Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00702240

Standard Name

TTLL12B (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt14922 | 109.m00140

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF00981 ) rotavirus RNA-binding Protein 53 (NS53)

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00702240

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_01167.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (1206
aa)
OxytrichaContig22637.0.g501.9990002532767049e-131Tubulin-tyrosine ligase family
WormBaseWBGene000084053.0012565309061457e-65locus:ttll-12 Tubulin--tyros
ine ligase-like protein 12 s
tatus:Confirmed UniProt:Q095
12 protein_id:CAA87778.1
Stentor CoeruleusSteCoe_231343.4811068399043105e-57
DictyBaseDDB_G02815410.00000000006996681903814525DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGDYBR094W0.0009001042212099794PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00702240(coding)
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TAAGAGGGAGGATTACCTGCGTAGTTAGTTTCTGTTTTAGCAGATAAATTAGAAAAGTAA
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GATGTTATGATTGAAAACGGAACCTATTAACCTAAACTTTTAGAAATGACTTTCTCTCCT
GACAGCAACCGTATTTGTAAATACTATCCCAGTTATTATAACGATTTGTTTTCACTTATT
TATCTCAATTAGGTAATTTTTTTATATTAATTAATTTAAAAAACTAATCAATAAATAAAT
AATATATTTATAGAATAACATTGA


>TTHERM_00702240(protein)
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AGETPTWFLNQLQGIAIQHSDTPNLKMIPFQYSPSNSDQDGQEIKSYSIVWPIYNIQAGD
LVYRDYLAGFDESKQRSARLTTWFKVPEEYFAKCIQDYKNKLMHQTLMGKNLIKQFKNQE
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LCNQFPYEQCIIHKAHLAQTVYSTIGQVDWLQQTFNLEYQLSEFIGEYQRRQNTLEDNIW
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PLEVYIYKNFVIRSSNNEFTNDYRSRENYETHFTVMNYGGKKMNEILQEEFIKIFEEENP
TIKWSDISNKIKSMVKELFIAVSTKYPKMHCENSRSVYGMDVMIENGTYQPKLLEMTFSP
DSNRICKYYPSYYNDLFSLIYLNQVIFLYQLIQKTNQQINNIFIEQH


>TTHERM_00702240(gene)
ATGTAAACTCTACTTTCAGAAAAGCATTAAGCATTCTACAATTTTCATAAATTTTAATTA
TAAGAGGGAGGATTACCTGCGTAGTTAGTTTCTGTTTTAGCAGATAAATTAGAAAAGTAA
ACATTCGATTTTGCAGAATACTTTTAAGTAAGGCAATCTAAAATTAATGAATGATGTGAC
TGTTTATATATATATATTTATATTATCACCATAAAAAAGATTTAGGATAATTAAAACGAT
GACACCTTCTAAGTAGTAGCTTCAGCTGATATTTAAAAAGATTCTAATGTAAGTCTTATC
ATTTATTTTTAGTTAGTTATTTGAATAGACTTTCATTTATTTTAAATTGTGTAATCATAA
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GCAAGTTCTCACTATAATATGTGAGCATTTAAGTCGAATAATATCAACTTTATTAGCATT
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ATTTTAATTGATTGAATGGAATATCATTCATTTATAATTTGATTAATAATAATTTAAACA
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GAAAAGGATCAAGAATTAGTTGAAACACTTAAATACCATCTTTAATATTTTGATGAAAAG
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TCATATTTTTTATTAGGATTAAGATGGATAGGAAATAAAATCTTATTCTATTGTTTGGCC
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ATCGAAACAAAGATCTGCAAGATTAACAACTTGGTTTAAGGTTCCCGAAGAATACTTTGC
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TAATTAATTTTTTTATATAAGATTAAACCCTTAGAAGTATACATATATAAAAACTTTGTT
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CATTTCACAGTCATGAACTATGGAGGTAAAAAAATGAATGAAATCTTACAAGAAGAATTC
ATTAAAATCTTTGAAGAAGAAAACCCAACAATAAAATGGAGTGATATTTCTAATAAAATA
AAGAGCATGGTAAAAGAGTTATTCATAGCAGTTTCCACAAAATACCCTAAAATGCACTGT
GAAAACGTAAATTAATAAAAAAATAAATAAATTTTAAAATATTTTTAGTTAAAAATAAAC
TAAATATAATAAACGTATCATATTATATTAATAATTTATTAAATATAGTCAAGATCTGTA
TATGGAATGGATGTTATGATTGAAAACGGAACCTATTAACCTAAACTTTTAGAAATGACT
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TCACTTATTTATCTCAATTAGGTAATTTTTTTATATTAATTAATTTAAAAAACTAATCAA
TAAATAAATAATATATTTATAGAATAACATTGA