Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00726050

Standard Name

TTN2 (Tetrahymena Tudor Nuclease 2)

Aliases

PreTt21871 | 117.m00123

Description

TTN2 tudor domain protein; Tudor domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• hydrolase activity, acting on ester bonds (IEA) | GO:0016788
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676

Domains

• ( PF00567 ) Tudor domain
• ( TIGR00166 ) ribosomal protein S6
• ( PF00565 ) Staphylococcal nuclease homologue
• ( PF08518 ) Spa2 homology domain (SHD) of

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.6%

TetraMine Data

TTHERM_00726050

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_16738	0
Tetrahymena borealis	EI9_04596.1	9.997093137033517e-262	tudor domain-containing protei n (826 aa)
Oxytricha	Contig20252.0.g83	5.998312950603665e-35	Staphylococcal nuclease homolo gue
WormBase	WBGene00006626	0.000000000029994712494008525	locus:tsn-1 status:Confirmed UniProt:Q19328 protein_id :CCD69204.1
DictyBase	DDB_G0279659	0.000019995566179747357	snd1 on chromosome: 3 position 2397433 to 2400394

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:17715366: Howard-Till RA, Yao MC (2007) Tudor nuclease genes and programmed DNA rearrangements in Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 6(10):1795-804

Sequences

>TTHERM_00726050(coding)
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GGAATTTGGGCTCTGAATAATCAAGATAGATTATCTGATGACGAAGGAGATAGTAGTGAT
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>TTHERM_00726050(protein)
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NPFSDELFQDLEYDATDQQIGIWALNNQDRLSDDEGDSSDSYDY

>TTHERM_00726050(gene)
ATGAAGACTGGACTTTTAGCAAACATTATTTCAAGCAGAAATATTATTATATAGAAAAAA
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ATCAAGATAGATTATCTGATGACGAAGGAGATAGTAGTGATAGTTATGACTATTGA