Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01002770

Standard Name

None

Aliases

PreTt17197 | 191.m00057 | 3761.m00249

Description

Zinc finger, C2H2 type family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• intracellular (IEA) | GO:0005622

Molecular Function

• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_01002770

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19844.1	9.997093137033517e-262	zinc finger, C2H2 type family protein (744 aa)
DictyBase	DDB_G0291342	5.998186291993296e-23	tacA on chromosome: 6 position 140829 to 143261
SGD	YOR113W	9.995317835403734e-19	AZF1 Zinc-finger transcription factor, involved in induction of CLN3 transcription in resp onse to glucose; genetic and p hysical interactions indicate a possible role in mitochondri al transcription or genome mai ntenance
Oxytricha	Contig15089.0.g93	2.000769134519826e-18	Zinc-finger double domain
WormBase	WBGene00021846	2.999758165421992e-18	locus:ztf-23 status:Confirme d UniProt:Q9N3C6 protein_i d:CCD72994.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_30788	0.000000002061153622438558

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01002770(coding)
ATGTCTGATTACAGTAAAACCTCTTAATTTAAGGCTCCTAATGGCTAAAATGAAAATTTC
GAGTGTTAGGAATGTAATAAAACCTTTAAATATGAATCTCATTTCTTGCGTCATATTCAA
ACCCACTCAGACTCTCGTCCTTTCGAGTGTCCAAAATGCTAAAAAAAGTTTAAACGTTAA
GATGCTCTCAAAACTCATGAGCGTACTCACTCTGATGATCTTCCTTTTAAATGTTCTCGC
GAAGGATGCTGCGAAAGCTTTGCAAGCAAGGCTGCTTTGCGCTACCATGAATTACGTCAT
ACTAATGAGACTGTATTCATTTGCGATAAAGATGGGTGCAACAAGAAATTTTTGACTCTT
GGCTAACTAAAATAACATTAGCGCACAAAAATTCATGCAAAGCAAGCATGTCCTTAAGTA
TTCGGAGACTTTGATTAGTACAATAAAGCTCAACCTGCTCAAAATCTCTCTCACTCCCTC
AGCAGTAGCGGAAATATTAATAATAATTCAACTAATTCTGGATACTAAAATCAAATTTTT
TATAACCCAGCTGCACCTTATATTTAATTTTCTCAACCTCAACAATTATACAGTCTATAA
AACTCAACTTAACCTAATTTCTTGTGTGGAAATAATGTCAATTTAATTTAGAGTATGAGC
GATTACCTTTCCAATGAAAACATTCCTTAAGTGAGCAGTGTTCCCTCCAACTCTGCTCCC
AGCATTTCTACCCTTGAATAAAAAATTAACATAAAGAAGGAGCATCACTAAGAGGACACC
TTCCTAGACGATTTTAGTGAGGATGAATAAGTGTTTATCGATCAAATATGGAGTACAATT
AAACAGGAAAATACTAATAATGATTATGAATGTCCTAAAAAATCCTCTAATGAATTCAAT
AATTCTTGCGATAATGCTTACCACAGTGATTATCCAATCCAAAAACGTCGTAGAAACAAC
CCAGTAAAAAGTGATAACAAAATTAATGCTAGCTCTAACACTTCTAATCTGCTTATGGAA
TTCACTGGTCTTAATGCATCTGGAAGCTCTTTCAGTCGTCTTAAATAAGAGCTGCGTATT
ATTGTGGGACTAATTGATAAAATTAAAAAGGAAGATGAAGAATTAATACCCCCAGCTTCA
AACAGCGAAAATTAAAACTTCATTGATAATTTCGATTCCAATCAATAAGAATAATAAATC
AGTAAAAACTCTGAAAAAAGATTAAACAGCTGTGAATTTTAGAAAAATTCCACTGATTAC
CAAGAAGATTCCAATTATCACTTCTATTAAAATGATGACAGTCCCTTCCACAACTACGAA
TGTCAAATGATTCACAACAATATTCCTAGTGAAGTAATTGATAAGGATGAAAAGGAATAA
TCCAATGGATATTACAAAACCTACGAACGCCCACTATTAAAAAAGAAGATCAAAACTGCT
GTCCGTTTCGTCCAATATTGCAAGAAGGTCTTCAAGGAGCAAAAGAAGCAATAAATTTAA
CAAGATTAATAACAATAATAATAAAAGCGCATGCAAATTCAAACCACTCAAAACTCCTAT
ACTAACAAACCTTTAAACAACTACTTTGAGCAGAACGTTTAATTTAGTTTTACTCCCAAA
TAAGAGTTCTAGTAATTCTCACAATAGTATGATACTAATTCTTAATTTAGCTAACAAAAC
ACCTATAACAATTACTAAAATTTCTAAAACTTCAACGTTGAAGACTTATATCCTAAGTAA
GTTCAAATGGCAAACAACATAAACTTCGCTTCCTCTAACAGAATTAACCAACGTAACTCT
TCTTTCAATTTCACTCAATAGTCTTTCTTGCAGAATGGTTAGTAAACATAAAATAACTTC
ATGAATTAATTCAATAATAACTTCTAGAAAAACATAACCGCAAATTACTCTTTAGACCAA
TACAGAGTTCAATCTTAGTAATAACCTTCTGCTAGTTACAATGATATGGCTCCTATCTAC
ATAAGCAGCTTAAATAATACTTTGGCTGATGATAGCTAATTACAGTTCAGTGATATCGAT
ATTAATTAATTTAGTGAAATGGCTCCTAATATATTCGATGCTGCTGATGAAGTTCAAAGC
GTTTAACTCTATACTGATCACTAATTCATCCCTACTTAATAATTTAATGTCTGCAACTGA

>TTHERM_01002770(protein)
MSDYSKTSQFKAPNGQNENFECQECNKTFKYESHFLRHIQTHSDSRPFECPKCQKKFKRQ
DALKTHERTHSDDLPFKCSREGCCESFASKAALRYHELRHTNETVFICDKDGCNKKFLTL
GQLKQHQRTKIHAKQACPQVFGDFDQYNKAQPAQNLSHSLSSSGNINNNSTNSGYQNQIF
YNPAAPYIQFSQPQQLYSLQNSTQPNFLCGNNVNLIQSMSDYLSNENIPQVSSVPSNSAP
SISTLEQKINIKKEHHQEDTFLDDFSEDEQVFIDQIWSTIKQENTNNDYECPKKSSNEFN
NSCDNAYHSDYPIQKRRRNNPVKSDNKINASSNTSNLLMEFTGLNASGSSFSRLKQELRI
IVGLIDKIKKEDEELIPPASNSENQNFIDNFDSNQQEQQISKNSEKRLNSCEFQKNSTDY
QEDSNYHFYQNDDSPFHNYECQMIHNNIPSEVIDKDEKEQSNGYYKTYERPLLKKKIKTA
VRFVQYCKKVFKEQKKQQIQQDQQQQQQKRMQIQTTQNSYTNKPLNNYFEQNVQFSFTPK
QEFQQFSQQYDTNSQFSQQNTYNNYQNFQNFNVEDLYPKQVQMANNINFASSNRINQRNS
SFNFTQQSFLQNGQQTQNNFMNQFNNNFQKNITANYSLDQYRVQSQQQPSASYNDMAPIY
ISSLNNTLADDSQLQFSDIDINQFSEMAPNIFDAADEVQSVQLYTDHQFIPTQQFNVCN

>TTHERM_01002770(gene)
ATGTCTGATTACAGTAAAACCTCTTAATTTAAGGCTCCTAATGGCTAAAATGAAAATTTC
GAGTGTTAGGAATGTAATAAAACCTTTAAATATGAATCTCATTTCTTGCGTCATATTCAA
ACCCACTCAGACTCTCGTCCTTTCGAGTGTCCAAAATGCTAAAAAAAGTTTAAACGTTAA
GATGCTCTCAAAACTCATGAGCGTACTCACTCTGATGATCTTCCTTTTAAATGTTCTCGC
GAAGGATGCTGCGAAAGCTTTGCAAGCAAGGCTGCTTTGCGCTACCATGAATTACGTCAT
ACTAATGAGACTGTATTCATTTGCGATAAAGATGGGTGCAACAAGAAATTTTTGACTCTT
GGCTAACTAAAATAACATTAGCGCACAAAAATTCATGCAAAGCAAGCATGTCCTTAAGTA
TTCGGAGACTTTGATTAGTACAATAAAGCTCAACCTGCTCAAAATCTCTCTCACTCCCTC
AGCAGTAGCGGAAATATTAATAATAATTCAACTAATTCTGGATACTAAAATCAAATTTTT
TATAACCCAGCTGCACCTTATATTTAATTTTCTCAACCTCAACAATTATACAGTCTATAA
AACTCAACTTAACCTAATTTCTTGTGTGGAAATAATGTCAATTTAATTTAGAGTATGAGC
GATTACCTTTCCAATGAAAACATTCCTTAAGTGAGCAGTGTTCCCTCCAACTCTGCTCCC
AGCATTTCTACCCTTGAATAAAAAATTAACATAAAGAAGGAGCATCACTAAGAGGACACC
TTCCTAGACGATTTTAGTGAGGATGAATAAGTGTTTATCGATCAAATATGGAGTACAATT
AAACAGGAAAATACTAATAATGATTATGAATGTCCTAAAAAATCCTCTAATGAATTCAAT
AATTCTTGCGATAATGCTTACCACAGTGATTATCCAATCCAAAAACGTCGTAGAAACAAC
CCAGTAAAAAGTGATAACAAAATTAATGCTAGCTCTAACACTTCTAATCTGCTTATGGAA
TTCACTGGTCTTAATGCATCTGGAAGCTCTTTCAGTCGTCTTAAATAAGAGCTGCGTATT
ATTGTGGGACTAATTGATAAAATTAAAAAGGAAGATGAAGAATTAATACCCCCAGCTTCA
AACAGCGAAAATTAAAACTTCATTGATAATTTCGATTCCAATCAATAAGAATAATAAATC
AGTAAAAACTCTGAAAAAAGATTAAACAGCTGTGAATTTTAGAAAAATTCCACTGATTAC
CAAGAAGATTCCAATTATCACTTCTATTAAAATGATGACAGTCCCTTCCACAACTACGAA
TGTCAAATGATTCACAACAATATTCCTAGTGAAGTAATTGATAAGGATGAAAAGGAATAA
TCCAATGGATATTACAAAACCTACGAACGCCCACTATTAAAAAAGAAGATCAAAACTGCT
GTCCGTTTCGTCCAATATTGCAAGAAGGTCTTCAAGGAGCAAAAGAAGCAATAAATTTAA
CAAGATTAATAACAATAATAATAAAAGCGCATGCAAATTCAAACCACTCAAAACTCCTAT
ACTAACAAACCTTTAAACAACTACTTTGAGCAGAACGTTTAATTTAGTTTTACTCCCAAA
TAAGAGTTCTAGTAATTCTCACAATAGTATGATACTAATTCTTAATTTAGCTAACAAAAC
ACCTATAACAATTACTAAAATTTCTAAAACTTCAACGTTGAAGACTTATATCCTAAGTAA
GTTCAAATGGCAAACAACATAAACTTCGCTTCCTCTAACAGAATTAACCAACGTAACTCT
TCTTTCAATTTCACTCAATAGTCTTTCTTGCAGAATGGTTAGTAAACATAAAATAACTTC
ATGAATTAATTCAATAATAACTTCTAGAAAAACATAACCGCAAATTACTCTTTAGACCAA
TACAGAGTTCAATCTTAGTAATAACCTTCTGCTAGTTACAATGATATGGCTCCTATCTAC
ATAAGCAGCTTAAATAATACTTTGGCTGATGATAGCTAATTACAGTTCAGTGATATCGAT
ATTAATTAATTTAGTGAAATGGCTCCTAATATATTCGATGCTGCTGATGAAGTTCAAAGC
GTTTAACTCTATACTGATCACTAATTCATCCCTACTTAATAATTTAATGTCTGCAACTGA