Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00913400

Standard Name

TTLL12A (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt23744 | 162.m00073

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF07723 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00913400

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_10477.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (819 a
a)
OxytrichaContig22637.0.g501.0004236668521093e-146Tubulin-tyrosine ligase family
WormBaseWBGene000084051.0000310450948521e-65locus:ttll-12 Tubulin--tyros
ine ligase-like protein 12 s
tatus:Confirmed UniProt:Q095
12 protein_id:CAA87778.1
Stentor CoeruleusSteCoe_231341.733141042341547e-58
DictyBaseDDB_G02815410.0000000010002658722841845DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00913400(coding)
ATGGAATAACAAAAAGGTGAAATAGTATTAGAAGGAAAGTACAAGGATTTTTATGAGTTC
CACGGAGTCTAATTGTACGGAGCTGGTTTCCCTGCTCACTTAGTACCTTAATTATTAGAT
AAGTTAGAAAAAGAAGTTTTTGATTTCACTGATAGTTTTGCAGTTTAGGACAACTAGGAG
GAAGAAACTTTCTAATCAGTAGCTCTAGAAAATGTTGAAAAGCACTCCAAAGTTATTTTG
ATTGACCATTAATTCACATTCAAAATGGAGGGTTTGAGAAGCGCTCTTGAATCCAGTCCT
GAGCTAATCAACAAGCTAAGATACGAATTGCAATATTTTGGAGATAAAAAAAACATACCT
GGAATTACAAAATCAGATAAATTTGAATGCAAGGAAGTTGTTGAATTCGATGAACAAGGA
ATCGTTGATCCTACTACATTAGATATTTAAAAGGATGTTGTTTCTCTTTCCTTATTTGAT
AACTAAGTTGAGTCCTTAGATTTAGTCAGATAAGTCCTTTAGAAGTTACCAGCTTTGAAA
GTGCTCTTTTTGAACTACAACCCAGTCAGCGACACAGAAGGATTTTTCGAAAAAATCGAA
GAGGAGTTTCCCAATATTGAATTGTTAAATTCCAAGTTTACCAAAAATGCAACCGACTTT
GGTCTTAAGTTTGCTCACTTTAAGTACAACTTAGATAAGAGCACAAAGCTTAAAACTGAC
ATGATTAAATAGTTAGATTTATAGAAAAAGGGAGTCTTCAGATTAGAAGATTTTACAGTT
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GTTTGTCCTACTTTAATGAGTGTTAACGATAGAACCTTCGCTTATGGAAAACCTTAACCA
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ATCTCTGTATAGCACTCTGATACACCTAACATTCGTATGGTTCCTTTCCTTTATGCTCCT
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GCAGGAAGCTGCTTATTCAGAGATTATTTAGTTGGATTCGATGAAAAGTCACATCGTTCT
GCTAGACTTTCTATATGGTTCAACGTACCTGATGATTTCTTTATCAAGGCTAACCAAGAA
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GTTATCACTGACAACTCTCTTGTTTCTGAGTATCTCACTGCTCCTGAATTTTAACTTTGC
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GACCACTACATGACTAAATTCTGCAACTAATTCCCAGATGAGTGCCATATTGTTCAAAAA
AATCATTTGGCTGATACAGTTTTCTCTACTCTTGGCCAAGTTGATTGGATTTAACCCACA
TATAACTTAAAAACTTAAATGAACGAATTTGTTGGTGAATATAAAAGAAGACGCAACACT
TTAGAAGATAATGTTTGGATCATCAAGGCTTTTAATTTAGCTAGAAGCTTAGATATGATA
GTAACCGATAATCTTGACTAAATCATTCGTTAAACAGAAACATTACCCAGATTAGCCTAA
AAATATATAACTAATCCAGTAACACTTTTTGGTAAGAAGATTGACTTGCGTTACATTGTT
TCAGTCAGATCACTTGAGCCTTTCGAAGTCTTCATCTATAAAGTCTTTTGGATTCGTACC
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GAGAAAGAGTACACACAAATTAAATGGGCTGCAATTCATGATAAAATCAAAACTATGGTT
AAAGAATTGTTTATGGCTGTCTACAAGAAGTATCCTGGTATGCCTCATCCTAACTGTAGA
GGTTCTTATGGTATGGATGTTATGATTGAAAACGGAACTTTCTAGCCTAAATTGTTAGAA
CTTACATTCTCTCCAGACTGTGAACGTGCTTGCAAATACCATCCCCACTTCTTCAATGAC
ATGTTCAAGCTCTTCTTCTTGAACGACTAAGAACACCCCAACTATGAAAAGTTATGA


>TTHERM_00913400(protein)
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EETFQSVALENVEKHSKVILIDHQFTFKMEGLRSALESSPELINKLRYELQYFGDKKNIP
GITKSDKFECKEVVEFDEQGIVDPTTLDIQKDVVSLSLFDNQVESLDLVRQVLQKLPALK
VLFLNYNPVSDTEGFFEKIEEEFPNIELLNSKFTKNATDFGLKFAHFKYNLDKSTKLKTD
MIKQLDLQKKGVFRLEDFTVFTAFKNLIHLDLSKNDFKAETDTPKLLNLLSKCSKLKNIN
LDWEVEMLLWDLYEQGKIKEVCPTLMSVNDRTFAYGKPQPNEEDIRFIIKNIWKIAGNYR
LMSEEQMDETSYWYLNDLCGISVQHSDTPNIRMVPFLYAPNNQLKEAKSYTIMWPLEDIS
AGSCLFRDYLVGFDEKSHRSARLSIWFNVPDDFFIKANQEYKNKLMQTTLYGKKYISEFK
SIPAKFVGLNDTLPKQTPLKVITDNSLVSEYLTAPEFQLCKTLEEANVIFLTHCFEETIR
DHYMTKFCNQFPDECHIVQKNHLADTVFSTLGQVDWIQPTYNLKTQMNEFVGEYKRRRNT
LEDNVWIIKAFNLARSLDMIVTDNLDQIIRQTETLPRLAQKYITNPVTLFGKKIDLRYIV
SVRSLEPFEVFIYKVFWIRTSNNDFTNDYRSREIYETHFTVMNYGKKLKQIHYDEFIEEF
EKEYTQIKWAAIHDKIKTMVKELFMAVYKKYPGMPHPNCRGSYGMDVMIENGTFQPKLLE
LTFSPDCERACKYHPHFFNDMFKLFFLNDQEHPNYEKL


>TTHERM_00913400(gene)
ATGGAATAACAAAAAGGTGAAATAGTATTAGAAGGAAAGTACAAGGATTTTTATGAGTTC
CACGGAGTCTAATTGTACGGAGCTGGTTTCCCTGCTCACTTAGTACCTTAATTATTAGAT
AAGTTAGAAAAAGAAGTTTTTGATTTCACTGATAGTTTTGCAGTTTAGGACAACTAGGAG
GAAGAAACTTTCTAATCAGTAGCTCTAGAAAATGTTGAAAAGCACTCCAAAGTTATTTTG
ATTGACCATTAATTCACATTCAAAATGGAGGGTTTGAGAAGCGCTCTTGAATCCAGTCCT
GAGCTAATCAACAAGCTAAGATACGAATTGCAATATTTTGGAGATAAAAAAAACATACCT
GGAATTACAAAATCAGATAAATTTGAATGCAAGGAAGTTGTTGAATTCGATGAACAAGGA
ATCGTTGATCCTACTACATTAGATATTTAAAAGGATGTTGTTTCTCTTTCCTTATTTGAT
AACTAAGTTGAGTCCTTAGATTTAGTCAGATAAGTCCTTTAGAAGTTACCAGCTTTGAAA
GTGCTCTTTTTGAACTACAACCCAGTCAGCGACACAGAAGGATTTTTCGAAAAAATCGAA
GAGGAGTTTCCCAATATTGAATTGTTAAATTCCAAGTTTACCAAAAATGCAACCGACTTT
GGTCTTAAGTTTGCTCACTTTAAGTACAACTTAGATAAGAGCACAAAGCTTAAAACTGAC
ATGATTAAATAGTTAGATTTATAGAAAAAGGGAGTCTTCAGATTAGAAGATTTTACAGTT
TTTACAGCTTTTAAGAATTTGATTCACTTAGATCTCTCTAAGAATGATTTCAAGGCTGAA
ACTGATACACCAAAGCTTTTAAATTTGTTATCTAAGTGCAGCAAGTTAAAAAATATAAAT
CTAGACTGGGAAGTAGAAATGCTTTTGTGGGATCTTTATGAATAAGGAAAGATTAAAGAA
GTTTGTCCTACTTTAATGAGTGTTAACGATAGAACCTTCGCTTATGGAAAACCTTAACCA
AACGAAGAAGATATACGCTTTATCATTAAGAATATCTGGAAGATTGCTGGCAATTACCGT
CTTATGAGTGAAGAGTAAATATTACAAATAAATTATATATTTTTTTTGAATAAAACTCAG
CTTAATAATATAAATCTTTTTAGACTTAACAAAAGCAATTAATAAAATAGAAATAATTTT
TTTATTTAAAAATTAAATAAAATTAGATTAGAATTGATTGATTGATTCTAATCAAATTTA
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CTTCTTACTGGTATTTAAATGATTTATGTGGTATCTCTGTATAGCACTCTGATACACCTA
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CTGATGATTTCTTTATCAAGGCTAACCAAGAATACAAAAATAAATTGATGTAAACAACTT
TGTATGGCAAAAAGTATATTTCTGAATTCAAGAGTATCCCTGCTAAATTCGTAGGATTGA
ATGATACTTTGCCAAAATAGACACCTTTGAAGGTTATCACTGACAACTCTCTTGTTTCTG
AGTATCTCACTGCTCCTGAATTTTAACTTTGCAAAACTCTTGAAGAAGCTAATGTTATTT
TCTTGACTCACTGTTTTGAAGAAACTATTAGAGACCACTACATGACTAAATTCTGCAACT
AATTCCCAGATGAGTGCCATATTGTTCAAAAAAATCATTTGGCTGATACAGTTTTCTCTA
CTCTTGGCCAAGTTGATTGGATTTAACCCACATATAACTTAAAAACTTAAATGAACGAAT
TTGTTGGTGAATATAAAAGAAGACGCAACACTTTAGAAGATAATGTTTGGATCATCAAGG
CTTTTAATTTAGCTAGAAGCTTAGATATGATAGTAACCGATAATCTTGACTAAATCATTC
GTTAAACAGAAACATTACCCAGATTAGCCTAAAAATATATAACTAATCCAGTAACACTTT
TTGGTAAGAAGATTGACTTGCGTTACATTGTTTCAGTCAGATCACTTGAGCCTTTCGAAG
TCTTCATCTATAAAGTCTTTTGGATTCGTACCTCAAACAACGATTTCACAAATGATTATC
GTTCTCGCGAAATCTATGAAACCCATTTTACAGTTATGAATTATGGTAAAAAACTTAAAT
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AAAACGGAACTTTCTAGCCTAAATTGTTAGAACTTACATTCTCTCCAGACTGTGAACGTG
CTTGCAAATACCATCCCCACTTCTTCAATGACATGTTCAAGCTCTTCTTCTTGAACGACT
AAGAACACCCCAACTATGAAAAGTTATGA