Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00564100

Standard Name

TTLL4E (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt08948 | 75.m00146 | 3721.m00028

Description

Related to tubulin polyglutamylase

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%

TetraMine Data

TTHERM_00564100

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14559.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (673 a
a)
OxytrichaContig16959.0.g382.0000211193600847e-137Tubulin-tyrosine ligase family
WormBaseWBGene000083312.000299424410363e-74locus:ttll-5 status:Partiall
y_confirmed UniProt:O17720
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Stentor CoeruleusSteCoe_276391.733141042341547e-58
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position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.00000000030007160092483236PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00564100(coding)
ATGGCTGATGAGTTTTCTGAATCAGTTGCAGATTTATTAGATATTTTAAATAAGCAAGAT
TTAAATAAGTTACAATAAATCTCATAGAAGACAGATCAATAGTCCAATTCAAACTTGTAA
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TATAATAATATTTATAATTTCAACAATAGCAAAAAAACAATTTAGCAATAAAGTACCAAT
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TTAAGTACTAATTAAAACTATGCATAATAAAAATATTGA


>TTHERM_00564100(protein)
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YNNIYNFNNSKKTIQQQSTNTLPTLPDTQQISSTVKSQNTVDTLISQKSINKENVKTPIQ
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AKSQGQGIFVTDNIQEILKKQNGSMVVCHYIQNPMLINDLKFDLRIYVVVTSINPLKIFI
YDDGLARFATSAYNTDKNTRPSRYVHLTNYSVNKYAQNFVPNKDAQDDAQGSKWSLTAFK
DYLKINGINYQLIFDRIEDLAVKTILSIENMMNSAFEMHVPYRNNCFELFGFDILIDSNL
KPWLLEVNLSPSMNTDSPLDLKIKGNLISDIFTLVGIVPNDQRYLSDVSHSLAQNQILTE
RQIQTQIQNLNNWSKYKQELSKIERYVIKEAEDEIKRCRRFKRIYPNENSFKYKTYFDVE
RPLNVLLRNYEMDKFKQNNNIQGNNQIRTNRTNSFTGMSTNTLNTTTTGVKITKNVYTNI
LSTNQNYAQQKY


>TTHERM_00564100(gene)
ATGGCTGATGAGTTTTCTGAATCAGTTGCAGATTTATTAGATATTTTAAATAAGCAAGAT
TTAAATAAGTTACAATAAATCTCATAGAAGACAGATCAATAGTCCAATTCAAACTTGTAA
TAAGATAAGGGAAGTAGCTAGGCTGAATTAAACAATAACTAATTGAACAATATAACAACA
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TGTGTTAGATATTTGCATTTTAAGCCTTGGAGTGGAGTAAGCAATCCAAATCCTTCAGAT
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GAAGAAAATGGATTTAAAGTAGGATTGATTATTTGTTCATAACGAATCAAAAACTCATAA
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GAACATTTATAACTTTTTTTACTAATAAACAAAGATTAATCATTTCCCTAAATCCTACGA
AATTACTAGGAAAGACTTACTGAGTAGAAATATTTCTAAAATGGCAGCAAAATTTGGTAA
TAACAATTTTAATTTTTGTCCTAAGACTTATCTAATACCCTCAGAGATGTCTCTTTTTCT
AGAAGTAAAATAAAACAACTGTAAAAGTTTATGTAATTGATTTTTATTATTAGGAAGCTG
AAAAAAATAAAGGTCAGTGGTATATCGTAAAGCCATCTGCGAAGTCTTAAGGTTAGGGTA
TTTTTGTAACTGATAACATTTAAGAAGTAATAAATTATTTTAGACTTTTTGATCACAAAG
AACTATAATATTTATTATATTGATTATTTAGATTTTGAAAAAATAAAATGGTAGCATGGT
TGTCTGCCACTATATTTAAAATCCTATGTTAATTAATGATCTCAAATTTGATCTACGTAT
TTACGTAGTTGTAACATCAATCAATCCTCTCAAAATATTTATTTATGATGATGGGTTGGC
TAGATTTGCAACAAGTGCATATAACACTGATAAAAACACAAGACCAAGCAGGTGAAAATA
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ATTTATTATTAATAAGTATTTGTTTAAATTTTAATTTAATAAAACTATTAAAGGATGCCT
AAGATGATGCTTAAGGTAGTAAATGGAGTTTAACAGCTTTCAAGGATTATTTGAAAATAA
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TACTGAAAGATAAATATAAACTCAAATATAAAACCTCAATAACTGGAGTAAATATAAATA
AGAACTTTCTAAAATAGAAAGATATGTAATTAAAGAAGCTGAAGATGAAATAAAAAGGTA
TTTATATTTAAAAAAAAAAAGCTTCATTTATCTAATGCATTTCTTTTATAAAATTCATAG
GTGCAGAAGATTCAAAAGAATATATCCTAACGAGAATTCATTCAAATATAAAACTTATTT
CGATGTAGAGAGACCACTTAACGTCTTGCTAAGAAACTAGTAAAATAAAAACCTAATTTA
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