Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00997770

Standard Name

TTLL14C (Tubulin Tyrosine Ligase-Like)

Aliases

PreTt25002 | 188.m00078

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF03008 ) Archaea bacterial proteins of unknown

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.6%

TetraMine Data

TTHERM_00997770

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_20922.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (775 a
a)
OxytrichaContig16201.0.g997.003299150740498e-122Tubulin-tyrosine ligase family
Stentor CoeruleusSteCoe_257391.1379798735078682e-50
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position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.0000000000019997478866288316PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00997770(coding)
ATGAGTGAAGATGTTTACAGAAGTTAAGGGAGGTAAAGGCTCCCGTCATTTTACGAAGAT
AGCTAAACAGTTAATTCTCCATCATCAATAAAGAAGGTTTTGAGCTTGGGAAAGCACAGT
TAAAAAAGTATTTAAGTAAAAAATATTTCTTCAGAAATGATGAAAATAATCAGAAGGTAT
CTGCATGTAGCCTCATCAGAATGGGAAACATAAATAGGTTAAAATAATACTTTGATTTTG
AAGAGAAGACATAACCAAAAATATTCTTCTTCACTATCCGACTAAAAATAATAGCTCAAT
TAAAACAGCTAGTAGCATGTGAAATCTCTTTCAAACCAATAAAAATTGTTAGGAAATTAA
AAAACAGAGTCTCCATCCAATAACTACGAGCAACTTAGAGATCCTAGATTTTGGATACAA
AGAAGCCTTTCTGAATAAATTGGAAATGTAAAAGGTTTGAACTCTGAGTTAGTAGATTAT
AAATTTAAAGTAACTCATAAAAATTAAAAAGATGAGGATATCAGATTGGCTTCCGAAAGG
AACAATTAGCCAGTAGGACTAGAGTTAAGAAAGATTGTTCCAAGCAGACAGAATAGCGAA
TTACCCTTTTGCCCCTCACCATCTCAAACAATATATAAATAAAATAGCAATAAGCTTTTA
GATATAAAAGTTTTAAAGGATCAATGGAATATTTCACGACCCAATTATTCTTTAGAAAAC
TCTAAAGATGAAGAATTAGTTGATCTTCACAAATAACACATTGTTTAAGATTTCTTTACT
TAATTTAAAAACGTACACTAAAATTCATACTAAAAAAACCTCAAAACAGCTGAAAGCCTT
CTAAGCCCAAAGAGAAAGATTCTCCCAAAAGTACTCAACTCTTCAAAAAGATAAAATATT
AATGCTAACTATGGTGCTTAAGAGAAGTTATACAGTGAAGAAGACACACACAATTTTATA
TTTCCATAGAATAGCAATGGAGGAAATTCTATTGAGTAATTGAGGCAAAATATTTAATCT
CCTAGCTAAAATTCAAAAATCTTGAAATTATTAAGCATTCAAAAATTGAACCATTAAAGC
TCACATAAATAAAGTAGATTGTCTTTATTATCTTAAACTCCTTAGTAGATGTACTATAAT
TTGAGCTCTGCTTCTTAAGATTAAAAATAAAATAGATACACAACAAAAGCAATAAGCGCC
TATTAAGCCATTTAGAAACTTTACAATAACTAAGATAAAATGAATAGATTTATGCTAGAG
ACAATTTAATTGACTCCTATTTCTAAATGTATTACAAAAGGTGCAACTGGGAATTCAAAA
GTATTAAGAATCATTTCAGAAGGTAATATTGCTAACAATTCTAGTGTCTAAGAATAAATT
TTAGGATACAAATTACACTAACCTTTTGAAGAGTAAGATAATGAAAGCGAAGTATACTTG
AATGATCTTTACAAGCAAGAGGATAACGGAAACAATATTGGAGGTGATAAGATGAATATA
GAAAATGATTATCAATAACAAAAAGAAGGAGATAATTGCAAGTAAAATAAAAATGAGTCA
AGGTAAAAAGATTACAAAATCAGGAAATTCCAAATTAAAAAAACTGACCCTAGCATTAAC
GCACTTGGTAAGTCTCATCCCATATACTACGAATAAAAGTATATTGTTAGATTGTAAAAG
GAAAAACAATTCACTGTAAGAATTAGTGCTTATAGAGATTTTATTCAAGCCATTAACTTT
TCAAATAAGCTCTATGTTTCGATACCAGAAGAGAAATAAAATCATCCCATTTATAAAGCT
TATGTAGGAAAAGGTAACAACTAGATGCTCATTCGCATGGTGATTAAATAGAGATGGTGG
TGGATAGTTACTGATTAGAAAGAAGATGCAAATATAAATTTAGTATGGACTTAGCTCAGA
AAGAATGAAATTTTGCAAACAATAAAAAGTTTGAAATAAGAATTAACTTAAGCTAGAATA
TAAAGACAGACATCTTCTACTTCAATTCTAGCTGCTCAACAATCTCCTTCTAATAACCTA
AATTAGTAGCCCTAGATTTTTTCACCTTCGAATAGCTAAACATCATTCACTCAATAATTC
TAAACTTTAGCTTAATAAACAAGCACGTAATCTCTCTTTGGTTCTTAAAGCGAAAGTACA
ACAGATGAAAGCACAATAATTTCTGCTTCAAATCTCAATTTGCAATCAAATTCAAAACAA
GTTGTAAAGTTGGGTAGATAAGCATAATTCCTAAAAAAACTTACAAATTAATCAGATTTT
TAAGCTCTTAATAACCTTTTTTCGAATAGAAATGGCAAAAAATTTGATTAAACAGCTTTC
TCAAACATTTAAGTCATGAGCAGCCTAATAAGAGAGTAAGAATGCAAATAAATTAAAGAG
CCAGTCTAACTTAAAATCCATAATCATCTTTAAGATAACTTTCACTTAAGTAATAAAAAG
GCTCTTTTTTACAACATGCGTAGCTATTATGAATCCAATCAATAAAACCCATTTGATTAT
ATTCCTCTTACTTTTCATATCTAAGAAGGTAAAAAAGATAAGGAATACTCAAAATTTGTA
GCTCATTTCAATTATCTAAAAGAGCTTGCTAGTAACAATTCTAACAATCAAAATAGCACA
GCAAAGAAAGAATAAAATATTTGGATTGTTAAACCTGGAGAAATAACAAACAGAGGATCA
GGCATTAAAGTATTATCTGATCTTGATTAAATAGAATAAATAGTTGAGTCTAATGAGTTC
CATAAAACAGGAATGAGAAAAACATTTATTATTTAAAAATATATTGAATATCCTTTACTC
TACTTTAAAAGAAAATTTGATATACGTTGTTACTATCTCTTGACTACAACTAATGGGTAT
CTGAAAGGTTACTGGTATTAAGATGGATATATAAGAACTGCATCAAAAGAATTTACAACT
AAAAATCTAGGTAAAATGATACATTTAACGAATGATGCAGTCCAAAAGAAAGATGACTAA
TATGGAAAATATGAAAAAGGAAATAAAGTTAGCTATGACGAGTTAGATAAATACATAACT
TCTTTACAACCAGAAAAAGACTTTTATAATTCAATATTGCCTCAAATGAAAGAAATAGCT
AGGGATACAATGAAAGCAGTATATGGTAAGATAGATCCTGATAAAAAAGAAACAACTTTT
GAAGTATTTGGACTTGATTTTATGATTGATGAAAACTTAAAAGTTTGGTTGATTGAAGTA
AATACAAATCCAGCTTTAGATATTTGTTGTCCTCTCTTATCAAAAATTATTCCTTAGATG
ATTGAAAATACATTTAGGATTGCTATTGATCCGCTATTCCCTCCACCTGCATTTAGCAAT
CACAAGAATTTTAATTTTGACAACATATTAGAGAACAATAAATACGAGCTTGTATTTGAT
GAAGTTGAAGATTCAAAATTAATAAAGATGACAGGAAAAGATACAAATTTAAATTGGTAA
ATGATTGAAGAAGAATTAGATGAAGATGAAGAAGACATAATTCCCGAATGA


>TTHERM_00997770(protein)
MSEDVYRSQGRQRLPSFYEDSQTVNSPSSIKKVLSLGKHSQKSIQVKNISSEMMKIIRRY
LHVASSEWETQIGQNNTLILKRRHNQKYSSSLSDQKQQLNQNSQQHVKSLSNQQKLLGNQ
KTESPSNNYEQLRDPRFWIQRSLSEQIGNVKGLNSELVDYKFKVTHKNQKDEDIRLASER
NNQPVGLELRKIVPSRQNSELPFCPSPSQTIYKQNSNKLLDIKVLKDQWNISRPNYSLEN
SKDEELVDLHKQHIVQDFFTQFKNVHQNSYQKNLKTAESLLSPKRKILPKVLNSSKRQNI
NANYGAQEKLYSEEDTHNFIFPQNSNGGNSIEQLRQNIQSPSQNSKILKLLSIQKLNHQS
SHKQSRLSLLSQTPQQMYYNLSSASQDQKQNRYTTKAISAYQAIQKLYNNQDKMNRFMLE
TIQLTPISKCITKGATGNSKVLRIISEGNIANNSSVQEQILGYKLHQPFEEQDNESEVYL
NDLYKQEDNGNNIGGDKMNIENDYQQQKEGDNCKQNKNESRQKDYKIRKFQIKKTDPSIN
ALGKSHPIYYEQKYIVRLQKEKQFTVRISAYRDFIQAINFSNKLYVSIPEEKQNHPIYKA
YVGKGNNQMLIRMVIKQRWWWIVTDQKEDANINLVWTQLRKNEILQTIKSLKQELTQARI
QRQTSSTSILAAQQSPSNNLNQQPQIFSPSNSQTSFTQQFQTLAQQTSTQSLFGSQSEST
TDESTIISASNLNLQSNSKQVVKLGRQAQFLKKLTNQSDFQALNNLFSNRNGKKFDQTAF
SNIQVMSSLIREQECKQIKEPVQLKIHNHLQDNFHLSNKKALFYNMRSYYESNQQNPFDY
IPLTFHIQEGKKDKEYSKFVAHFNYLKELASNNSNNQNSTAKKEQNIWIVKPGEITNRGS
GIKVLSDLDQIEQIVESNEFHKTGMRKTFIIQKYIEYPLLYFKRKFDIRCYYLLTTTNGY
LKGYWYQDGYIRTASKEFTTKNLGKMIHLTNDAVQKKDDQYGKYEKGNKVSYDELDKYIT
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NTNPALDICCPLLSKIIPQMIENTFRIAIDPLFPPPAFSNHKNFNFDNILENNKYELVFD
EVEDSKLIKMTGKDTNLNWQMIEEELDEDEEDIIPE


>TTHERM_00997770(gene)
ATGAGTGAAGATGTTTACAGAAGTTAAGGGAGGTAAAGGCTCCCGTCATTTTACGAAGAT
AGCTAAACAGTTAAGTAAAATGAAGTTTTTAAGGTTTTAATTAGAAAAAAAGAAATTTAA
ATATAGAATGAAATATCCATCCATAAATATGTTCAAACAAATCTATTATTAATTTATAAA
AACAGTTCTCCATCATCAATAAAGAAGGTTTTGAGCTTGGGAAAGCACAGTTAAAAAAGT
ATTTAAGTAAAAAATATTTCTTCAGAAATGATGAAAATAATCAGAAGGTATCTGCATGTA
GCCTCATCAGAATGGGAAACATAAATAGGTTAAAATAATACTTTGATTTTGAAGAGAAGA
CATAACCAAAAATATTCTTCTTCACTATCCGACTAAAAATAATAGCTCAATTAAAACAGC
TAGTAGCATGTGAAATCTCTTTCAAACCAATAAAAATTGTTAGGAAGTAAACATTTTCAT
CAAATTAATTATCAACTTTAATGATAAAAATTTCCAAAATAATATTAAATTCATAAATAA
AATAATAATTTATGTCAATTCTTATTTTATGAATTAACATTTGGTTAAATAGATTAAAAA
ACAGAGTCTCCATCCAATAACTACGAGCAACTTAGAGATCCTAGATTTTGGATACAAAGA
AGCCTTTCTGAATAAATTGGAAATGTAAAAGGTAATTAATTTTAAAGCACCTTAAAACTA
CTTCTACTACGAATTGAATTAATGTGATACAAAGAAATATTATGCAAAAAAAAAAAAAAA
CTTATATTTCAATTATTTTTTAATTAATTTTCTTTTTTTTCCTGCTACTTCATGAACAAT
TCCCATTTGTTAAGATAAATAATTAGATAGAAATCAAAATATGTTATATTAAATTTTTAA
AAGTTGATTTATCTTGAAAAATGGATAACCCATCAAAAAAAAAAAATTTTTTTTAAATAT
TAACATAATATAATAATTAAATAAATAAAATAGGTTTGAACTCTGAGTTAGTAGATTATA
AATTTAAAGGTATTATAAACAAATTAATTTTAAATATGTATATTTTTGGTTTTATAATAA
TTAACTAAAGTAACTCATAAAAATTAAAAAGATGAGGATATCAGATTGGCTTCCGAAAGG
AACAATTAGCCAGTAGGACTAGAGTTAAGAAAGGTTGTTATTTATTTTTTTTATTATCTA
TACAAATTATACTTAAAATAGATTGTTCCAAGCAGACAGAATAGCGAATTACCCTTTTGC
CCCTCACCATCTCAAACAATATATAAATAAAATAGCAATAAGCTTTTAGATATAAAAGTT
TTAAAGGATCAATGGAATATTTCACGACCCAATTATTCTTTAGAAAACTCTAAAGATGAA
GAATTAGTTGATCTTCACAAATAACACATTGTTTAAGATTTCTTTACTTAATTTAAAAAC
GTACACTAAAATTCATACTAAAAAAACCTCAAAACAGCTGAAAGCCTTCTAAGCCCAAAG
AGAAAGATTCTCCCAAAAGTACTCAACTCTTCAAAAAGATAAAGTAAACTCATTTAATAA
AAACTTCATTTAAATTTAATGATTATTAAATAATAAAATTAAAATAATTTCTTTATATTA
TCAAAGACAAACTAAAAAATTATTTCATTTCTAAAATTTTTCTTAGAACTGATTAAATAT
TTAAATTTCTAATTTAAAAAAAATAAAAAGATATTAATGCTAACTATGGTGCTTAAGAGA
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AATTATTAAGCATTCAAAAATTGAACCATTAAAGCTCACATAAATAAAGTAGATTGTCTT
TATTATCTTAAACTCCTTAGTAGATGTACTATAATTTGAGCTCTGCTTCTTAAGATTAAA
AATAAAATAGATACACAACAAAAGCAATAAGCGCCTATTAAGCCATTTAGAAACTTTACA
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ATATTGCTAACAATTCTAGTGTCTAAGAATAAATTTTAGGATACAAATTACACTAACCTT
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AAGGAGATAATTGCAAGTAAAATAAAAATGAGTCAAGGTAAAAAGATTACAAAATCAGGA
AATTCCAAATTAAAAAAACTGACCCTAGCATTAACGCACTTGGTAAGTCTCATCCCATAT
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GTGCTTATAGAGATTTTATTCAAGCCATTAACTTTTCAAATAAGCTCTATGTTTCGATAC
CAGAAGAGAAATAAAATCATCCCATTTATAAAGCTTATGTAGGAAAAGGTAACAACTAGA
TGCTCATTCGCATGGTGATTAAATAGAGATGGTGGTGGATAGTTACTGATTAGAAAGAAG
ATGCAAATATAAATTTAGTATGGACTTAGCTCAGAAAGAATGAAATTTTGCAAACAATAA
AAAGTTTGAAATAAGAATTAACTTAAGCTAGAATATAAAGACAGACATCTTCTACTTCAA
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AATTCCTAAAAAAACTTACAAATTAATCAGATTTTTAAGCTCTTAATAACCTTTTTTCGA
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GTATTTTTGTACTTTTTAATAACAGTTTATGATATTTTATCTTTAGGAAATAGCTAGGGA
TACAATGAAAGCAGTATATGGTAAGATAGATCCTGATAAAAAAGAAACAACTTTTGAAGT
ATTTGGACTTGATTTTATGATTGATGAAAACTTAAAAGTTTGGTTGATTGAAGTAAATAC
AAATCCAGCTTTAGATATTTGTTGTCCTCTCTTATCAAAAATTATTCCTTAGATGATTGA
AAATACATTTAGGTTTTAAATTATTAAAATTAATTTCATTTATAACAGCTTAATATTTAA
ATAATATTAGGATTGCTATTGATCCGCTATTCCCTCCACCTGCATTTAGCAATCACAAGA
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TTACTTTTTTTGTCATTTTAATTAATTTTAAATATAAAAGGGTAAATGATTGAAGAAGAA
TTAGATGAAGATGAAGAAGACATAATTCCCGAATGA