Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00316230

Standard Name

TTLL3D (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt20934 | 31.m00236 | 3687.m00038

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00612 ) IQ calmodulin-binding motif
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00316230

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_05635.19.999776257620412e-83tubulin-tyrosine ligase (1118
aa)
OxytrichaContig11464.0.g1121.9990871925214856e-61Tubulin-tyrosine ligase family
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position 4627625 to 4629265
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SGDYBR094W0.0000000400154582995175PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00316230(coding)
ATGAGTGATCGAATATATCATTCTTATGTGAATAACTTCTATCAAAAGGCTAAGAGTCCT
AAAAATACCTAACTCATTAAATAAATTTAGAGGAGCAATCCTACTTCACCTAAAAAAAAC
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AACATTCTTCTTACAACAAAAAATAGCTAGCCAAAAGTGTTTGAAAAGTTAATATAATTA
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AAAAATGTAGAAGACTCAGCAATCAGTCTAAAGTTATTAAAACATATTATTAAAAAAGAA
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CTAAACAGCAATAACTTTTAATCTGAAGACTCTGAAGAAAGATTTATTTCAGCAGCTATT
ACAATTTAAAAGTGGTACAGATAAATAAAGCTAATGAAAAATGAAAATTAAAAAATATGA


>TTHERM_00316230(protein)
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QNYIKNKLELQERKMYLENQNPKSLSPIKIHFNEKSMPFKNKIQKKITYNEQSSIQQTIT
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INSQDQFVQEVLIELGWIENKLFKSDLFHLKWIYTDINKDYENLKEGQFYNHFQNNQELT
NKGRLLRNIKLYLVSYPHLQKYFPIQFDVIYKQQKEEFLNEFQKFEIFRKFKDVIQIIKN
DLTQELINQLTQIYHTKFIKKEEEEELQYGLITYFRQNQQFKQYIEYINQVNKDIINLLS
KIPNPNINEMLIKYLNDLSILQVDKLECDQEQGDKNIQAQIINLSISIELDNILEQIYPY
TNFCNFWIIKPCGSSKGQGLQIMSDDNQIVNYTTQLQARLVQKYIERIYICKSQEYPQLY
NKKFDLRLWVLVKSFNPLTVYYYKHAYLRVCSSEYDLSDTRNIFSHFTNYSINRNKFIQN
KNVEDSAISLKLLKHIIKKEHGISYQKKIQPQINEIIIHSLKSVQKKIKQNNSCFEIYGF
DIIFDEQFNPYLLEVNLSPACSKRNEFISKLQKEMFISTLNILFNTEYYQIQNWKKIKIQ
DQIQKVINESTHTQLQEEVILNSNNFQSEDSEERFISAAITIQKWYRQIKLMKNENQKI


>TTHERM_00316230(gene)
ATGAGTGATCGAATATATCATTCTTATGTGAATAACTTCTATCAAAAGGCTAAGAGTCCT
AAAAATACCTAACTCATTAAATAAATTTAGAGGAGCAATCCTACTTCACCTAAAAAAAAC
TTACAAATATATAAAAATATTAATCCATTCAATCATGAAAATTGGTAGAAATTTGTGATA
CATTATTTTGAAAATATTAAATTATATCGTTTAAATAAAAGCCAAAGGATAATTGAAGAG
AATGCAATTCGCTTTTCGGATAAAAAAACTGTCTAGCTTGGAACGGTGTATGGATGCAAC
ATTCTTCTTACAACAAAAAATAGCTAGCCAAAAGTGTTTGAAAAGTTAATATAATTAAGT
GATAATAGTAACTTTAGATAAGTCACTTTGCTAAAAAGTATTAGCCCAGTTAGTGTGGTT
AAAGCAAAAGATTTTCTAAATGATTCTATTAGCAATAGATCAAGGTCTGCCTAAAAAATG
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TTTTAACAAATTATAAAGGCAAATATCAAAGATTAGATTTCTGAAGAGAGCAAAAGCAAA
AGAAATAAAATAAAGGTTATAAAAGATATGCCAATTTAGCTGGATAACTCTTTTTAAACA
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TTGCATAATATTTTTAAAAAGAGACAACAAGCTGAAGAAGGTTTACAAATATAAGAAGAG
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TAAAATCCTAAATCTCTCAGTCCAATCAAGATACATTTCAATGAAAAATCTATGCCTTTT
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TGCATAAATTCTTAAGATTAATTTGTCTAAGAAGTTCTAATTGAGCTAGGATGGATAGAA
AATAAACTCTTCAAGTCTGACCTTTTTCACTTGAAATGGATTTACACTGATATTAATAAG
GATTATGAAAATTTGAAAGAAGGTTAATTTTACAATCATTTTCAAAACAACCAAGAATTG
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CAAAAATACTTTCCTATATAATTCGATGTTATTTATAAATAACAAAAAGAAGAATTTTTA
AATGAATTCCAAAAATTTGAAATTTTTAGAAAGTTTAAGGATGTAATATAAATAATTAAA
AACGATTTAACTTAGGAATTAATTAATTAATTAACACAGATATACCATACAAAATTTATA
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TAAATTATAAATTTGAGTATTTCAATCGAATTAGATAATATACTTGAATAAATATACCCT
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TATACTATTATAAACATGCTTACCTTAGAGTATGCAGTAGTGAGTATGATTTATCAGATA
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ATAAAAATGTAGAAGACTCAGCAATCAGTCTAAAGTTATTAAAACATATTATTAAAAAAG
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TTGATATTATATTTGATGAATAATTCAATCCCTATTTACTAGAAGTAAATTTGAGCCCAG
CATGCTCCAAAAGAAATGAATTTATATCAAAGCTATAAAAAGAAATGTTCATTTCAACTC
TAAATATTCTGTTTAATACTGAATACTATTAAATATAAAACTGGAAGAAAATAAAAATAT
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TTCTAAACAGCAATAACTTTTAATCTGAAGACTCTGAAGAAAGATTTATTTCAGCAGCTA
TTACAATTTAAAAGTGGTACAGATAAATAAAGCTAATGAAAAATGAAAATTAAAAAATAT
GA