Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00170310

Standard Name

TTLL14J (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt29742 | 14.m00309

Description

Similar to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00904 ) Involucrin repeat
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%

TetraMine Data

TTHERM_00170310

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_08845.13.999284652801983e-113tubulin-tyrosine ligase (1240
aa)
OxytrichaContig18630.0.g114.001540793770557e-102Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_73012.2856936767186716e-49
WormBaseWBGene000441871.9994498063102785e-22locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
DictyBaseDDB_G02815418.000721090200152e-18DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.000000004999139696582238PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00170310(coding)
ATGCAGTAAAATAATGCAAATAACATTGTGGAATATATTCGTTCTAAGAAGATTTAAAAA
GAAGAAAAGAATTTTAAATTTTTAATATTTAATGGAAATGGTTCCCATTTTATAAGAAGT
GATTTGTTAAAGAGATAAAACTGGGATGAAGTAATAAATTTAAGACATTTGATACTTATT
ATATTTATCATAAATATTATAATTCAGATTAAATCAACGCAAGATGAAAAAAGGTCAATT
AAGAACTCAGATTTTATTTGGAGTTCATAGAACTTTCATTATAAGATATTCTCCATTATA
GAAGATTTGGAGCTAGAACAATAGTAGAGATTATTAGTTAATCACTTCGAAAACACCAAA
TTTATGTGCACCAAAAATGGCTTAATCAAGTCATTAAGAAATTACTATTAGCATAATTTG
TAATCTAGCTAAGTAGGGTATTCTGTTTTCCATACAACTCCAACTACATTTATAGTCAAA
TAAGGTTTTGAAGACATCGAATTCTAAAAATTCTTAGCAAAATACAAAGCATTTGAAAAT
GGAAAATTTGAAACAGAGTTGATTCCTATGAAGCACTGCATTCAAAATTTATGGTTGATA
AAGCCAGGAAATTAGAATCAAGGAAGAGGAATAGTGATTTATAAAAATTAGAATGATATA
ATAAATTTCTTTTAAAATAAGCTGAATTAATAGCAATGGATAATTTAGAAGTACATCGAA
AAGCCTCTGTTATACAAAAATAGGAAATTTGATATAAGAATGTGGGCTTTGATCACATGT
AAAAATGAAATCTTTTTTTATCATGATGGTTATATGAGAACTAGCAGCCATGATTATAAT
CTAGATAATTGTTCTTCAAATATTCATTTAACTAATAATTTTTAATAAAAATATTTTTAA
AATTATGGTTTATATGAACCTGGAAATACCTTGCCTATTGATCGATTGTTTGAATATATT
TCTTTCAATAATAAAGACAAAGCAAGTTAGATTAAAAGTCTCCTTATATCTAGGATGAAG
GATTTAGTCATTGATTCCTTTTTAGCAGCTAGAAAAAATATGGTACAACAAAAAAAATAC
CTTAATTATGAATTGTTTGGATATGATTTCCTAATAGACGAAGACTTGAGAGTTTGGCTT
TTAGAAATTAATTCAAATCCTTACCTAGGAACTCCTAATGATGAAATGAAAAATTTAATT
CCTAAAATGATAGAAGAAATGCTTGATATTATGCTTAAAAACAAACCCAGAAAAAATAAC
AAATTTGAGCTAATTTATAGTGAATCTATGTAGGGTGGCTGGAGTTAATTTTTAGTTAGT
GTGAACCAAAGATAATCATTTAACACATCTCTATATCCAGAATAGCAATTACAATAGTTA
TAGTTTATCAGAAATGAAAATACTCCAACTCTTTGCAAAACTATTCGATAAGAGTTTTAT
GGAGCAACATAGACTAATTTTATTACAAATTTAATGGGGAAAAAAGATGATGAACAGATA
GCCAAACAGCTTTATTAACATCTTTATTTATAGATTTAAAATTATCCTTTTAAAGACTAT
GATCCATTTAGAAATTCATTCACAACTATTTTAACGAAAATAAAGATTTGGAAAGAGTTA
GAATAAAAAGAACTAAAATGGTATATTAAGGGGTTTAAGCTAATATTGGAATCAAACATA
AAACTCATTCTGCTTGAAAAAGAATATTCAGATAAAGTTTATTCAATTATTTTATAGGAA
GACTTACCAGAATAAATTTAAAGCATTTTGATTGAAGCAAGTTATGAAATATCTAATTAA
ATTTTAAATAAAAACATTTCCATCAAAGAAAATATGAATCCAGAAGAGTTATAGCATGAT
AAATAAATTGAAATTTTGACAAAATCTTTACTGGTGATAGGTGGATAATTTGATAGGAAA
AAATACATCCCTGGCGAAACGTAGAACAGTGAAAAATCTCGAAAGCAGCTCATATAAAAT
GGAGGATTAATAGTTATTTATTTTTTATAGCAAAATGAAGACCTTTCTTTCGAAAATATA
AACTCTTCTATAAAATAGTTTTTAGATTCTTTAGATTACTAAGATTTTTTTTATCAGAAC
TAACTTTTCAAGGAATGGATTGAGCAAGTTAATTCAATCAAACCCAAAAAATACTAATTT
TTTAATGGATTTAGCTAAAATTTAAATAATGAAGAAATAAAAGATCATAATTTCATTAAT
AATAATTCAGAATTCAACAAAAAAAACCACAAAACAAACAAGACTCGAATTGCTAATATT
TTAATTCATGCTAATTATGAAAATAAAATAGAGAACAATTAGGAGTAGCTTTAAAATAGA
AATGAAATTGACGAAAACCAAAAAATAAAATTAAAAAACGAAAACTTGTTTGTTGAGAGA
TCAAAGTCAAATGAAAATTTAAGTTAAAATACTCAAATTCCTTTTCCTAAATTTTTAGAT
AGCTTTTTTAATAAGACTTATAATTAAAATGAATTTGCTAATTATTTAGAATAACAATTA
TAAATTCTGTCTCCTAAATTTAAGTAGCAGTTTTATAAAATAAAATTTATGAGCCAACAG
AAGATAGATTAAAGAGACAAATAATTATCTGCAGTTTAGATCCCTAACCATAAAAAGTTT
AAATTTAACAAAAGTGCATCTCCAAGCAGACAATCTGATAGAAAAGAACTAATGAACAAA
TCTATAAATTAAATATCGAAAATAGAAAATTAAAAATTTCAACAAAATGTAAATTTATTA
ACGATTTGCAAATCAGAGTTAGAATTACAAAAAAATACTTAATAAAATTCAATCAATATT
GAAAATACAAAGTTAGAAATAATAAAAAATTAAGTGAAAAGCTTAGAGCAAATCAGAAGT
GAATCTCCTTTTGTGAGAAGACACTAAAATTAAATATAAAAATGTAGACATTACAATTTA
GATAAAGAAGATTAAAAATTGAGCTTTTAAACTGCCTAATAAAACAAATAGCCTATAAAG
TATACACTTATGAATAATAAGTAGTTGAGTCCTAACTCAGCAATATAAAAAAACTCAGAT
TTTAAATAAAAAAGTTGTGAGCAAAATTAGTTTTTCCTACCTCAAAATTTTTAGATTTAA
CAATAAAATTTGAAAAAAAAATAAAAAGAATTGAGTCCTTCTAGAGAGTTTAGAAAGAAA
TAATCAGTAACAATAAATTCAGTAAATAACCAACAAGCTGTTTTTTCTGGTTTTTAAAAA
ATAAGGTCTTCTCCTAAATTAAACGAGTTAAGGAATAGAAAAATAGAAAATTAAGCTAAT
AAATATAATTATGATATAGAAAAAGATACTAAAAATGAAAGTTTACAAGAAAAGAGAGAA
TTTATTTAAGTTGAAGATATTCTCGCTCAACAAAATTTTTAAATACTTAATTAGTAAGTA
AATAATTTAGAATAGGAATAAATAGAAAGTAATACAAATTAGTAGAACAAGCTAGAATTA
AATTAAATTGACACTACTATGACCTAATAAAAATAAGAAATTGATATAAATAAATCAATA
AATTATTCAGATAAAGATTTTCTAAATTTTGATACTGAAGTAGATCTAAGTAACTAGAAG
TAGTAACAAAATCTAAATGACAATCAATGTGAAATTATAAATAAAAATTTTAAAAGTATT
AATTAATCAAATGTTGATTAAAATATTATTGAATAGCATGCCTGA


>TTHERM_00170310(protein)
MQQNNANNIVEYIRSKKIQKEEKNFKFLIFNGNGSHFIRSDLLKRQNWDEVINLRHLILI
IFIINIIIQIKSTQDEKRSIKNSDFIWSSQNFHYKIFSIIEDLELEQQQRLLVNHFENTK
FMCTKNGLIKSLRNYYQHNLQSSQVGYSVFHTTPTTFIVKQGFEDIEFQKFLAKYKAFEN
GKFETELIPMKHCIQNLWLIKPGNQNQGRGIVIYKNQNDIINFFQNKLNQQQWIIQKYIE
KPLLYKNRKFDIRMWALITCKNEIFFYHDGYMRTSSHDYNLDNCSSNIHLTNNFQQKYFQ
NYGLYEPGNTLPIDRLFEYISFNNKDKASQIKSLLISRMKDLVIDSFLAARKNMVQQKKY
LNYELFGYDFLIDEDLRVWLLEINSNPYLGTPNDEMKNLIPKMIEEMLDIMLKNKPRKNN
KFELIYSESMQGGWSQFLVSVNQRQSFNTSLYPEQQLQQLQFIRNENTPTLCKTIRQEFY
GATQTNFITNLMGKKDDEQIAKQLYQHLYLQIQNYPFKDYDPFRNSFTTILTKIKIWKEL
EQKELKWYIKGFKLILESNIKLILLEKEYSDKVYSIILQEDLPEQIQSILIEASYEISNQ
ILNKNISIKENMNPEELQHDKQIEILTKSLLVIGGQFDRKKYIPGETQNSEKSRKQLIQN
GGLIVIYFLQQNEDLSFENINSSIKQFLDSLDYQDFFYQNQLFKEWIEQVNSIKPKKYQF
FNGFSQNLNNEEIKDHNFINNNSEFNKKNHKTNKTRIANILIHANYENKIENNQEQLQNR
NEIDENQKIKLKNENLFVERSKSNENLSQNTQIPFPKFLDSFFNKTYNQNEFANYLEQQL
QILSPKFKQQFYKIKFMSQQKIDQRDKQLSAVQIPNHKKFKFNKSASPSRQSDRKELMNK
SINQISKIENQKFQQNVNLLTICKSELELQKNTQQNSINIENTKLEIIKNQVKSLEQIRS
ESPFVRRHQNQIQKCRHYNLDKEDQKLSFQTAQQNKQPIKYTLMNNKQLSPNSAIQKNSD
FKQKSCEQNQFFLPQNFQIQQQNLKKKQKELSPSREFRKKQSVTINSVNNQQAVFSGFQK
IRSSPKLNELRNRKIENQANKYNYDIEKDTKNESLQEKREFIQVEDILAQQNFQILNQQV
NNLEQEQIESNTNQQNKLELNQIDTTMTQQKQEIDINKSINYSDKDFLNFDTEVDLSNQK
QQQNLNDNQCEIINKNFKSINQSNVDQNIIEQHA


>TTHERM_00170310(gene)
ATGCAGTAAAATAATGCAAATAACATTGTGGAATATATTCGTTCTAAGAAGATTTAAAAA
GAAGAAAAGAATTTTAAATTTTTAATATTTAATGGAAATGGTTCCCATTTTATAAGAAGT
GATTTGTTAAAGAGATAAAACTGGGATGAAGTAATAAATTTAAGACATTTGATACTTATT
ATATTTATCATAAATATTATAATTCAGATTAAATCAACGCAAGATGAAAAAAGGTCAATT
AAGAACTCAGATTTTATTTGGAGTTCATAGAACTTTCATTATAAGGTTAATATTCTAAAT
ATTTCTGAATAAAATGTAAAAATAAATCCAATTTATATTTTAGATATTCTCCATTATAGA
AGATTTGGAGCTAGAACAATAGTAGAGATTAGTAAATGAATTAATTAACCATTTAATAAA
AACAAAATATTTAATAACCATATTTTATTTCTTTATCAGTTAGTTAATCACTTCGAAAAC
ACCAAATTTATGTGCACCAAAAATGGCTTAATCAAGTCATTAAGAAATTACTATTAGCAT
AATTTGTAATCTAGTAAATATTTAGTTAATTTAACTTTAAAACTATATTCAAAACTTTAT
TTATCTGAAATTTAATTAGGCTAAGTAGGGTATTCTGTTTTCCATACAACTCCAACTACA
TTTATAGTCAAATAAGGTTTTGAAGACATCGAATTCTAAAAATTCTTAGCAAAATACAAA
GCATTTGAAAATGGAAAATTTGAAACAGAGTTGATTCCTATGAAGCACTGCATTCAAAAT
TTATGGTTGATAAAGCCAGGAAATTAGAATCAAGGAAGAGGAATAGTGATTTATAAAAAT
TAGAATGATATAATAAATTTCTTTTAAAATAAGCTGAATTAATAGCAATGGATAATTTAG
AAGTACATCGAAAAGCCTCTGTTATACAAAAATAGGAAATTTGATATAAGAATGTGGGCT
TTGATCACATGTAAAAATGAAATCTTTTTTTATCATGATGGTTATATGAGAACTAGCAGC
CATGATTATAATCTAGATAATTGTTCTTCAAATATTCATTTAACTAATAATTTTTAATAA
AAATATTTTTAAAATTATGGTTTATATGAACCTGGAAATACCTTGCCTATTGATCGATTG
TTTGAATATATTTCTTTCAATAATAAAGACAAAGCAAGTTAGATTAAAAGTCTCCTTATA
TCTAGGATGAAGGATTTAGTCATTGATTCCTTTTTAGCAGCTAGAAAAAATATGGTACAA
CAAAAAAAATACCTTAATTATGAATTGTTTGGATATGATTTCCTAATAGACGAAGACTTG
AGAGTTTGGCTTTTAGAAATTAATTCAAATCCTTACCTAGGTAAGCAAAATTAATTTATA
GTATTTTACATATCTAATCAAATTTCTATTTTATAATTTTAAGGAACTCCTAATGATGAA
ATGAAAAATTTAATTCCTAAAATGATAGAAGAAATGCTTGATATTATGCTTAAAAACAAA
CCCAGAAAAAGTAAAAAATCATTCATTTCTTTTTAAATATTTTATATTTAATTAATTATT
TTTTTTTTAAAACTTTGATTAAAAAAATGTTAGATTTTATGATAAATTTTAATGAGGTAA
TTAATGATTTTTAAATTTATTAAGATTTTTAATAAATTCTTTCTTATCTATCAATATGAT
TTTGGGTTAATTCTAAAATTGACTCTAATCCCCCATGATTGATAATAATTTTTATAAATT
CTTTAAAATATAATTTCAATTTATTTGTTGATATTTTTTTTAATTATTTATTATAAATAA
ATTATTAATTAATTAATTTAATAGATAACAAATTTGAGCTAATTTATAGTGAATCTATGT
AGGGTGGCTGGAGTTAATTTTTAGTTAGTGTGAACCAAAGATAATCATTTAACACATCTC
TATATCCAGAATAGCAATTACAATAGTTATAGTTTATCAGAAATGAAAATACTCCAACTC
TTTGCAAAACTATTCGATAAGAGTTTTATGGAGCAACATAGACTAATTTTATTACAAATT
TAATGGGGAAAAAAGATGATGAACAGATAGCCAAACAGCTTTATTAACATCTTTATTTAT
AGATTTAAAATTATCCTTTTAAAGACTATGATCCATTTAGAAATTCATTCACAACTATTT
TAACGAAAATAAAGATTTGGAAAGAGTTAGAATAAAAAGAACTAAAATGGTATATTAAGG
GGTTTAAGCTAATATTGGAATCAAACATAAAACTCATTCTGCTTGAAAAAGAATATTCAG
ATAAAGTTTATTCAATTATTTTATAGGAAGACTTACCAGAATAAATTTAAAGCATTTTGA
TTGAAGCAAGTTATGAAATATGTAAAATCATACTGAATAAACGAAAATAAATGCCTGACT
AATATGTTAACACATTATGCAGTTTATTATTCTAAAAAGCTAATTAAATTTTAAATAAAA
ACATTTCCATCAAAGAAAATATGAATCCAGAAGAGTTATAGCATGATAAATAAATTGAAA
TTTTGACAAAATCTTTACTGGTGATAGGTGGATAATTTGATAGGAAAAAATACATCCCTG
GCGAAACGTAGAACAGTGAAAAATCTCGAAAGCAGCTCATATAAAATGGAGGATTAATAG
TTATTTATTTTTTATAGCAAAATGAAGACCTTTCTTTCGAAAATATAAACTCTTCTATAA
AATAGTTTTTAGATTCTTTAGATTACTAAGATTTTTTTTATCAGAACTAACTTTTCAAGG
AATGGATTGAGCAAGTTAATTCAATCAAACCCAAAAAATACTAATTTTTTAATGGATTTA
GCTAAAATTTAAATAATGAAGAAATAAAAGATCATAATTTCATTAATAATAATTCAGAAT
TCAACAAAAAAAACCACAAAACAAACAAGACTCGAATTGCTAATATTTTAATTCATGCTA
ATTATGAAAATAAAATAGAGAAGTACTTTTTTAAATTAGAAAATTTAATTTTGGGAATTT
AATATAAATTTTTATAGCAATTAGGAGTAGCTTTAAAATAGAAATGAAATTGACGAAAAC
CAAAAAATAAAATTAAAAAACGAAGTAAAAAATAATTTTTCATATAAATTTATAAATTAA
ATGTTTTTAAATTAGAACTTGTTTGTTGAGAGATCAAAGTCAAATGAAAATTTAAGTTAA
AATACTCAAATTCCTTTTCCTAAGTAATTTTGAAATTAATAAATGAAAATTTCAAAAATC
CTTTTCTAAATATAGATTTTTAGATAGCTTTTTTAATAAGACTTATAATTAAAATGAATT
TGCTAATTATTTAGAATAACAATTATAAATTCTGTCTCCTAAATTTAAGTAGCAGTTTTA
TAAAATAAAATTTATGAGCCAACAGAAGATAGATTAAAGAGACAAATAATTATCTGCAGT
TTAGATCCCTAACCATAAAAAGTTTAAATTTAACAAAAGTGCATCTCCAAGCAGACAATC
TGATAGAAAAGAACTAATGAACAAATCTATAAATTAAATATCGAAAATAGAAAATTAAAA
ATTTCAACAAAATGTAAATTTATTAACGATTTGCAAATCAGAGTTAGAATTACAAAAAAA
TACTTAATAAAATTCAATCAATGTAAGTTAATTTTTATAATTTAATTTATAATGTGTTAA
AATAGATTTAAAATTTTTAATTTAACTCAGATTGAAAATACAAAGTTAGAAATAATAAAA
AATTAAGTGAAAAGCTTAGAGCAAATCAGAAGTGAATCTCCTTTTGTGAGAAGACACTAA
AATTAAATATAAAAATGTAGACATTACAATTTAGATAAAGAAGATTAAAAATTGAGCTTT
TAAACTGCCTAATAAAACAAATAGCCTATAAAGTATACACTTATGAATAATAAGTAGTTG
AGTCCTAACTCAGCAATATAAAAAAACTCAGATTTTAAATAAAAAAGTTGTGAGCAAAAT
TAGTTTTTCCTACCTCAAAATTTTTAGATTTAACAATAAAATTTGAAAAAAAAATAAAAA
GTATAAAAAATATTTTACTATTTGAATAAATACATAAAAAATTTAATTAATAAAATAACA
GGAATTGAGTCCTTCTAGAGAGTTTAGAAAGAAATAATCAGTAACAATAAATTCAGTAAA
TAACCAACAAGCTGTTTTTTCTGGTTTTTAAAGTAATTTAATACAAACTTAAACAAAATA
ATTTTATTAAATTCTAATAAATAAAGAAATAAGGTCTTCTCCTAAATTAAACGAGTTAAG
GAATAGAAAAATAGAAAATTAAGCTAATAAATATAATTATGATATAGAAAAAGATACTAA
AAATGAAAGTTTACAAGAAAAGAGAGAATTTATTTAAGTTGAAGATATTCTCGCTCAACA
AAATTTTTAAATACTTAATTAGTAAGTAAATAATTTAGAATAGGAATAAATAGAAAGTAA
TACAAATTAGTAGAACAAGCTAGAATTAAATTAAATTGACACTACTATGACCTAATAAAA
ATAAGAAATTGATATAAATAAATCAATAAATTATTCAGATAAAGATTTTCTAAATTTTGA
TACTGAAGTAGATCTAAGTAACTAGAAGTAGTAACAAAATCTAAATGACAATCAATGTGA
AATTATAAATAAAAATTTTAAAAGTATTAATTAATCAAATGTTGATTAAAATATTATTGA
ATAGCATGCCTGA