Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00284020

Standard Name

TTLL6A (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt04940 | 25.m00404 | 3694.m00187

Description

TTLL6A tubulin-tyrosine ligase family protein; Beta-tubulin polyglutamylase

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%

TetraMine Data

TTHERM_00284020

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_09038.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (2068
aa)
OxytrichaContig11903.0.g292.9994339188023638e-146Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_298637.362997122252211e-76
WormBaseWBGene000192301.9992362000979228e-56locus:ttll-11 status:Partial
ly_confirmed UniProt:H2KZM9
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position 4627625 to 4629265

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00284020(coding)
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AATCAACCAAAAGATTTAGAAAAAATTTATAATACAAAAATAGGAGCTAAACTACCTCCT
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CCAAGCTCTTCTTAATTAAACGAAGAAGGTGAAACTATTCAATGCGAAGACCAAGAATAA
AATAAAGATGAAGCTATTGAAAACGCTATCACAAGATCAGCTAGTGGAAGAATGCATGAT
TTTAGGATTAAAAAATAAAATTCTCCATATAATATACACCAAAAATTCAAAAATAAAATA
TAAAACAGAGTAGCAATAGGAGTCAAAGAATTGAAGCTAGCAGAAGAACCTTTCCAATTT
GAAGAAAATATAAATGGCAAACCATCTAATCCAAATGTCAAAAAGATCTAAGCGTATATC
ACCTCAGAAAAGGAGCAATTAGAAATAAAAAACATGAATATTCTTTAAGATTAAAATTAT
AATTCCTCTAGAGCAGTTTAAGCTAAAAAGCCATAAATAGAGCCATAAGTATTATTTGTA
TAAGAACCTCAAACTAAAAAGCTTTAAATTCTCAATTAAGCAAAACCACCCTAACAAAAA
TTATAATTTTAATTAATTGATAATACAGCTGCTTAAATGGAAGAAGAAAGGAGATAATGG
CTTATACAAGCTTAAAGAAATTTATAATATCAGCTATCTTAACAATAATACTAACCTTAA
TAAAAGCTGACATTACTTCCAAAAGGACCACCTATACATCCTTAAACAAATGTAATGCAA
TCTATTGCAGATATTCCTAATAGTTCTAATAGTAAGGAAATACTAGCAGCTGTTGGAGGA
GCTATTTCTGGATAATATAAAACTGATAAACGAGTGACAATAAAATAAAAGGGGTAGATA
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AGCCTGGATTAAAATTTAATTGGAATAAATTAGAATATGGTTGGGCTAAATGATCTTTTT
GTCTCAGGTAAAAGCCATAAAGTATAACCTCATTATTAAGCATAATAAGATTCATATAGT
TACCAAAAGCATAATAGCTATAGTAATTACTATCAAAAATGA


>TTHERM_00284020(protein)
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EENVHEKVVDNNQKLNIQQNNINDYQEDIKKDQSNNLVDIQQNNEIIKEVNSEDQQQKNE
MDNKQSDIVLAQEESKQSEQVEAPIVKQKKIELRPKVIYDPKNDVDQYTGDYSDSGESDE
EANNEDDDEDEDDESENESRSRKNKAQLLKKRIIRKNTKYPVVKFVGKKIFKWKLAYDME
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PQTWLLPAEYNDFKNQFEKSRSQQKIFIVKPEASCQGRGIFLTRSLDDLNPSDHYVVQRY
LNKPYLIDGLKFDFRLYVLLAGCDPLRIYLYYEGLTRFATEKYQEVNRDNIEDMCMHLTN
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PTLAHHYKSCQPDNFMNNMCFEILGFDIILDSHLKPWVLEVNHTPSFSTDTPLDSYIKKN
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>TTHERM_00284020(gene)
ATGTCATAGAAAGATATATATAATAAATATTCAAATTAAAGCGCAGACGACCAATAAGAG
GAAGATGATGATGAGAATTAAGAATCATCATGCCAATTAAGTCCAGAAAAAGATTTAGGA
GAATCATTATAAGGCGAAGACTTGGATGAAGATTAAGGAGTTATAGGCGAAGATGATGAA
GAATAAGAAGAATCTTATGATGAGGAAGACGAAGAAGAAGATGATGAAGAAAATAATTAA
GATTAATAAAATAATTCAGAATCCAATTTATAGTATGACAAAACAAACCAGAAGAATTAG
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AAAACAAATGAAAAAAGCGAATTAAAATATCAACTTGACATTTAAAGTAACTTGTCTGGT
GAAAATGTATAAGATATGGATGAAAAACTTAAACAATATATAGAATTAAATGGAAAAAAT
GAAAATTAATAAGCTGCAGAAAGTAAAAAAATTGAAAATGATGAAATTATGAAGAAATCA
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GACTATTTTAGTAAAAAAAATAAGCAAATACATTTAAAGTAGAAAAATAAATAAAAATAT
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TAAATGGAAATTAGCCTATGACATGGAATCTATGGATTTTGATATCTTTTGGACTGATAA
TGCTGTTTAACCAGAATAGCTAGGACGTATGCAGCCATATTAAAAAATCAATCACTTTCC
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TGATTTTAAAAACTAATTTGAAAAGAGCAGATCCTAATAAAAAATATTTATAGTTAAACC
TGAAGCTAGTTGTTAAGGCAGAGGTATTTTCCTAACTCGAAGTCTAGATGACTTAAATCC
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GTTCGATTTCAGACTATACGTCTTACTAGCTGGGTGTGATCCTCTTAGAATTTATTTATA
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TTTTCCACTGATACTCCACTTGATAGGTAATATTTTATTTAAAATATAGATTAATAATAA
GCGTTTTTAATCAAAGTTACATCAAAAAGAACACAATTAGGGACTCATTAAAATTGATGA
ATTGTACTTGTAAAGCAAAAAATGAGATTATAAATTAAAGAAAGGAAATAATGTAAAAAA
GAGTTTTGACTGGTAAAAAAGTGAAGTACACACCTGAAGAAAAGCTAGAAGAAATAAAAA
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AGCCATAAGTATTATTTGTATAAGAACCTCAAACTAAAAAGCTTTAAATTCTCAATTAAG
CAAAACCACCCTAACAAAAATTATAATTTTAATTGTAATTTAATAAATAAATTTTATGTT
TTCAAAATAAATAAAATATTTTAACTAATAGAATTGATAATACAGCTGCTTAAATGGAAG
AAGAAAGGAGATAATGGCTTATACAAGCTTAAAGAAATTTATAATATCAGCTATCTTAAC
AATAATACTAACCTTAATAAAAGCTGACATTACTTCCAAAAGGACCACCTATACATCCTT
AAACAAATGTAATGCAATCTATTGCAGATATTCCTAATAGTTCTAATAGTAAGGAAATAC
TAGCAGCTGTTGGAGGAGCTATTTCTGGATAATATAAAACTGATAAACGAGTGACAATAA
AGTAATTAATTTACTGAATGAAATTCAAATTATAATTATTTTTTTAAGATAAAAGGGGTA
GATATAGAATTAAAGTATAAATTAACTCAAGGATAATAATGGCTTGTTTTTACAACCAAA
ACTTTTTGAAATTCAAAGCTTTTAATCTAGTTAGCAGTAATAAGCATAATAAGCTATACA
AAGCAGCCTGGATTAAAATTTAATTGGAATAAATTAGAATATGGTTGGGCTAAATGATCT
TTTTGTCTCAGGTAAAAGCCATAAAGTATAACCTCATTATTAAGCATAATAAGATTCATA
TAGTTACCAAAAGCATAATAGCTATAGTAATTACTATCAAAAATGA