Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00348000

Standard Name

TTLL15B

Aliases

PreTt05212 | 36.m00176 | 3703.m00009

Description

Similar to tubulin polyglutamylase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF08814 ) XisH protein
  • ( PF04326 ) divergent AAA domain
  • ( PF00533 ) BRCA1 C Terminus (BRCT) domain
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00348000

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_09721.19.997093137033517e-262hypothetical protein (1612 aa)
Stentor CoeruleusSteCoe_20721.5628821893349888e-18
OxytrichaContig19772.0.0.g730.0000000000000700196834671948Tubulin-tyrosine ligase family
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y_confirmed UniProt:Q564U4
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DictyBaseDDB_G02815410.000006997203421143941DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00348000(coding)
ATGAAAAAAAAGACTTAAAAAAAAGTAGAATAAACAAAAAGCTTAGTAGACAGGTTGAGG
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>TTHERM_00348000(protein)
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GEQKFMGYLPKECLYKNQL


>TTHERM_00348000(gene)
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GGTCTATCACTGGAAAAGATTTAGTCATAGATAATTACAGACTTTACTAGTAAAAACCAT
TTATTAACAAGGATAAATGCTGGTAGCATGTTACATTTATGCCAGAGTCTTATCGTTTAT
ACAATTCAAACGAATGCAAGAGTTTTTTCAAATTTCTTTAATCAGATGAATACAAGGAAT
TAATCAAAAAAGATGGAATAGGATTTATAATGAAGTAGGGAAGAGATATTCATCGTGGTT
AAGGAATTAATTTAATTTCTCCTTAAATTTTGTAAGATTTGATGAAGAAATACAATAACG
GAAACAAGTGTGACTCTATTCATGAAGTTTATCAAGTTCAAAGGTAGATAAAACACAATA
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TGCATGATAACAAGAAGTTGGAAGTTCGTATTTACTTTTTTATTGCAAGTACTGATCCTT
TGATAATCTATGTTTAGAAATTAGCCCTTCTTAAAAAATGTGCCAGCGATTATAATAAAT
TCGATTATGATTTTTCTAGACATGTTTGCAATACCTCAATTAGTAAATAAATAACTGACT
CATTCGTAGTTGAATTTGCTCTAGAAGGTTTAGAAAAGTACTTACTAGAAAACAATAAAA
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CTTTAGACTTTTTGATAGATGAAGATTCAAAAGTATGGTTCTTAGAAAATAATCCTAATC
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AAGAAATGGCAGAAGAAATCCAAAATAACACTTTTGACTAAAAAGTCTATAAAATTAAAT
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GCAGCTATGTTAAAATATATGATGAATCTTTAGAAGGAGAATAAAAATTTATGGGGTATC
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