Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00438840

Standard Name

TTLL6D (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt05441 | 49.m00213 | 3708.m00062

Description

Beta-tubulin polyglutamylase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF08650 ) DASH complex subunit Dad4
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00438840

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_12438.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (936 a
a)
OxytrichaContig759.1.g381.9992560499818233e-109Tubulin-tyrosine ligase family
WormBaseWBGene000083313.000969471571755e-58locus:ttll-5 status:Partiall
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ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00438840(coding)
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AAAGTAAATCCTGCTGTTGCTGCTTAAAATAATCATAATTCTTAATCAAGTAGCTCTACT
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GATTCACACTCAGTGTTAAACTCTACTCAAGTAAGTCAGGCTAAGTCAGAATAAAAAACA
AAAGCTCCAAACTCAACTAAAAAAAATCTTTCCTAAGTTTTTGATGATTAAAGAGATAAA
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GAAAATAGAAGCAACAATGGAAATAAACTGTCTAATATTGCAAATGATTCTGTAATATAA
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AGGTAAGAGTTGCATTAACCATCCTTTTTGACTAACTAAAATATTAATAATAATAACAAT
AATATTATTGTGTCTCCATTTTAAATAAACATACAAAATAATTAATAATCAAATAATCAA
ATAAATAATAACACCATATTCAGCAATATAAATAGTAATAATAACAACAATAATAATAAT
GTAAACATAAATACTTTAAATACATAAATTTCTTTCAATTACAACAATAATAATAGTAAT
AACATTTCTAACTATTCAAATGGAAAGAACATCATTTAATAAGAAGTATAAATGTCCTAC
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AATGAGAGTATAGCTGGTAATTATAAAGCAGATTAGTTTTCTAAGCACTCAATTAAACCT
GATTAAGTTATGATTCCAAGCTATACTTAAATAAGGAATAAGACAACAGATTCAATTGAT
AATTTTACAAATTAAAATAATTATTCCTATAATATTGAATCTTAGACAATAGGTGGATTA
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AAAAACACTTCTAATAATTTTAACAATATTTTACTTTATGGTAATGCCTAATAAATTAAC
TCAAACAATCTAAACGATAATAAAATTTACTAAAAAAACTAATTTATAGTTCAACAAAAT
AAGCTTCTTTAAATAAAAAAATGA


>TTHERM_00438840(protein)
MSLQNLNDKQQLIQDDEQMQKEEQNQQFNQKIVNIDQGREGIDYENIYNPKIEEGNQEQA
EIEINLEEEQDDKQYPFMCLSEVVKMTRNIKKNKKIVFDVTDTIYKVIKNQGSVTMGWTT
ITSPPQNREEWNICWYDTYISEEVLRRMLPYQKINHFPGSHNLGKKNYLAANLTRMRKVL
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>TTHERM_00438840(gene)
ATGAGTCTTCAAAATTTAAATGGTATAAAATTTATTGGTTTTTATTTCAACAATTAGAAA
TCACTATGATACTTATATAATAAATTATATAAAATCAATTAAGATAAGTAACAGCTAATT
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AAAAAGAAGAATATTAAAAAAGAGCATAGATAGAAAGCACGTAAAAGATATGATTATGAA
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TTAAGTTATGATTCCAAGCTATACTTAAATAAGGAATAAGACAACAGATTCAATTGATAA
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TCATAGCAATTAAAATCAAACTGCTTAAATAATTAGCTAAAATAATACTCCAATCTTGCA
AGCTATATCACCATAAGGTAAAAATATTGATTAATAGAATATAATGGCCTTAAAAAATCA
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AAACAATCTAAACGATAATAAAATTTACTAAAAAAACTAATTTATAGTTCAACAAAATAA
GCTTCTTTAAATAAAAAAATGA