Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00599750

Standard Name

TTLL10F (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt22042 | 83.m00111 | 3685.m00003

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00599750

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14844.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (873 a
a)
OxytrichaContig1329.1.g1191.0004572433669413e-23Tubulin-tyrosine ligase family
DictyBaseDDB_G02815419.997764199084386e-16DDB_G0281541 on chromosome: 3
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Stentor CoeruleusSteCoe_103120.0000000001026187963170189
SGDYBR094W0.000030009396760408108PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00599750(coding)
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AATTATGATAACCCAGTATATTAAAATAAAAAAAGAGAAAAATTTATTTATTGA


>TTHERM_00599750(protein)
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EDYLELANHRKYNNSHTFIAGVENNSTGKIILQQVVKGSANFLQIYNNYKSKFAPYSSNH
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IGIKLSYNLTEILSTIDQQKRDLDKSHVDQNEDGFSLVQKYIERPYLINKKKFDFRMYPI
MISASPLVVVYLNGYVRSSLFDYTLNNLDEGIHLTNLHVQKSHPQFNQLQDQAHISIQDF
ENQFFLKDFSQEQLEIMYNHIKAVCAFSLQAIYQSKKDTIGRFQAYGVDIMIDDQANVQL
IEMNSNPYFINGTSLHVNLLPKLIKNFLDLSTEILRQNEIYGKVISTDFIAEMCPHCDIL
IDETKNFYYLNYFNQTTGQFNYDNPVYQNKKREKFIY


>TTHERM_00599750(gene)
ATGAGCTAATAACAGAATAAAAAGGAAACAATTTAGGATAATTTTTATGAAGACCCTACA
AAGGAAAAATTAAGCATAGAATTTATAAGATAAAGAAGAAAGGAGTTGAAAGATGACTGC
AAAAAACAACTTATTTCAATATTTATTATTCTTTTTGTACTTATTATGGCAATAATCTAG
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GTGCTTTTTCTTTGTAGGCAATATATCAAAGCAAAAAGGATACTATAGGTAGATTCTAAG
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