Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00149550

Standard Name

TTLL14Q (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt20714 | 12.m00388 | 3700.m00110

Description

imilar to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF02732 ) ERCC4 domain
  • ( PF00633 ) Helix-hairpin-helix motif
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF08272 ) Topoisomerase I zinc-ribbon-like
  • ( PF03413 ) Peptidase propeptide and YPEB domain

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00149550

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_05017.19.997093137033517e-262hypothetical protein (575 aa)
OxytrichaContig22013.0.g142.0006398763136557e-76Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_234731.7587922024243116e-25
WormBaseWBGene000441874.0006511639687014e-23locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
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position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.000000000004997916451710233PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00149550(coding)
ATGAACATCCAACAAATAGGTTTAAGAAATAAAAATGTTTAAAAGTAAAACAAAAACTAG
GAGAACAAGCTAGATATTTTGATTCAAGGAAACAATAATTTTACATTAGATAGACTAAAT
GTTCCTAGAGGATATACTTCAAATAGATTCTCCTCTTAAATTCCAGATATGTCACCCAAA
AATTAGATGCATCAAATATAGACTATAGATGAAACAAGCACTTTTGTAGGTTTTGCCTCT
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AATAAAAATAGCTTAATTGGAAGTAATAGAAGCGGTTATCTTAAAAATCCGCACTCAGCA
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TAAAACAAAATAGATTAATTGAATTCACAGATAATGATGAAGAGTGATGATCCAACTTTT
TTCTACCCATAATCTAACTATGGAGGTACTATGTAATTCAAAGGATATTAAAAAGATGAC
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TTAGTTGATTTAAAGGGATTATAAAGCTAGCAATTATTCTAAGGAGTAACGAATAATGTG
GTAGGGAGTAATTTGACTTCAGGAAATCAAAACTAATTTCAAGCTTATCGCTATTATGTT
GGATATGGTAATAATGCAGAACTTGTTAAGAGAATTTTAAAATCTAGAGAGTGGTGGTGT
GAGTTTAACAGTGAAACTTAATAAGGGAGCTATAACTTCAGATGGACATAAGGGATTTAA
GGAATAAAGTATGAGAAATTGAATTCAAACGGACCTAAGTAATGTGTAAATCACTTTGAA
GAGCACAGAGAAATAAGTTAAAAAGATAATTTAGTAAAGAACCTAAAATTATTTTGTGAA
ACGAATAAAATTTCTCTTTTTAGCTTAACTCCTTGCACATTTTTGATTGATCTCAATGAT
GATTCTTGCGAATTACAGATAACTAAATTTGCTAATTTCTTTTGTAAACATCATCCTAAA
TCAGAGTTTTTTGAAAATAGTAAAAAAATGGTTGCAGAATTCAAAAAAAATATCAGACAA
ATTTTTTAATCAGTAAATGCTAACTATAAAAAGATTAAATCAAATAGCTACTCCAAACCT
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CAGATTAAAATTTATTCAGATGGTACTCTCGATAGAAATTTAATGTTAGCAGAGGAGTAT
TAACAAATCTCTACAAATGATTAAAATAAGTAACTCTAATCACCAAGTGAAAATGAAAAA
GAAGGAAATAATTAAAATCAATAATACTAAGAATCTTCAGGCTAAATGCTTTTATCTGGC
TCAACTTAATAATCAAATCAAACTGGACTTACGTGCAGTGTAGAGCAAATTGGTTGTAGC
CTTAAAGACTCAAATTAGTAAAAGGATGTACTAACTTCTAAAAATAAAGAAAAAGATCAG
AAGCAAGTGAAAAGCTGGTAAATTTTAAAGAGCTAAACATTTGTTATTTAAAAGTACATT
GAGAAACCTATGCTTATAAAAGGAAGAAAATTTGATATGAGAATGTTTGTATTAGTAACT
CATACAATGGATAGTTACTTTTACAAGTGTGGATATATCCGTACAGCGAGTGAGATATAT
AGAATGGATGATTTAGATAACTAATTTATTCACCTTACTAATAATGCTGTATAAAAATAT
GCTAAAAATTATGGAGAGTTTGAAGATGGAAATATTCTGTCACTAGAATAGTTTGATCAG
TTTATAAAGTAAGCAGGTAATAAATACGAAGGCTTAGATCTTTTTGGTAAAATAGTTCCT
ACAATAAGAGAAATTTGCTTAATAACTCTAGCAAGTGCTAAAAAAAAATTAAACTCACAA
GATAGAAAGTATTGCTTTGAGATGTTTGGATTTGATTTTTTTATTGATGAGGACTACAAG
GTGTGGCTGATTGAAGTTAATACAAACCCTTGTATAGAAGAATCTAATTAATATTTGCAT
TAATTAATGCCACGTTTGCTGGATGATACATTCAAATTAACTATAGACTAAATATTTCCT
CGCCCAGGAGGATCAGGCAATAACTAGCAATAACAAAAATAATAGTAAAATTAAATGTAA
TCCTCTTAAATGATAAATGGAAACAGTAAATTAAATAAGAGAAATTCATCACTTATTTCT
TAATAGGTCCCAAATAATCATTAATCAAGTGATCGTAATCTGTAAGAATTGCAGTCAGTA
AAAATTACAAGTAATATATAACAAAAAAAAGAAAATATATTATAATTTCATTAATAATCC
CCTTCTAAATATGAAAACGAGGATAATTCACAGTAAAAGAATTTCTAAACTCCTCTAGAA
AATATAAATCTAAATTAAAATGAGAACAAAGAAAATACTAGAGACCAAGACAATAATAGT
AATGTTGGATCAGATTTACAGAAACAAAGTAGAAAAAGAGAGAAATTTCAAATATAAGGA
CACAATGACGATGAAAATCTATGGCAATTTATGGCAAATTTAAATAAATTTAATTACTCT
ACTTATAGTTATTAAACTCTTAGTAGCATTGCTCCTAATCAGTACCACCCACTCAAAGAA
TTATATACAAACTCTAGTAAATTAGCAAACTAAAAAAATAGTAAAAAGAAAGAATGA


>TTHERM_00149550(protein)
MNIQQIGLRNKNVQKQNKNQENKLDILIQGNNNFTLDRLNVPRGYTSNRFSSQIPDMSPK
NQMHQIQTIDETSTFVGFASSSNPRIVNRQISKGNNQLINNMTTQHKNQNSAEKNISAVS
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>TTHERM_00149550(gene)
ATGAACATCCAACAAATAGGTTTAAGAAATAAAAATGTTTAAAAGTAAAACAAAAACTAG
GAGAACAAGCTAGATATTTTGATTCAAGGAAACAATAATTTTACATTAGATAGACTAAAT
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AAAAAAGAAAATATATTATAATTTCATTAATAATCCCCTTCTAAATATGAAAACGAGGAT
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AACAAAGAAAATACTAGAGACCAAGACAATAATAGTAATGTTGGATCAGATTTACAGAAA
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CAATTTATGGCAAATTTAAATAAATTTAATTACTCTACTTATAGTTATTAAACTCTTAGT
AGCATTGCTCCTAATCAGTACCACCCACTCAAAGAATTATATACAAACTCTAGTAAATTA
GCAAACTAAAAAAATAGTAAAAAGAAAGAATGA