Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00284020

Standard Name

TTLL6A (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt04940 | 25.m00404 | 3694.m00187

Description

Beta-tubulin polyglutamylase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00284020

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_09038.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (2068
aa)
OxytrichaContig11903.0.g292.9994339188023638e-146Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_298637.362997122252211e-76
WormBaseWBGene000192301.9992362000979228e-56locus:ttll-11 status:Partial
ly_confirmed UniProt:H2KZM9
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position 4627625 to 4629265

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00284020(coding)
ATGTCATAGAAAGATATATATAATAAATATTCAAATTAAAGCGCAGACGACCAATAAGAG
GAAGATGATGATGAGAATTAAGAATCATCATGCCAATTAAGTCCAGAAAAAGATTTAGGA
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GAATAAGAAGAATCTTATGATGAGGAAGACGAAGAAGAAGATGATGAAGAAAATAATTAA
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TAAACTGAGATGACTGACAACTAAAATGAATTTTTAGCAGAAGACTATTTAAGTTAAATA
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GAAAATGTATAAGATATGGATGAAAAACTTAAACAATATATAGAATTAAATGGAAAAAAT
GAAAATTAATAAGCTGCAGAAAGTAAAAAAATTGAAAATGATGAAATTATGAAGAAATCA
GAGGAAAATGTTCATGAAAAAGTTGTAGATAATAATTAAAAATTAAACATTCAGTAAAAT
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TTTTTCCCGTAAACTTGGCTTCTTCCTGCTGAATACAATGATTTTAAAAACTAATTTGAA
AAGAGCAGATCCTAATAAAAAATATTTATAGTTAAACCTGAAGCTAGTTGTTAAGGCAGA
GGTATTTTCCTAACTCGAAGTCTAGATGACTTAAATCCTTCAGATCATTATGTTGTATAA
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TATATCACCTCAGAAAAGGAGCAATTAGAAATAAAAAACATGAATATTCTTTAAGATTAA
AATTATAATTCCTCTAGAGCAGTTTAAGCTAAAAAGCCATAAATAGAGCCATAAGTATTA
TTTGTATAAGAACCTCAAACTAAAAAGCTTTAAATTCTCAATTAAGCAAAACCACCCTAA
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ATGCAATCTATTGCAGATATTCCTAATAGTTCTAATAGTAAGGAAATACTAGCAGCTGTT
GGAGGAGCTATTTCTGGATAATATAAAACTGATAAACGAGTGACAATAAAATAAAAGGGG
TAGATATAGAATTAAAGTATAAATTAACTCAAGGATAATAATGGCTTGTTTTTACAACCA
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CAAAGCAGCCTGGATTAAAATTTAATTGGAATAAATTAGAATATGGTTGGGCTAAATGAT
CTTTTTGTCTCAGGTAAAAGCCATAAAGTATAACCTCATTATTAAGCATAATAAGATTCA
TATAGTTACCAAAAGCATAATAGCTATAGTAATTACTATCAAAAATGA


>TTHERM_00284020(protein)
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EENVHEKVVDNNQKLNIQQNNINDYQEDIKKDQSNNLVDIQQNNEIIKEVNSEDQQQKNE
MDNKQSDIVLAQEESKQSEQVEAPIVKQKKIELRPKVIYDPKNDVDQYTGDYSDSGESDE
EANNEDDDEDEDDESENESRSRKNKAQLLKKKNNKKEQAKKQQVKKVYKKQTLVLNVADT
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GIFLTRSLDDLNPSDHYVVQRYLNKPYLIDGLKFDFRLYVLLAGCDPLRIYLYYEGLTRF
ATEKYQEVNRDNIEDMCMHLTNYAINKDNPNFKFNKDKEKMDVGHKRSLTSVLQLLEDQG
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LEVNHTPSFSTDTPLDSYIKKNTIRDSLKLMNCTCKAKNEIINQRKEIMQKRVLTGKKVK
YTPEEKLEEIKKAQQKRDEYEDKHLGGFERIFPMEDDEDDNFTEYMQYALKCYEEQTGAN
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QSSLDQNLIGINQNMVGLNDLFVSGKSHKVQPHYQAQQDSYSYQKHNSYSNYYQK


>TTHERM_00284020(gene)
AATAAAGAAAGCTATCTATAACTACAAATAACAATTATTTATTACTTTCAATCATAATTT
TTCAAACTTATTATTTTTAAAAATTTTACACTGCATTAAAAATAGGCAAAAAAGATGTCA
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TAAAATAATTCAGAATCCAATTTATAGTATGACAAAACAAACCAGAAGAATTAGTAAACT
GAGATGACTGACAACTAAAATGAATTTTTAGCAGAAGACTATTTAAGTTAAATAAAAACA
AATGAAAAAAGCGAATTAAAATATCAACTTGACATTTAAAGTAACTTGTCTGGTGAAAAT
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AATGATGTTGATTAATATACAGGAGACTATTCTGATTCAGGAGAAAGTGATGAAGAAGCA
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GCTGTTGGAGGAGCTATTTCTGGATAATATAAAACTGATAAACGAGTGACAATAAAGTAA
TTAATTTACTGAATGAAATTCAAATTATAATTATTTTTTTAAGATAAAAGGGGTAGATAT
AGAATTAAAGTATAAATTAACTCAAGGATAATAATGGCTTGTTTTTACAACCAAAACTTT
TTGAAATTCAAAGCTTTTAATCTAGTTAGCAGTAATAAGCATAATAAGCTATACAAAGCA
GCCTGGATTAAAATTTAATTGGAATAAATTAGAATATGGTTGGGCTAAATGATCTTTTTG
TCTCAGGTAAAAGCCATAAAGTATAACCTCATTATTAAGCATAATAAGATTCATATAGTT
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