Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00770730
Standard Name
TTLL3C (Tubulin Tyrosine Ligase-Like)
Aliases
PreTt13915 | 127.m00078
Description
Related to tubulin tyrosine ligase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
Biological Process
Domains
- ( PF05923 ) APC cysteine-rich region
- ( PF00612 ) IQ calmodulin-binding motif
- ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
- ( PF08518 ) Spa2 homology domain (SHD) of
Gene Expression Profile
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
| Source | Identifier | Score | Description |
| Tetrahymena borealis | EI9_05635.1 | 9.99709313703352e-262 | tubulin-tyrosine ligase (1...
|
| ParameciumDB | GSPATP00035219001 | 3.00087253230244e-87 | Paramecium tetraurelia GSPATP0
0035219001 protein
|
| Oxytricha | Contig11464.0.g112 | 4.00069088536873e-76 | Tubulin-tyrosine ligase family
|
| ToxoDB | 641.m01467 | 7.00002890075518e-46 | Toxoplasma gondii tubulin-tyro
sine ligase family protein
|
| IPI(HUMAN) | IPI:IPI00094972.4 | 2.00032180237354e-33 | 04657|VEGA:OTTHUMP00000028514
Tax_Id=9606 PREDICTED: simila
r to tubulin tyrosine ligase-l
ike family, member 3 isoform 1
|
| FlyBase | FBgn0031854 | 2.00013047882648e-26 | |
| DictyBase | DDB0218317 | 5.00009613306889e-23 | JC3V2_0_01847 CG11323 protein.
|
| WormBase | F25C8.5 | 2.99851380290819e-19 | WBGene00044187
|
| PlasmoDB | PFE0700c | 8.99902975825788e-19 | Plasmodium falciparum PFE0700c
|
| TAIR | AT1G77550 | 2.00057776818706e-11 | expressed protein
|
| SGD | YBR094W | 0.00500158708457064 | YBR094W SGDID:S000000298, Chr
II from 432030-434291, Unchara
cterized ORF, "Hypothetical pr
otein"
|
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00770730(coding)
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ATGAATCATTTTGCAAATATAAACAATTATTAAGACAATAAATTTTCTTTAGAATCTTTA
AATTAAGCTTAGTAAGATAATCTTTAGAAAGAAGAAGATTTATCCATTCTTTCTTTTGAT
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GGAGATATTTTTGGCTATTAAACTCGATACACATTTTTTGAAAATAGAAATAATTTATTA
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GCTGCTTCTAATGGTTTTCAAAATTTAGATTTTTCGTATAAATAAAAACAGTAACTTATT
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GAAAAAAATAATTTAAATAGCAACTTAAATGATTAAAATTTTTATGATGATTTTGCTGAG
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GTTACAAATTAAAATTAAATAAAAAATGAGCAAACAGAAAGGAAACCAAATATGTTTGGT
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GAAAACGAAAATACTTAAAAGGAAAATGTGCTCTAATAAAAAAAAAATTAATCCAATTAA
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AATTCTACTGTTAAAAATTCTGACAACAATAATCAAAATCAAACTAATCCTTAAAATTAA
AACACTAATTTAAAAGAGAACAATGATAAATAAAATTTAAAAAAAACTAAAATATAATCA
GCAAGTGCAAATTAAGCTGGATAATCAAATAATTAATTACAAAAAACATTTTTTATCAAC
TCATAAGATGAATATGTCAGAAGGACACTTCTTAGAATGGGCTGGAAAGAAAATAAACTT
CTTTTAAATAATAATTTTGATTTAAAATGGATTTATATAGATTCAAATGATGACTACAAG
TTTTTAAATGATAACTAATTTTACAACCACTTTAAAAATAACACTGAGCTTACATAAAAG
GGAAGACTGCTCTACAACTTGAAAAATAACACACAATTTGGTGTAAATTAGGAATTATTT
TTTCCAAGGTGCTACGATCTTGGAAATGATCAGGAAAGAGGAGAATTTTCTAATGAATTT
AATAGAATGAATGTGATGAATCTGTTGAAAAAGCACATACAATATATAAAGCTAAGAAGA
AGTCAAACGTATTAGGAAATCAAGCAAGCTTATTAATAGAAGCAAGCCAATAAATTAAAT
GCTTAAGTAAAAGATGGGATATTCTTTGCAAAAGTAACGAAATAGAAGTTCTTTAGTCCT
TTAATGTACGAAGATACGAAGAGAGATAACAGATTTATTTTTAACATTACTGTGATAGCT
GAAGCTGTGGAGATACTCAAAAAATTAAAAAGATAGTAAGAGGAATATATAGATGAAACA
AGATAATCAAGAGATTGCTAATTATATATTTACTAAACAAATTTTAAATTGGAGTCTATG
ATTTCTCAGTATGTTAAAATTAATGTACCTTTCGATGAAGAAAAGTTTGTATTTGAAAAG
ATCGTGGGTATGTCAAAAGAACATTGGTCATCTCCATCTATGAAACTTATGAAAAAGCTT
TACTCATTGTATAAATATTTCAAAGATGCTGACCCATAATTTAAAGTTTCTGGAACAAAA
AATATTTGGATAATTAAACCATCTGCTAATTCAAGAGGATCTGGGATATATTTAGTAGAT
AAATTAGACGAAGCTATTGACAGTGGTTTAAAAATGTAGGCGAGAATAGTTTAAAAGTAT
ATTGAGAGGCCTTTAATATTTCAAGGAGCAAAATATAAGAAACTGAACAATAAAAAATTT
GACATCCGATAATGGGTCTTGGTAACAAGCTTTAAGCCTCTCAAAATTTATTTTTTTACA
AGCAGCTATTTAAGAGTGTGCAGCTAATCTTTTGATTTGGACAATATTAAGATTCTTTCT
AAGCACTTAACAAATTTCAGTTTAAATAAAAATAGTCTAGCCAAAGAAAACTGGGATGAG
ACTGTAGTTGAGCTAAAAGATTTCATTAGTTATTTGAAGGAGTTTAAAAATATAGATTAT
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GACAAAATTGTCAACAGAAAAAAAAGCTTTGAGTTATATGGCTTTGATATTTTGTTAGAC
GAGTATGCTCATCCTTGGTTGCTTGAAGTAAATTTAAGTCCAGCTTGTTCAGAAAGAAGC
TCGTTTTTGACTGAAATGCTTGATGCGATGGCATACAAGATGTTCTAAATTGTTTTTAAA
TAAAACAACTTATAAGAAGACTTAGAAATCAATAAAGAAACTGCAATTTCTACTGCACCT
GCTTCTTGCCAAAATCCAGATTATGATTGGGAAGAAATTTATAATGAAGAGTAAAAAGAA
TATTTTTGTGAAGAAGATAATAATATGCAATTAGCCTTTAATAATGATATCCAACTTATG
GTTATAGGGTAAAAAGCAGATTTAAAAAAGGAAAAAAATCTTGATAAAAAATACTTCTAA
TATTGGGGAGCGATTAAAATTCAATCAAAGATTAGATCATTTTTAGCCAAAAAGAAGCTA
TAAAGATTGAAAAATTAAAAGTTTACATTTGCAGCCATTAAAATTTAGTAAAAGATGAGA
CAATTTTTAGCTAAAAAGCAGTTAAATATTTTGAAAAAGCAATAATAAACAAATATAAAT
ATTCCAATAGAAGATTTTAACTAAGTTAGTGTTATTGAAGTATGA
>TTHERM_00770730(protein)
MILPFEYYFLNDADNSSKSNYNNIQFINENQNNNLRQKPKFYPNNQFLIEQEQDKYENKK
IKNYISDQIQLQPKNTPINKMNHFANINNYQDNKFSLESLNQAQQDNLQKEEDLSILSFD
SQEELNYLQEGEENNQFLNEGDIFGYQTRYTFFENRNNLLVEDATNKNNNNYNYNYNNNN
SSTQRNYDFNYQNTNEMLQKKKKSNFQNKSQSQLNNHKNEEKKPSQQRKEQLMKRFESLS
RIYNKELSQTVTNGWLKPSQAKTISQDNNLGSSAAKSSKVFYQQQKPFSAQITNSSLKYA
AASNGFQNLDFSYKQKQQLIQQETKNKIKEQQNVESNNRISMKPPKSANLNSYKNISNLK
NFKEIILTRPNSKQVKFQQQNSVNSQPSSLVSQPLKIQSIEKNNLNSNLNDQNFYDDFAE
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VTNQNQIKNEQTERKPNMFGKTLTTLARPFSKEYSNRKDILKSAQQNVRFNKNLDYLDSQ
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SPLIKQNSIDLNAAEIIQNDENENTQKENVLQQKKNQSNQIVTSQQQSNNYFKQETTTNT
SNFSTTSNRIISLQALRQKNNSTVKNSDNNNQNQTNPQNQNTNLKENNDKQNLKKTKIQS
ASANQAGQSNNQLQKTFFINSQDEYVRRTLLRMGWKENKLLLNNNFDLKWIYIDSNDDYK
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IPIEDFNQVSVIEV
>TTHERM_00770730(gene)
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AATTAAGCTTAGTAAGATAATCTTTAGAAAGAAGAAGATTTATCCATTCTTTCTTTTGAT
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AAGAAGAAAAGTAATTTTTAAAATAAAAGTCAAAGTTAATTAAATAATCATAAAAATGAA
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GCTAAAACAATAAGTTAGGATAACAATTTAGGGAGTTCTGCTGCTAAGAGTAGCAAGGTT
TTTTACTAATAATAGAAACCTTTTTCTGCTTAAATTACAAATTCATCTCTTAAATATGCA
GCTGCTTCTAATGGTTTTCAAAATTTAGATTTTTCGTATAAATAAAAACAGTAACTTATT
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AATTCTGTTAATTCTCAGCCTTCTTCTTTGGTTTCCTAACCTCTAAAAATTTAAAGTATA
GAAAAAAATAATTTAAATAGCAACTTAAATGATTAAAATTTTTATGATGATTTTGCTGAG
TTAGGCTCAACTGAAACTACTGGCTTTTCTTTTTAGAATGTTTTTTAGTTGGCAGGTGTT
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TTTTATTTTAATTGTTATAGAAAATGAGCAAACAGAAAGGAAACCAAATATGTTTGGTAA
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AATTCAATCAAAGATTAGATCATTTTTAGCCAAAAAGAAGCTATAAAGATTGAAAAATTA
AAAGTTTACATTTGCAGCCATTAAAATTTAGTAAAAGATGAGACAATTTTTAGCTAAAAA
GCAGTTAAATATTTTGAAAAAGCAATAATAAACAAATATAAATATTCCAATAGAAGATTT
TAACTAAGTTAGTGTTATTGAAGTATGA
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