Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00852920

Standard Name

TTLL10C (Tubulin Tyrosine Ligase-Like )

Aliases

PreTt01191 | 150.m00083 | 3834.m00358

Description

Related to tubulin tyrosine ligase

Genome Browser (Macronucleus)

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Genome Browser (Micronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03133 ) Tubulin-tyrosine ligase family
  • ( TIGR00188 ) ribonuclease P protein component

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00852920

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_15913.19.997093137033517e-262tubulin-tyrosine ligase (546 a
a)
OxytrichaContig14300.0.g1065.997672135862771e-69Tubulin-tyrosine ligase family
DictyBaseDDB_G02815411.999790113608142e-24DDB_G0281541 on chromosome: 3
position 4627625 to 4629265
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y_confirmed UniProt:Q564U4
protein_id:CAI79169.1
Stentor CoeruleusSteCoe_341566.305116760146989e-16
SGDYBR094W0.0000008998839737394744PBY1 Putative tubulin tyrosine
ligase associated with P-bodi
es

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:15890843: Janke C, Rogowski K, Wloga D, Regnard C, Kajava AV, Strub JM, Temurak N, van Dijk J, Boucher D, van Dorsselaer A, Suryavanshi S, Gaertig J, Eddé B (2005) Tubulin polyglutamylase enzymes are members of the TTL domain protein family. Science (New York, N.Y.) 308(5729):1758-62

Sequences

>TTHERM_00852920(coding)
ATGCTTTTACAGATTAATAATTAATAAAAATTGTAGCAACAATAGGCGTATGACTATGCT
GCTCTTTAAAGTAATAAAAGGGTGATAAAAAATGGTCAAAATATTTCGTCATAGATTTAT
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GGCAATCAATTATAAATACAAATTAAGCCTTAAAATAAAACCTAATTGCCACCAATAATG
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TTCTTCCATGATGGATAATAAATAGTTAATCACATTCAAAATATTTCCATTATCGCAACT
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>TTHERM_00852920(protein)
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KSGLVQTIKDFESKDKFLASSYGIHSSQFMPETFRLDVTRDDYSIEEQNFLNQKNTGLWI
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SPLLLDKKKFDMRVYVFIACTDPLLVLYNPGYLRLSMNDYNKENVDDNNEKFTHLTNAAI
QKKHPNFQKNKENTIWSVERFEKYVMQNYNVSLKQLDELKKKIKSVLTYVIRSAEKKLDK
KQGCFELLGCDILLGSDFTPYLIEMNHNPALHLDTVVQSQVIPQVVNDALEIVMQIHEKQ
EKPELAIKGEFNTRCFQTLINEANNFCFLRSQKQNLQQVGSQEIKKDLTPVSTKDKSLST
FQTLQSQQSMKEHS


>TTHERM_00852920(gene)
ATGCTTTTACAGATTAATAATTAATAAAAATTGTAGCAACAATAGGCGTATGACTATGCT
GCTCTTTAAAGTAATAAAAGGGTGATAAAAAATGGTCAAAATATTTCGTCATAGATTTAT
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GCAATTAATCAATCAATAAGTTATTTCTAAGAAACAAAAAACAATTTTTAAAAAATACCA
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ATTGAGCAAAAATTATTTAATTTATTTTATGCTCTTTCATTTTTATTTGGCGTTTTTTTC
AAATTAATCATTTTGTCTTTTCTTATATCCAGAATCTATCAAATTATCAATCTATCTATC
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TTATAATCTAATTATTAATAAATTTATATTATTATCTTTCTTAATAAGGTTAATCACATT
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ACATTTCGCTTAGATGTGACCAGAGACGATTATTCCATAGAAGAATAGAACTTTTTGAAC
TAGAAAAATACTGGTTTATGGATAAACAAACCAACCAATTTTAATTGTGGTAAAGGAATT
TAAATGGTGTCTGATATTAAAAAGTTTAAAGATGAATTTACTCGTTTAAAGTCTTAGAGT
TATTCCCTTAGGTAAGGTAAGTCTATTGCTTCAACTAAATTCTAAGTCTTCCATAAGAAA
TGTATAATATAAAGATATATAGAAAGCCCATTACTACTTGATAAAAAGAAATTTGATATG
CGTGTCTACGTTTTTATTGCATGCACTGATCCTCTTCTTGTCCTCTATAATCCTGGGTAC
CTTCGTCTCTCCATGAATGACTACAATAAAGGTATATTATTTTTTTAATAATTGAATTGT
TTTCTATTTTATTATGATTTAATAAATTCTTTTAAATTAAAATGTTTGTTTAAAGTATGT
TTGTTTTTCCAACTTACATCTTCAGATTTAAATAAAGCAAAAATAAAATTAGAGAAAGAA
TTTAATAAAATAAAAAATTAACTGACATATAATTCGTAAAAATATAAATTAATTTGATTA
GAGAATTAAATGAGATATGTTAAAAAGTTATTAAACTTTTATCTCTTTGATGAATGATTA
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AACTAGATGAATTAAAAAAGAAAATAAAATCTGTTCTTACTTATGTTATACGTTCAGCTG
AGAAAAAATTAGATAAAAAATAAGGCTGCTTTGAATTACTAGGTTGTGATATCTTATTAG
GAAGCGATTTTACTCCTTACTTGATTGAAATGAATCATAATCCGGCTCTTCATTTAGGTA
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TTTTTTTCTTAATTCGTTGCTGAAATTTTTGAAATATTTTTAATATGAATGAAATAATAA
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GACACTGTTGTGTAAAGTTAAGTTATTCCATAAGTAGTAAATGATGCATTAGAAATAGTA
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CAAAACTTACAGTAAGTTGGTAGTTAGGAAATAAAAAAAGATTTAACTCCCGTTTCTACT
AAAGATAAGTCACTTTCAACATTTTAAACTCTTCAAAGCCAATAATCCATGAAAGAGCAT
TCATGA