Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00985000
Standard Name
TTLL4B (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )
Aliases
PreTt23270 | 184.m00045
Description
Related to tubulin polyglutamylase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
( TIGR00590 ) proliferating cell nuclear antigen (pcna)
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.7%
TetraMine Data
TTHERM_00985000
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_07233.1 9.997093137033517e-262 tubulin-tyrosine ligase (624 a
a)
Oxytricha Contig1070.1.g45 2.000127961544401e-120 Tubulin-tyrosine ligase family
WormBase WBGene00014232 1.9994274381022833e-63 locus:ttll-4 Tubulin polyglu
tamylase ttll-4 status:Parti
ally_confirmed UniProt:Q0964
7 protein_id:CAA87425.3
Stentor Coeruleus SteCoe_5424 2.3455513385429143e-59
DictyBase DDB_G0281541 3.9989916100764785e-24 DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGD YBR094W 0.00020003864201578029 PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:15890843 : Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00985000(coding)ATG AAT AAC TCT TCA CCT ATA AGA GTA AAT AGC TAC CTC TAA AGT AAC AAT TAA GCA TGG TAA TTA GCT TAA TAG ATA TGC CAA TCG GCA ACG AAG TCA AAT TAA TAA AAT ACA AGT TCA ATA GAA AGA CCA CAT TCA TAA ATT TAA GGT TAG GCT TCT TAA TAA ATA TAG TTA AAT GGT TAT AAT TTT TAA GGC CAC ACC AGC ATT ATT TCG AAT GGC AAC TAT TAG CAT CAA CTG CAT CAT TAA AAA GTA GCA ATT AGC GAA TCG CCA TAA AGA CCT TAA TAG CAA ATA ATA AAT AAT CAA ATT ATA AAA TTA GAG GCA TTG GGA GTG CAA AAA GAT AAT CCG AAT TAG ATA TTT TCA TTT CAT CAC TAA AAT GGA TAT TTT AAA AAG AAA AAC TAT TCC GCA GCA GTA AAG AGG AAT CTT TCT TAG CAA GTA TCT TAG CAA TTA TTT AAC TGC GAA TTA AAA GGC ATC AAT CCT TAA CAT AAT ATT TTC TGT GAT CAA AAT AAA GGA TCA CAT TTA AGA TCC AGC TCC AAC CAC GTT AAC CCA TAT ATT TAG TAA AAG ATA AAT GGG TTT TAG TAA AGT GTT TTA CAA AAT AAA ACT TTG TAC TAT GGC TCA AAT GCA AGC AAT TCC CTT TTA TCA TCA TAA CCC TAA AAA ATA GAT ATA TTC GCT CGT TCA ACT TAC TAC GTT AGA CCT TTA TAA GAG CTA GTA CAG CTC AAC TCA GGG AAA AGA ATT TTG GAT CCT TAA AGC TAT GCA AAT GCT GAA AAT ATA AAT TAA CTT GAG TAA CCT GAA AAG GCT TTA ATT TAA GAA ATT GAA TGC AAC TAG CAA GAA ACT AAT ACA AGT TTA AAT ATT GAT GAT TCA AGT AAA CAC AAT TAG AGA AAT CTT AGT ATA AAT GAA GGG AAA ATT CAA AAA GAG ATT ATT GGA TTA CAA AAT TAG TCA TTT GGA ATA CAT TGC GAT AAT CCA AAC AAA AGG TTG TCA GAT AGT ATT ACA ATA TAA GCT CCT TTC AGT AGT CAC AAT TAT GAT TTC CAA TAA GAG GAT TAT AAA CTA TAG AGA GTA ACT CTT AAC CCA GTA TAT AAA ACA GAA TAA AAT ATA GAA AGA TTG GAA CCT ATT GAA AAT GGA GAT TAG TTC ACT CCT TAA AGC AGC AAT TTG GAA TAA AAA AAA TCA AAA AAA ATA CAA AAC TTT CCT GAT TAG ATG CAA TTT AGT GAA ACC AAA AGG TAA ATA AAA CAA GCT GAA CTA TTT AGG ATA TCT TCG CCA CTC AAA TAC ATA AAA TCA AAT GCA TAG TTC AAA TTA AGA TCA ATT TCA TAG TAA GAT CCA GCT TTA AAA AAT GTA TTA TAA GTA CAG GAA AGC CCT ATC AAG CAA ATT TAT TAA GAA AGA GAA GTT ATT GTA AAA TAA AGT ATC ACA AAT ACG AAT TTT GCC AAC AAT CCA CTT ATG GTT ACA TCT TCT ATA GAA AAA ACA ATA GAC TTC TAG CCA AAT AAT AAT ATT TAA GAT GAA AAA GAG AGA ATT ATA AGC AAA AGC TAT TCA GCT GTA AAA AAA TCT CTA GCA GAG AGG ACG TCA AGG TCT TAA AAC CCT CAT GAA ATT CTT AAT CGA ACT TAA AAT GTG ATT TAG ATG TAT CAA AGT TAA AAT AGT TAC AAT AGC AAT TAC GGG AGC ATA AGG AAG AGT AAG AAT CAT TAT TCT TTT ACA AAA AAG CAG AAG GAA GAA AAA ATT GAA TAA ATC ATT TTG AAA TGC ACA GAT AAA ACA TAT TTT GAT CCT GCT GGT GAT ATG AGA AAT GAG TTG CAG TAA TAA CAG CAA AAG GTT AGT ACT TTG AAT AAG AAT GAT TTC AAA GTC GGA ATA AAC AGC GAA AAA GCT TCT CCA AAA TCA TAA ACA GTA ATA TAA AAA TAT GGT ATT AAT CAA TCA GAG TAA AAG GAA GGT GAT CAA GCC AAA AAA GTG TTT GTG TTT AAA AAA AAT ATT AAT AAA AAT GAA GAA GAT GAC GAT GAT GAA GAG AAA AAT CAA AAC AAC AGT GAT AGC GAT TCA TCG AAA GAT TTA GAT GTC GAT AGT GAT GAA GAT GAA GAT GAG GAT GAG AAT GAC TTA GAA GAT AGC ATC GAC TAA GCA TTG ATT AAT TCA GCA TAT GAA CCA TCA ACA GAA TGC TCT GCT TCA TTT TAA CCT CCA GTC TTG CAA CCA AAT AGA TAT AAC AAG CTC TTA CTA TTA AAA AGT GTG TAT GAA AAC CGT CCT TTG ACC GTA TTC TTT CCC TAT CCT CCT TAA TGT GGA GAT ATC ATC AGA AAC TCT TCT AGA ACA GTT GTA GCA ACC GAT TAT GAA GAA AAA AGG TTT GAT ATG AGG TTT AAG GTG ACC ACT AAT AGC TTA AAT AGG TGT GTT GGA CAT GCA TTT TAG TAT GCA GGT ATT AGA GAG ACT GAA GAT AAT GAC TGG AAT ATG GTA TGG AGC ACT GGA AGA GAT AAT AGA GTA AAA AAT ATG ATT AAA TAT TAA AAA ATT AAC CAC TTC CCA TAG TAT TGG AAT ATG GGG AGA AAG GAC TGC TTG TGG AAA AAT TTG TCT AAA GTT AAA AGA AAA TTT CCA TAA GAA TAT GAC TTT ATT CCA AAT ACT TAT ATA TTG TAA CAT TAA TCA GAT TGG GAT AGA TTT TTG GCA AAA AGA GAT GAT GCT GAG AAA GGA AAA TTG TGG ATT ATG AAG CCT AGC AAC TAG GCC TAA GGA AAA AAT ATA AAG ATG ATA TCA AAG AGA AGC AAA GTA TAA AGA AAG CAA GAA TAC ATT ATT TGT GAG TAT GTA GCA AAT CCA CAT TTG ATT GAT GGA TTA AAA TAT GAT CTT CGT ATA TAT GTT TTA GTC ACT TCA TAT GAT CCT CTT AGG ATA TAC ATT TTC GAT GAT GGT TTG ACT CGT TTC GCG ACT GAA AAA TAT TCA ACT AAT ACA AAA GAA CTC TCA AAA AGA TAT GTG CAT TTG ACT AAT TAC TCA CTT AAT AAA AAT AAT CCT AAC TTC AAG AAA AAC AAG GAT GCT AAT GAA GAT AGT GAA GGC TCG AAG TGG TCA TTA AAA GCT CTA TTT AGA AAA TAC ACA GAG ATG GGA GTT AAC ACT GCT CAG TTG TGG GAC AGA ATA AAA GAT ATT GTA ATT AAA ACT TGT ATT GCA ACT GAG CCA TAT ATG ACA GAT TAG TAT GTA AAA TGT GAA AAT CAT AGA ACA AAT TGT TTT GAA TTG TAT GGC TTT GAC ATA TTA ATC GAT GAT ACC CTA AAG CCT TGG TTG CTT GAA GTA AAT GTG CGT CCA TCT TTA AGC AGT TCT TCT CCT TTA GAC AGA AGA ATA AAG CAT ACT TTA GTA TGT GAT ACA TTC AAT TTG ATA GGA ATC TAG CCT TAT GAT AAA AGA AAG TTT GAA GAA GAT CAA AGA AAA AAG ATT CCA GGA GTA TCT GAT TAA AAA AGA GGA TTT TCT AAA AAC TTA AAA GAT TTA TCA GAT TTA AAT GAA TTC AAC TGT TTG CAA AAG CTT TCA CCA GAA GAT TGG AAT ATG CTT TTT GAA ACA GAC GAA GAG AAC TAT AGA ACA GGA CAT TTC GAG AGA ATT TTT CCT CCT CCT AAA GAT AAA ATT GAT TTT TAC TTG AAG TTT TTT GAA TAT GAG AGA TAT AAC AAC ATA ATC ATT CGC AGT TGG GTC AAG TCA AGC ACC AAC TTT TTA GAA AAA ATC TTG AAA AAA GTT TAT GAA TTT AAT GTT TGA >TTHERM_00985000(protein)M N N S S P I R V N S Y L Q S N N Q A W Q L A Q Q I C Q S A T K S N Q Q N T S S I E R P H S Q I Q G Q A S Q Q I Q L N G Y N F Q G H T S I I S N G N Y Q H Q L H H Q K V A I S E S P Q R P Q Q Q I I N N Q I I K L E A L G V Q K D N P N Q I F S F H H Q N G Y F K K K N Y S A A V K R N L S Q Q V S Q Q L F N C E L K G I N P Q H N I F C D Q N K G S H L R S S S N H V N P Y I Q Q K I N G F Q Q S V L Q N K T L Y Y G S N A S N S L L S S Q P Q K I D I F A R S T Y Y V R P L Q E L V Q L N S G K R I L D P Q S Y A N A E N I N Q L E Q P E K A L I Q E I E C N Q Q E T N T S L N I D D S S K H N Q R N L S I N E G K I Q K E I I G L Q N Q S F G I H C D N P N K R L S D S I T I Q A P F S S H N Y D F Q Q E D Y K L Q R V T L N P V Y K T E Q N I E R L E P I E N G D Q F T P Q S S N L E Q K K S K K I Q N F P D Q M Q F S E T K R Q I K Q A E L F R I S S P L K Y I K S N A Q F K L R S I S Q Q D P A L K N V L Q V Q E S P I K Q I Y Q E R E V I V K Q S I T N T N F A N N P L M V T S S I E K T I D F Q P N N N I Q D E K E R I I S K S Y S A V K K S L A E R T S R S Q N P H E I L N R T Q N V I Q M Y Q S Q N S Y N S N Y G S I R K S K N H Y S F T K K Q K E E K I E Q I I L K C T D K T Y F D P A G D M R N E L Q Q Q Q Q K V S T L N K N D F K V G I N S E K A S P K S Q T V I Q K Y G I N Q S E Q K E G D Q A K K V F V F K K N I N K N E E D D D D E E K N Q N N S D S D S S K D L D V D S D E D E D E D E N D L E D S I D Q A L I N S A Y E P S T E C S A S F Q P P V L Q P N R Y N K L L L L K S V Y E N R P L T V F F P Y P P Q C G D I I R N S S R T V V A T D Y E E K R F D M R F K V T T N S L N R C V G H A F Q Y A G I R E T E D N D W N M V W S T G R D N R V K N M I K Y Q K I N H F P Q Y W N M G R K D C L W K N L S K V K R K F P Q E Y D F I P N T Y I L Q H Q S D W D R F L A K R D D A E K G K L W I M K P S N Q A Q G K N I K M I S K R S K V Q R K Q E Y I I C E Y V A N P H L I D G L K Y D L R I Y V L V T S Y D P L R I Y I F D D G L T R F A T E K Y S T N T K E L S K R Y V H L T N Y S L N K N N P N F K K N K D A N E D S E G S K W S L K A L F R K Y T E M G V N T A Q L W D R I K D I V I K T C I A T E P Y M T D Q Y V K C E N H R T N C F E L Y G F D I L I D D T L K P W L L E V N V R P S L S S S S P L D R R I K H T L V C D T F N L I G I Q P Y D K R K F E E D Q R K K I P G V S D Q K R G F S K N L K D L S D L N E F N C L Q K L S P E D W N M L F E T D E E N Y R T G H F E R I F P P P K D K I D F Y L K F F E Y E R Y N N I I I R S W V K S S T N F L E K I L K K V Y E F N V >TTHERM_00985000(gene)ATG AAT AAC TCT TCA CCT ATA AGA GTA AAT AGC TAC CTC TAA AGT AAC AAT TAA GCA TGG TAA TTA GCT TAA TAG ATA TGC CAA TCG GCA ACG AAG TCA AAT TAA TAA AAT ACA AGT TCA ATA GAA AGA CCA CAT TCA TAA ATT TAA GGT TAG GCT TCT TAA TAA ATA TAG TTA AAT GGT TAT AAT TTT TAA GGC CAC ACC AGC ATT ATT TCG AAT GGC AAC TAT TAG CAT CAA CTG CAT CAT TAA AAA GTA GCA ATT AGC GAA TCG CCA TAA AGA CCT TAA TAG CAA ATA ATA AAT AAT CAA ATT ATA AAA TTA GAG GCA TTG GGA GTG CAA AAA GAT AAT CCG AAT TAG ATA TTT TCA TTT CAT CAC TAA AAT GGA TAT TTT AAA AAG AAA AAC TAT TCC GCA GCA GTA AAG AGG AAT CTT TCT TAG CAA GTA TCT TAG CAA TTA TTT AAC TGC GAA TTA AAA GGC ATC AAT CCT TAA CAT AAT ATT TTC TGT GAT CAA AAT AAA GGA TCA CAT TTA AGA TCC AGC TCC AAC CAC GTT AAC CCA TAT ATT TAG TAA AAG ATA AAT GGG TTT TAG TAA AGT GTT TTA CAA AAT AAA ACT TTG TAC TAT GGC TCA AAT GCA AGC AAT TCC CTT TTA TCA TCA TAA CCC TAA AAA ATA GAT ATA TTC GCT CGT TCA ACT TAC TAC GTT AGA CCT TTA TAA GAG CTA GTA CAG CTC AAC TCA GGG AAA AGA ATT TTG GAT CCT TAA AGC TAT GCA AAT GCT GAA AAT ATA AAT TAA CTT GAG TAA CCT GAA AAG GCT TTA ATT TAA GAA ATT GAA TGC AAC TAG CAA GAA ACT AAT ACA AGT TTA AAT ATT GAT GAT TCA AGT AAA CAC AAT TAG AGA AAT CTT AGT ATA AAT GAA GGG AAA ATT CAA AAA GAG ATT ATT GGA TTA CAA AAT TAG TCA TTT GGA ATA CAT TGC GAT AAT CCA AAC AAA AGG TTG TCA GAT AGT ATT ACA ATA TAA GCT CCT TTC AGT AGT CAC AAT TAT GAT TTC CAA TAA GAG GAT TAT AAA CTA TAG AGA GTA ACT CTT AAC CCA GTA TAT AAA ACA GAA TAA AAT ATA GAA AGA TTG GAA CCT ATT GAA AAT GGA GAT TAG TTC ACT CCT TAA AGC AGC AAT TTG GAA TAA AAA AAA TCA AAA AAA ATA CAA AAC TTT CCT GAT TAG ATG CAA TTT AGT GAA ACC AAA AGG TAA ATA AAA CAA GCT GAA CTA TTT AGG ATA TCT TCG CCA CTC AAA TAC ATA AAA TCA AAT GCA TAG TTC AAA TTA AGA TCA ATT TCA TAG TAA GAT CCA GCT TTA AAA AAT GTA TTA TAA GTA CAG GAA AGC CCT ATC AAG CAA ATT TAT TAA GAA AGA GAG TAA AAA TTA TAA ATT TTA CAT TAA AAT TTG ATT GAA AAT AAA ATT TTA TTT TTA AAA TTA AAA AAA AAA TAG AGT TAT TGT AAA ATA AAG TAT CAC AAA TAC GAA TTT TGC CAA CAA TCC ACT TAT GGT TAC ATC TTC TAT AGA AAA AAC AAT AGA CTT CTA GCC AAA TAA TAA TAT TTA AGA TGA AAA AGA GAG AAT TAT AAG CAA AAG CTA TTC AGC TGT AAA AAA ATC TCT AGC AGA GAG GAC GTC AAG GTC TTA AAA CCC TCA TGA AAT TCT TAA TCG AAC TTA AAA TGT GAT TTA GAT GTA TCA AAG TTA AAA TAG TTA CAA TAG CAA TTA CGG GAG CAT AAG GAA GAG TAA GAA TCA TTA TTC TTT TAC AAA AAA GCA GAA GGA AGA AAA AAT TGA ATA AAT CAT TTT GAA ATG CAC AGA TAA AAC ATA TTT TGA TCC TGC TGG TGA TAT GAG AAA TGA GTT GCA GTA ATA ACA GCA AAA GGT TAG TAC TTT GAA TAA GAA TGA TTT CAA AGT CGG AAT AAA CAG CGA AAA AGC TTC TCC AAA ATC ATA AAC AGT AAT ATA AAA ATA TGG TAT TAA TCA ATC AGA GTA AAA GGA AGG TGA TCA AGC CAA AAA AGT GTT TGT GTT TAA AAA AAA TAT TAA TAA AAA TGA AGA AGA TGA CGA TGA TGA AGA GAA AAA TCA AAA CAA CAG TGA TAG CGA TTC ATC GAA AGA TTT AGA TGT CGA TAG TGA TGA AGA TGA AGA TGA GGA TGA GAA TGA CTT AGA AGA TAG CAT CGA CTA AGC ATT GAT TAA TTC AGC ATA TGA ACC ATC AAC AGA ATG CTC TGC TTC ATT TTA ACC TCC AGT CTT GCA ACC AAA TAG ATA TAA CAA GCT CTT ACT ATT AAA AAG TGT GTA TGA AAA CCG TCC TTT GAC CGT ATT CTT TCC CTA TCC TCC TTA ATG TGG AGA TAT CAT CAG AAA CTC TTC TAG AAC AGT TGT AGC AAC CGA TTA TGA AGA AAA AAG GTT TGA TAT GAG GTA AAT TTT TAT TTT TTA AAG TAT TTA AGC TGT AAT GAA ATC ATT TAG TTG TTT TTC ATT TTT TTT TGA TGT TGT TGT AAA TTT TTG TTA TAT TTT TGC TAT GGA AAA TAT TGA ATA ATC AAG AAA TTA AAA AAA ATT TTG TTT TTT AAA GGT TTA AGG TGA CCA CTA ATA GCT TAA ATA GGT GTG TTG GAC ATG CAT TTT AGT ATG CAG GTA TTA GAG AGA CTG AAG ATA ATG ACT GGA ATA TGG TAT GGA GCA CTG GAA GAG ATA ATA GAG TAA AAA ATA TGA TTA AAT ATT AAA AAA TTA ACC ACT TCC CAT AGT ATT GGA ATA TGG GGA GAA AGG ACT GCT TGT GGA AAA ATT TGT CTA AAG TTA AAA GAA AAT TTC CAT AAG AAT ATG ACT TTA TTC CAA ATA CTT ATA TAT TGT AAC ATT AAT CAG ATT GGG ATA GAT TTT TGG CAA AAA GAG ATG ATG CTG AGA AAG GAA AAT TGT GGA TTA TGA AGC CTA GCA ACT AGG CCT AAG GAA AAA ATA TAA AGA TGA TAT CAA AGA GAA GCA AAG TAT AAA GAA AGC AAG AAT ACA TTA TTT GTG AGT ATG TAG CAA ATC CAC ATT TGA TTG ATG GAT TAA AAT ATG ATC TTC GTA TAT ATG TTT TAG TCA CTT CAT ATG ATC CTC TTA GGA TAT ACA TTT TCG ATG ATG GTT TGA CTC GTT TCG CGA CTG AAA AAT ATT CAA CTA ATA CAA AAG AAC TCT CAA AAA GAT ATG TGC ATT TGA CTA ATT ACT CAC TTA ATA AAA ATA ATC CTA ACT TCA AGA AAA ACA AGG ATG CTA ATG AAG ATA GTG AAG GCT CGA AGT GGT CAT TAA AAG CTC TAT TTA GAA AAT ACA CAG AGA TGG GAG TTA ACA CTG CTC AGT TGT GGG ACA GAA TAA AAG ATA TTG TAA TTA AAA CTT GTA TTG CAA CTG AGC CAT ATA TGA CAG ATT AGT ATG TAA AAT GTG AAA ATC ATA GAA CAA ATT GTT TTG AAT TGT ATG GCT TTG ACA TAT TAA TCG ATG ATA CCC TAA AGC CTT GGT TGC TTG AAG TAA ATG TGC GTC CAT CTT TAA GCA GTT CTT CTC CTT TAG ACA GAA GAA TAA AGC ATA CTT TAG TAT GTG ATA CAT TCA ATT TGA TAG GAA TCT AGC CTT ATG ATA AAA GAA AGT TTG AAG AAG ATC AAA GAA AAA AGA TTC CAG GAG TAT CTG ATT AAA AAA GAG GAT TTT CTA AAA ACT TAA AAG ATT TAT CAG ATT TAA ATG AAT TCA ACT GTT TGC AAA AGC TTT CAC CAG AAG ATT GGA ATA TGC TTT TTG AAA CAG ACG AAG AGA ACT ATA GAA CAG GAC ATT TCG AGA GAA TTT TTC CTC CTC CTA AAG ATA AAA TTG ATT TTT ACT TGA AGT TTT TTG AAT ATG AGA GAT ATA ACA ACA TAA TCA TTC GCA GTT GGG TCA AGT CAA GCA CCA ACT TTT TAG AAA AAA TCT TGA AAA AAG TTT ATG AAT TTA ATG TTT GA