Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00316230
Standard Name
TTLL3D (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )
Aliases
PreTt20934 | 31.m00236 | 3687.m00038
Description
TTLL3D tubulin glycylase 3C; Related to tubulin tyrosine ligase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( PF00612 ) IQ calmodulin-binding motif
( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00316230
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_05635.1 9.999776257620412e-83 tubulin-tyrosine ligase (1118
aa)
Oxytricha Contig11464.0.g112 1.9990871925214856e-61 Tubulin-tyrosine ligase family
DictyBase DDB_G0281541 1.000382677035467e-28 DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
WormBase WBGene00044187 5.997739233660418e-28 locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
Stentor Coeruleus SteCoe_9315 3.221340285992516e-27
SGD YBR094W 0.0000000400154582995175 PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:15890843 : Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00316230(coding)ATG AGT GAT CGA ATA TAT CAT TCT TAT GTG AAT AAC TTC TAT CAA AAG GCT AAG AGT CCT AAA AAT ACC TAA CTC ATT AAA TAA ATT TAG AGG AGC AAT CCT ACT TCA CCT AAA AAA AAC TTA CAA ATA TAT AAA AAT ATT AAT CCA TTC AAT CAT GAA AAT TGC CAA AGG ATA ATT GAA GAG AAT GCA ATT CGC TTT TCG GAT AAA AAA ACT GTC TAG CTT GGA ACG GTG TAT GGA TGC AAC ATT CTT CTT ACA ACA AAA AAT AGC TAG CCA AAA GTG TTT GAA AAG TTA ATA TAA TTA AGT GAT AAT AGT AAC TTT AGA TAA GTC ACT TTG CTA AAA AGT ATT AGC CCA GTT AGT GTG GTT AAA GCA AAA GAT TTT CTA AAT GAT TCT ATT AGC AAT AGA TCA AGG TCT GCC TAA AAA ATG TAT TCA GAT AAA GAT AAA TTT TAA GTA GGA AAT AAT AAA AGT TCT CTG AGA TCT CTT ATT TAT TTT CCA CTA GCA AAT ATC AAA GAT TAG ATT TCT GAA GAG AGC AAA AGC AAA AGA AAT AAA ATA AAG GTT ATA AAA GAT ATG CCA ATT TAG CTG GAT AAC TCT TTT TAA ACA ATT AAT CAT TAA ATA AAC TCA CCT AAC AAT AAT ATA GTT GGC GAT TAA TCA CAT GTT ATT TTG CAT AAT ATT TTT AAA AAG AGA CAA CAA GCT GAA GAA GGT TTA CAA ATA TAA GAA GAG CCT TAA AAT TAT ATT AAA AAC AAA TTA GAA TTA TAA GAG AGA AAA ATG TAT TTG GAA AAT TAA AAT CCT AAA TCT CTC AGT CCA ATC AAG ATA CAT TTC AAT GAA AAA TCT ATG CCT TTT AAA AAT AAA ATT CAA AAA AAA ATT ACG TAT AAT GAG TAA AGC AGT ATT TAA TAA ACA ATA ACA CTA ATT AAA AAG AAA ATA CTT GGT CCA CCT TCA TTA TAT AGC AGA CTG AAA AAA AAC TCT GAA TAA TTC AAG AAT ATT GAA AAT TTG ATT AAA AAT AAA GCA AAA GAG TCC CAC GAG CAA AAT ATG CAG GAG TAT TTA AAA AGG ATA GGC TGC ACT GAT AAA AAT AAA AAA GTA TTT TGC ATA AAT TCT TAA GAT TAA TTT GTC TAA GAA GTT CTA ATT GAG CTA GGA TGG ATA GAA AAT AAA CTC TTC AAG TCT GAC CTT TTT CAC TTG AAA TGG ATT TAC ACT GAT ATT AAT AAG GAT TAT GAA AAT TTG AAA GAA GGT TAA TTT TAC AAT CAT TTT CAA AAC AAC CAA GAA TTG ACT AAT AAA GGA AGA CTG TTA AGA AAC ATC AAA TTA TAC TTA GTT TCT TAT CCA CAC TTA CAA AAA TAC TTT CCT ATA TAA TTC GAT GTT ATT TAT AAA TAA CAA AAA GAA GAA TTT TTA AAT GAA TTC CAA AAA TTT GAA ATT TTT AGA AAG TTT AAG GAT GTA ATA TAA ATA ATT AAA AAC GAT TTA ACT TAG GAA TTA ATT AAT TAA TTA ACA CAG ATA TAC CAT ACA AAA TTT ATA AAA AAA GAA GAA GAA GAA GAA TTA CAA TAT GGA TTA ATT ACA TAT TTT AGA TAG AAT TAA TAA TTC AAA CAA TAC ATA GAA TAC ATT AAT TAG GTA AAT AAA GAT ATT ATT AAT TTA CTT AGC AAA ATA CCA AAT CCA AAT ATT AAT GAG ATG CTA ATT AAA TAT TTA AAT GAT TTA AGC ATA TTG CAA GTA GAT AAA TTA GAA TGT GAT TAA GAG CAA GGA GAT AAA AAT ATC TAA GCA TAA ATT ATA AAT TTG AGT ATT TCA ATC GAA TTA GAT AAT ATA CTT GAA TAA ATA TAC CCT TAT ACT AAT TTT TGT AAC TTT TGG ATC ATC AAA CCG TGT GGA AGC TCA AAG GGA CAA GGC TTG CAG ATA ATG AGT GAT GAT AAT TAA ATT GTC AAT TAC ACA ACT CAA CTC TAA GCA AGA CTA GTA TAG AAA TAT ATT GAA CGT ATT TAC ATT TGC AAA AGC TAA GAA TAT CCT TAG TTG TAT AAT AAA AAA TTT GAT CTA CGA TTA TGG GTA TTA GTG AAA AGC TTT AAT CCC CTT ACA GTA TAC TAT TAT AAA CAT GCT TAC CTT AGA GTA TGC AGT AGT GAG TAT GAT TTA TCA GAT ACA AGG AAC ATA TTT TCT CAC TTT ACT AAT TAT TCT ATT AAT AGA AAT AAA TTT ATC TAA AAT AAA AAT GTA GAA GAC TCA GCA ATC AGT CTA AAG TTA TTA AAA CAT ATT ATT AAA AAA GAA CAT GGA ATA AGC TAC CAA AAA AAA ATT TAA CCA TAG ATA AAT GAA ATA ATT ATC CAT TCT CTA AAA TCT GTC TAA AAA AAG ATT AAG CAA AAC AAC TCT TGC TTT GAA ATA TAT GGA TTT GAT ATT ATA TTT GAT GAA TAA TTC AAT CCC TAT TTA CTA GAA GTA AAT TTG AGC CCA GCA TGC TCC AAA AGA AAT GAA TTT ATA TCA AAG CTA TAA AAA GAA ATG TTC ATT TCA ACT CTA AAT ATT CTG TTT AAT ACT GAA TAC TAT TAA ATA TAA AAC TGG AAG AAA ATA AAA ATA TAA GAT TAA ATT CAA AAA GTA ATA AAT GAA AGC ACC CAT ACA TAG TTG TAA GAA GAA GTA ATT CTA AAC AGC AAT AAC TTT TAA TCT GAA GAC TCT GAA GAA AGA TTT ATT TCA GCA GCT ATT ACA ATT TAA AAG TGG TAC AGA TAA ATA AAG CTA ATG AAA AAT GAA AAT TAA AAA ATA TGA >TTHERM_00316230(protein)M S D R I Y H S Y V N N F Y Q K A K S P K N T Q L I K Q I Q R S N P T S P K K N L Q I Y K N I N P F N H E N C Q R I I E E N A I R F S D K K T V Q L G T V Y G C N I L L T T K N S Q P K V F E K L I Q L S D N S N F R Q V T L L K S I S P V S V V K A K D F L N D S I S N R S R S A Q K M Y S D K D K F Q V G N N K S S L R S L I Y F P L A N I K D Q I S E E S K S K R N K I K V I K D M P I Q L D N S F Q T I N H Q I N S P N N N I V G D Q S H V I L H N I F K K R Q Q A E E G L Q I Q E E P Q N Y I K N K L E L Q E R K M Y L E N Q N P K S L S P I K I H F N E K S M P F K N K I Q K K I T Y N E Q S S I Q Q T I T L I K K K I L G P P S L Y S R L K K N S E Q F K N I E N L I K N K A K E S H E Q N M Q E Y L K R I G C T D K N K K V F C I N S Q D Q F V Q E V L I E L G W I E N K L F K S D L F H L K W I Y T D I N K D Y E N L K E G Q F Y N H F Q N N Q E L T N K G R L L R N I K L Y L V S Y P H L Q K Y F P I Q F D V I Y K Q Q K E E F L N E F Q K F E I F R K F K D V I Q I I K N D L T Q E L I N Q L T Q I Y H T K F I K K E E E E E L Q Y G L I T Y F R Q N Q Q F K Q Y I E Y I N Q V N K D I I N L L S K I P N P N I N E M L I K Y L N D L S I L Q V D K L E C D Q E Q G D K N I Q A Q I I N L S I S I E L D N I L E Q I Y P Y T N F C N F W I I K P C G S S K G Q G L Q I M S D D N Q I V N Y T T Q L Q A R L V Q K Y I E R I Y I C K S Q E Y P Q L Y N K K F D L R L W V L V K S F N P L T V Y Y Y K H A Y L R V C S S E Y D L S D T R N I F S H F T N Y S I N R N K F I Q N K N V E D S A I S L K L L K H I I K K E H G I S Y Q K K I Q P Q I N E I I I H S L K S V Q K K I K Q N N S C F E I Y G F D I I F D E Q F N P Y L L E V N L S P A C S K R N E F I S K L Q K E M F I S T L N I L F N T E Y Y Q I Q N W K K I K I Q D Q I Q K V I N E S T H T Q L Q E E V I L N S N N F Q S E D S E E R F I S A A I T I Q K W Y R Q I K L M K N E N Q K I >TTHERM_00316230(gene)ATG AGT GAT CGA ATA TAT CAT TCT TAT GTG AAT AAC TTC TAT CAA AAG GCT AAG AGT CCT AAA AAT ACC TAA CTC ATT AAA TAA ATT TAG AGG AGC AAT CCT ACT TCA CCT AAA AAA AAC TTA CAA ATA TAT AAA AAT ATT AAT CCA TTC AAT CAT GAA AAT TGG TAG AAA TTT GTG ATA CAT TAT TTT GAA AAT ATT AAA TTA TAT CGT TTA AAT AAA AGC CAA AGG ATA ATT GAA GAG AAT GCA ATT CGC TTT TCG GAT AAA AAA ACT GTC TAG CTT GGA ACG GTG TAT GGA TGC AAC ATT CTT CTT ACA ACA AAA AAT AGC TAG CCA AAA GTG TTT GAA AAG TTA ATA TAA TTA AGT GAT AAT AGT AAC TTT AGA TAA GTC ACT TTG CTA AAA AGT ATT AGC CCA GTT AGT GTG GTT AAA GCA AAA GAT TTT CTA AAT GAT TCT ATT AGC AAT AGA TCA AGG TCT GCC TAA AAA ATG TAT TCA GAT AAA GAT AAA TTT TAA GTA GGA AAT AAT AAA AGT TCT CTG AGA TCT CTT ATT TAT TTT CCA CTA GTA TTT AAT ATA AAA CTA AAA TGC AAA CGA ATT CAT TAT ATA AAT ATT TTT TAA CAA ATT ATA AAG GCA AAT ATC AAA GAT TAG ATT TCT GAA GAG AGC AAA AGC AAA AGA AAT AAA ATA AAG GTT ATA AAA GAT ATG CCA ATT TAG CTG GAT AAC TCT TTT TAA ACA ATT AAT CAT TAA ATA AAC TCA CCT AAC AAT AAT ATA GTT GGC GAT TAA TCA CAT GTT ATT TTG CAT AAT ATT TTT AAA AAG AGA CAA CAA GCT GAA GAA GGT TTA CAA ATA TAA GAA GAG CCT TAA AAT TAT ATT AAA AAC AAA TTA GAA TTA TAA GAG AGA AAA ATG TAT TTG GAA AAT TAA AAT CCT AAA TCT CTC AGT CCA ATC AAG ATA CAT TTC AAT GAA AAA TCT ATG CCT TTT AAA AAT AAA ATT CAA AAA AAA ATT ACG TAT AAT GAG TAA AGC AGT ATT TAA TAA ACA ATA ACA CTA ATT AAA AAG AAA ATA CTT GGT CCA CCT TCA TTA TAT AGC AGA CTG AAA AAA AAC TCT GAA TAA TTC AAG AAT ATT GAA AAT TTG ATT AAA AAT AAA GCA AAA GAG TCC CAC GAG CAA AAT ATG CAG GAG TAT TTA AAA AGG ATA GGC TGC ACT GAT AAA AAT AAA AAA GTA TTT TGC ATA AAT TCT TAA GAT TAA TTT GTC TAA GAA GTT CTA ATT GAG CTA GGA TGG ATA GAA AAT AAA CTC TTC AAG TCT GAC CTT TTT CAC TTG AAA TGG ATT TAC ACT GAT ATT AAT AAG GAT TAT GAA AAT TTG AAA GAA GGT TAA TTT TAC AAT CAT TTT CAA AAC AAC CAA GAA TTG ACT AAT AAA GGA AGA CTG TTA AGA AAC ATC AAA TTA TAC TTA GTT TCT TAT CCA CAC TTA CAA AAA TAC TTT CCT ATA TAA TTC GAT GTT ATT TAT AAA TAA CAA AAA GAA GAA TTT TTA AAT GAA TTC CAA AAA TTT GAA ATT TTT AGA AAG TTT AAG GAT GTA ATA TAA ATA ATT AAA AAC GAT TTA ACT TAG GAA TTA ATT AAT TAA TTA ACA CAG ATA TAC CAT ACA AAA TTT ATA AAA AAA GAA GAA GAA GAA GAA TTA CAA TAT GGA TTA ATT ACA TAT TTT AGA TAG AAT TAA TAA TTC AAA CAA TAC ATA GAA TAC ATT AAT TAG GTA AAT AAA GAT ATT ATT AAT TTA CTT AGC AAA ATA CCA AAT CCA AAT ATT AAT GAG ATG CTA ATT AAA TAT TTA AAT GAT TTA AGC ATA TTG CAA GTA GAT AAA TTA GAA TGT GAT TAA GAG CAA GGA GAT AAA AAT ATC TAA GCA TAA ATT ATA AAT TTG AGT ATT TCA ATC GAA TTA GAT AAT ATA CTT GAA TAA ATA TAC CCT TAT ACT AAT TTT TGT AAC TTT TGG ATC ATC AAA CCG TGT GGA AGC TCA AAG TAA TTT CTT TAA GTA TTT AAA AAA TTT ATT AAA TAT TAA TAT TTT TTA TTT ATT TTA GGG GAC AAG GCT TGC AGA TAA TGA GTG ATG ATA ATT AAA TTG TCA ATT ACA CAA CTC AAC TCT AAG CAA GAC TAG TAT AGA AAT ATA TTG AAC GTA TTT ACA TTT GCA AAA GCT AAG AAT ATC CTT AGT TGT ATA ATA AAA AAT TTG ATC TAC GAT TAT GGG TAT TAG TGA AAA GCT TTA ATC CCC TTA CAG TAT ACT ATT ATA AAC ATG CTT ACC TTA GAG TAT GCA GTA GTG AGT ATG ATT TAT CAG ATA CAA GGA ACA TAT TTT CTC ACT TTA CTA ATT ATT CTA TTA ATA GAA ATA AAT TTA TCT AAA ATA AAA ATG TAG AAG ACT CAG CAA TCA GTC TAA AGT TAT TAA AAC ATA TTA TTA AAA AAG AAC ATG GAA TAA GCT ACC AAA AAA AAA TTT AAC CAT AGA TAA ATG AAA TAA TTA TCC ATT CTC TAA AAT CTG TCT AAA AAA AGA TTA AGC AAA ACA ACT CTT GCT TTG AAA TAT ATG GAT TTG ATA TTA TAT TTG ATG AAT AAT TCA ATC CCT ATT TAC TAG AAG TAA ATT TGA GCC CAG CAT GCT CCA AAA GAA ATG AAT TTA TAT CAA AGC TAT AAA AAG AAA TGT TCA TTT CAA CTC TAA ATA TTC TGT TTA ATA CTG AAT ACT ATT AAA TAT AAA ACT GGA AGA AAA TAA AAA TAT AAG ATT AAA TTC AAA AAG TAA TAA ATG AAA GCA CCC ATA CAT AGT TGT AAG AAG AAG TAA TTC TAA ACA GCA ATA ACT TTT AAT CTG AAG ACT CTG AAG AAA GAT TTA TTT CAG CAG CTA TTA CAA TTT AAA AGT GGT ACA GAT AAA TAA AGC TAA TGA AAA ATG AAA ATT AAA AAA TAT GA