Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01087810

Standard Name

MTA6 (Mating type gene )

Aliases

PreTt05182 | 227.m00038

Description

transmembrane protein putative; Required for matting type recognition.

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF07649 ) C1-like domain
  • ( PF01500 ) Keratin, high sulfur B2 protein
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
  • ( PF06247 ) Plasmodium ookinete surface protein Pvs28

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 76.8%

TetraMine Data

TTHERM_01087810

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_20056.12.9988601762256104e-132hypothetical protein (1520 aa)
OxytrichaContig1040.1.g1220.00000030014504373857585Protein of unknown function (D
UF3659)

General Information

Paragraph NoGene NameParagraph Text
93MTA6The germline MAT locus was discovered in 1953 and remains the only known Mating type locus in T. thermophila. The mat-1-like allele codes for mating type I,II,III,V,VI. The MTA and MTB genes determine mating type.These genes code for trans-membrane proteins that may localize to the cell surface. The proteins may play a role in self/non-self recognition, since cell-cell contact is required to stimulate cells for mating. The MTA6 and MTB6 genes have been shown to be necessary for mating type recognition, but may also play a role in cell-cell recognition during mating.

Associated Literature

  1. Ref:23555191: Cervantes MD, Hamilton EP, Xiong J, Lawson MJ, Yuan D, Hadjithomas M, Miao W, Orias E (2013) Selecting one of several mating types through gene segment joining and deletion in Tetrahymena thermophila. PLoS biology 11(3):e1001518

Sequences

>TTHERM_01087810(coding)
ATGCTATTCCTATTGATTTCAATACAGTAGACTCTCTGCGATTGGAGATTTGTTTAAATT
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GCTTGTCTTCCTACATGCAGCCCTTAATATGTAGCCTATAATGGTACTTGTTTAGCTTGC
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CAGACAGCAAGATCAAGATTATTAGATTACTCTTTATCTACAAATCTTGCAGATAATATA
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GCGAGTGGGAAAGAGCATAAAGGAGTGAGAGAAAGAGAAAAGGAATTGCGTGGTTAGCGA
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CTTTTGTGGGGTTTTTCAGTATCAGGAGGGGATTTTGAGAGTCCTGTTTTGTAAACCTTG
CTCGGAGCTTGTGCATTGAGCACTCTATTGTGGATTTTTGATGCATATTTGTTAGGTTCT
ATCCTTGCAAACTCGGAGAACACGCCAAAGACTAGCTGTCTTTTGAATCCTCTGCCCTCT
TCAAAGAGGGAAGGCTGTCTTTCTTTTCTAATAGTACCTGCAAGATTAGCTTTCTGCCTC
ATACCTAAGTCTGTGAGCTTGACACTAACTAATATCTTTTCAGTTGAAGGGTGGTTTAGA
TATCCATATGGAGAAGACGTCGAAAGAGCTACCATTGTGCTGACAAACTTTAGAAAAGTG
CTTTCGTCTTAAATCAAGAGCAACGTTTCAGGTTTATGCTCACTTGTGTCCTTTCTGATC
CTGCAGTATCCTGAAGTACTCTCCAGCTACGTGCAAATTTACGATCTTATTATTTTTGAT
ATTGTAATGACAATCCTCTGTCTCACTAACATCAGAAATGTAGACAAGCTAATCTCCACC
TTAAATCAAATCTAAGAAAGCGAGGGAGAGCTTTGA


>TTHERM_01087810(protein)
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QIVNQLWFWAKNQQNYLLPFSSNTFKRRMTYNVYDKDNNLVNYGSFRSFIKILNVQQRLI
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AFNTISTYLRDIFNFTMTFSYPIYLWEKHHLNIQLPYQFLGSNNITCQPASFVQCSLQMG
TQQNYSTLNLLILQQVLPDTKITIEVYQVVVVAENTIQQKQAVIKLFLENRLINTKSKII
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TEESSSAKADQREGGESSSNTGSKVMGQLQDTVGALKGGGAIFIWIVLAALAVSVSQSVL
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IVMTILCLTNIRNVDKLISTLNQIQESEGEL


>TTHERM_01087810(gene)
ATGCTATTCCTATTGGTGATCTTAAATGTAGGCAATTTAATTCTACTATTTATCATTTTA
GCTCCCTTTAATAAAATATTATTCATATAATTTTTAATGAAAATTGAATTCCTTCATGAA
TACAATTTAGTTCTACTATGTTATAAAACCCACTTATTTTTTAAATAAAGTATTATTTAA
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TTAGCTCATGTTTAGATTGTTACAAATGATGAATCTGCGATAACCAACTCAACTGTAAAT
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CTTGCAGATAATATAGACACTACTCATCCAGATGATGCACAAAAATCAGACAAAGCGCAA
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AGTTAGAGCGTTCTCAGATACACCTACAATAAATTGAAAGGGAAGAGTCATTCGAATGGG
AGCAGCAGCGGCATGAGGAGGAGCAGCAGCGGCAGTAGAAGCAGCAGCAGTGGTAGCAGT
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AACTTTAGAAAAGTGCTTTCGTCTTAAATCAAGAGCAACGTTTCAGGTTTATGCTCACTT
GTGTCCTTTCTGATCCTGCAGTATCCTGAAGTACTCTCCAGCTACGTGCAAATTTACGAT
CTTATTATTTTTGATATTGTAATGACAATCCTCTGTCTCACTAACATCAGAAATGTAGAC
AAGCTAATCTCCACCTTAAATCAAATCTAAGAAAGCGAGGGAGAGCTTTGA