Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00327110

Standard Name

TTLL6F

Aliases

PreTt30214 | 33.m00226 | 3705.m00054

Description

Tubulin-tyrosine ligase family protein, Beta-tubulin polyglutamylase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF08231 ) SYF2 splicing factor
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%

TetraMine Data

TTHERM_00327110

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_08607.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (921 a
a)
OxytrichaContig759.1.g381.0004236668521093e-146Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_80264.020060215743355e-74
WormBaseWBGene000083311.9999167998962255e-60locus:ttll-5 status:Partiall
y_confirmed UniProt:O17720
protein_id:CAB02862.3
DictyBaseDDB_G02815415.0000961330688895e-23DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.000019995566179747357PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00327110(coding)
ATGTCTTAGAGCGATTTTAAAGAGGAGTAATTAGACTCTAAAAAGAGCAGTAAGCAAGTT
GCTGATAAAAAGGAATTGGTTTTAGGTATCAATTTTGATCCTGATAAAGAGGAATACGAT
GGAAACTACTCTGATTCTGGAGAAGAATCCGAATCAGAATAAGCATAAACAAATTATGAC
GATGATATGGCAGAAGATGAGTAACTAGTGCCAGAAGATGGTGTTTCAACAAAATAAAAT
AATAATAAAAAAGGAAACGGTGATAAAAAAACTAAGAAAGTAAAAAAAGCTCCTGCAAAA
TAGGCATCTTAGGCTAAAAGAAAGCCACAAACTTTGGTTATGAATGTTGCTGATACATAG
TATCCTGTTGTTAAATTCGTGGGCAAAAAGATTTTCAAATGGAAACTTTGTTATGATGCA
GAAAACACTGATTGCGATATTACTTGGACTGATAACGCTGTTTAACCAGAATAGCTAGGA
AAAATGCAGCCCCATTAAAAAATTAATCACTTTCCTGGCATGTTTGTGCTAGCTAGAAAA
AACCACTTAGCTAGAAATCTAAAAAAAATGAAGAAACAGTTCCCTGATCACTATAAATTT
TTCCCTTAAACTTGGTTATTGCCTGCTGAATACAACGAACTTCGTACTGAATTCGATAAG
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GGTATCTTTTTGACTAGGAATTTAGATGATTTAAACAGTACCGATCATTATGTAGTTTAA
AGATATTTACACAAGCCCTATCTCATAGATGGATTAAAGTTTGATTTTAGAATTTACGTT
TTGCTTGCAGCTTGTGATCCTATGAGAATATATATTTTTAAAGAAGGATTAGCTCGTTTA
GCTACAGAAGAATATGAAGCTCCACATCGTGATAATTTAGATAATCTTTGCATGCACTTA
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ATGGATGTAGGTCACAAAAGGTCTTTGACTTCAGTAATGGAGCTTCTTAAAAATTAAGGA
CATGATATTTAAAAGTTATGGGATCAAATTAAGGACATCATAATAAAAACAATAATTAGT
GCTTAGCCTACTCTAAGTCATCACTATAAATCTTGTCAACCAGATAACTACATGAATAAT
ATGTGTTTTGAAATATTGGGATTTGATGTTTTCTTAGACGCCCATTTAAAACCTTGGCTA
TTAGAAATTAATCATACTCCTAGTTTTACTACAGATACTCCTCTTGATAGTTTGATCAAA
AAGAATTGTATCCGTGATGCATTAACATTGATGAATTCGACTGTTAAAGCTAGAAACGAA
ATTGTTTCACAAAGAAAGGAATAACTTTAAAAAAGAGTCCTAACTGGTAAAAAATAAAAA
TTAACAGCTGAAGAAAAAGCAGCTGAAATAAAAAAAGCTATGTAAAAGAGGGATGAGTAC
GAATCAAAGAATTTAGGAAACTATGAAAAGGTTTATCCTCTAGAACCTGATGTTGAAGAT
ATTTACATTGCTTTCCAACAACACTCTCAATAGCTTTATGAAAACTGGACGGGAGCAAAT
ATTAGAAGAGTCTCAAAGAAAGACAGTTCAATAGGAGGTAATACTATCTAAGGAACAACA
GCGAATAACAGTGTCAAAGGAGTACCAAATTAACAAAGAAATTCGATAAATGATAAAAAT
AAACCAAACTTACCTGCAGCTAAGGTACCAATTAAGCCAGTTGCAGCCACCAAATAAGTG
ATTCCTAAAGTTGTCTAAAATAAGACTCAAGTTCCCACCTTCTCTTCAAGCTCGAAAATT
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TTATAGAGCCAGCAGACATCCAGCAACTTGAGTGCTAGCCAAACAGGTGGCTACTCTGAG
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AAACCTCCCAGCCCATTTACTTTGGGAAGTACCGGTTAAATCAGTAGCTTAGATGCAAGA
AAATAGTACGCTATTCCAAAATAAATAGGCTCATCTCTATAAAACGAAGAAGAAAGACAG
TAAATGGTAAAAAAATATGCATAGTTTGCAATAGATCTTAATTCCTAATCAAGTAATACT
AGCAGCTCTTTGAATAATGTCTAAATTTAAAAGAAATAATACGAAAACACTAATTAACTA
ACCTAACAATACAATACCGATATAAATGCTTAACAATCTCCATATCAGTATATCAGATAA
CAAAGCCAGCAGAGCTCAATTTAACCTCCTCAGAATTTAAATAGCACTGGTAGACCCTAA
TTTCAATAAATTAATATGCAGTAATACCCAGTTAAAATGCTTCCTGGACTTGTAAGAAAC
GGTATGAATAACGATGACTATGTAGCATTGACTCATCAAAAAAGAATGTAAGAAATGAAT
AAGTACTCTAAACCATTATAAACTTCAAATAACAATGGACTTTATTTGTAGCCAAAGCTA
TTTGATCTAAATGTATTAACCAAAATGAATGATGAAGAACCTATAAGAAAAGATTAAATA
GTTAGAAATAAGTAAGTGGTATACTCAAATATCTCCTCAAATAACTTTGGTAATAACTAT
GATATAAATTCATAAAAGCTAATAACTAATAATAATTACTATACAAGAAGAAAATGA


>TTHERM_00327110(protein)
MSQSDFKEEQLDSKKSSKQVADKKELVLGINFDPDKEEYDGNYSDSGEESESEQAQTNYD
DDMAEDEQLVPEDGVSTKQNNNKKGNGDKKTKKVKKAPAKQASQAKRKPQTLVMNVADTQ
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NHLARNLKKMKKQFPDHYKFFPQTWLLPAEYNELRTEFDKISKGKCKTFIVKPEASCQGR
GIFLTRNLDDLNSTDHYVVQRYLHKPYLIDGLKFDFRIYVLLAACDPMRIYIFKEGLARL
ATEEYEAPHRDNLDNLCMHLTNYAINKDNPNFEFNEDENQMDVGHKRSLTSVMELLKNQG
HDIQKLWDQIKDIIIKTIISAQPTLSHHYKSCQPDNYMNNMCFEILGFDVFLDAHLKPWL
LEINHTPSFTTDTPLDSLIKKNCIRDALTLMNSTVKARNEIVSQRKEQLQKRVLTGKKQK
LTAEEKAAEIKKAMQKRDEYESKNLGNYEKVYPLEPDVEDIYIAFQQHSQQLYENWTGAN
IRRVSKKDSSIGGNTIQGTTANNSVKGVPNQQRNSINDKNKPNLPAAKVPIKPVAATKQV
IPKVVQNKTQVPTFSSSSKIRSNENIEGEDGQFKLPKQIKLQSQQTSSNLSASQTGGYSE
TYQINETPGKFSDNNSGVYQKPPSPFTLGSTGQISSLDARKQYAIPKQIGSSLQNEEERQ
QMVKKYAQFAIDLNSQSSNTSSSLNNVQIQKKQYENTNQLTQQYNTDINAQQSPYQYIRQ
QSQQSSIQPPQNLNSTGRPQFQQINMQQYPVKMLPGLVRNGMNNDDYVALTHQKRMQEMN
KYSKPLQTSNNNGLYLQPKLFDLNVLTKMNDEEPIRKDQIVRNKQVVYSNISSNNFGNNY
DINSQKLITNNNYYTRRK


>TTHERM_00327110(gene)
ATGTCTTAGAGCGATTTTAAAGAGGAGTAATTAGACTCTAAAAAGAGCAGTAAGCAAGTT
GCTGATAAAAAGGAATTGGTTTTAGGTATCAATTTTGATCCTGATAAAGAGGAATACGAT
GGAAACTACTCTGATTCTGGAGAAGAATCCGAATCAGAATAAGCATAAACAAATTATGAC
GATGATATGGCAGAAGATGAGTAACTAGTGCCAGAAGATGGTGTTTCAACAAAATAAAAT
AATAATAAAAAAGGAAACGGTGATAAAAAAACTAAGAAAGTAAAAAAAGCTCCTGCAAAA
TAGGCATCTTAGGCTAAAAGAAAGCCACAAACTTTGGTTATGAATGTTGCTGGTTTGTTA
TTTTTTGATTTCTTTTAGCTTTTTTTCCTTTAAAATTATATAGTTAGATTTTAACTAACC
TACTACCTACCTACATACATACATACCAAGCTATTTCTTATTCATTAAGTATAAATAAAT
CACACAAGCAAAAATCTTTAAAAATATGTTAAAAAAATATTGAATTTAAGCATTCGCTGT
CCTTTTCCCATTTAAACATAAAATGAATTTTAAAAAAGCATTATTTTAGTCATTTTAAAA
GTAAAGCAGGAAAAATAAGCTCAAATTGTAAAGTTAATCACTCCTCAGTTGCAGATTTTA
AAAATTTTTTATAAGAAATGAAATAAAATTTCTGCACAAATAGAGCAAATTTAACAGATA
TTGAATAATAAATGAGTAGCAGGTGTAGTATTAATGAGAGTATTAGCTAATATTATGATT
TAAATTACAATTATTAACAAATATAGATACATAGTATCCTGTTGTTAAATTCGTGGGCAA
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GACTGATAACGCTGTTTAACCAGAATAGCTAGGAAAAATGCAGCCCCATTAAAAAATTAA
TCACTTTCCTGGCATGTTTGTGCTAGCTAGAAAAAACCACTTAGCTAGAAATCTAAAAAA
AATGAAGAAACAGTTCCCTGATCACTATAAATTTTTCCCTTAAACTTGGTTATTGCCTGC
TGAATACAACGAACTTCGTACTGAATTCGATAAGATCTCTAAAGGAAAATGCAAAACATT
TATTGTTAAACCAGTAACTAACTAATTATTTGATGATTTATTTTTGAAATGACAAAAAAA
ATAAGCAAATGGAATTATTCGTTTATTATTAATTCTCAAAGAGTAGATTTACAATTTTAT
TAAAATTAAAAGCAACAACAGCTTTTATAAAATTTGACCCAATTCTTTGGACATAAAAAT
TTTAAATAAACAAATTGTTTCATTTAATATGATAGAATTAAGACTGTTAGAAATTTCATC
AATATTTTAAATGCAAATTAAATAAACAGATATTTGCTTTTAGATGAATAGAATATTAGA
AATATATTTTTGCAGTTTAAATATTTATATTTTCTTTATAACAGGAAGCAAGTTGCTAGG
GAAGAGGTATCTTTTTGACTAGGAATTTAGATGATTTAAACAGTACCGATCATTATGTAG
TTTAAAGGTAAAATAAATAATTATTTTCTCTATTAAAAATAATATTATTTTTTATAGATA
TTTACACAAGCCCTATCTCATAGATGGATTAAAGTTTGATTTTAGAATTTACGTTTTGCT
TGCAGCTTGTGATCCTATGAGAATATATATTTTTAAAGAAGGATTAGCTCGTTTAGCTAC
AGAAGAATATGAAGCTCCACATCGTGATAATTTAGATAATCTTTGCATGCACTTAACTAA
CTATGCCATCAATAAAGATAACCCTAATTTTGAATTTAATGAAGATGAAAATTAAATGGA
TGTAGGTCACAAAAGGTCTTTGACTTCAGTAATGGAGGTAAACCTTTTTAATCAAAAAAG
CTCAAAAAATATTAAACCAAAAAAATCTCATAGCAATAAAAATTTAATCTAATTTTTTAT
CGAAAAAGCTTCTTAAAAATTAAGGACATGATATTTAAAAGTTATGGGATCAAATTAAGG
ACATCATAATAAAAACAATAATTAGTGCTTAGCCTACTCTAAGTCATCACTATAAATCTT
GTCAACCAGATAACTACATGAATAATATGTGTTTTGAAATATTGGGATTTGATGTTTTCT
TAGACGCCCATTTAAAACCTTGGCTATTAGAAATTAATCATACTCCTAGTTTTACTACAG
ATACTCCTCTTGATAGTTTGATCAAAAAGAATTGTATCCGTGATGCATTAACATTGATGA
ATTCGACTGTTAAAGCTAGAAACGAAATTGTTTCACAAAGAAAGGAATAACTTTAAAAAA
GAGTCCTAACTGGTAAAAAATAAAAATTAACAGCTGAAGAAAAAGCAGCTGAAATAAAAA
AAGCTATGTAAAAGAGGGATGAGTACGAATCAAAGAATTTAGGAAACTATGAAAAGGTTT
ATCCTCTAGAAGTAAATAAATTTATTTAATTAACCCTAAGTTAATATTCTAAAAATAAAT
AAAAAGCCTGATGTTGAAGATATTTACATTGCTTTCCAACAACACTCTCAATAGCTTTAT
GAAAACTGGACGGGAGCAAGTAATTAATATAAATAGATGATTTTGGATTTAAATTTATTT
TGATAATCTAAAAAGATATTAGAAGAGTCTCAAAGAAAGACAGTTCAATAGGAGGTAATA
CTATCTAAGGAACAACAGCGAATAACAGTGTCAAAGGAGTACCAAATTAACAAAGAAATT
CGATAAATGATAAAAATAAACCAAACTTACCTGCAGCTAAGGTACCAATTAAGCCAGTTG
CAGCCACCAAATAAGTGATTCCTAAAGTTGTCTAAAATAAGACTCAAGTTCCCACCTTCT
CTTCAAGCTCGAAAATTAGATCAAATGAAAATGTAACAAAATTTTTAATTTGAACATAAA
AATGATTAGTACAGGTTTGAATATAAATATATATATGATATTTATATAATATTAAGATTG
AAGGAGAAGATGGATAATTTAAACTCCCTAAATAAATAAAATTATAGAGCCAGCAGACAT
CCAGCAACTTGAGTGCTAGCCAAACAGGTGGCTACTCTGAGACTTACTAAATTAATGAAA
CACCTGGAAAGTTTTCTGATAATAATAGTGGAGTGTATTAGAAACCTCCCAGCCCATTTA
CTTTGGGAAGTACCGGTTAAAGTAAATATTTTAAATATTGATATATGGCTTTAAAAGAAC
TTTTGTTTAACTTATTTAGTCAGTAGCTTAGATGCAAGAAAATAGTACGCTATTCCAAAA
TAAATAGGCTCATCTCTATAAAACGAAGAAGAAAGACAGTAAATGGTAAAAAAATATGCA
TAGTTTGCAATAGATCTTAATTCCTAATCAAGTAATACTAGCAGCTCTTTGAATAATGTC
TAAATTTAAAAGAAATAATAGTAAGTTATTATTTATTGATGTTAGTTTATTAATCATGAT
AATTAATTACTATATTAAAAGCGAAAACACTAATTAACTAACCTAACAATACAATACCGA
TATAAATGCTTAACAATCTCCATATCAGTATATCAGATAACAAAGCCAGCAGAGCTCAAT
TTAACCTCCTCAGAATTTAAATAGCACTGGTAGACCCTAATTTCAATAAATTAATATGCA
GTAATACCCAGTTAAAATGCTTCCTGGACTTGTAAGAAACGGTATGAATAACGATGACTA
TGTAGCATTGACTCATCAAAAAAGAATGTAAGAAATGAATAAGTACTCTAAACCATTATA
GTAAATATTTTACATACTAAATTGATTTATTTATAAATTTAATTAATTTATTATAAATAT
AAAATAAACAAACTCTTTCTTGATAAAGAAATGAATAAACTTTTAAAATAGCTATTTAAT
ATTAACATTTTTTTATTGATTAAAAAAGAACTTCAAATAACAATGGACTTTATTTGTAGC
CAAAGCTATTTGATCTAAATGTATTAACCAAAATGAATGATGAAGAACCTATAAGAAAAG
ATTAAATAGTTAGAAATAAGTAAGTGGTATACTCAAATATCTCCTCAAATAACTTTGGTA
ATAACTATGATATAAATTCATAAAAGCTAATAACTAATAATAATTACTATACAAGAAGAA
AATGA