Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00327110
Standard Name
TTLL6F
Aliases
PreTt30214 | 33.m00226 | 3705.m00054
Description
TTLL6F tubulin-tyrosine ligase family protein; Tubulin-tyrosine ligase family protein- Beta-tubulin polyglutamylase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( PF08231 ) SYF2 splicing factor
( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%
TetraMine Data
TTHERM_00327110
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_08607.1 9.997093137033517e-262 tubulin-tyrosine ligase (921 a
a)
Oxytricha Contig759.1.g38 1.0004236668521093e-146 Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor Coeruleus SteCoe_8026 4.020060215743355e-74
WormBase WBGene00008331 1.9999167998962255e-60 locus:ttll-5 status:Partiall
y_confirmed UniProt:O17720
protein_id:CAB02862.3
DictyBase DDB_G0281541 5.0000961330688895e-23 DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGD YBR094W 0.000019995566179747357 PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:15890843 : Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00327110(coding)ATG TCT TAG AGC GAT TTT AAA GAG GAG TAA TTA GAC TCT AAA AAG AGC AGT AAG CAA GTT GCT GAT AAA AAG GAA TTG GTT TTA GGT ATC AAT TTT GAT CCT GAT AAA GAG GAA TAC GAT GGA AAC TAC TCT GAT TCT GGA GAA GAA TCC GAA TCA GAA TAA GCA TAA ACA AAT TAT GAC GAT GAT ATG GCA GAA GAT GAG TAA CTA GTG CCA GAA GAT GGT GTT TCA ACA AAA TAA AAT AAT AAT AAA AAA GGA AAC GGT GAT AAA AAA ACT AAG AAA GTA AAA AAA GCT CCT GCA AAA TAG GCA TCT TAG GCT AAA AGA AAG CCA CAA ACT TTG GTT ATG AAT GTT GCT GAT ACA TAG TAT CCT GTT GTT AAA TTC GTG GGC AAA AAG ATT TTC AAA TGG AAA CTT TGT TAT GAT GCA GAA AAC ACT GAT TGC GAT ATT ACT TGG ACT GAT AAC GCT GTT TAA CCA GAA TAG CTA GGA AAA ATG CAG CCC CAT TAA AAA ATT AAT CAC TTT CCT GGC ATG TTT GTG CTA GCT AGA AAA AAC CAC TTA GCT AGA AAT CTA AAA AAA ATG AAG AAA CAG TTC CCT GAT CAC TAT AAA TTT TTC CCT TAA ACT TGG TTA TTG CCT GCT GAA TAC AAC GAA CTT CGT ACT GAA TTC GAT AAG ATC TCT AAA GGA AAA TGC AAA ACA TTT ATT GTT AAA CCA GAA GCA AGT TGC TAG GGA AGA GGT ATC TTT TTG ACT AGG AAT TTA GAT GAT TTA AAC AGT ACC GAT CAT TAT GTA GTT TAA AGA TAT TTA CAC AAG CCC TAT CTC ATA GAT GGA TTA AAG TTT GAT TTT AGA ATT TAC GTT TTG CTT GCA GCT TGT GAT CCT ATG AGA ATA TAT ATT TTT AAA GAA GGA TTA GCT CGT TTA GCT ACA GAA GAA TAT GAA GCT CCA CAT CGT GAT AAT TTA GAT AAT CTT TGC ATG CAC TTA ACT AAC TAT GCC ATC AAT AAA GAT AAC CCT AAT TTT GAA TTT AAT GAA GAT GAA AAT TAA ATG GAT GTA GGT CAC AAA AGG TCT TTG ACT TCA GTA ATG GAG CTT CTT AAA AAT TAA GGA CAT GAT ATT TAA AAG TTA TGG GAT CAA ATT AAG GAC ATC ATA ATA AAA ACA ATA ATT AGT GCT TAG CCT ACT CTA AGT CAT CAC TAT AAA TCT TGT CAA CCA GAT AAC TAC ATG AAT AAT ATG TGT TTT GAA ATA TTG GGA TTT GAT GTT TTC TTA GAC GCC CAT TTA AAA CCT TGG CTA TTA GAA ATT AAT CAT ACT CCT AGT TTT ACT ACA GAT ACT CCT CTT GAT AGT TTG ATC AAA AAG AAT TGT ATC CGT GAT GCA TTA ACA TTG ATG AAT TCG ACT GTT AAA GCT AGA AAC GAA ATT GTT TCA CAA AGA AAG GAA TAA CTT TAA AAA AGA GTC CTA ACT GGT AAA AAA TAA AAA TTA ACA GCT GAA GAA AAA GCA GCT GAA ATA AAA AAA GCT ATG TAA AAG AGG GAT GAG TAC GAA TCA AAG AAT TTA GGA AAC TAT GAA AAG GTT TAT CCT CTA GAA CCT GAT GTT GAA GAT ATT TAC ATT GCT TTC CAA CAA CAC TCT CAA TAG CTT TAT GAA AAC TGG ACG GGA GCA AAT ATT AGA AGA GTC TCA AAG AAA GAC AGT TCA ATA GGA GGT AAT ACT ATC TAA GGA ACA ACA GCG AAT AAC AGT GTC AAA GGA GTA CCA AAT TAA CAA AGA AAT TCG ATA AAT GAT AAA AAT AAA CCA AAC TTA CCT GCA GCT AAG GTA CCA ATT AAG CCA GTT GCA GCC ACC AAA TAA GTG ATT CCT AAA GTT GTC TAA AAT AAG ACT CAA GTT CCC ACC TTC TCT TCA AGC TCG AAA ATT AGA TCA AAT GAA AAT ATT GAA GGA GAA GAT GGA TAA TTT AAA CTC CCT AAA TAA ATA AAA TTA TAG AGC CAG CAG ACA TCC AGC AAC TTG AGT GCT AGC CAA ACA GGT GGC TAC TCT GAG ACT TAC TAA ATT AAT GAA ACA CCT GGA AAG TTT TCT GAT AAT AAT AGT GGA GTG TAT TAG AAA CCT CCC AGC CCA TTT ACT TTG GGA AGT ACC GGT TAA ATC AGT AGC TTA GAT GCA AGA AAA TAG TAC GCT ATT CCA AAA TAA ATA GGC TCA TCT CTA TAA AAC GAA GAA GAA AGA CAG TAA ATG GTA AAA AAA TAT GCA TAG TTT GCA ATA GAT CTT AAT TCC TAA TCA AGT AAT ACT AGC AGC TCT TTG AAT AAT GTC TAA ATT TAA AAG AAA TAA TAC GAA AAC ACT AAT TAA CTA ACC TAA CAA TAC AAT ACC GAT ATA AAT GCT TAA CAA TCT CCA TAT CAG TAT ATC AGA TAA CAA AGC CAG CAG AGC TCA ATT TAA CCT CCT CAG AAT TTA AAT AGC ACT GGT AGA CCC TAA TTT CAA TAA ATT AAT ATG CAG TAA TAC CCA GTT AAA ATG CTT CCT GGA CTT GTA AGA AAC GGT ATG AAT AAC GAT GAC TAT GTA GCA TTG ACT CAT CAA AAA AGA ATG TAA GAA ATG AAT AAG TAC TCT AAA CCA TTA TAA ACT TCA AAT AAC AAT GGA CTT TAT TTG TAG CCA AAG CTA TTT GAT CTA AAT GTA TTA ACC AAA ATG AAT GAT GAA GAA CCT ATA AGA AAA GAT TAA ATA GTT AGA AAT AAG TAA GTG GTA TAC TCA AAT ATC TCC TCA AAT AAC TTT GGT AAT AAC TAT GAT ATA AAT TCA TAA AAG CTA ATA ACT AAT AAT AAT TAC TAT ACA AGA AGA AAA TGA >TTHERM_00327110(protein)M S Q S D F K E E Q L D S K K S S K Q V A D K K E L V L G I N F D P D K E E Y D G N Y S D S G E E S E S E Q A Q T N Y D D D M A E D E Q L V P E D G V S T K Q N N N K K G N G D K K T K K V K K A P A K Q A S Q A K R K P Q T L V M N V A D T Q Y P V V K F V G K K I F K W K L C Y D A E N T D C D I T W T D N A V Q P E Q L G K M Q P H Q K I N H F P G M F V L A R K N H L A R N L K K M K K Q F P D H Y K F F P Q T W L L P A E Y N E L R T E F D K I S K G K C K T F I V K P E A S C Q G R G I F L T R N L D D L N S T D H Y V V Q R Y L H K P Y L I D G L K F D F R I Y V L L A A C D P M R I Y I F K E G L A R L A T E E Y E A P H R D N L D N L C M H L T N Y A I N K D N P N F E F N E D E N Q M D V G H K R S L T S V M E L L K N Q G H D I Q K L W D Q I K D I I I K T I I S A Q P T L S H H Y K S C Q P D N Y M N N M C F E I L G F D V F L D A H L K P W L L E I N H T P S F T T D T P L D S L I K K N C I R D A L T L M N S T V K A R N E I V S Q R K E Q L Q K R V L T G K K Q K L T A E E K A A E I K K A M Q K R D E Y E S K N L G N Y E K V Y P L E P D V E D I Y I A F Q Q H S Q Q L Y E N W T G A N I R R V S K K D S S I G G N T I Q G T T A N N S V K G V P N Q Q R N S I N D K N K P N L P A A K V P I K P V A A T K Q V I P K V V Q N K T Q V P T F S S S S K I R S N E N I E G E D G Q F K L P K Q I K L Q S Q Q T S S N L S A S Q T G G Y S E T Y Q I N E T P G K F S D N N S G V Y Q K P P S P F T L G S T G Q I S S L D A R K Q Y A I P K Q I G S S L Q N E E E R Q Q M V K K Y A Q F A I D L N S Q S S N T S S S L N N V Q I Q K K Q Y E N T N Q L T Q Q Y N T D I N A Q Q S P Y Q Y I R Q Q S Q Q S S I Q P P Q N L N S T G R P Q F Q Q I N M Q Q Y P V K M L P G L V R N G M N N D D Y V A L T H Q K R M Q E M N K Y S K P L Q T S N N N G L Y L Q P K L F D L N V L T K M N D E E P I R K D Q I V R N K Q V V Y S N I S S N N F G N N Y D I N S Q K L I T N N N Y Y T R R K >TTHERM_00327110(gene)ATG TCT TAG AGC GAT TTT AAA GAG GAG TAA TTA GAC TCT AAA AAG AGC AGT AAG CAA GTT GCT GAT AAA AAG GAA TTG GTT TTA GGT ATC AAT TTT GAT CCT GAT AAA GAG GAA TAC GAT GGA AAC TAC TCT GAT TCT GGA GAA GAA TCC GAA TCA GAA TAA GCA TAA ACA AAT TAT GAC GAT GAT ATG GCA GAA GAT GAG TAA CTA GTG CCA GAA GAT GGT GTT TCA ACA AAA TAA AAT AAT AAT AAA AAA GGA AAC GGT GAT AAA AAA ACT AAG AAA GTA AAA AAA GCT CCT GCA AAA TAG GCA TCT TAG GCT AAA AGA AAG CCA CAA ACT TTG GTT ATG AAT GTT GCT GGT TTG TTA TTT TTT GAT TTC TTT TAG CTT TTT TTC CTT TAA AAT TAT ATA GTT AGA TTT TAA CTA ACC TAC TAC CTA CCT ACA TAC ATA CAT ACC AAG CTA TTT CTT ATT CAT TAA GTA TAA ATA AAT CAC ACA AGC AAA AAT CTT TAA AAA TAT GTT AAA AAA ATA TTG AAT TTA AGC ATT CGC TGT CCT TTT CCC ATT TAA ACA TAA AAT GAA TTT TAA AAA AGC ATT ATT TTA GTC ATT TTA AAA GTA AAG CAG GAA AAA TAA GCT CAA ATT GTA AAG TTA ATC ACT CCT CAG TTG CAG ATT TTA AAA ATT TTT TAT AAG AAA TGA AAT AAA ATT TCT GCA CAA ATA GAG CAA ATT TAA CAG ATA TTG AAT AAT AAA TGA GTA GCA GGT GTA GTA TTA ATG AGA GTA TTA GCT AAT ATT ATG ATT TAA ATT ACA ATT ATT AAC AAA TAT AGA TAC ATA GTA TCC TGT TGT TAA ATT CGT GGG CAA AAA GAT TTT CAA ATG GAA ACT TTG TTA TGA TGC AGA AAA CAC TGA TTG CGA TAT TAC TTG GAC TGA TAA CGC TGT TTA ACC AGA ATA GCT AGG AAA AAT GCA GCC CCA TTA AAA AAT TAA TCA CTT TCC TGG CAT GTT TGT GCT AGC TAG AAA AAA CCA CTT AGC TAG AAA TCT AAA AAA AAT GAA GAA ACA GTT CCC TGA TCA CTA TAA ATT TTT CCC TTA AAC TTG GTT ATT GCC TGC TGA ATA CAA CGA ACT TCG TAC TGA ATT CGA TAA GAT CTC TAA AGG AAA ATG CAA AAC ATT TAT TGT TAA ACC AGT AAC TAA CTA ATT ATT TGA TGA TTT ATT TTT GAA ATG ACA AAA AAA ATA AGC AAA TGG AAT TAT TCG TTT ATT ATT AAT TCT CAA AGA GTA GAT TTA CAA TTT TAT TAA AAT TAA AAG CAA CAA CAG CTT TTA TAA AAT TTG ACC CAA TTC TTT GGA CAT AAA AAT TTT AAA TAA ACA AAT TGT TTC ATT TAA TAT GAT AGA ATT AAG ACT GTT AGA AAT TTC ATC AAT ATT TTA AAT GCA AAT TAA ATA AAC AGA TAT TTG CTT TTA GAT GAA TAG AAT ATT AGA AAT ATA TTT TTG CAG TTT AAA TAT TTA TAT TTT CTT TAT AAC AGG AAG CAA GTT GCT AGG GAA GAG GTA TCT TTT TGA CTA GGA ATT TAG ATG ATT TAA ACA GTA CCG ATC ATT ATG TAG TTT AAA GGT AAA ATA AAT AAT TAT TTT CTC TAT TAA AAA TAA TAT TAT TTT TTA TAG ATA TTT ACA CAA GCC CTA TCT CAT AGA TGG ATT AAA GTT TGA TTT TAG AAT TTA CGT TTT GCT TGC AGC TTG TGA TCC TAT GAG AAT ATA TAT TTT TAA AGA AGG ATT AGC TCG TTT AGC TAC AGA AGA ATA TGA AGC TCC ACA TCG TGA TAA TTT AGA TAA TCT TTG CAT GCA CTT AAC TAA CTA TGC CAT CAA TAA AGA TAA CCC TAA TTT TGA ATT TAA TGA AGA TGA AAA TTA AAT GGA TGT AGG TCA CAA AAG GTC TTT GAC TTC AGT AAT GGA GGT AAA CCT TTT TAA TCA AAA AAG CTC AAA AAA TAT TAA ACC AAA AAA ATC TCA TAG CAA TAA AAA TTT AAT CTA ATT TTT TAT CGA AAA AGC TTC TTA AAA ATT AAG GAC ATG ATA TTT AAA AGT TAT GGG ATC AAA TTA AGG ACA TCA TAA TAA AAA CAA TAA TTA GTG CTT AGC CTA CTC TAA GTC ATC ACT ATA AAT CTT GTC AAC CAG ATA ACT ACA TGA ATA ATA TGT GTT TTG AAA TAT TGG GAT TTG ATG TTT TCT TAG ACG CCC ATT TAA AAC CTT GGC TAT TAG AAA TTA ATC ATA CTC CTA GTT TTA CTA CAG ATA CTC CTC TTG ATA GTT TGA TCA AAA AGA ATT GTA TCC GTG ATG CAT TAA CAT TGA TGA ATT CGA CTG TTA AAG CTA GAA ACG AAA TTG TTT CAC AAA GAA AGG AAT AAC TTT AAA AAA GAG TCC TAA CTG GTA AAA AAT AAA AAT TAA CAG CTG AAG AAA AAG CAG CTG AAA TAA AAA AAG CTA TGT AAA AGA GGG ATG AGT ACG AAT CAA AGA ATT TAG GAA ACT ATG AAA AGG TTT ATC CTC TAG AAG TAA ATA AAT TTA TTT AAT TAA CCC TAA GTT AAT ATT CTA AAA ATA AAT AAA AAG CCT GAT GTT GAA GAT ATT TAC ATT GCT TTC CAA CAA CAC TCT CAA TAG CTT TAT GAA AAC TGG ACG GGA GCA AGT AAT TAA TAT AAA TAG ATG ATT TTG GAT TTA AAT TTA TTT TGA TAA TCT AAA AAG ATA TTA GAA GAG TCT CAA AGA AAG ACA GTT CAA TAG GAG GTA ATA CTA TCT AAG GAA CAA CAG CGA ATA ACA GTG TCA AAG GAG TAC CAA ATT AAC AAA GAA ATT CGA TAA ATG ATA AAA ATA AAC CAA ACT TAC CTG CAG CTA AGG TAC CAA TTA AGC CAG TTG CAG CCA CCA AAT AAG TGA TTC CTA AAG TTG TCT AAA ATA AGA CTC AAG TTC CCA CCT TCT CTT CAA GCT CGA AAA TTA GAT CAA ATG AAA ATG TAA CAA AAT TTT TAA TTT GAA CAT AAA AAT GAT TAG TAC AGG TTT GAA TAT AAA TAT ATA TAT GAT ATT TAT ATA ATA TTA AGA TTG AAG GAG AAG ATG GAT AAT TTA AAC TCC CTA AAT AAA TAA AAT TAT AGA GCC AGC AGA CAT CCA GCA ACT TGA GTG CTA GCC AAA CAG GTG GCT ACT CTG AGA CTT ACT AAA TTA ATG AAA CAC CTG GAA AGT TTT CTG ATA ATA ATA GTG GAG TGT ATT AGA AAC CTC CCA GCC CAT TTA CTT TGG GAA GTA CCG GTT AAA GTA AAT ATT TTA AAT ATT GAT ATA TGG CTT TAA AAG AAC TTT TGT TTA ACT TAT TTA GTC AGT AGC TTA GAT GCA AGA AAA TAG TAC GCT ATT CCA AAA TAA ATA GGC TCA TCT CTA TAA AAC GAA GAA GAA AGA CAG TAA ATG GTA AAA AAA TAT GCA TAG TTT GCA ATA GAT CTT AAT TCC TAA TCA AGT AAT ACT AGC AGC TCT TTG AAT AAT GTC TAA ATT TAA AAG AAA TAA TAG TAA GTT ATT ATT TAT TGA TGT TAG TTT ATT AAT CAT GAT AAT TAA TTA CTA TAT TAA AAG CGA AAA CAC TAA TTA ACT AAC CTA ACA ATA CAA TAC CGA TAT AAA TGC TTA ACA ATC TCC ATA TCA GTA TAT CAG ATA ACA AAG CCA GCA GAG CTC AAT TTA ACC TCC TCA GAA TTT AAA TAG CAC TGG TAG ACC CTA ATT TCA ATA AAT TAA TAT GCA GTA ATA CCC AGT TAA AAT GCT TCC TGG ACT TGT AAG AAA CGG TAT GAA TAA CGA TGA CTA TGT AGC ATT GAC TCA TCA AAA AAG AAT GTA AGA AAT GAA TAA GTA CTC TAA ACC ATT ATA GTA AAT ATT TTA CAT ACT AAA TTG ATT TAT TTA TAA ATT TAA TTA ATT TAT TAT AAA TAT AAA ATA AAC AAA CTC TTT CTT GAT AAA GAA ATG AAT AAA CTT TTA AAA TAG CTA TTT AAT ATT AAC ATT TTT TTA TTG ATT AAA AAA GAA CTT CAA ATA ACA ATG GAC TTT ATT TGT AGC CAA AGC TAT TTG ATC TAA ATG TAT TAA CCA AAA TGA ATG ATG AAG AAC CTA TAA GAA AAG ATT AAA TAG TTA GAA ATA AGT AAG TGG TAT ACT CAA ATA TCT CCT CAA ATA ACT TTG GTA ATA ACT ATG ATA TAA ATT CAT AAA AGC TAA TAA CTA ATA ATA ATT ACT ATA CAA GAA GAA AAT GA