
AAGATACCAGCACAACTTAAATATGCTTGTAAGCTATTAAAATTTAGAAAATATGTTATG
GAAATTGATCCATCCAAAGACTTAAAGCAAAGCTTTTACTATATTTGA


>TTHERM_01132860(protein)
MNKLSKRPIISYDQSNQQEGSFLKQVQLRTNLFQMSNTINTKNDVQQQIIIYHYSIKIIP
STCIRVKKLLWQARELLQNVYGRNFISNQEIYSFKKVEENQKIYIEIENIIYCLKIFYRR
EIELNLTESNQINQNKTLQKKISSLAIQSISAIYKSVYKQFQKDILKQTGLAKNDCKQLD
HYNFQCFFREQINYRANLNEAILSDQNLSSLLKDVKNQKNVEDIILGKYVRMKHQLNKLY
QIQRIDYTKNPLSTFYCAKYKQNMTFQKYYKERYNLEIIDLNQPLFVVNIKKQSIQPIDQ
HIKYQEIYLIPEFCLIFFQLKPQKFNKIKQIQVNLRQKIYYLKFLQKLQHETGIQISKES
CTVNAYALNPPKLIFQKNKKFIDLKNSKTNFNISNQILSNISFKEWIFIYPKSDANLCLQ
LSQQIQEQGQVLGIRIPQPTMIQMKRHNLSDGINLLENYFLVNQVPQFILSYVNFNHPRQ
QTFYQELKLYLYATVAIEHQHFNDDFSCHKNKNAAISSLIIQIASKLGYPLWQTHIPNQI
FNKTMIIAIAVEQKTLHLNKQQQMIAVVTTISKDFTQMHSEIFFNEIQNGPISILSKIIL
SSIKNYVLNTKQLPDQIIIYRQGLIEPSLQIEKESIINGFRLFKEDYQPKFAYFCVSQSK
KQQIFSQSDQKMDITGSVIPLVQNNQVKFEFFLCSKIIQEGFSIPTRYSCLYDDTLISQE
QHWQFTYYQCFNYFNFQGALKIPAQLKYACKLLKFRKYVMEIDPSKDLKQSFYYI


>TTHERM_01132860(gene)
TTATAATTATTAATAAAAAAAATATTTTTCTAGGCACAGTGAAATCTGATATGAATAAGT
TATCAAAAAGACCTATTATATCATATGATCAAAGTAATTAACAGGAAGGTAGCTTTTTAA
AATAAGTCTAATTGAGAACTAATTTATTCTAAATGAGCAATACTATAAATACAAAGAATG
ATGTTTAATAATAAATAATTATTTACCATTACAGTATAAAAATAATTCCTTCTACTTGCA
TAAGAGTGAAAAAACTTTTATGGCAAGCTCGAGAACTGTTATAAAATGTATATGGTAGAA
ACTTTATCTCAAATCAAGAAATTTATTCTTTTAAAAAGGTTGAAGAAAATTAGAAAATAT
ATATAGAAATTGAAAATATTATTTATTGCTTAAAAATATTCTATAGAAGAGAGATAGAAT
TAAATTTAACAGAAAGCAATTAAATAAATTAAAATAAAACTTTATAAAAAAAGATATCTA
GTCTAGCAATATAAAGTATAAGCGCTATTTACAAATCAGTTTATAAATAATTTCAAAAAG
ACATTCTTAAACAGACTGGACTTGCTAAAAATGATTGCAAACAATTAGACCATTATAATT
TTTAATGCTTTTTTAGAGAATAGATTAATTATAGAGCAAATTTAAATGAAGCAATCTTGA
GTGATTAAAATCTTAGCTCCTTGCTAAAAGATGTTAAGAATCAAAAGAATGTTGAAGATA
TTATTTTAGGAAAATATGTGAGGATGAAGCACTAATTAAACAAACTGTATTAAATATAAA
GAATTGACTATACTAAGAATCCACTAAGTACATTCTATTGTGCGAAGTATAAGTAAAATA
TGACATTTTAGAAGTATTATAAGGAAAGGTACAACTTAGAAATAATAGATTTGAATTAGC
CTTTGTTTGTTGTAAACATAAAAAAACAGTCAATTTAGCCTATCGATTAACATATTAAAT
ATCAAGAAATTTATTTAATTCCAGAATTTTGTTTGATTTTTTTCCAACTAAAACCTCAAA
AATTCAACAAAATTAAACAAATTCAAGTTAATTTGAGATAAAAGATTTATTATCTAAAAT
TTTTATAAAAATTACAACACGAAACAGGAATATAAATTAGCAAAGAAAGTTGCACTGTAA
ATGCATATGCATTAAATCCACCAAAATTAATTTTTTAAAAGAATAAAAAATTTATTGATT
TAAAAAATTCTAAAACTAATTTTAATATATCCAACTAAATATTAAGTAATATATCATTCA
AAGAATGGATTTTTATATATCCAAAAAGTGATGCAAATTTGTGCTTATAATTATCATAAT
AAATTTAAGAATAAGGTCAAGTGCTAGGAATTAGAATTCCTCAACCAACTATGATATAAA
TGAAAAGGCACAATCTTTCAGATGGAATAAATTTATTGGAGAATTACTTTTTAGTGAATT
AAGTACCTTAATTTATTCTTTCTTATGTAAATTTTAACCATCCAAGACAATAAACTTTTT
ACTAAGAACTGAAATTATATTTGTATGCTACTGTAGCCATTGAGCACTAGCATTTCAATG
ATGATTTTTCTTGCCATAAAAATAAAAATGCTGCTATTTCTTCTCTAATTATCTAAATTG
CTTCTAAATTAGGATATCCTTTATGGTAAACACACATTCCTAATCAAATATTTAATAAAA
CAATGATCATAGCAATCGCAGTAGAGCAAAAAACACTCCATCGTAAATTAATAAATTACA
TGAAAAAATTATTTAATTTTTAATTAATTCAATCAAGATTATTGATTAGTTTTTAATTTA
AAATAATTTTATAGTTAATAAATAATAGCAAATGATAGCAGTTGTTACCACAATAAGCAA
GGATTTTACTTAAATGCACTCAGAGATTTTTTTTAATGAGATATAAAATGGACCAATTTC
AATACTCTCTAAAATTATTTTGAGCTCTATAAAGAATTATGTTTTAAATACAAAACAACT
TCCTGATTAAATAATAATATATAGATAAGGTTTAATAGAACCTTCCTTATAAATAGAAAA
GGAATCTATTATAAATGGTTTTAGGCTTTTTAAGGAAGATTATTAACCTAAATTTGCTTA
TTTTTGTGTTAGTTAATCCAAAAAGCAATAGATTTTCTCTTAAAGTGACTAAAAGATGGA
TATCACCGGAAGTGTAATTCCTTTGGTACAAAATAATTAAGTGAAATTTGAGTTTTTTCT
TTGTTCTAAGATTATCTAAGAAGGTTTTAGCATACCAACAAGATATTCATGCTTATATGA
TGATACTTTAATCTCATAAGAGTAGCATTGGCAATTTACTTATTACTAATGCTTCAATTA
CTTTAATTTTCAAGGAGCATTAAAGATACCAGCACAACTTAAATATGCTTGTAAGCTATT
AAAATTTAGAAAATATGTTATGGAAATTGATCCATCCAAAGACTTAAAGCAAAGCTTTTA
CTATATTTGAAAATTTTAATCTAAAGTGAATTACTCATATCTAAATGGATGGATACTAAA
ATAATAATCTAATAAATTAATTATTAATTAGAATTAATTAATAATCTTTAAAATTTAAAT
AAATAAAGTAGCTTTTTTATCTAATACAATGTATTTGAATTATATATTTCTAATAAAAAT
CCTATTTTAATAATAATCAATCACTTT