Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01093530

Standard Name

MAF4 (membrane flagellar associated protein 4)

Aliases

PreTt16926 | 230.m00035 | 3806.m00216

Description

hypothetical protein

Genome Browser

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database: TTHERM_01093530

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
ParameciumDB	GSPATP00037432001	9.99709313703352e-262	Paramecium tetraurelia GSPATP0 0037432001 protein
IPI(HUMAN)	IPI:IPI00396243.4	9.99709313703352e-262	0288634|REFSEQ:NP_079408|H- I NV:HIT000001353;HIT000010054;H IT000042781 Tax_Id=9606 WD rep eat domain 19
FlyBase	FBgn0034452	1.00044479194984e-158
WormBase	ZK520.1	2.00004349420983e-96	WBGene00013990
ToxoDB	27.m00855	1.99938521878112e-51	Toxoplasma gondii hypothetical protein

General Information

Paragraph No	Gene Name	Paragraph Text
29	MAF4	Tetrahymena thermophila MAF4 is homologous with proteins from the WD40 superfamily, mostly membrane and flagellar associated proteins. It contains two domains; the first domain (E-value=1.95E-5), in the clathrin family, indicates that the protein could have a membrane spanning domain due to repeated alpha-helices. The second domain (E-value=7.46E-3) is a kinase complex, which indicates possible movement function, and correlates with the homologs being flagellar associated proteins. It is possible that this protein is an integral membrane protein that has a function in flagellar movement. Paragraph by: Lauren Mitten and Rebecca Dutta (undergraduates), Keck Science Department, Scripps College

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01093530(coding)
ATGCTTCAATTAGTTTATATAAAATAATCATAGGTTTTTGAATTCAAAGATGACCTCAAT
GGTAGCGGAAAAGTGTTATTTTCATGGAGCTAAGATTGTAGTTATATCGCAGTTTGTGGA
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GGTATTTCTCGTACTTCTATTAAACTTGGAGATATTCAAAGAGGTGTTACTATAGCTAAA
GAACTAATTGACAATAATATTGTTATCGAAATAGCAGTAGTTTGTGAGAATATGAAGTAG
TATCTTGAAGCTGCTGAACTTTACCAAAAGTCTGGAATGCTTGAAAAAGCAGCATCTTTA
TATATTGAATCAAAAGACTTTAAAAAAGCTGCTCCTTTAATCAGCATGATAAAATCCCCC
AATCTTCTTAAGCAATATGCAAAAGCTAAAGAATCCGAAGGTGCATATAATGAAGCAGAA
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GATAACTTAAGAAAAGCAATTGCCGTCTTAAGGACTAAATGTGATACAAGCACTGTTTGC
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TAATATATTGATGATATGATTGATCTTGTTTGTAGAAATAAGTAACAAGAATCTCTTTAA
CAGACTCTTCTTGATTATTTGCTTGAAGGAGAAAAACCTAAAGATCCTATATATCTTCTT
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GTTTGCAAAAATATAAGTTAATTCCCCACTCACGCTGTCAATATTTTAACATCTGCAGTA
ATTGCAGCTATGAAAAGCAAAAACAGACCACTAGCTTACAAGTGGTCAGTTGAATTAGTT
CGCCCTGAATACCGTTCACACATAAATGAAAAATACAAAACTAGAATTGAAAACATTGCT
AGAAAGCCACTAAAAGAAGAGCCTGTGGAAAACAAAACTGAGTGTCCATTCTGCAAAGAA
TATGTAGGCGAATTTTAGTTAGTCTGTGAATCTTGTTAAAACGTCATACCCTTTTGTATT
GCTTCAGGAACACACGTTATTGCTGACCAGCTTTGTTTCTGCCCATCTTGCAGATTCCCA
GCAAATATTAATTATTTTATAAAGTACGCTGAATCAGAAGAGGGAAGATGCCCTATGTGT
TCAGTTTAAATTAATTTAAATGAAGTAAAAGTGGAAAATCCAGAACAGGCTGCTTCTATA
TTAAAATAACTTAGAGCAACAAGATAAAGTTCTGAGTAAAAGAAAAAATGA

>TTHERM_01093530(protein)
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KLQNYDLLIKILKYHRRGRKLKETVLKSKNKVIGLEWDKDQEFLAILQENSTCFLLWNVF
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>TTHERM_01093530(gene)
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AATACCGTTCACACATAAATGAAAAATACAAAACTAGAATTGAAAACATTGCTAGAAAGC
CACTAAAAGAAGAGCCTGTGGAAAACAAAACTGAGTGTCCATTCTGCAAAGTAAAATAAA
AATAATAAGCTTTATATAATTTATTATTTTTTTTAGGAATATGTAGGCGAATTTTAGTTA
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