Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01341600

Standard Name

TTLL14G (Tubulin Tyrosine Ligase-Like)

Aliases

PreTt12825 | 335.m00019

Description

Similar to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF09267 ) Dictyostelium STAT, coiled coil

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_01341600

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_10013.15.002220803647507e-75hypothetical protein (679 aa)
OxytrichaContig14054.0.g184.9976494746363024e-29Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_103121.1548224173015786e-17
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y_confirmed UniProt:Q564U4
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ligase associated with P-bodi
es
DictyBaseDDB_G02815410.00010003404299092957DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_01341600(coding)
ATGAAAAAGGATAAATTTTAGGACAATTTTTTAAATTCTGAATAAAATGCATTTGTTGAT
TTTTAGACATTTTCATATTAAGGGGACTAAAGTGAAGACATGAATTAAATTTTGGCTATT
ACATAATCATAAATGAAATCTAAGGAAGGAAATACCGACTTAGCATAAATGGAGATACCT
TTTACAGCACAAAATAACTTAGATAAAACCAATTAGCGCCAGTAATTCCAGCTGATTCAA
GAACTAAAGTAAACAATAGAGCAAGGTAGTAGTAATACAAGAAATAATTCAAAGTATAGA
GATTCGCTTTTGAAAAAATAGAACTCACCTAATAGATAGTAATTGCAAGTAAAGTTTGCA
TAAGATTAATTTCGATAAAATCAAAATTATTCAAATAATGATAGTAGTACTGTAAATTAG
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TATAACTAAAATACATAAACATTTAATGACCAAATTTCACAAAATATTTAAAATCTACCA
CAAAGGAAATTCAGACAAAATAATTATTTTTACCAAGAACCTAATGATACTTAATCTATC
CAAGCAAAATCTCCTATTGATTCACTCAGAAAGAGGTAGTTAACAGGAGATTTTAATTAA
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AAGTTTCTCATTGGATTGCAGCAACCTGATGATTTTTAAATCCAATTAGAAAGAAAATCA
AATGCAATATGTCCGCTTACTAAAAATTTTTAATAAACAAAGACTTCTAAAATTAAATAA
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GATATAATTAACTTTTCCAATGGAATTATACAGCCATTTAAAATCAAAATGCACGTCCCT
ATTTACAAAATAGGACTAAATACACAAAACGATCCCCAACTTATAGCCTAAGTTGTCTAA
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AAATAATCTCATTATTATGGAAACTAAGAGTGTCAAATTGAAAGCCAGTTATAGAAATTC
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GAGGGTCCTTTGAATTTACTTTCCCATCAAAACAGCTAAGAAGGATGCTTTATTAGCTAG
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TAAGAAAACTAAGAGTTCATTTCAAAAAAAAATCTAATCAATAATATTAAATTTTACTAC
AATCAAAAATATGACTCCTGTGAAAAAGCTTTTAACATTATTCCTAAATCCTTCATCATA
ACCAAAAATAGCGATCAAGGAAAAACAGAGTGGAGGAATTAAAAGCTTTATGAAACTAGC
GCAAGAAAATCTGATTCATCTCAAAAAACTCTATCTTCTTGTTTATGGATTATAAAGTAA
CAAGGTCGAAATTCATGGAGGAATTATAAAATAACAAACGAATATTCGGTTATAGACTAA
TTTATTGAAAATTTTCAAAATCAACATAAATAGTCTTACTTTATTATATAGCAGTACATT
CCAGATCCTTTATTGCTTGTTGGTAGAAAAATTTCATTGCAATTTTTCTTGCTAGTAACA
TGCTATAATGACTATGTCAAAGGGTATCTTTATGATGAAGGAATTGTTAACATGAGCTCA
TAAAATTATTAAGCTGAAGAATTCAATAATATTTACATTCATAATACAAATATTAACACA
TAGCAATACTCCTAAAATGAAAATGAATTTTCTCAAAATAACAAGATAATGTTTTCATAC
TTCAAAGACTACGTCAACGACTAAAAGCAAAAAGGGAACTTTAGCCAAATAGATACCAAT
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GCAGACAAGCTTCAAAAACAATTTGCTTTTTAAACATTTAGCATAGACTTTTTGATTGAC
GAATTAGGGCAAGTTTGGCTCAATGATGTAGAACCCGCTCCTTAATATAGCTAATTTGAT
GGCTATTCTCTACAAAAATTAGCGCTTTCTTTGATCGATCAAACCTTTTAAATTGCCGTT
GATCCATTATTCCCACCACCTCACTTTCCTATTTCTTACTTAGATCAAATTCCTTAAAAA
ATTTACTCAGAAAATAAATTTTAGCTAATTTTCGATCAAATTTTGTCGAACATAACTTTA
ATATAAAATATAAAATGA


>TTHERM_01341600(protein)
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QRKFRQNNYFYQEPNDTQSIQAKSPIDSLRKRQLTGDFNQDSDFSISLKKGTSKLINSQN
DTLSIIKSIKDLRSQFSSRQYERSESGPFFYDFLNNLCLLTKKILSPGDKINQVDCSFQG
IENAIQYIEAQQNNLQTQNTDDGIQKVQVLQILSSEFTWLKEKKKELESQQNFQNESNTT
PKRGLLNNEKKKILTEDAQLNVFTNKDRFGASERVDQVNISPFNHHQTKKFQFQNTQSQQ
HTQSSQYSQSMSSNSPSVSHQFSPSKLQQNQQSRFSISSMLQRQYSITTNQSTPKQMECS
KIAHKHYFHKNTALQIQTEGLSPRLNPSTNPNKSSQRSSISSHKASSIISGQVLTNNSLN
KFLIGLQQPDDFQIQLERKSNAICPLTKNFQQTKTSKIKQMNLLKTQSPLSAQSLSPYSK
SPLSSSSSSKKKFFQPSKNIANQIKYKEVQPFVDPNNRPKEHLDKIEKKQAYGQQYRDFL
DIINFSNGIIQPFKIKMHVPIYKIGLNTQNDPQLIAQVVQKRWWWKFSDGRDNGCDFQLL
WTDEKDYNFFKNMKSVKEICNENIVIAGDKQSSYEDQGIIKQSHYYGNQECQIESQLQKF
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DPLFPPPHFPISYLDQIPQKIYSENKFQLIFDQILSNITLIQNIK


>TTHERM_01341600(gene)
AATTTTTAAGTAAATAATACAAATAAAAACAAAGAAACAAAGCAATTAAGCTATATAGAT
TGTTAATTAACATATATGAAAAAGGATAAATTTTAGGACAATTTTTTAAATTCTGAATAA
AATGCATTTGTTGATTTTTAGACATTTTCATATTAAGGTAGTTATTTGCTCGCTTGATCA
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TTAATTTCACCACTTTTCTACTGAATTTTTATTTTAGCAGATATAAATGCCTAATCGCAA
TTAACAATTAATTTCTAAAACAATTAGGAAGGAAATACCGACTTAGCATAAATGGAGATA
CCTTTTACAGCACAAAATAACTTAGATAAAACCAATTAGCGCCAGTAATTCCAGCTGATT
CAGTAAAATTTTGAGTTTTATGATTGTAGTTGTTGATTATAAATAATCGTATTCTTTTTT
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ATAGAGATTCGCTTTTGAAAAAATAGAACTCACCTAATAGATAGTAATTGCAAGTAAAGT
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AAATTTTAACAGAGGATGCGCAGCTGAACGTTTTCACTAATAAAGATAGATTTGGAGCTA
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TAAATTATTCCTTTTTATACAATCAGAAAATATGCCAAACTGTGATTCTCTCTGCCTATT
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TTTACTCAGAAAATAAATTTTAGCTAATTTTCGATCAAATTTTGTCGAACATAACTTTAA
TATAAAATATAAAATGA