Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00702240
Standard Name
TTLL12B (Tubulin Tyrosine Ligase-Like
)
Aliases
PreTt14922 | 109.m00140
Description
Related to tubulin tyrosine ligase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
( PF00981 ) rotavirus RNA-binding Protein 53 (NS53)
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12.4%
TetraMine Data
TTHERM_00702240
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_01167.1 9.997093137033517e-262 tubulin-tyrosine ligase (1206
aa)
Oxytricha Contig22637.0.g50 1.9990002532767049e-131 Tubulin-tyrosine ligase family
WormBase WBGene00008405 3.0012565309061457e-65 locus:ttll-12 Tubulin--tyros
ine ligase-like protein 12 s
tatus:Confirmed UniProt:Q095
12 protein_id:CAA87778.1
Stentor Coeruleus SteCoe_23134 3.4811068399043105e-57
DictyBase DDB_G0281541 0.00000000006996681903814525 DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
SGD YBR094W 0.0009001042212099794 PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:15890843 : Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62
Sequences
>TTHERM_00702240(coding)ATG TAA ACT CTA CTT TCA GAA AAG CAT TAA GCA TTC TAC AAT TTT CAT AAA TTT TAA TTA TAA GAG GGA GGA TTA CCT GCG TAG TTA GTT TCT GTT TTA GCA GAT AAA TTA GAA AAG TAA ACA TTC GAT TTT GCA GAA TAC TTT TAA ATT TAG GAT AAT TAA AAC GAT GAC ACC TTC TAA GTA GTA GCT TCA GCT GAT ATT TAA AAA GAT TCT AAT GTT TTT CTA ATT GAC CAT TAG CTT ACT TTT AAA TCT GAT GAA CTT AGA AAT ATA TTA GAA AAG GAT CAA GAA TTA GTT GAA ACA CTT AAA TAC CAT CTT TAA TAT TTT GAT GAA AAG AAA AAA ATT CCT GGA TTA GAG CAG CCT ACT TAA AAA TTT AAA GGA GTC GAG GAA TAT GAT TCT TTA GAG ATA GTG GAC CCT TCT ACT TAC AAG ATT CCA AAA ACA ACA GTG AGC GTT TCT TTC TTT GAT AAT TAA ATA AAG TCA TTA GAG TTA GTT AAA ATC ATG TTA AGA GAA CTC CCA AAT TTG AAG TGT TTG TTT TTA AAT TAC AAT CCA GTT TGC GAG GAA CTT GGT TTT AAA GAT ACT ATT GAA AAC GAA TTC CCT TAA ATT GAA ATT TTA AAT TCA AAG CTA ACA TCT AAT TCT GGG GAA TTC GGT ATA AAA TAC TGC AGT TAT AAA TAT AAT TTA GAC AAG ACA AAT AAG ATT AAA ACA GAA ATG ATT AAA TAA TTG GAT TTG TCT AAT AGA GAA GTC TTA AAT ATG AAG AGT TTT GAA GTA TTC AGC CAA TTT AAA AAT TTG GTT TAA TTG GAT GTC AGA AAA AAT GAT TTC GAT ACT GAA GAT AAA TTT AAT AAA TTG CTA TAA ATT CTT TAA AAT TGC AAT AAG CTC ACT AGT TTA TTC ATA GAT TTT GAA TAT GAA CTT AAA TTA TGG GAT TTA CAA GAG ATA GGA AAA TTG AAA GAA GTT TGT CCA ACT TTA GAA AAA ATA AAT GAA CGT TTT TTA AGT TAC AAG AAA CCT TAA GAA AAT GAA GAA GAT ATC AAG TTT ATA ACA AAA AAT ATA TGG AAA TCT ATT GGA AAT TAC TAC AAG CTT GGA AAA AAC GAA GCT GGA GAA ACT CCA ACT TGG TTT TTA AAC TAA CTT TAA GGG ATA GCT ATT CAG CAT TCA GAC ACA CCC AAT CTG AAA ATG ATA CCT TTT TAG TAT TCG CCC TCA AAT TCA GAT TAA GAT GGA TAG GAA ATA AAA TCT TAT TCT ATT GTT TGG CCT ATT TAT AAT ATA CAA GCA GGA GAT CTT GTT TAT AGA GAC TAT TTA GCA GGA TTT GAT GAA TCG AAA CAA AGA TCT GCA AGA TTA ACA ACT TGG TTT AAG GTT CCC GAA GAA TAC TTT GCC AAA TGC ATC TAA GAT TAT AAA AAT AAA TTA ATG CAT TAA ACA TTA ATG GGG AAG AAT TTA ATA AAA TAA TTT AAA AAT TAA GAA GGC TTA ATT GTA GGA AAA GTA CCT TCT TAA AGG CCC TTG AGA GTT ATT ACT GAT TAT TAA TTA GTC AAA GAT AAC CTA ACA TTA AAA GAA TTC GAA CTT ATA GAA GAT GAA TAA AAG GCA GAT GTT GCT TTT TTA GTT TAC AAT TTC TAA AAT AGG CTC AAA GAC TTG ATG AAT ACT CAT TTA TGT AAT TAA TTC CCT TAC GAG TAG TGT ATC ATT CAT AAG GCG CAC CTT GCT TAG ACT GTT TAC TCA ACT ATT GGA TAA GTA GAC TGG CTA TAA TAA ACA TTT AAC TTA GAG TAT TAG TTA AGT GAA TTT ATT GGT GAG TAT TAA AGA AGA TAA AAT ACA TTA GAA GAC AAT ATT TGG ATT ATA AAG GCT TTT GAT TTA GCA AGA AGC ATG GAT ATG ATA GTT ACT GAT AAT CTA GAT TAA ATA ATT AGA TAA ACA GAA ACT TTA CCA AGG CTT GCT TAA AAA TAT ATT CAA AAT CCA TTA ACT ATC TAG AAA AAG AAG ATA GAT TTA AGA TTC ATG GTT GCA GTC AGA TCT ATT AAA CCC TTA GAA GTA TAC ATA TAT AAA AAC TTT GTT ATA CGT TCC TCT AAC AAT GAA TTC ACT AAT GAC TAT AGA TCA CGT GAA AAT TAT GAA ACA CAT TTC ACA GTC ATG AAC TAT GGA GGT AAA AAA ATG AAT GAA ATC TTA CAA GAA GAA TTC ATT AAA ATC TTT GAA GAA GAA AAC CCA ACA ATA AAA TGG AGT GAT ATT TCT AAT AAA ATA AAG AGC ATG GTA AAA GAG TTA TTC ATA GCA GTT TCC ACA AAA TAC CCT AAA ATG CAC TGT GAA AAC TCA AGA TCT GTA TAT GGA ATG GAT GTT ATG ATT GAA AAC GGA ACC TAT TAA CCT AAA CTT TTA GAA ATG ACT TTC TCT CCT GAC AGC AAC CGT ATT TGT AAA TAC TAT CCC AGT TAT TAT AAC GAT TTG TTT TCA CTT ATT TAT CTC AAT TAG GTA ATT TTT TTA TAT TAA TTA ATT TAA AAA ACT AAT CAA TAA ATA AAT AAT ATA TTT ATA GAA TAA CAT TGA >TTHERM_00702240(protein)M Q T L L S E K H Q A F Y N F H K F Q L Q E G G L P A Q L V S V L A D K L E K Q T F D F A E Y F Q I Q D N Q N D D T F Q V V A S A D I Q K D S N V F L I D H Q L T F K S D E L R N I L E K D Q E L V E T L K Y H L Q Y F D E K K K I P G L E Q P T Q K F K G V E E Y D S L E I V D P S T Y K I P K T T V S V S F F D N Q I K S L E L V K I M L R E L P N L K C L F L N Y N P V C E E L G F K D T I E N E F P Q I E I L N S K L T S N S G E F G I K Y C S Y K Y N L D K T N K I K T E M I K Q L D L S N R E V L N M K S F E V F S Q F K N L V Q L D V R K N D F D T E D K F N K L L Q I L Q N C N K L T S L F I D F E Y E L K L W D L Q E I G K L K E V C P T L E K I N E R F L S Y K K P Q E N E E D I K F I T K N I W K S I G N Y Y K L G K N E A G E T P T W F L N Q L Q G I A I Q H S D T P N L K M I P F Q Y S P S N S D Q D G Q E I K S Y S I V W P I Y N I Q A G D L V Y R D Y L A G F D E S K Q R S A R L T T W F K V P E E Y F A K C I Q D Y K N K L M H Q T L M G K N L I K Q F K N Q E G L I V G K V P S Q R P L R V I T D Y Q L V K D N L T L K E F E L I E D E Q K A D V A F L V Y N F Q N R L K D L M N T H L C N Q F P Y E Q C I I H K A H L A Q T V Y S T I G Q V D W L Q Q T F N L E Y Q L S E F I G E Y Q R R Q N T L E D N I W I I K A F D L A R S M D M I V T D N L D Q I I R Q T E T L P R L A Q K Y I Q N P L T I Q K K K I D L R F M V A V R S I K P L E V Y I Y K N F V I R S S N N E F T N D Y R S R E N Y E T H F T V M N Y G G K K M N E I L Q E E F I K I F E E E N P T I K W S D I S N K I K S M V K E L F I A V S T K Y P K M H C E N S R S V Y G M D V M I E N G T Y Q P K L L E M T F S P D S N R I C K Y Y P S Y Y N D L F S L I Y L N Q V I F L Y Q L I Q K T N Q Q I N N I F I E Q H >TTHERM_00702240(gene)ATG TAA ACT CTA CTT TCA GAA AAG CAT TAA GCA TTC TAC AAT TTT CAT AAA TTT TAA TTA TAA GAG GGA GGA TTA CCT GCG TAG TTA GTT TCT GTT TTA GCA GAT AAA TTA GAA AAG TAA ACA TTC GAT TTT GCA GAA TAC TTT TAA GTA AGG CAA TCT AAA ATT AAT GAA TGA TGT GAC TGT TTA TAT ATA TAT ATT TAT ATT ATC ACC ATA AAA AAG ATT TAG GAT AAT TAA AAC GAT GAC ACC TTC TAA GTA GTA GCT TCA GCT GAT ATT TAA AAA GAT TCT AAT GTA AGT CTT ATC ATT TAT TTT TAG TTA GTT ATT TGA ATA GAC TTT CAT TTA TTT TAA ATT GTG TAA TCA TAA AAA GCA TGT AGA GAT TAC ATC TAT TCA TTA ATG AAA TTT TGA TTG ATA TTA TCT TTT AAT GCA AGT TCT CAC TAT AAT ATG TGA GCA TTT AAG TCG AAT AAT ATC AAC TTT ATT AGC ATT AAT GAG CGA ATT TAA ACC GAT TTT TAT CAT AAA TTT AAA AAA CAT ATC TAA AAA TGT ATA ATT TTA ATT GAT TGA ATG GAA TAT CAT TCA TTT ATA ATT TGA TTA ATA ATA ATT TAA ACA AAA TGT TTT TAT AAA ATA TTT TAT TCA TTA ATT TAT GCT AAA ATT TTC TTA GCA AAT CCA AAA ATC ATT TTC GAT GTA AAA TTG TTT GTA AAA TAA TTA AAT TTT ATA TGA ATT ATT AAT AAG CAA TAT TAG CTT AAC TAT TCT CTA ATT TTT ATT ATT TTA AGT AAA TTT TTT GAA TAA AAA ATA AGT AAA ACA ATT AAG AGA ATA AAT TTT ACT TTT TAT CAC AAA TAA ATA ATT TTA TAG GTT TTT CTA ATT GAC CAT TAG CTT ACT TTT AAA TCT GAT GAA CTT AGA AAT ATA TTA GAA AAG GAT CAA GAA TTA GTT GAA ACA CTT AAA TAC CAT CTT TAA TAT TTT GAT GAA AAG AAA AAA ATT CCT GGA TTA GAG CAG CCT ACT TAA AAA GTA ATT TAA TAT TTA GTT AAT AAG TGA ATC ATT AAT TAA TTG ATT AAC TTC AAT TAA AAA AAT AGC AAA ATA TAT CAA AAT TAT TTT AGT TTT GAT AAT AAT TAG ATT TTT AAT ATC TTC AAA TAT ATA AAT GAA ATA GTT TTT ACC ATG TTG AAA ATA GGG GTA TTT GTA AAT AAA ATT AAA ATA TTT AGA AAA AAA GCA ATA TTA ATA AAG TTT TAA AAA AAG AAA AAA TAA CTT AGA AAA GTT AAA TTT TTC TAT CCC TTT TAA AAT ATA ATA AAT TAA AAT ATT TTA AAT TAA ATT AAT GAT AAA TTT ATA TAG TTT AAA GGA GTC GAG GAA TAT GAT TCT TTA GAG ATA GTG GAC CCT TCT ACT TAC AAG GTA AAA AAA TTC GCT AAG ATA ATA TTT TAC AAT AGT TTA TTT ATT TAT TCT CAT TTT ATA AAT ATA AAA TCT AAA AAG ATT CCA AAA ACA ACA GTG AGC GTT TCT TTC TTT GAT AAT TAA ATA AAG TCA TTA GAG TTA GTT AAA ATC ATG TTA AGA GAA CTC CCA AAT TTG AAG TGT TTG TTT TTA AAT TAC AAT CCA GTT TGC GAG GAA CTT GGT TTT AAA GAT ACT ATT GAA AAC GAA TTC CCT TAA ATT GAA ATT TTA AAT TCA AAG CTA ACA TCT AAT TCT GGT ATT TTA AAT CAA TTT AGA CTT AAA TTA AAC AAT CTG ATT TTA AAA TTA GGG GAA TTC GGT ATA AAA TAC TGC AGT TAT AAA TAT AAT TTA GAC AAG ACA AAT AAG ATT AAA ACA GAA ATG ATT AAA TAA TTG GAT TTG TCT AAT AGA GAA GTC TTA AAT ATG AAG AGT TTT GAA GTA TTC AGC CAA TTT AAA AAT TTG GTT TAA TTG GAT GTC AGA GTA ATT TTT ATT ATT TTA TAT TTA ATA GTT ATA TTA TTT TTA TTT ATG ATA ACA AAT AAA TAT CTT AAC ATA TTT TAA TTA GAA AAA TGA TTT CGA TAC TGA AGA TAA ATT TAA TAA ATT GCT ATA AAT TCT TTA AAA TTG CAA TAA GCT CAC TAG TTT ATT CAT AGA TTT TGA ATA TGA ACT TAA ATT ATG GGA TTT ACA AGA GAT AGG AAA ATT GAA AGA AGT TTG TCC AAC TTT AGA AAA AAT AAA TGA ACG TTT TTT AAG TTA CAA GAA ACC TTA AGA AAA TGA AGA AGA TAT CAA GTT TAT AAC AAA AAA TAT ATG GAA ATC TAT TGG AAA TTA CTA CAA GCT TGG AAA AAA CGA AGC TGG AGA AAC TCC AAC TTG GTT TTT AAA CTA ACT TTA AGG GAT AGC TAT TCA GCA TTC AGA CAC AGT ATT TAT TTT AAT TTA ATT CAT ATC CTA TAA TAT TAT TTC ATT ATT TTT TTT TTC TAA AAC AAT ACA ACT AGC CCA ATC TGA AAA TGA TAC CTT TTT AGT ATT CGC CCT CAA ATT CAG TAA ATA ATT TAA GCT TAA AAT AAA TAA AAA TTA ATT TAA TCA TAT TTT TTA TTA GGA TTA AGA TGG ATA GGA AAT AAA ATC TTA TTC TAT TGT TTG GCC TAT TTA TAA TAT ACA AGC AGG AGA TCT TGT TTA TAG AGA CTA TTT AGC AGG ATT TGA TGA ATC GAA ACA AAG ATC TGC AAG ATT AAC AAC TTG GTT TAA GGT TCC CGA AGA ATA CTT TGC CAA ATG CAT CTA AGA TTA TAA AAA TAA ATT AAT GCA TTA AAC ATT AAT GGG GAA GAA TTT AAT AAA ATA ATT TAA AAA TTA AGA AGG CTT AAT TGT AAA TAT TTT AAT TTA GTT AGA TAA CTT TTG AAA TTA ACA TAA TAA TTC TAA ATA AAA TAG GTA GGA AAA GTA CCT TCT TAA AGG CCC TTG AGA GTT ATT ACT GAT TAT TAA TTA GTC AAA GAT AAC CTA ACA TTA AAA GAA TTC GAA CTT ATA GAA GAT GAA TAA AAG GCA GAT GTT GCT TTT TTA GTT TAC AAT TTC TAA AAT AGG CTC AAA GAC TTG ATG AAT ACT CAT TTA TGT AAT TAA TTC CCT TAC GAG TAG TGT ATC ATT CAT AAG GCG CAC CTT GCT TAG ACT GTT TAC TCA ACG TAA ATT TTA TTT ATT TAT TTG CTT ATC TAT TTA TTA AAA ACA TAA ATT TAA TAT TTT AAA TCA TTT TAA ATT AAA AAC TTT TAT ATT TAA TTA ATT TTA ATT GAA TAA AAT ATT TTT TTT CCC TAT GAA ACT TCA ATG TTT TTT TAC ATT TAT TTA ATC CTT ATA TAT TTA AAT ATA AAG TAT TGG ATA AGT AGA CTG GCT ATA ATA AAC ATT TAA CTT AGA GTA TTA GTT AAG TGA ATT TAT TGG TGA GTA TTA AAG AAG ATA AAA TAC ATT AGA AGA CAA TAT TTG GAT TAT AAA GGC TTT TGA TTT AGC AAG AAG CAT GGA TAT GAT AGT TAC TGA TAA TCT AGA TTA AAT AAT TAG ATA AAC AGA AAC TTT ACC AAG GCT TGC TTA AAA ATA TAT TCA AAA TCC ATT AAC TAT CTA GAA AAA GAA GAT AGA TTT AAG ATT CAT GGT TGC AGT CAG ATC TGT AAA ATT GAT TAA ATA AGT TGT TTT ATC TAA AAA TAC TAA TTA ATT TTT TTA TAT AAG ATT AAA CCC TTA GAA GTA TAC ATA TAT AAA AAC TTT GTT ATA CGT TCC TCT AAC AAT GAA TTC ACT AAT GAC TAT AGA TCA CGT GAA AAT TAT GAA ACA CAT TTC ACA GTC ATG AAC TAT GGA GGT AAA AAA ATG AAT GAA ATC TTA CAA GAA GAA TTC ATT AAA ATC TTT GAA GAA GAA AAC CCA ACA ATA AAA TGG AGT GAT ATT TCT AAT AAA ATA AAG AGC ATG GTA AAA GAG TTA TTC ATA GCA GTT TCC ACA AAA TAC CCT AAA ATG CAC TGT GAA AAC GTA AAT TAA TAA AAA AAT AAA TAA ATT TTA AAA TAT TTT TAG TTA AAA ATA AAC TAA ATA TAA TAA ACG TAT CAT ATT ATA TTA ATA ATT TAT TAA ATA TAG TCA AGA TCT GTA TAT GGA ATG GAT GTT ATG ATT GAA AAC GGA ACC TAT TAA CCT AAA CTT TTA GAA ATG ACT TTC TCT CCT GAC AGC AAC CGT ATT TGT AAA TAC TAT CCC AGT TAT TAT AAC GAT TTG TTT TCA CTT ATT TAT CTC AAT TAG GTA ATT TTT TTA TAT TAA TTA ATT TAA AAA ACT AAT CAA TAA ATA AAT AAT ATA TTT ATA GAA TAA CAT TGA