Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00125600

Standard Name

TTLL3B (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt09322 | 9.m00343 | 3699.m00053

Description

Tubulin-tyrosine ligase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00125600

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_09103.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (1182
aa)
OxytrichaContig17998.0.g144.000646128913442e-117Tubulin-tyrosine ligase family
DictyBaseDDB_G02815413.998777993244535e-41DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
Stentor CoeruleusSteCoe_66331.2160992992528256e-37
WormBaseWBGene000441875.001425520048966e-32locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
SGDYBR094W0.0000000000019997478866288316PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00125600(coding)
ATGTTTAGCATCGATATTTAAGGCAAATCTATGAGCTTATGTGATCCTACATCGAAAATC
AAGTAGATGCAATAATAGTAACAGCAGTTATAATAGGGTACTAATAATGGAATTCAAAAA
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TATAATTCGCCTCTTAGTCATTAGTAGCATCATTAATTCAAAATCGGTCATTAAAATAAG
CTAGAATATCTTCGATAGCAACAAGCATAGAAGTATAACTAAATTTACTAGTTAGACCCT
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AATGGCAGTGCTTAAAACAGCATTCTTCTTTAATAATACTTAAGCAACAATAAGGGCTAA
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GAAAATATTGATGTGTATAAATTTTTCCCAAGATGTTTTGATCTTGGAGATCTTCAAGAA
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TTCAACTACGACGTTCTACCTTGTGTAAGTCCAGAAGAATGGGAAATAATTTCAAAAGAT
GAATTCTAATTAGATAATAAGAAAATAGAGTTTTACTTAGAAAGGCTGAGATCTCATCCA
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AAAAATTCTCATAGAATATCTGTTAATCATAATCATAACGATCCTATAGAAGAAGAAAGT
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CATTTAAACGGTTATAGAAATATTTGGATAGTTAAACCTAATTTCTTATCTAGAGGAAGA
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TGCTATATTAGATTATGCTCTGTTGAGCACAATATAGATGATTTGAATAATAGATTTGTT
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TTTTATGAAGAAATTTAACCTAAGCTTAAATAAATGGTCATTTAATCGTTAAAGAGCTGT
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ACATCAATCACTGAGGAACTAGTTCAGAGAGTCTTGCAAGATACTACAAAAGTAATAGTA
GATTACTCTATGGCTAAAAAAGGAACTAAAAAGAATGTTGATACAGGTGGATTTAAGCTC
ATATACAAAGGAGAGAAGTAAACAAAAAATAATAAAGTACTAGCTTCTTACAAAAAATGA


>TTHERM_00125600(protein)
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HQLLHSLVQQQPQPLSQQHSNQSSQSSNPQSQSPLPLSISSQQPVISMANYFNQPSQQSN
SLFNGQQPTMFNSSENFQQKNILYSCVGNPNNPYNHHINNPYLQEKRYYKSSKLPKIKKE
NKPQQAFSDIRPSSREKSARFHLAASINTILNQNGSTSVNTQNNENMVQTLKGHSYSAVT
EKSNIGQQEVNIPTTSKTQTLIKEHSLTNINSASKENNQVTLASNSNQTSKKAYENLMSA
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QFVVQKYIENPLLINNKKFDMRQWAIVQDFCPPRIWFFEECYIRLCSVEHNIDDLNNRFV
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DYSMAKKGTKKNVDTGGFKLIYKGEKQTKNNKVLASYKK


>TTHERM_00125600(gene)
ATGTTTAGCATCGATATTTAAGGCAAATCTATGAGCTTATGTGATCCTACATCGAAAATC
AAGTAGATGCAATAATAGTAACAGCAGTTATAATAGGGTACTAATAATGGAATTCAAAAA
GATTAGCAACTTCCTAATATGATTATAAATGGGAATTCCAATAGCTATTTAAATAATGGA
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ATTTAAGCTCATATACAAAGGAGAGAAGTAAACAAAAAATAATAAAGTACTAGCTTCTTA
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