Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00772000

Standard Name

None

Aliases

PreTt13939 | 127.m00102

Description

MHC class II transactivator

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00772000

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_05664.19.997093137033517e-262hypothetical protein (432 aa)
OxytrichaContig18859.0.g50.00000005001214305021125Conserved protein (DUF2356)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00772000(coding)
ATGTAATTAGTAGAATAGAATAATTAGGTCCTAGAATCATTTTTAAAAAGCGAATATAAT
ATTTACAAATATTCTCTCTGTCATTATTTGAACGAACATGATTAAATTTTCGTCAATTCG
TTCTATTTCCTGAAGCATATTATGGATAATAATTCTTCTGTAGCAGAAAGGTCTCGAAAA
ATTCAGCAATTAACTCTAAATAATGATTAAAATATGCACTTTATATCACACGGTATTCTT
TACCATATTCTGCTTTGTAAAGATAACGAATAAGAACTCTTCTAATATTTAAAGACAATA
AGAACTCAAGCGATGGAGGAATTCATAAACAAATTAATATGGATATAACAATTTGAGTTT
GACGATTTGAAAGATCAGGCTGTTTACTAACTTGGGGCCATTTTAGAAACTCTACTGAAA
TATAATGAAATGTTTCGCTTGGATGAAGTTTTTTTTTACTACCTGAAGAATATTATTTAA
GGAGATTTTTCAGAAAGAAACTTAACTTACTTTTCAAAAATAATAACTCTAATTTATGAC
AATATAGAAAGCATTAAAACATTTCAAGCAATTAACATTTTAGTATTCTTTAAAACCATT
AAGTTACTAAATATTTTCATGTACGTAGACGATCCTAGCTTATCCGAATATAAGCAAATC
ATGATATTAATTATTTAAGTTATCTGGAATCATGATAAAATAGCTTGTCTCTCTCTTGGT
AGAGATTTAGTTAGGCTGCTCTCCGATACCAATAAAGATGAGCTAGAATAAATTACAAAA
GACTTACTAACAGTGCAACCTAATGGCGATACTCTCTTAGATATGTTAATCAAAAATGTA
TACGTTAAGAAAGAATAAAAATATTTTATATATTCTGTTTTAATTCCTTGCAAACTAGAA
TATATGCTAGAGCCTATGCTAAGTTCAAATAGTTCTAGTGCAAACGAATACAGACTAAAA
TGGATTATGAAATAATATAAAACTCCTGAGTCCAATATTTAATTTTTATTTGTTGATATT
ATACGTTTTTTAATTCAAAACAACAACCAACAAAACCCAAATTGTATAGACTGTAAGCCT
CAAATATTTTTATGGGCTCTTAACAATTCAGAGAATTTAGACCTCATTAAATCCCAGATT
AAAGAAGCAATATTCCATGATTGGCTATTTTACAACGAACAAGATGATTTTAAGCCTATT
ATCTCTGGCCTTTAATTTATAAATTGTCTTAAGGAACCAAAGATCATTCAAGAAATGCTA
GAATTCATACTTCTTTACTACCAAAAGTTTAATCCAGCCTAGACTGATAAATATAGAAAT
TCAATTAGAAAATGCTTCTTAATAGGATAATAAGAAAAGTTTATAAAAATAGATGATATT
CTAATGAGAGTATCATTAAGCGACATAAGAAAAGAAATTAGACAGCTTTTAGATAACACA
TAAAATTCGGGAAATCAAATCTATGAATTATCAATTACTAATAATCTTCCAATCCCTTCT
CAATCTGTTAAAGTTGACATTAACTCTTCCTCTGATGATGAAATCTACATTTCAGAAAAT
ACCTAATTCAAGGTTTCTAGCAGATAAAAATTTGATGATGACGATGATGACGTAGATATG
AAAGAAGAAGATTCTTCTAATTTTTACAATCCAAGTGATGTCCACATTGAAGTCCAAAAT
TAAAAGTATTCATACTAGCAAATGATCCCATAAGAACCAAAGGTTGAAAAAATATCTAGC
AAATATAAAAATGTTAGAGGATATGATCCTCTAAATGTAGAAACTCCATATAGATTTAAT
GACTCAGAAAGTACTTCAAATGATATACAGTAAATTAGCGACATTTACAATCCAAGTGAC
ATCAAACTTTAAGACAATTAAGCAAAGCAACCTTATACTGCTTGCAGTGTTACTTGTAGT
ACCCCAAACTTGGAAGAGGAAATAGAAGAATAACTGGAACCTTAATATGATTAGATAGAA
GAAGAATTTGAAGAAATAGAAGTCACAGATTAAGCAGAAATGTATCTTCCTCAAGAATTT
TATTCAAACTTTAGTGATGAAATCAATTAACTTGCTCAAAATCCATCCATCGAAAATTTG
CAAGAATTTTTAAATGAATTCATCAGACAAATGAAATCAAAGTCAAATTCTAAAAACGAA
GCTGTAATGATTTAGTCAGCTGCGGCTTTAATTTATAATGTATTTCAATCCCACTTTGAT
GATTTAAATATAATTATTTAAGAGAATGCTTGTCTGGAGATTATCAATCAATTAGCAGAT
GCGCATAGAAAAGAAAATGACTCAGATTACAAAATGATGTTTGGAATTTTTGAATAGCTG
AATATTATACATAATAACATGGCTGATTTCTTATTTATACAACTCTCAGCCGCATATTTA
TAAAAAGATAAACAAGTTGTTTTAGCTTCACTAAAAAAAATATATTTAAGTATAGTCTCT
AAAGATAATCAAAACTCTTCTTCAAAAATTTAATTTGATGTAAAGGAAGAGATGAATAAA
ATATACTTAATTTTAGGACCAAAAAATTTCTAGACCCTCATCAAAAATCTTGTTATTAAT
AGCTTTGATGTTGTTTTTCTAAATTTTATGTTTATGAAATCTATTTGCTTGTACTGCTCT
TCGAGTTTTATTATAACTGAGCTGGTTCCCATTATAACTAACTTAAAACTATTCGCTTTC
ACTTCAGACCTAAATTAAACCTTCTCTAAAGCTTTTGCAATGGTAGAATATGAGCAAGAT
TCCTTTTGGAGAATTTATGAATCATATTTGTTAACAAATATAAAGAAACCATAAATCATA
GAGAATGTTATTAAAGAAATTTTGATTTTCCTTTCTGATCCGTTTGTTTAAATAGATGAT
AATCTTTCTTTTTGGGGAAATCTATCCTCCTTTTTATCAAAATTTTTGAAGCAAAATAAA
GATATCACAATTATGAATTTATTTATTATGGACACTAATTAAGGAGAAAAATTTGGGTTC
CTTCTCAAAAATGTTGATCAATCTGTCTTACTAGGTTTATTTAAAAAATTATTAGCTTCA
GAAACGTTTAATCCTTAATGCTTGCCTTCTTTAATATAAAATTGCATGTCATGGAAGAAA
TATGGTATAAAATTCAATTAGCAAGGATTCAAAGAATTTTTTGAGCCAAAGCTCTATAAT
AAATTATCATAACACTTATAACAATCTGAGTTAAAACAGTACCAGACTAATCTAATGACA
TTACAAATTTAATAATGA


>TTHERM_00772000(protein)
MQLVEQNNQVLESFLKSEYNIYKYSLCHYLNEHDQIFVNSFYFLKHIMDNNSSVAERSRK
IQQLTLNNDQNMHFISHGILYHILLCKDNEQELFQYLKTIRTQAMEEFINKLIWIQQFEF
DDLKDQAVYQLGAILETLLKYNEMFRLDEVFFYYLKNIIQGDFSERNLTYFSKIITLIYD
NIESIKTFQAINILVFFKTIKLLNIFMYVDDPSLSEYKQIMILIIQVIWNHDKIACLSLG
RDLVRLLSDTNKDELEQITKDLLTVQPNGDTLLDMLIKNVYVKKEQKYFIYSVLIPCKLE
YMLEPMLSSNSSSANEYRLKWIMKQYKTPESNIQFLFVDIIRFLIQNNNQQNPNCIDCKP
QIFLWALNNSENLDLIKSQIKEAIFHDWLFYNEQDDFKPIISGLQFINCLKEPKIIQEML
EFILLYYQKFNPAQTDKYRNSIRKCFLIGQQEKFIKIDDILMRVSLSDIRKEIRQLLDNT
QNSGNQIYELSITNNLPIPSQSVKVDINSSSDDEIYISENTQFKVSSRQKFDDDDDDVDM
KEEDSSNFYNPSDVHIEVQNQKYSYQQMIPQEPKVEKISSKYKNVRGYDPLNVETPYRFN
DSESTSNDIQQISDIYNPSDIKLQDNQAKQPYTACSVTCSTPNLEEEIEEQLEPQYDQIE
EEFEEIEVTDQAEMYLPQEFYSNFSDEINQLAQNPSIENLQEFLNEFIRQMKSKSNSKNE
AVMIQSAAALIYNVFQSHFDDLNIIIQENACLEIINQLADAHRKENDSDYKMMFGIFEQL
NIIHNNMADFLFIQLSAAYLQKDKQVVLASLKKIYLSIVSKDNQNSSSKIQFDVKEEMNK
IYLILGPKNFQTLIKNLVINSFDVVFLNFMFMKSICLYCSSSFIITELVPIITNLKLFAF
TSDLNQTFSKAFAMVEYEQDSFWRIYESYLLTNIKKPQIIENVIKEILIFLSDPFVQIDD
NLSFWGNLSSFLSKFLKQNKDITIMNLFIMDTNQGEKFGFLLKNVDQSVLLGLFKKLLAS
ETFNPQCLPSLIQNCMSWKKYGIKFNQQGFKEFFEPKLYNKLSQHLQQSELKQYQTNLMT
LQIQQ


>TTHERM_00772000(gene)
ATGTAATTAGTAGAATAGAATAATTAGGTCCTAGAATCATTTTTAAAAAGCGAATATAAT
ATTTACAAATATTCTCTCTGTCATTATTTGAACGAACATGATTAAGTCAGCATATTTATT
TGCATATATTATTTAAAACAAACAAAAACTTGCTTATGTTTGTTTTTCATTTCTCTCACT
ATCAATAACTTTGATTGATAGAAGCATTTTTCAATCAGCTAATTTTATTATCTGCATTTC
ATAGCAAAATTTTTTATTTCTTTGGTGTAATAATTCTTTTTTATATAGATTTTCGTCAAT
TCGTTCTATTTCCTGAAGCATATTATGGATAATAATTCTTCTGTAGCAGAAAGGTCTCGA
AAAATTCAGCAATTAGTACAGCTTTGTTTTTAATTAAAATTCTTGAAGTTTGATTGATGT
TCAATCCAATTTATTTTTGATTTCTATTTTTTAACAAAAGACTCTAAATAATGATTAAAA
TATGCACTTTATATCACACGGTATTCTTTACCATATTCTGCTTTGTAAAGATAACGAATA
AGAAGTAACATTTAATTGAAAAATAATCTAAAAAATTTAATACTTTTTTATATTAATCGC
TGCTAGCTCTTCTAATATTTAAAGACAATAAGAACTCAAGCGATGGAGGAATTCATAAAC
AAATTAATATGGGTATAGAAGTTAAAATTTGCTTAATTAATTTAATTGACTTGATAAATA
ATTATATAGATATAACAATTTGAGTTTGACGATTTGAAAGATCAGGCTGTTTACTAACTT
GGGGCCATTTTAGAAACTCTACTGAAATATAATGAAATGTTTCGCTTGGATGAAGTTTTT
TTTTACTACCTGAAGAATATTATTTAAGGAGATTTTTCAGAAAGAAACTTAACTTACTTT
TCAAAAATAATAACTCTAATTTATGACAATATAGAAAGCATTAAAACATTTCAAGCAATT
AACATTTTAGTATTCTTTAAAACCATTAAGTTACTAAATATTTTCATGTACGTAGACGAT
CCTAGCTTATCCGAATATAAGCAAATCATGATATTAATTATTTAAGTTATCTGGAATCAT
GATAAAATAGCTTGTCTCTCTCTTGGTAGAGATTTAGTTAGGCTGCTCTCCGATACCAAT
AAAGATGAGCTAGAATAAATTACAAAAGACTTACTAACAGTGCAACCTAATGGCGAGTAA
CCACAATAATAATTTAGAAATATTCTGTATAATATTTATTAATTTTATTAAACTGTTTAG
TACTCTCTTAGATATGTTAATCAAAAATGTATACGTTAAGAAAGAATAAAAATATTTTAT
ATATTCTGTTTTAATTCCTTGCAAACTAGAATATATGCTAGAGCCTATGCTAAGTGTAAC
CGAAAATTAATTAATTTTTTTATTTATTTACATTGTTCAAAACATTTTTTTTGAAATACT
TTATTAATATAATATGTAAACTATCATTCATTTCTTATTAAAAGAATTTATTTTAAGATT
TAATATTGTTGAAAACATTAAAATAATTTTATTTAAGTCAAATAGTTCTAGTGCAAACGA
ATACAGACTAAAATGGATTATGAAATAATATAAAACTCCTGAGTCCAATATTTAATTTTT
ATTTGTTGATATTATACGTTTTTTAATTCAAAACAACAACCAACAAAACCCAAATTGTAT
AGACTGTAAGCCTCAAATATTTTTATGGGCTCTTAACAATTCAGAGAATTTAGACCTCAT
TAAATCCCAGATTAAAGAAGCAATATTCCATGATTGGCTATTTTACAAGTATGTGAATAT
TTTATGAAACAAACTCACCATTAATATTTTTATCTTACTTTTTTAGCGAACAAGATGATT
TTAAGCCTATTATCTCTGGCCTTTAATTTATAAATTGTCTTAAGGAACCAAAGATCATTC
AAGAAATGCTAGAATTCATACTTCTTTACTACCAAAAGTTTAATCCAGCCTAGACTGATA
AATATAGAAATTCAATTAGAAAATGCTTCTTAATAGGATAATAAGAAAAGTTTATGTAAT
TAAACAATTAAATTAAAATTTTAACAAACATAAAATATTTTACAATAAATTGATTCCTTT
TTTATAGAAAAATAGATGATATTCTAATGAGAGTATCATTAAGCGACATAAGAAAAGAAA
TTAGACAGCTTTTAGATAACACATAAAATTCGGGAAATCAAATCTATGAATTATCAATTA
CTAATAATCTTCCAATCCCTTCTCAATCTGTTAAAGTTGACATTAACTCTTCCTCTGATG
ATGAAATCTACATTTCAGAAAATACCTAATTCAAGGTTTCTAGCAGATAAAAATTTGATG
ATGACGATGATGACGTAGATATGAAAGAAGAAGATTCTTCTAATTTTTACAATCCAAGTG
ATGTCCACATTGAAGTCCAAAATTAAAAGTATTCATACTAGCAAATGATCCCATAAGAAC
CAAAGGTTGAAAAAATATCTAGCAAATATAAAAATGTTAGAGGATATGATCCTCTAAATG
TAGAAACTCCATATAGATTTAATGACTCAGAAAGTACTTCAAATGATATACAGTAAATTA
GCGACATTTACAATCCAAGTGACATCAAACTTTAAGAGTAAATTATATTTATTTTCTAAT
TGCATTTTAAAAACTTAAAAAATTTGAAACCCAAAATAGCTTTAAAAAATTAACATGTAA
AAATAAAAATAGGTACTGTAAATTATTTTTTTCAATTACAAAGATTTTAATAAATTTTAA
TAAAACTCTTTTAAAATTGATTTTAAAATATTTAAATAATTCTAACAAAGATAAATATTA
TAAAATTGATTAATTACAGTATATTTTTGTTAAATTTTACATTAATGATTGAATATCATT
AATATATTTTTTACATAAATCATTTATTTTTAAAATATAAAGCAATTAAGCAAAGCAACC
TTATACTGCTTGCAGTGTTACTTGTAGTACCCCAAACTTGGAAGAGGAAATAGAAGAATA
ACTGGAACCTTAATATGATTAGATAGAAGAAGAATTTGAAGAAATAGAAGTCACAGATTA
AGCAGAAATGTATCTTCCTCAAGAATTTTATTCAAACTTTAGTGATGAAATCAATTAACT
TGCTCAAAATCCATCCATCGAAAATTTGCAAGAATTTTTAAATGTATTTCATTTTTGTTT
TCAATATAGAAATAAAAGTGTTTTTTTTTGGAATTAGGAATTCATCAGACAAATGAAATC
AAAGTCAAATTCTAAAAACGAAGCTGTAATGATTTAGTCAGCTGCGGCTTTAATTTATAA
TGTATTTCAATCCCACTTTGATGATTTAAATATAAGTAATTTTAAATTCAATTTTTATAA
CCAATTGCTTTAACTCCCGCTTTTTTATATTATTATCAAATCTTTTTTTCTTTTTTAGCC
ATAAAAAATAATTAAAATTTCTTTAATCCTCCAAAACTCAATAATTCAATTAAATTAAAA
AAAATTTATCTATTTTAAGCTGCAAATTTAATAGTCGTTGTTATTAAATTCAATATTAGT
TATTTAAGAGAATGCTTGTCTGGAGATTATCAATCAATTAGCAGATGCGCATAGAAAAGA
AAATGACTCAGATTACAAAATGATGTTTGGAATTTTTGAATAGCTGAATATTATACATAA
TAACATGGCTGATTTCTTATTTATACAACTCTCAGCCGCATATTTATAAAAAGATAAACA
AGTTGTTTTAGCTTCACTAAAAAAAATATATTTAAGTATAGTCTCTAAAGATAATCAAAA
CTCTTCTTCAAAAATTTAATTTGATGTAAAGGAAGAGATGAATAAAATATACTTAATTTT
AGGACCAAAAAATTTCTAGACCCTCATCAAAAATGTAAATAAATATTTTTCAGAAGTAAA
ACTTTTTATTTAAATATTTTTATTATATTTCTTAGCTTGTTATTAATAGCTTTGATGTTG
TTTTTCTAAATTTTATGTTTATGAAATCTATTTGCTTGTACTGCTCTTCGAGTTTTATTA
TAACTGAGCTGGTTCCCATTATAACTAACTTAAAACTATTCGCTTTCACTTCAGACCTAA
ATTAAACCTTCTCTAAAGCTTTTGCAATGGTAGAATATGAGCAAGATTCCTTTTGGAGAA
TTTATGAATCATATTTGTTAACAAATATAAAGAAGTAATTAATAATTTAATTTAGATATT
TTATTGATATTAATTACAAAGCAACTTCTAAATAATTAATTAGACCATAAATCATAGAGA
ATGTTATTAAAGAAATTTTGATTTTCCTTTCTGATCCGTTTGTTTAAATAGATGATAATC
TTTCTTTTTGGGGAAATCTATCCTCCTTTTTATCAAAATTTTTGAAGCAAAATAAAGATG
TAACCAATTTATATTACAAACATTCTGTAAATTCGCTTAATTTTTCTAATCAAAAGATCA
CAATTATGAATTTATTTATTATGGACACTAATTAAGGAGAAAAATTTGGGTTCCTTCTCA
AAAATGTTGATCAATCTGTCTTACTAGGTTTATTTAAAAAATTATTAGCTTCAGAAACGT
TTAATCCTTAATGCTTGCCTTCTTTAATATGTAATTAATTTTATTATTTAAAATACCTAC
TTACAATAAAATCTCCATTTTGATTAGAAAATTGCATGTCATGGAAGAAATATGGTATAA
AATTCAATTAGCAAGGATTCAAAGAATTTTTTGAGCCAAAGCTCTATAATAAATTATCAT
AACACTTATAAGTAATTATACAAATTCATATATTAATATACTTTATTAGATTTATTATTA
ATAATAAACATATTTTTATTATAGCAATCTGAGTTAAAACAGTACCAGACTAATCTAATG
ACATTACAAATTTAATAATGA