Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00348000
Standard Name
TTLL15B
Aliases
PreTt05212 | 36.m00176 | 3703.m00009
Description
TTLL15B tubulin tyrosine ligase family protein; Similar to tubulin polyglutamylase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( PF08814 ) XisH protein
( PF04326 ) divergent AAA domain
( PF00533 ) BRCA1 C Terminus (BRCT) domain
( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%
TetraMine Data
TTHERM_00348000
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_09721.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1612 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_2072 1.5628821893349888e-18
Oxytricha Contig19772.0.0.g73 0.0000000000000700196834671948 Tubulin-tyrosine ligase family
WormBase WBGene00044187 0.0000000010002658722841845 locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
DictyBase DDB_G0281541 0.000006997203421143941 DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:15890843 : Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00348000(coding)ATG AAA AAA AAG ACT TAA AAA AAA GTA GAA TAA ACA AAA AGC TTA GTA GAC AGG TTG AGG TCA ATT TAA CTA TGG CAA ATT ATA CTA GGT ATA ATT GTC ATA TTA TTG GCC AGA AAT TTT TAT TTA AAC AAC GAT TTG CAT CCA TAG CAG CAG AAT TCA AAT GAG TTT TCT TAA GAT GAT TAT TAT GTA GAA AAT ATG CAT GGG GAA GCA AAT TAT ATG CTT AAA GAT AAT CTC AAA AAA TTG GCA CAC CCT GAT GTT GGA AAA TAT AAA AAG AGA GTT TCT TAA CCT TTG GAT TAA TTT TGG TAA GGA AAG GAA AAA ATA GCA GAA AGA ATT GCT TCT CTC TTT AAC GAA TTT AAT TAT AAA TAA ATG GAT TTG CAA ATA CAT TTT GAA AAT AGC AGA AAC TAT GAT AGG CCC TCT TTA GGT ATA ATC AGT GAT CCT GAG TAT TGT AAA AAA AGT AAT ATG CAT CAT ATT TTG CAT CCT GAG TCA ATT TAA AAA AAC TAT TTG ATA TTT ACA GAT TTT GGA TAT AAT GAA TTG CCA AGA GAG GTT GCT TAG CAA TTT GGT GTT GAC TTA CTT CCT TAA GTT TCT TAG TAA ATG AGT GAT AGA AAA TAA TAA GAA AGA GTA TAT AAT CTA CCA GTC GAA ACT GCT TTG ATT CAC TCT AGA ATA TCT AGA ATA CAC CAT TTT TTT GAG TTT AAT AAG AAT ATT ATT TGC ACA TAT TAA TCA GCA AAT CAT ATT CCA GGT AAA TGG TCT ATC ACT GGA AAA GAT TTA GTC ATA GAT AAT TAC AGA CTT TAC TAG TAA AAA CCA TTT ATT AAC AAG GAT AAA TGC TGG TAG CAT GTT ACA TTT ATG CCA GAG TCT TAT CGT TTA TAC AAT TCA AAC GAA TGC AAG AGT TTT TTC AAA TTT CTT TAA TCA GAT GAA TAC AAG GAA TTA ATC AAA AAA GAT GGA ATA GGA TTT ATA ATG AAG TAG GGA AGA GAT ATT CAT CGT GGT TAA GGA ATT AAT TTA ATT TCT CCT TAA ATT TTG TAA GAT TTG ATG AAG AAA TAC AAT AAC GGA AAC AAG TGT GAC TCT ATT CAT GAA GTT TAT CAA GTT CAA AGG TAC GTT AAT AAT CCT ATA TTG CAT GAT AAC AAG AAG TTG GAA GTT CGT ATT TAC TTT TTT ATT GCA AGT ACT GAT CCT TTG ATA ATC TAT GTT TAG AAA TTA GCC CTT CTT AAA AAA TGT GCC AGC GAT TAT AAT AAA TTC GAT TAT GAT TTT TCT AGA CAT GTT TGC AAT ACC TCA ATT AGT AAA TAA ATA ACT GAC TCA TTC GTA GTT GAA TTT GCT CTA GAA GGT TTA GAA AAG TAC TTA CTA GAA AAC AAT AAA ATC ACT AAC CCT AAG TGG CTA GAA GAA GAA ATT TAT CCA TAA ATT TAC AGA GCA GTC ACA CAT TTG GTA AGA TCT GGA GCT CAT GAT TTT TTG ATT GAC TCT CGT GTG AAT GAA AAC TTT GCT TTA GAC TTT TTG ATA GAT GAA GAT TCA AAA GTA TGG TTC TTA GAA AAT AAT CCT AAT CCT CAA GTA CTA AGA AGC TCT GTA AAA AGA ACA ATG AGA CAT TAT GTA ATG TTT GGT GAC TTA TTT TAA ATC CAA TTC GCA TAC CTT CGT AGT CGT GCT TAA AGA TTA AAT TAG CTT GCC AAA GAA ATG GCA GAA GAA ATC CAA AAT AAC ACT TTT GAC TAA AAA GTC TAT AAA ATT AAA TTC GAA AAA GCA AAT AAA AAC TTT TTA GAG CCC GAG TTT GAA TAG CAA ATA AGA AAA GAT AGC AGC TAT GTT AAA ATA TAT GAT GAA TCT TTA GAA GGA GAA TAA AAA TTT ATG GGG TAT CTT CCC AAA GAA TGT TTG TAT AAA AAT CAA TTA TGA >TTHERM_00348000(protein)M K K K T Q K K V E Q T K S L V D R L R S I Q L W Q I I L G I I V I L L A R N F Y L N N D L H P Q Q Q N S N E F S Q D D Y Y V E N M H G E A N Y M L K D N L K K L A H P D V G K Y K K R V S Q P L D Q F W Q G K E K I A E R I A S L F N E F N Y K Q M D L Q I H F E N S R N Y D R P S L G I I S D P E Y C K K S N M H H I L H P E S I Q K N Y L I F T D F G Y N E L P R E V A Q Q F G V D L L P Q V S Q Q M S D R K Q Q E R V Y N L P V E T A L I H S R I S R I H H F F E F N K N I I C T Y Q S A N H I P G K W S I T G K D L V I D N Y R L Y Q Q K P F I N K D K C W Q H V T F M P E S Y R L Y N S N E C K S F F K F L Q S D E Y K E L I K K D G I G F I M K Q G R D I H R G Q G I N L I S P Q I L Q D L M K K Y N N G N K C D S I H E V Y Q V Q R Y V N N P I L H D N K K L E V R I Y F F I A S T D P L I I Y V Q K L A L L K K C A S D Y N K F D Y D F S R H V C N T S I S K Q I T D S F V V E F A L E G L E K Y L L E N N K I T N P K W L E E E I Y P Q I Y R A V T H L V R S G A H D F L I D S R V N E N F A L D F L I D E D S K V W F L E N N P N P Q V L R S S V K R T M R H Y V M F G D L F Q I Q F A Y L R S R A Q R L N Q L A K E M A E E I Q N N T F D Q K V Y K I K F E K A N K N F L E P E F E Q Q I R K D S S Y V K I Y D E S L E G E Q K F M G Y L P K E C L Y K N Q L >TTHERM_00348000(gene)ATG AAA AAA AAG ACT TAA AAA AAA GTA GAA TAA ACA AAA AGC TTA GTA GAC AGG TTG AGG TCA ATT TAA CTA TGG CAA ATT ATA CTA GGT ATA ATT GTC ATA TTA TTG GCC AGA AAT TTT TAT TTA AAC AAC GAT TTG CAT CCA TAG CAG CAG AAT TCA AAT GAG TTT TCT TAA GAT GAT TAT TAT GTA GAA AAT ATG CAT GGG GAA GCA AAT TAT ATG CTT AAA GAT AAT CTC AAA AAA TTG GCA CAC CCT GAT GTT GGA AAA TAT AAA AAG AGA GTT TCT TAA CCT TTG GAT TAA TTT TGG TAA GGA AAG GAA AAA ATA GCA GAA AGA ATT GCT TCT CTC TTT AAC GAA TTT AAT TAT AAA TAA ATG GAT TTG CAA ATA CAT TTT GAA AAT AGC AGA AAC TAT GAT AGG CCC TCT TTA GGT ATA ATC AGT GAT CCT GAG TAT TGT AAA AAA AGT AAT ATG CAT CAT ATT TTG CAT CCT GAG TCA ATT TAA AAA AAC TAT TTG ATA TTT ACA GGT AAA TAA ATA AAC ATT AAA ATG TTT CTT TTT CCT CTT TTG AAG ATA TTT CTG ATA TGT TTT AAA AAG TTA TTT TGA TGA TTT TAA TGC CCC TAA ATA TAA CCA AAA AAT ATC TTA ATC AAA ATA TAT TAA TAA ATT AAT TAA AAG TTA ATA ATA AAA TTA ATA TCT GAT GTA TCT TTG CAA ATT TTA TCA TTT AAA ATA TCA TGT TTA GGT TAT TAA TTA AAT CAA TAA TTT AAA AAG ATT TTG GAT ATA ATG AAT TGC CAA GAG AGG TTG CTT AGC AAT TTG GTG TTG ACT TAC TTC CTT AAG TTT CTT AGT AAA TGA GTG ATA GAA AAT AAT AAG AAA GAG TAT ATA ATC TAC CAG TCG AAA CTG CTT TGA TTC ACT CTA GAA TAT CTA GAA TAC ACC ATT TTT TTG AGT TTA ATA AGA ATA TTA TTT GCA CAT ATT AAT CAG CAA ATC ATA TTC CAG GTA AAT GGT CTA TCA CTG GAA AAG ATT TAG TCA TAG ATA ATT ACA GAC TTT ACT AGT AAA AAC CAT TTA TTA ACA AGG ATA AAT GCT GGT AGC ATG TTA CAT TTA TGC CAG AGT CTT ATC GTT TAT ACA ATT CAA ACG AAT GCA AGA GTT TTT TCA AAT TTC TTT AAT CAG ATG AAT ACA AGG AAT TAA TCA AAA AAG ATG GAA TAG GAT TTA TAA TGA AGT AGG GAA GAG ATA TTC ATC GTG GTT AAG GAA TTA ATT TAA TTT CTC CTT AAA TTT TGT AAG ATT TGA TGA AGA AAT ACA ATA ACG GAA ACA AGT GTG ACT CTA TTC ATG AAG TTT ATC AAG TTC AAA GGT AGA TAA AAC ACA ATA TAA TTT TTT TTA AAT TTA AAA ATA TTT TTA AAT GCA ACA GGT ACG TTA ATA ATC CTA TAT TGC ATG ATA ACA AGA AGT TGG AAG TTC GTA TTT ACT TTT TTA TTG CAA GTA CTG ATC CTT TGA TAA TCT ATG TTT AGA AAT TAG CCC TTC TTA AAA AAT GTG CCA GCG ATT ATA ATA AAT TCG ATT ATG ATT TTT CTA GAC ATG TTT GCA ATA CCT CAA TTA GTA AAT AAA TAA CTG ACT CAT TCG TAG TTG AAT TTG CTC TAG AAG GTT TAG AAA AGT ACT TAC TAG AAA ACA ATA AAA TCA CTA ACC CTA AGT GGC TAG AAG AAG AAA TTT ATC CAT AAA TTT ACA GAG CAG TCA CAC ATT TGG TAA GAT CTG GAG CTC ATG ATT TTT TGA TTG ACT CTC GTG TGA ATG AAA ACT TTG CTT TAG ACT TTT TGA TAG ATG AAG ATT CAA AAG TAT GGT TCT TAG AAA ATA ATC CTA ATC CTC AAG TAC TAA GAA GCT CTG TAA AAA GAA CAA TGA GAC ATT ATG TAA TGT TTG GTG ACT TAT TTT AAA TCC AAT TCG CAT ACC TTC GTA GTC GTG CTT AAA GAT TAA ATT AGC TTG CCA AAG AAA TGG CAG AAG AAA TCC AAA ATA ACA CTT TTG ACT AAA AAG TCT ATA AAA TTA AAT TCG AAA AAG CAA ATA AAA ACT TTT TAG AGC CCG AGT TTG AAT AGC AAA TAA GAA AAG ATA GCA GCT ATG TTA AAA TAT ATG ATG AAT CTT TAG AAG GAG AAT AAA AAT TTA TGG GGT ATC TTC CCA AAG AAT GTT TGT ATA AAA ATC AAT TAT GA