Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00837850
Standard Name
TTLL4D (Tubulin Tyrosine Ligase-Like
)
Aliases
PreTt17798 | 146.m00099 | 3743.m00030
Description
TTLL4D tubulin-tyrosine ligase family protein; Related to tubulin polyglutamylase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%
TetraMine Data
TTHERM_00837850
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_19551.1 9.997093137033517e-262 tubulin-tyrosine ligase (683 a
a)
Oxytricha Contig16959.0.g38 2.9988601762256104e-132 Tubulin-tyrosine ligase family
WormBase WBGene00008331 3.000809166761476e-75 locus:ttll-5 status:Partiall
y_confirmed UniProt:O17720
protein_id:CAB02862.3
Stentor Coeruleus SteCoe_27639 3.917469664450395e-64
DictyBase DDB_G0281541 3.0000451088882257e-25 DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGD YBR094W 0.00008003872323201264 PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:15890843 : Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00837850(coding)ATG AAT ATT AGG TCT CAA CGG CTG TAA CCT ATG CAA TAT GAA TTT TAT GAT AGT AAC TAA AGA TAA GAG TCT GCT TTG AAA TAA AAT TCA TTT TCG AAA TTT AAC GAA AAC AAT GAT GAA GAT GAA TTA GAT TCT CTT ATT TAA TTT TGT AGT TCT TTG AAT AAA AAT TCA AAT AAT GTT GCT AAA CTT CCA CCT AAA TTG ATC CCT GTG AAT TAA AAT ATT GTT AGA TAC TTA TAA TTT AAA CCT TGG AAT GGT GTT TTA TAA GAT AAT GTT TAA GAC AGT GGC TAT TAT TTT AAG TTA AAC AAT TGT AAT ATT AAA CTA GTA AGA GGG CTA CTA GAA GAA AAT GGA TTT AGA GAA ACC ATT GAC AAA GAT TGG ACA ATT ATG TGG GTC GTT GGA TCT ATA AAA TCG GAA ATA TAT CAA ACC ATG ATG GCA TAT TAA AAA GTT AAC CAC TTT CCT AAG AGT ATT GAA ATT ACT AGG AAA GAT TTG ATG AAC AGA AAT ATA AGC AAG ATG TAA ATA AGA TGT GGG TTA TCT AAC TTT AAT TTT GTT CCT AAA ACC TAC ATT CTA CCA TCA GAG TAA TCT CTG CTT ATA GAA GAT TTT GAA AAG ATT AAA TCC ACA AAG TAA TTA TTT ATT GTT AAA CCT TAG AAT GGT TCA TAG GGA AAG AAT ATA TTT GTT ACT GAT AAG CTA AAC GAT ATT CTG AGA GCA AAT GTC GGA AGC GGT TTA GTT GTC AGC CAT TAT GTA GCG AAT CCT CTT TTA ATT AAC AAT TTA AAA TTC GAT TTG AGA ATA TAT GTT GCA ATT ACT TCT ATT CAT CCT TTA AGA GTA TAT ATT TAT GAA GAT GGG CTG GTT AGG TTT GCA ACT TAA GAA TAT CAT GCT GAT ATT GAT CTA CTT AAA GAT AAG TAC GTC CAC TTG ACA AAC TAT AGC ATT AAC AAA AAC AGC AAT AAT TTT GTT AGT AAT AAG GAT GCT TAA GAA GAT TTT AAA GGA AGT AAA TGG TCA CTT GCA TCT CTT AAA GAT TAC TTA AGA GTC AAT GGG ATT AAT GTG GAG CAA CTA TTT GAT AAA ATA GAA GAC ATG ATA GTA AAA ACA ATC ATC TCA ATT GAG GGA TAA ATT TTC AGT TCT TTT GAA ATG CAA GTT CCA TAT AGA AAT AAT TGC TTT GAA GTA TTA GGT TTT GAT GTT TTG ATA GAT GAC ACA TTA AAA CCC TAC CTG CTT GAA GTT AAT TTG AAT TCT TCT TTA AAT ACT GAT AGT CCT TTA GAT TTA AGA ATA AAA GGT GAA ATG TTA AGC GAT TTA TTT ACT TTA GTT GGG ATA GTT CCC TTA GAC TAA AGG TAC TCA ATC GAT TAG TCT TTC AAC TTT ACA TTA AAT AGT GCA ATA AAT GAA AAA TAA TAT GCT AAC ATA GTC AAT TCG TTG ACA TCT AAT TGG GAG TAA CAT AAG AAA CAA TTA ACA AAA CTT GAA AGG GCA GTT TTA AAA GAA ACT GAA GAC GAG CTC AAA AGA TGT AGA AAA TTC AAG AGA ATT TAT CCA GGT GAA ACG TGC TTT AAA TAT AAA AAT TAC TTT GAA TAA GAT AGA CCT TTT AAT ATT TTA TTG AGA AAT TGG GAA ATG GAT AAG GCA AAG AAA AAT AAT ATA AAT CAA AGT TTA AAC AAT CAT AAA TAC AGT GCA CCT GTG AGT AGA CAA GCA AAT CAT AGT TCT GCA CAA AAA ACA TCA CCA TCT AAC ACA AGC TAT TAC TAA AAT ACT TCT TTT AAT AAA ATT GGA GCC TCC ACT TTA GGA TAA AGA AAT AGT TCT TTA CTT AAA TCA GTA AAT ATA AAA AGA AAC TGA >TTHERM_00837850(protein)M N I R S Q R L Q P M Q Y E F Y D S N Q R Q E S A L K Q N S F S K F N E N N D E D E L D S L I Q F C S S L N K N S N N V A K L P P K L I P V N Q N I V R Y L Q F K P W N G V L Q D N V Q D S G Y Y F K L N N C N I K L V R G L L E E N G F R E T I D K D W T I M W V V G S I K S E I Y Q T M M A Y Q K V N H F P K S I E I T R K D L M N R N I S K M Q I R C G L S N F N F V P K T Y I L P S E Q S L L I E D F E K I K S T K Q L F I V K P Q N G S Q G K N I F V T D K L N D I L R A N V G S G L V V S H Y V A N P L L I N N L K F D L R I Y V A I T S I H P L R V Y I Y E D G L V R F A T Q E Y H A D I D L L K D K Y V H L T N Y S I N K N S N N F V S N K D A Q E D F K G S K W S L A S L K D Y L R V N G I N V E Q L F D K I E D M I V K T I I S I E G Q I F S S F E M Q V P Y R N N C F E V L G F D V L I D D T L K P Y L L E V N L N S S L N T D S P L D L R I K G E M L S D L F T L V G I V P L D Q R Y S I D Q S F N F T L N S A I N E K Q Y A N I V N S L T S N W E Q H K K Q L T K L E R A V L K E T E D E L K R C R K F K R I Y P G E T C F K Y K N Y F E Q D R P F N I L L R N W E M D K A K K N N I N Q S L N N H K Y S A P V S R Q A N H S S A Q K T S P S N T S Y Y Q N T S F N K I G A S T L G Q R N S S L L K S V N I K R N >TTHERM_00837850(gene)ATG AAT ATT AGG TCT CAA CGG CTG TAA CCT ATG CAA TAT GAA TTT TAT GAT AGT AAC TAA AGA TAA GAG TCT GCT TTG AAA TAA AAT TCA TTT TCG AAA TTT AAC GAA AAC AAT GAT GAA GAT GAA TTA GAT TCT CTT ATT TAA TTT TGT AGT TCT TTG AAT AAA AAT TCA AAT AAT GTT GCT AAA CTT CCA CCT AAA TTG ATC CCT GTG AAT TAA AAT ATT GTT AGA TAC TTA TAA TTT AAA CCT TGG AAT GGT GTT TTA TAA GAT AAT GTT TAA GAC AGT GGC TAT TAT TTT AAG TTA AAC AAT TGT AAT ATT AAA CTA GTA AGA GGG CTA CTA GAA GAA AAT GGA TTT AGA GTA TTT TTT AGC TTT CTT TAA ATG GCA ATT ATT TTA ATA AAA ACT AAA TGA TTA TTA GGA AAC CAT TGA CAA AGA TTG GAC AAT TAT GTG GGT CGT TGG ATC TAT AAA ATC GGA AAT ATA TCA AAC CAT GAT GGC ATA TTA AAA AGT AAA TAT ATT TTT TGT TAG TTT TAT CAA TAT ATA TAT TCG GGG ATA TTT AAG AAA ATC AAA TTA GAA TTT GAA TAT TAT ACT TTA ATA AAT CAA CAA AAA TTT ATA GTT TGA AAA GAC AGC ATT AAA AAC AGC AAC AAC AAT GCA AAA TAT ATA TTA TTC AAA TAG GTT AAC CAC TTT CCT AAG AGT ATT GAA ATT ACT AGG AAA GAT TTG ATG AAC AGA AAT ATA AGC AAG ATG TAA ATA AGA TGT GGG TTA TCT AAC TTT AAT TTT GTT CCT AAA ACC TAC ATT CTA CCA TCA GAG TAA TCT CTG CTT ATA GAA GAT TTT GAA AAG ATT AAA TCC ACA AAG TAA TTA TTT ATT GTT AAA CCT TAG AAT GGT TCA TAG GGA AAG AAT ATA TTT GTT ACT GAT AAG CTA AAC GAT GTA ATA ATA ATG TAT TTT TTT AAT TAT TTA CAT TAA ATG ATT ATT AAA AGA TTC TGA GAG CAA ATG TCG GAA GCG GTT TAG TTG TCA GCC ATT ATG TAG CGA ATC CTC TTT TAA TTA ACA ATT TAA AAT TCG ATT TGA GAA TAT ATG TTG CAA TTA CTT CTA TTC ATC CTT TAA GAG TAT ATA TTT ATG AAG ATG GGC TGG TTA GGT TTG CAA CTT AAG AAT ATC ATG CTG ATA TTG ATC TAC TTA AAG ATA AGT AAT GAT AAT ATT AAT TAA AGT AGT TTT AAT ATT TTG AAA ATG TAT AAA TAA GGT ACG TCC ACT TGA CAA ACT ATA GCA TTA ACA AAA ACA GCA ATA ATT TTG TTA GTA ATA AGG TAA ATA AAT ATT GCT TTC ATA ACA AGC AAC TGA TTC AAT ATA ATA AAT TAT TTA GGA TGC TTA AGA AGA TTT TAA AGG AAG TAA ATG GTC ACT TGC ATC TCT TAA AGA TTA CTT AAG AGT CAA TGG GAT TAA TGT GGA GCA ACT ATT TGA TAA AAT AGA AGA CAT GAT AGT AAA AAC AAT CAT CTC AAT TGA GGG ATA AAT TTT CAG TTC TTT TGA AAT GCA AGT TCC ATA TAG AAA TAA TTG CTT TGA AGT ATT AGG TTT TGA TGT TTT GAT AGA TGA CAC ATT AAA ACC CTA CCT GCT TGA AGT TAA TTT GAA TTC TTC TTT AAA TAC TGA TAG TCC TTT AGA TTT AAG AAT AAA AGG TGA AAT GTT AAG CGA TTT ATT TAC TTT AGT TGG GAT AGT TCC CTT AGA CTA AAG GTA CTC AAT CGA TTA GTC TTT CAA CTT TAC ATT AAA TAG TGC AAT AAA TGA AAA ATA ATA TGC TAA CAT AGT CAA TTC GTT GAC ATC TAA TTG GGA GTA ACA TAA GAA ACA ATT AAC AAA ACT TGA AAG GGC AGT TTT AAA AGA AAC TGA AGA CGA GCT CAA AAG GTA ATC TAA ACC ACT TAT CAA ATA AAT GAA ATT AAT TAA AGA TAA ATA TTT TTA ATT ATA GAT GTA GAA AAT TCA AGA GAA TTT ATC CAG GTG AAA CGT GCT TTA AAT ATA AAA ATT ACT TTG AAT AAG ATA GAC CTT TTA ATA TTT TAT TGA GAA ATT GGT AAT AAT CAT TTT TTT ATG AAA ATA CAT TTA ATA TAA ATA TTT TAT AAA AGG GAA ATG GAT AAG GCA AAG AAA AAT AAT ATA AAT CAA AGT TTA AAC AAT CAT AAA TAC AGT GCA CCT GTG AGT AGA CAA GCA AAT CAT AGT TCT GCA CAA AAA ACA TCA CCA TCT AAC ACA AGC TAT TAC TAA AAG TAA TCA AAT TTA AAT TTT TTA AAG ATA TAA ATA ATC TAA TAT AAA TTC AAT AGT ACT TCT TTT AAT AAA ATT GGA GCC TCC ACT TTA GGA TAA AGA AAT AGT TCT TTA CTT AAA TCA GTA AAT ATA AAA AGA AAC TGA