Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00666600

Standard Name

TTLL3A (Tubulin Tyrosine Ligase-Like)

Aliases

PreTt23913 | 99.m00154

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF02189 ) Immunoreceptor tyrosine-based activation motif

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12.3%

TetraMine Data

TTHERM_00666600

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_16571.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (871 a
a)
OxytrichaContig15566.0.g284.0008598455422075e-100Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_74521.6889118802245324e-48
DictyBaseDDB_G02815418.999219783133462e-31DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
WormBaseWBGene000441876.0002282540086176e-27locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
SGDYBR094W0.000000000010004361180063202PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00666600(coding)
ATGTTCTAATAGAATTAGCAGTCATAAAATTAGTAAGCATAGAACTTAATGCATATTTAG
TTGAATGGTAATACCTAGCTTGGGTTAGGCGCCTTACAAACAATTAATGTCAAACCAATA
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GAAGATACAGCTAAAGTTATCCATCATCACTTTGTAGAAGGTGAAAAGAGATTTAACAAA
AATATTGAATATGGTCTATGGAAAAATATCTATAGAGAATAAAAATGA


>TTHERM_00666600(protein)
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ATRAKYKYKEKIDFTRSIIMRTLGYESRQIIQQLKENMALEEQEYEDLEDDADREYEELK
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VALKRRTFSIEKKISLISVNTLPIISPEEWSVLNRQDNNYLFLEQNPDVYHRLSQIITRE
MDSEESNAVDLSKLAQKYLEASKEYDPQYDLNEKNLWIVKPAGLSRGRGIRAFDQLEPLL
NYIMGKDVMWVAQKYMENPLTIHKKKFDIRQWVLVTEWNPLTIYFYDTCYIRICFDEYDP
SDLQNKFAHLANNCISKHADNFEEKVNDTMMYLEDFVEYIKKIEGKDMFYSKIQKEMMNI
AINSIKSCKDSIEPRRNSLELYGYDFMVDQNYNTWLLEINSSPSMEYSTPVTTKLVKMGL
EDTAKVIHHHFVEGEKRFNKNIEYGLWKNIYREQK


>TTHERM_00666600(gene)
ATGTTCTAATAGAATTAGCAGTCATAAAATTAGTAAGCATAGAACTTAATGCATATTTAG
TTGAATGGTAATACCTAGCTTGGGTTAGGCGCCTTACAAACAATTAATGTCAAACCAATA
AAGCTTCAAAGTCGCGCTCAATCATTAAACCCCAATTTAAGAATAAGTATTTGCAATTTA
TTTTTGAAAGCATTTGAATTTAATACTGTTTTTTCAACTATTTGAAATACTAGGTGAAAG
AAACAAATAGACAACTTAAACCAGCAGCAACAGACAAAATATTTCAAATAAATCTCCAAA
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AAGTTCAAGTGCACCTAAGAAAATATCTGGCAACTTTAGTTCAAGAGTAATTTACAGAGC
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GGCTTTCTAGAGGAAGAGGTATTAGAGCATTTGACTAGCTTGAACCTCTATTAAATTATA
TCATGGGCAAAGATGTTATGTGGGTAGCTCAAAAATACATGGAAAACCCTTTAACAATTC
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TTTATGATACATGCTATATTAGAATATGCTTTGATGAATATGATCCAAGTGATTTGTAGA
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TTAAATTTATAGAAGTGAAATTTTATGATGAAATAATTATTTTATAGAAAATAGAAGGAA
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