Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00145320

Standard Name

TTLL6B (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt26740 | 11.m00437 | 3702.m00159

Description

Beta-tubulin polyglutamylase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%

TetraMine Data

TTHERM_00145320

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_04739.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (1106
aa)
OxytrichaContig759.1.g385.999199635766896e-119Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_161806.375869581278994e-59
WormBaseWBGene000192307.999270105144775e-57locus:ttll-11 status:Partial
ly_confirmed UniProt:Q9N5L6
protein_id:CCD68978.1
DictyBaseDDB_G02815416.998542127613979e-20DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.000000100009565553302PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00145320(coding)
ATGGAAGATTACTAAAGTAGCTCTTTTAAAGATGAAGCTCAAGTTTCTTATAGTAAATTA
GATTCTACATCTAAGAGCTCTAAGAATCAAAATGATGAATCACAATCTGATGAGAAAAAA
TCAGATGATGAATCAGAAGCTGTAAATACAGAGTTTGATGTTCATTAAAAAGGAGCTATT
CTTACTTTATAGCATCTTATCAAATTAAAAAGAAAACCCAGAAAGAGCAAAAAGATAGTG
GTTGACCTGTCAAATACAAAATATGATGTAATAAAACAAATATGCTCAGAATCATTTAAT
TGGAATATAACTTACAGATCTAACGCAGATTGGAATATTAAATGGCAAGATTTTTATATT
AACGAAGATGATTTGCGCAGGATGCTTCCATATCAAAAAATTAATCATTTCCCAGGTTCT
TATAACCTAGGAAAAAAGAATTATTTAGGAAAGAACTTATCAAAAATGAGATTGAAATTT
CCTGATGATTTTGACTTTTGCCCACGCACATGGCTATTACCTTACTAGTATGAAGATTTA
AGAAATTTTTATGAAAAAAATAAATCTAAAAAACCTGTGTTTATTGTTAAACCAGAAGCT
AGTTGTTAAGGAAAAGGAATTTATCTAGTTAAAAAATTTTCAACGCTAAAATAAGATCAG
CACATGGTTGTTTAGGAATATATTAAACATCCTTTCTTGATTGATGGACTTAAGTTTGAT
TTTAGAGTGTATGTTTTAGTTAAGAGCGTGTGTCCTTTAAAAGTGTTTATTTACAGAGAA
GGATTGGCTAGGTTTGCTACTTGCAAATATTCCAAGCCTTCTAAAAAAAATCTGAAAAAT
ATGTGCATGCATTTGACAAATTATGCTGTAAACAAGCACAATCCTGAATTTTAATTTAAT
TCAAATGCCAACTAAGATAACGTTGGCCATAAAAGAAGCTTTTCATCAATATTAAAATAT
TTAGAAGATAATGGAAAAGACGCAACTGGAGTGTTTTTGTAAATTAAGCAAATAGTTAAT
AAAACTATGTGCAGTGTTTAACCTTATCTTAGCCATTTATATAGAAGCTGTTAGCTAAAA
GAAGAGAATTCAGAAATGTGTTTTGAGGTTTTTGGATTTGATATTATGCTTGATGATGAT
TTAAAAGCATATCTTATAGAAGTTAATCACACACCTAGTTTTACTACAGATACTCCATTA
GATTATCACATAAAGCACAGTTTAATTACAGATACTTTAATTTTAGTGGATACAAGAAAT
AAAGCAAAATCAAATTATTTAGAATCTAAAAAATAAATGATAATTGGGAAATCTAGTGTA
AAAATGAATTAAGAGGATAAGGAGAATATGTAGAGAAAGCTAGATGCATATGAGCATAAA
TATTAAAATGGATATATTAAATCTTTACCTGCAGATAGTGATGATAATTTAAACTACGAA
AAATTCATTTAAGCAGCTTAATCTATTCATGATGAATTTACTGGCACTAAAAGAAATTTT
GAGAGACTATAAACTCAATAGTAACCTTCCACTACTTCACTCTAAAATCAAAGTGAAAAA
AAGAAATAGGAATAAGATGCACCTAACATTCCTAAGCCTAAAAATATAAATATTGTTAGG
AGACCTGTATCTGGCATTCCATTAAACTTATAGAAAAGGATGAATTAAGAAACAAATTAA
ACTGACAATGATATATCTAAATTAGCTAATAATACGACTGGGTTTTTAAATCAAAGCTTT
AATCAATAAAGCTAAAACCAATCTGTTAACGGTTATTAACCATAAACTTAAGATTTACAA
AGCTAAGCTTAGGGTAATTCATCTTCGAGCTCTTCGATTTAAACAGTATCTGCTCTATCT
TAGAAATCAAATACAAATCACATAATAAAAAATATTAGAAAGATTTCTTAAAGGAGTGTT
TATAAACCTTCATAAAGTGTTGTAGATTATTCAGTAGATGCTAATCAGTAATCTGGCTCA
ACTACTAATATATATTCCAGTGTATAAAATAAAAACTAAAATGCAATAAGTACTATGAAT
AATTATTCTAGAGAGGAAACATCAATTTTTAACATAGATAAAGGTGATCAGCAGCTAAAA
TAATTTGGATCCAATAATAACATTTAGCTTAATATGAGACCAGAGTCAGGAAGATAAGAA
CTATCTTACAAATTAGACCAACTTAAAAGAGAATTATAAATGGCAAAAGAAGAAGCTTCA
AGATGCTTAAATGAGTAAGAATCTGTTAAGCTTTAATAGTTATCTCATACAAGAGGTCTT
ACTTAGGTATTAGAAACCACAAATAATATTACAGCTCAAGCAAAAATTTCAATAAGACCT
CAATCTTCCTCAATAGCTGGATAACTTTACAGAAATAATTTAAACCAATATAATTAGAAT
TAAAATAATGGAATAACTCCTCTTTCCTCAACTTCTTCTCGTCCTCTAATGTAAAATGGA
AATAAAGCGGTCTTTTTAAAAATTAAAGAAGATGCTATAGTAAGAAACACAGTTAATTCT
AATGGAACGCTAGTATACATTTAATAGTCTAATAACAGCAACGCGCTTTAACAAAACAGA
AATGAATTCTTAAGCATACAGCGAGTCAAAATAGAGCCTAAACTTTATGCTAATTCTTCT
TTAAATAGTAATTCCAATTAAAATAATGCTTATTTAGCTCCCGTAAGTTATAGCTCTAGC
AGAGTTGTTAATATTCCAAGCTTACATGGATACTCTAATAACTAGAATCTAAATTAAAAT
AGCACAAATGCATACTTTAACAGCATATCTCCAAAACATTATTAAAACTCTATAACACCA
TCTTCATAATAATTCTTAAATCATGCAAACAGCAGCATCTCACAAAATATTCTTTAAGAA
ATGAATAATAAAAATATGAATGTTATAATTGAAAACAAAGAAAAAAATAATTATAAATCT
CGTGGCAGCTCAGCAATAGGTGGCTAGAGAGAATTAAAATAGTATTTGAATTCTAACTAA
CCACCATAAACCTAGCAAAACTTAAACTTAACAAACAACTTAAATACAAGCAATAACACA
AACAACAATAACAATCATAGCCAAAATAGTTAATAACATTTACATTCTAATTTAAGATCT
AATTCTTATGGTAATTTACATACAGAAAAAGGGTATATTTTAACCGTTGAAAACGCTTAA
ACAACTACCAATGCTACAAACTATGCCTAGAGAAAGGGTTTACCAAAAAGATCATTTAAA
TTTGATGATAAAATATAAAATCTGATATAATTTAACATTCAAGATGAAATATAATCCTGA


>TTHERM_00145320(protein)
MEDYQSSSFKDEAQVSYSKLDSTSKSSKNQNDESQSDEKKSDDESEAVNTEFDVHQKGAI
LTLQHLIKLKRKPRKSKKIVVDLSNTKYDVIKQICSESFNWNITYRSNADWNIKWQDFYI
NEDDLRRMLPYQKINHFPGSYNLGKKNYLGKNLSKMRLKFPDDFDFCPRTWLLPYQYEDL
RNFYEKNKSKKPVFIVKPEASCQGKGIYLVKKFSTLKQDQHMVVQEYIKHPFLIDGLKFD
FRVYVLVKSVCPLKVFIYREGLARFATCKYSKPSKKNLKNMCMHLTNYAVNKHNPEFQFN
SNANQDNVGHKRSFSSILKYLEDNGKDATGVFLQIKQIVNKTMCSVQPYLSHLYRSCQLK
EENSEMCFEVFGFDIMLDDDLKAYLIEVNHTPSFTTDTPLDYHIKHSLITDTLILVDTRN
KAKSNYLESKKQMIIGKSSVKMNQEDKENMQRKLDAYEHKYQNGYIKSLPADSDDNLNYE
KFIQAAQSIHDEFTGTKRNFERLQTQQQPSTTSLQNQSEKKKQEQDAPNIPKPKNINIVR
RPVSGIPLNLQKRMNQETNQTDNDISKLANNTTGFLNQSFNQQSQNQSVNGYQPQTQDLQ
SQAQGNSSSSSSIQTVSALSQKSNTNHIIKNIRKISQRSVYKPSQSVVDYSVDANQQSGS
TTNIYSSVQNKNQNAISTMNNYSREETSIFNIDKGDQQLKQFGSNNNIQLNMRPESGRQE
LSYKLDQLKRELQMAKEEASRCLNEQESVKLQQLSHTRGLTQVLETTNNITAQAKISIRP
QSSSIAGQLYRNNLNQYNQNQNNGITPLSSTSSRPLMQNGNKAVFLKIKEDAIVRNTVNS
NGTLVYIQQSNNSNALQQNRNEFLSIQRVKIEPKLYANSSLNSNSNQNNAYLAPVSYSSS
RVVNIPSLHGYSNNQNLNQNSTNAYFNSISPKHYQNSITPSSQQFLNHANSSISQNILQE
MNNKNMNVIIENKEKNNYKSRGSSAIGGQRELKQYLNSNQPPQTQQNLNLTNNLNTSNNT
NNNNNHSQNSQQHLHSNLRSNSYGNLHTEKGYILTVENAQTTTNATNYAQRKGLPKRSFK
FDDKIQNLIQFNIQDEIQS


>TTHERM_00145320(gene)
ATGGAAGATTACTAAAGTAGCTCTTTTAAAGATGAAGCTCAAGTTTCTTATAGTAAATTA
GATTCTACATCTAAGAGCTCTAAGAATCAAAATGATGAATCACAATCTGATGAGAAAAAA
TCAGATGATGAATCAGAAGCTGTAAATACAGAGTTTGATGTTCATTAAAAAGGAGCTATT
CTTACTTTATAGCATCTTATCAAATTAAAAAGAAAACCCAGAAAGAGCAAAAAGATAGTG
GTTGACCTGTCAAGTAAAAAAATGTTAAATTCATTTTTAAGATAGATATATTATTTAACT
ATAGTAGTTTTTAAAATTATGATAGCAATAAATAAACTCTTACAGCTTTATCAAATATCA
AAAATATGAATTTATTTGTTTATGACAAGTTCATTTTAATTATGCAAGTTAACTAAAATT
TAATTATAACAGATACAAAATATGATGTAATAAAACAAATATGCTCAGAATCATTTAATT
GGAATATAACTTACAGATCTAACGCAGATTGGAATATTAAATGGCAAGATTTTTATATTA
ACGAAGATGATTTGCGCAGGATGCTTCCATATCAAAAAATTAATCATTTCCCAGGTTCTT
ATAACCTAGGAAAAAAGAATTATTTAGGAAAGAACTTATCAAAAATGAGATTGAAATTTC
CTGATGATTTTGACTTTTGCCCACGCACATGGCTATTACCTTACTAGTATGAAGATTTAA
GAAATTTTTATGAAAAAAATAAATCTAAAAAACCTGTGTTTATTGTTAAACCAGAAGCTA
GTTGTTAAGGAAAAGGAATTTATCTAGTTAAAAAATTTTCAACGCTAAGTAAATAATTTT
AAAAATTAAACTCTTTTTACCAAGATTTAACTATAGATATGAAACTAACATTATAACAAA
AATTTCTATCATATTTTTTATCAATATTTTAGTTTAATTTCTATATTAAAAAAGATAATT
AATTATTAAAATAGAATAAGATCAGCACATGGTTGTTTAGGAATATATTAAACATCCTTT
CTTGATTGATGGACTTAAGTTTGATTTTAGAGTGTATGTTTTAGTTAAGAGCGTGTGTCC
TTTAAAAGTGTTTATTTACAGAGAAGGATTGGCTAGGTTTGCTACTTGCAAATATTCCAA
GCCTTCTAAAAAAAATCTGAAAAATATGTGCATGCATTTGACAAATTATGCTGTAAACAA
GCACAATCCTGAATTTTAATTTAATTCAAATGCCAACTAAGATAACGTTGGCCATAAAAG
AAGCTTTTCATCAATATTAAAAGTAATCTAATATTTATATTATTTTGAATTCTAACTTTT
AATACAAAAGTATTTAGAAGATAATGGAAAAGACGCAACTGGAGTGTTTTTGTAAATTAA
GCAAATAGTTAATAAAACTATGTGCAGTGTTTAACCTTATCTTAGCCATTTATATAGAAG
CTGTTAGCTAAAAGAAGAGAATTCAGAAATGTGTTTTGAGGTTTTTGGGTAAATTTAAAA
TCAGGAAATAAATAAAATTGTTAATATTTTATTTTTTAAAAAAAGATTTGATATTATGCT
TGATGATGATTTAAAAGCATATCTTATAGAAGTTAATCACACACCTAGTTTTACTACAGA
TACTCCATTAGATTATCACATAAAGCACAGTTTAATTACAGATACTTTAATTTTAGTGGA
TACAAGAAATAAAGCAAAATCAAAGTAAATTGATTTGAATAAATTATTGAATATATTTTA
TTTAGCTTTTGGTTTAATAAAGTTATTTAGAATCTAAAAAATAAATGATAATTGGGAAAT
CTAGTGTAAAAATGAATTAAGAGGATAAGGAGAATATGTAGAGAAAGCTAGATGCATATG
AGCATAAATATTAAAATGGATATATTAAATCTTTACCTGCAGATAGTGTAAATATATAAA
TTAATTAAATACACTTATAATAAATATCATTATTTTAATATTTTTCTTTCTTAAACAAAT
TAAGGATGATAATTTAAACTACGAAAAATTCATTTAAGCAGCTTAATCTATTCATGATGA
ATTTACTGGCACTAAAAGAAATTTTGAGAGACTATAAACTCAATAGTAACCTTCCACTAC
TTCACTCTAAAATCAAAGTGAAAAAAAGAAATAGGAATAAGATGCACCTAACATTCCTAA
GCCTAAAAATATAAATATTGTTAGGAGACCTGTATCTGGCATTCCATTAAACTTATAGAA
AAGGATGAATTAAGAAACAAATTAAACTGACAATGATATATCTAAATTAGCTAATAATAC
GACTGGGTTTTTAAATCAAAGCTTTAATCAATAAAGCTAAAACCAATCTGTTAACGGTTA
TTAACCATAAACTTAAGATTTACAAAGCTAAGCTTAGGGTAATTCATCTTCGAGCTCTTC
GATTTAAACAGTATCTGCTCTATCTTAGAAATCAAATACAAATCACATAATAAAAAATAT
TAGAAAGATTTCTTAAAGGAGTGTTTATAAACCTTCATAAAGTGTTGTAGATTATTCAGT
AGATGCTAATCAGTAATCTGGCTCAACTACTAATATATATTCCAGTGTATAAAATAAAAA
CTAAAATGCAATAAGTACTATGAATAATTATTCTAGAGAGGAAACATCAATTTTTAACAT
AGATAAAGGTGATCAGCAGCTAAAATAATTTGGATCCAATAATAACATTTAGCTTAATAT
GAGACCAGAGTCAGGAAGATAAGAACTATCTTACAAATTAGACCAACTTAAAAGAGAATT
ATAAATGGCAAAAGAAGAAGCTTCAAGATGCTTAAATGAGTAAGAATCTGTTAAGCTTTA
ATAGTTATCTCATACAAGAGGTCTTACTTAGGTATTAGAAACCACAAATAATATTACAGC
TCAAGCAAAAATTTCAATAAGACCTCAATCTTCCTCAATAGCTGGATAACTTTACAGAAA
TAATTTAAACCAATATAATTAGAATTAAAATAATGGAATAACTCCTCTTTCCTCAACTTC
TTCTCGTCCTCTAATGTAAAATGGAAATAAAGCGGTCTTTTTAAAAATTAAAGAAGATGC
TATAGTAAGAAACACAGTTAATTCTAATGGAACGCTAGTATACATTTAATAGTCTAATAA
CAGCAACGCGCTTTAACAAAACAGAAATGAATTCTTAAGCATACAGCGAGTCAAAATAGA
GCCTAAACTTTATGCTAATTCTTCTTTAAATAGTAATTCCAATTAAAATAATGCTTATTT
AGCTCCCGTAAGTTATAGCTCTAGCAGAGTTGTTAATATTCCAAGCTTACATGGATACTC
TAATAACTAGAATCTAAATTAAAATAGCACAAATGCATACTTTAACAGCATATCTCCAAA
ACATTATTAAAACTCTATAACACCATCTTCATAATAATTCTTAAATCATGCAAACAGCAG
CATCTCACAAAATATTCTTTAAGAAATGAATAATAAAAATATGAATGTTATAATTGAAAA
CAAAGAAAAAAATAATTATAAATCTCGTGGCAGCTCAGCAATAGGTGGCTAGAGAGAATT
AAAATAGTATTTGAATTCTAACTAACCACCATAAACCTAGCAAAACTTAAACTTAACAAA
CAACTTAAATACAAGCAATAACACAAACAACAATAACAATCATAGCCAAAATAGTTAATA
ACATTTACATTCTAATTTAAGATCTAATTCTTATGGTAATTTACATACAGAAAAAGGGTA
TATTTTAACCGTTGAAAACGCTTAAACAACTACCAATGCTACAAACTATGCCTAGAGAAA
GGGTTTACCAAAAAGATCATTTAAATTTGATGATAAAATATAAAATCTGATATAATTTAA
CATTCAAGATGAAATATAATCCTGA