Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00770730

Standard Name

TTLL3C (Tubulin Tyrosine Ligase-Like)

Aliases

PreTt13915 | 127.m00078

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF05923 ) APC cysteine-rich region
  • ( PF00612 ) IQ calmodulin-binding motif
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF08518 ) Spa2 homology domain (SHD) of

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.7%

TetraMine Data

TTHERM_00770730

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_05635.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (1118
aa)
OxytrichaContig11464.0.g1124.0006908853687255e-76Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_205303.6251409191435593e-34
DictyBaseDDB_G02815411.999981404597394e-31DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
WormBaseWBGene000441877.002116201343823e-26locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
SGDYBR094W0.000004000864880866421PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00770730(coding)
ATGATATTGCCTTTTGAATACTATTTTTTAAATGACGCTGATAACAGCAGCAAAAGCAAC
TATAACAATATATAATTTATTAATGAAAATTAGAATAATAATTTAAGACAAAAGCCTAAA
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ATGAATCATTTTGCAAATATAAACAATTATTAAGACAATAAATTTTCTTTAGAATCTTTA
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GTAGAGGATGCAACAAACAAAAACAACAACAACTACAACTACAACTACAACAACAACAAT
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GTTACAAATTAAAATTAAATAAAAAATGAGCAAACAGAAAGGAAACCAAATATGTTTGGT
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AATAAAGTTGTAGCCAAAAACAAAAAAAGAACAATTTTTAAAATAAATTAAAATAATCTG
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AACACTAATTTAAAAGAGAACAATGATAAATAAAATTTAAAAAAAACTAAAATATAATCA
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GGAAGACTGCTCTACAACTTGAAAAATAACACACAATTTGGTGTAAATTAGGAATTATTT
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GCTTAAGTAAAAGATGGGATATTCTTTGCAAAAGTAACGAAATAGAAGTTCTTTAGTCCT
TTAATGTACGAAGATACGAAGAGAGATAACAGATTTATTTTTAACATTACTGTGATAGCT
GAAGCTGTGGAGATACTCAAAAAATTAAAAAGATAGTAAGAGGAATATATAGATGAAACA
AGATAATCAAGAGATTGCTAATTATATATTTACTAAACAAATTTTAAATTGGAGTCTATG
ATTTCTCAGTATGTTAAAATTAATGTACCTTTCGATGAAGAAAAGTTTGTATTTGAAAAG
ATCGTGGGTATGTCAAAAGAACATTGGTCATCTCCATCTATGAAACTTATGAAAAAGCTT
TACTCATTGTATAAATATTTCAAAGATGCTGACCCATAATTTAAAGTTTCTGGAACAAAA
AATATTTGGATAATTAAACCATCTGCTAATTCAAGAGGATCTGGGATATATTTAGTAGAT
AAATTAGACGAAGCTATTGACAGTGGTTTAAAAATGTAGGCGAGAATAGTTTAAAAGTAT
ATTGAGAGGCCTTTAATATTTCAAGGAGCAAAATATAAGAAACTGAACAATAAAAAATTT
GACATCCGATAATGGGTCTTGGTAACAAGCTTTAAGCCTCTCAAAATTTATTTTTTTACA
AGCAGCTATTTAAGAGTGTGCAGCTAATCTTTTGATTTGGACAATATTAAGATTCTTTCT
AAGCACTTAACAAATTTCAGTTTAAATAAAAATAGTCTAGCCAAAGAAAACTGGGATGAG
ACTGTAGTTGAGCTAAAAGATTTCATTAGTTATTTGAAGGAGTTTAAAAATATAGATTAT
CAGGAAGATGTAAAGCCTAAAATAAAGGATTTAGTTATAGAAACAATTAAATGTGCAGCA
GACAAAATTGTCAACAGAAAAAAAAGCTTTGAGTTATATGGCTTTGATATTTTGTTAGAC
GAGTATGCTCATCCTTGGTTGCTTGAAGTAAATTTAAGTCCAGCTTGTTCAGAAAGAAGC
TCGTTTTTGACTGAAATGCTTGATGCGATGGCATACAAGATGTTCTAAATTGTTTTTAAA
TAAAACAACTTATAAGAAGACTTAGAAATCAATAAAGAAACTGCAATTTCTACTGCACCT
GCTTCTTGCCAAAATCCAGATTATGATTGGGAAGAAATTTATAATGAAGAGTAAAAAGAA
TATTTTTGTGAAGAAGATAATAATATGCAATTAGCCTTTAATAATGATATCCAACTTATG
GTTATAGGGTAAAAAGCAGATTTAAAAAAGGAAAAAAATCTTGATAAAAAATACTTCTAA
TATTGGGGAGCGATTAAAATTCAATCAAAGATTAGATCATTTTTAGCCAAAAAGAAGCTA
TAAAGATTGAAAAATTAAAAGTTTACATTTGCAGCCATTAAAATTTAGTAAAAGATGAGA
CAATTTTTAGCTAAAAAGCAGTTAAATATTTTGAAAAAGCAATAATAAACAAATATAAAT
ATTCCAATAGAAGATTTTAACTAAGTTAGTGTTATTGAAGTATGA


>TTHERM_00770730(protein)
MILPFEYYFLNDADNSSKSNYNNIQFINENQNNNLRQKPKFYPNNQFLIEQEQDKYENKK
IKNYISDQIQLQPKNTPINKMNHFANINNYQDNKFSLESLNQAQQDNLQKEEDLSILSFD
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SSTQRNYDFNYQNTNEMLQKKKKSNFQNKSQSQLNNHKNEEKKPSQQRKEQLMKRFESLS
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SNFSTTSNRIISLQALRQKNNSTVKNSDNNNQNQTNPQNQNTNLKENNDKQNLKKTKIQS
ASANQAGQSNNQLQKTFFINSQDEYVRRTLLRMGWKENKLLLNNNFDLKWIYIDSNDDYK
FLNDNQFYNHFKNNTELTQKGRLLYNLKNNTQFGVNQELFFPRCYDLGNDQERGEFSNEF
NRMNVMNLLKKHIQYIKLRRSQTYQEIKQAYQQKQANKLNAQVKDGIFFAKVTKQKFFSP
LMYEDTKRDNRFIFNITVIAEAVEILKKLKRQQEEYIDETRQSRDCQLYIYQTNFKLESM
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TVVELKDFISYLKEFKNIDYQEDVKPKIKDLVIETIKCAADKIVNRKKSFELYGFDILLD
EYAHPWLLEVNLSPACSERSSFLTEMLDAMAYKMFQIVFKQNNLQEDLEINKETAISTAP
ASCQNPDYDWEEIYNEEQKEYFCEEDNNMQLAFNNDIQLMVIGQKADLKKEKNLDKKYFQ
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>TTHERM_00770730(gene)
ATGATATTGCCTTTTGAATACTATTTTTTAAATGACGCTGATAACAGCAGCAAAAGCAAC
TATAACAATATATAATTTATTAATGAAAATTAGAATAATAATTTAAGACAAAAGCCTAAA
TTTTATCCAAACAACCAATTTTTAATTGAGCAAGAATAGGATAAATATGAGAATAAAAAG
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AATTAAGCTTAGTAAGATAATCTTTAGAAAGAAGAAGATTTATCCATTCTTTCTTTTGAT
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AAGACTTAGAAATCAATAAAGAAACTGCAATTTCTACTGCACCTGCTTCTTGCCAAAATC
CAGATTATGATTGGGAAGAAATTTATAATGAAGAGTAAAAAGAATATTTTTGTGAAGAAG
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CAGATTTAAAAAAGGAAAAAAATCTTGATAAAAAATACTTCTAATATTGGTAATTAATTT
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AAAGTTTACATTTGCAGCCATTAAAATTTAGTAAAAGATGAGACAATTTTTAGCTAAAAA
GCAGTTAAATATTTTGAAAAAGCAATAATAAACAAATATAAATATTCCAATAGAAGATTT
TAACTAAGTTAGTGTTATTGAAGTATGA