Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00299600

Standard Name

TTLL14D

Aliases

PreTt19263 | 28.m00222 | 3691.m00040

Description

Tubulin-tyrosine ligase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( TIGR00013 ) 4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%

TetraMine Data

TTHERM_00299600

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_07587.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (1055
aa)
OxytrichaContig1329.1.g1191.999447289884935e-116Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_257391.2479464629129513e-47
WormBaseWBGene000441871.9994498063102785e-22locus:ttll-9 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
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position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.00000000000020009182674645818PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00299600(coding)
ATGAATAATGAATCTAACGTATACATTCGCAAAAGCAAAAATATTAAGCAGCAAGCAGTT
CCGAGAAATTCTGATGAAATAGACATGGGTAATAGTCGAAGAGCCAATGAAAAAGAAAAC
AGTTCTCGCTTGTACTAAAATATTGGTGGTAGTTTGATGAATAACATAGGACTTGATTAA
ATTAAGATTGGGAATACCTCTTAGTATTACAGTGCAGGAGGAACACAAACAAATTTACCT
TCTCATATGGGTTTATCTTAAAACAGTGGGATTTCAAATCAAACAACTAATAGCTAAGGA
TCAAATAGCACTTAAAATGTGATACTTACTGTTACTAGAATTGTTCCATATTAATAACAC
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AACGAAGTCAATCACAACTTTATTTCTTCTTAGCAAGAATTCAATTAGAACTACCCTTCT
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GAAGATGCAAATAGTAATGATATAAATAGATCTTCTAGCACTCCTATGCTATTGAAGAAA
GAAGCTACTAAGCGTCTTGAAAAGATAAAACATCATAATACAATAGAAGGTAATGGGAAT
GAAAACGAATAGTAAAACAACCGCTATGAAAAAATTACATCTCAAAAGATCAATGCAGTT
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AATTTAAATAGATTTGAAGATTCTGATAGAGAAAGTGATCATCCCTAACTGAATCCACTC
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ACAACAAAAGAAAAAGAAGCCAAGCTATCTGAATAAACTATTTAAAATAATGCTGACATA
AACGCCTCAAATAAAAAAAAATAGAAAAAGAAAAAGAAAAGAAACACATTAGTTGGACCT
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TTAGTAGGAAAATATGATAACCTTCCTAAAGAAGTGTAAAGGATAAACTAATATTAAGAT
TTCATAAGAGCAGTTAATTTCTCTAACAATATTGATGTTATTCCAATTTAAAAGCCTTGC
TTTAAGATGTATGTTGGCAAAGGTAATAATTCTTACTTAATCAAATCAAGCGTTAAATAG
AGATGGTGGCTTCAGTTAGAAACAAACAAAGATAAAGTTGATCAATGCCACATAGTGTGG
ACATAGCTAAGATTTAATGAATTTCTTAATAACCTCAAAGCTTTTACTGGACCCAGGATC
ACAACAGACAATTAAATCCTTGGTTCTGAATAAAAGATTAATATAAAAACTAACGACTCA
TTTGCAGATACAAACAATAACAACGATGCTTCTACGAACTTTGAAAACTCCCCACTCCTA
GACCACAAAATGAATTCATCAATAAATAAAGATTTAGACTCATAAAGCCAATTATAAGGA
GACTTAGGGAATGCAATTGATTCAAGTGATTCAGAAACTGAAAAATTAAGATCTTTAACA
TCTCGTCCCACAGTTAAAAAATCTAACTCTTTAAATAATTCCCTCTCTAGTTTAAAAGCA
GAGTTAAAGAAAGGCTCTCCTAACCCAGGAACAGCAAATTCATAACCATAAAATAAAGAA
ACACGTTCTCTCACACCAAGCACTAGAGGAAATGCCCCATAGAATTAATTGAAAGTGTAA
GCAACCTATAATGTAAATGCTAAGCGTTTATTCCATCCTAATGACTTTAAAAAAATTATG
GAGATTCAACCTAACAAAGACTACGATTTAAGATATTTCTTTTCCTAATCTCTGCCTGAT
TAATTTTAACAATTCCAAAAAGAATTCGACACTTTTTAAGATCCTAACTCATTAAAAATG
CATAATCACTTGGAAAATAATTGGAATCTCTCAAATAAAAAAGCTCTCTTTTATAATTTA
AGAAACTATTACACAACAATAAAACAGAACCCATTCGAAAACATACCATTAACTTTTCAT
ATTAAAGATGGAATTAATGATCCTGAATACACCAAATTTTTAGAACACTGGAAACAAAAA
GAAGATGAATGCAACTAAAAAGAAAAGTTGAGATTAGAATACAAGTATTCTTCAGATAAA
GCAAAGCAATCAATAGGAAGTAATATGAAGAAACCCAGAAATATTTGGATTATAAAACCA
GGTGAAATTACAAACAGAGGAACAGGTATTACAGTTCTCAATGAAATAGATTAAATCACT
TAACTTTTAGCTAAAAATGATTTACACCCAAACGGTAAGCCAAAAACCTACATAGTTTAA
AAATATTTAGACAATCCACTACTTTATAATAAGCGTAAATTTGACATTAGATGCTATCTG
CTTGTTACTGTTATAAAAGGAAGGATGAAGGCATACTGGTATTAAGATGGGTATATTAGA
ACTAGTTGTAAGGAGTATAATTGCAAAAGCTTAACTAATAAAATGATTCATTTAACAAAT
GACGCTGTGCAAAAAAAGTGCGAAGATTATGGAAAATATGAACCTGGAAATAAACTTTCT
TATAATGATCTTTAAAGGTATCTTGACTAGAATCACACAGAATAAAAAATAAATTTCTAA
ACTGTTATTTATCCTAGAATGAGATAATTAGCTCTTGATTGTATTAAATCAACTTTCCTT
AAGATGGATCCACAGAGAAGGGAAATCACCTTTGAAGTTTTTGGTTTAGATTACATGATT
GATGAAGAATTTAAAACGTGGCTTATTGAAGTAAATACTAACCCATGCCTTGAGCTCTCT
TCACCTCTTCTAGCACGTATTATTCCAGCTATGATAGAAAATGCTTTTAGAATCGCAATT
GATCCCATTTTTGGATTTCCTCCAATTAATGACTGGTCAGCATCTGCTAAAAAAACATTC
ATTCCTGATTCAATAATGGAAAACAATAAATTTGAATTGATATTTGACGAAGCATTTGAT
GGTCCATCTTTACAAGCTCTTTTCGCTCAATATAATGAATAATAATAGGATATAATTATA
GAAGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAAGAAATTGAAGATGAATAATGA


>TTHERM_00299600(protein)
MNNESNVYIRKSKNIKQQAVPRNSDEIDMGNSRRANEKENSSRLYQNIGGSLMNNIGLDQ
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PSQTQQLQQQILNHQQQQQLMSSLQNNMLQSSQFQQQSGNQNIYYQNYQQSNSQKGQMNS
PTRRFVQNQKPLQNGQSKKTQSIGNIQQQQQQVTNASIEKTNETDDVNSPGGPRQISIHY
LNGQSSFQGQVQQNNLSGQSMGVHYNAQKKSMNHIEMEESGGQGADQSGNCSGLDKSPKF
KPQTKFPPITKGSSAQSSQNTSNYKLQKIKMQDKEVRKNIVALDSISRMDQFTGLNQVGG
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TAGQGEGRENKFIENYSAGQEDANSNDINRSSSTPMLLKKEATKRLEKIKHHNTIEGNGN
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DFFKINPKENQLNQNERASSNIKGAIITNDQSSFEKTPQMRKKTYQQKQAMNLGNNQIKQ
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QGGQNNGLSSLNQGQMKNGQLVGKYDNLPKEVQRINQYQDFIRAVNFSNNIDVIPIQKPC
FKMYVGKGNNSYLIKSSVKQRWWLQLETNKDKVDQCHIVWTQLRFNEFLNNLKAFTGPRI
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YNDLQRYLDQNHTEQKINFQTVIYPRMRQLALDCIKSTFLKMDPQRREITFEVFGLDYMI
DEEFKTWLIEVNTNPCLELSSPLLARIIPAMIENAFRIAIDPIFGFPPINDWSASAKKTF
IPDSIMENNKFELIFDEAFDGPSLQALFAQYNEQQQDIIIEEEEEEEEEIEDEQ


>TTHERM_00299600(gene)
ATGAATAATGAATCTAACGTATACATTCGCAAAAGGTTTTATATTTTTTAGTTCTTATTA
GCTAATTAGTTTCACTTAATTAGGTCTTCTTTAAGATCAAATGACTATTATTTTACTTTT
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AAAAAATGATTTAGGAATTCGACACTTTTTAAGATCCTAACTCATTAAAAATGCATAATC
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ATGGAATTAATGATCCTGAATACACCAAATTTTTAGAACACTGGAAACAAAAAGAAGATG
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AATCCACTACTTTATAATAAGGTAAACAAATTTAATTATTTCAAGCAATGATTTTTATCT
TAACATTGTCATTGTTTGGCTTTGTTTTATTTATTTATAAAAAAAATTAATTATGTTGCA
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AGATGATTCATTTAACAAATGACGCTGTGCAAAAAAAGTGCGAAGATTATGGAAAATATG
AACCTGGAAATAAACTTTCTTATAATGATCTTTAAAGGTATCTTGACTAGAATCACACAG
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CTAATTAATTTCAAATATTAAATGTAATTTATTCAATTAAGTAATTAGCTCTTGATTGTA
TTAAATCAACTTTCCTTAAGATGGATCCACAGAGAAGGGAAATCACCTTTGAAGTACATA
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AACATTCATTCCTGATTCAATAATGGAAAACAATAAATTTGAATTGATATTTGACGAAGC
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ATATTTATACAAACAGTATTATATTAAACCTTTATCAACAAAAACTTAGAGGATATAATT
ATAGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAAGAAATTGAAGATGAATAATGA