Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00837850

Standard Name

TTLL4D (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt17798 | 146.m00099 | 3743.m00030

Description

Related to tubulin polyglutamylase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00837850

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_19551.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (683 a
a)
OxytrichaContig16959.0.g382.9988601762256104e-132Tubulin-tyrosine ligase family
WormBaseWBGene000083313.000809166761476e-75locus:ttll-5 status:Partiall
y_confirmed UniProt:O17720
protein_id:CAB02862.3
Stentor CoeruleusSteCoe_276393.917469664450395e-64
DictyBaseDDB_G02815413.0000451088882257e-25DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.00008003872323201264PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00837850(coding)
ATGAATATTAGGTCTCAACGGCTGTAACCTATGCAATATGAATTTTATGATAGTAACTAA
AGATAAGAGTCTGCTTTGAAATAAAATTCATTTTCGAAATTTAACGAAAACAATGATGAA
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>TTHERM_00837850(protein)
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AKLPPKLIPVNQNIVRYLQFKPWNGVLQDNVQDSGYYFKLNNCNIKLVRGLLEENGFRET
IDKDWTIMWVVGSIKSEIYQTMMAYQKVNHFPKSIEITRKDLMNRNISKMQIRCGLSNFN
FVPKTYILPSEQSLLIEDFEKIKSTKQLFIVKPQNGSQGKNIFVTDKLNDILRANVGSGL
VVSHYVANPLLINNLKFDLRIYVAITSIHPLRVYIYEDGLVRFATQEYHADIDLLKDKYV
HLTNYSINKNSNNFVSNKDAQEDFKGSKWSLASLKDYLRVNGINVEQLFDKIEDMIVKTI
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EMLSDLFTLVGIVPLDQRYSIDQSFNFTLNSAINEKQYANIVNSLTSNWEQHKKQLTKLE
RAVLKETEDELKRCRKFKRIYPGETCFKYKNYFEQDRPFNILLRNWEMDKAKKNNINQSL
NNHKYSAPVSRQANHSSAQKTSPSNTSYYQNTSFNKIGASTLGQRNSSLLKSVNIKRN


>TTHERM_00837850(gene)
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TGACAAAGATTGGACAATTATGTGGGTCGTTGGATCTATAAAATCGGAAATATATCAAAC
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AAAAGATTCTGAGAGCAAATGTCGGAAGCGGTTTAGTTGTCAGCCATTATGTAGCGAATC
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ATCCTTTAAGAGTATATATTTATGAAGATGGGCTGGTTAGGTTTGCAACTTAAGAATATC
ATGCTGATATTGATCTACTTAAAGATAAGTAATGATAATATTAATTAAAGTAGTTTTAAT
ATTTTGAAAATGTATAAATAAGGTACGTCCACTTGACAAACTATAGCATTAACAAAAACA
GCAATAATTTTGTTAGTAATAAGGTAAATAAATATTGCTTTCATAACAAGCAACTGATTC
AATATAATAAATTATTTAGGATGCTTAAGAAGATTTTAAAGGAAGTAAATGGTCACTTGC
ATCTCTTAAAGATTACTTAAGAGTCAATGGGATTAATGTGGAGCAACTATTTGATAAAAT
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AATGCAAGTTCCATATAGAAATAATTGCTTTGAAGTATTAGGTTTTGATGTTTTGATAGA
TGACACATTAAAACCCTACCTGCTTGAAGTTAATTTGAATTCTTCTTTAAATACTGATAG
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AGAAACTGA