Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00616290
Standard Name
JUB4 (Junk Buster 4)
Aliases
PreTt19178 | 85.m00171 | 3725.m00062
Description
hypothetical protein; Heterochromatin Body Component Jub4p
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.4%
TetraMine Data
TTHERM_00616290
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_18349.1 8.001307376279851e-107 hypothetical protein (630 aa)
General Information
Paragraph No Gene Name Paragraph Text 111 JUB1 ,
COI16 ,
JUB6 ,
COI6 ,
COI3 ,
HPL2 ,
JUB4 ,
JUB2 ,
JUB3 This protein co-localizes with Pdd1p in heterochromatin body in the new macronucleus.
Associated Literature
Ref:27466409 : Kataoka K, Noto T, Mochizuki K (2016) Phosphorylation of an HP1-like protein is a prerequisite for heterochromatin body formation in Tetrahymena DNA elimination. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113(32):9027-32Ref:26688337 : Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88
Sequences
>TTHERM_00616290(coding)ATG ATT AAT CAA TTA TTT TTA TTT TTA AAT TTT TAT TTA TAT TTA TTA GAT TTT ATA TTG AAA TAT TAA TCT AAA AAA TCT TTA TAA AGT AAT TTT GTT GAA TAT TTA ATT AAA TAA GAA AAC TTT TTG CTT AAA AAA GTA CTC AAA TAC CTT CAT TTG TAA ATA TTT GAT ACT AAA ACT AGT CTA AGA ATG AAT CAG GTA AAT AGC GTA ATG GTT GAT AAC TAA ATG CTG CAA TCC TTC TCT GAT TGC CTT GAT TTA CAA CTT TTT ATG TAG CAT CAG TAA GAA GAA AAA GTA AAA GAA AAT TAA ATG TTC TAC AAG TAT TTA CAA AAT TAA TTG CAG ATT TTG ACT ACA GAC TTA GAG AAC GAT AAT ATT TAA AAA TAA ATG CCA AAA CAG AAT AAA AAT GGG ATC ACT ATA AAT AAA ACA CCT TAA AGT TAG TAG AGA CTA AAC AGA TAT TTA GAG ATG AAA AGC ATT ATA GAT ATA AAT TTT AAG TAA AAT ATA TCA TTT TAC ATC AAA TAG AGA GAA TTG ATT AAG TTG CTT AAA GAG AGG TTA TAT TTT GTC AAC TCT ATG ATA GCT AAT AAA AGA TAG GTT TAT GAA ATA GAT TTA GAA TCT TAA GAG ACA AGA ATT TTA GTT AGA GAT TAC TTT GAG TTA AAA GAG GAT AAT CCA GAG TTA AAG AAT AAT ATC AAC ATT AAT AAT AAC TTA TCT GAT AAC TTA AAT AAT TGT GAT TTC TTT TCA GAT TCA TTT GAT TAA TCT AAC AAA GCA GGT GAA GAT GAT TAA GAT AAG ATG GAT GAC TGG ATT AGA TCT TTT AAT GAT AAA GTG CAG AAT TAT AAT TTG ATA GAA GTT GAT TTT GGA TTT GAG GAT ATT AAA TAA TAA GAA CAA TCT TTT GTT AAT TCT TTG CAG TGG ATT GTA TCA GGC ATG AAC GGT ATT TAG CTC AGT GAA TCG AAT AGT TCG AAT TAG ATT TTA GAA TAA AAT TAA TTA CAA AAC CAA AAG CAG GAT ATT TTT TAA TCT TCT TTT CTT CAA GAC ATA GAA AAT GAT AAT TAG AAT AAA TAT AGC AAA GAA AAT CTA GAG CCA ATT AAA TTG AAC AAT TAA AAT GAT TCT ATA AGT AAA AAT CGT ACT CAA AAT AAC AAG AAT TAA ATA TAT ATA GAG ATA GAA AGT AAA GAA GAT ATA CAA GAG AAT GAG GAA ATT GAA GAG GAA GAA GAC TAA GTT GAA TAG GAA AAG GAA AAT AAA TAA GCA GTA AAA TCA AAA CCT TAA ACT CCT TCT AAA TTA AAA GAA AAA ATG TCA TTC GAA AAT GGT GGT AGT AGA GGA GTA ATT ACA AGA TCA GCA TCT AAG AAG TTA GTT TAA ATT AGT CCA GAG CAA TAA GTA AAA AAT TAA AGC TAA GCT CAA GAA AAA GCT AAT ATT TGG AAT GAT TCT TGT AAT TTG TAA TAA ATG GAT AAT GCA ATA TTT ATA TCT AAT TCG ATT GAA TAA GAA AAC TCT CCT CGA AAG GGA AAT ACG ATT TTA TAA AAA GAA TTA TTG GAA ATA CAC TCC AAC TCA TCT TCA CTA AAT AAT GTT TAA AAA GAG CAG CAG AGT AAA GAA ATT TAA CTT AAA AAA ATG TTA AAA AAA GAA ACT ATA AAT GAA AAT AGC TAA ATA CCT TAA AAA TAA GTA TTA AAT AAC AAA AAT GAA GGT TTA TAA ATG AAA AAA ACT ATA TAA ATA ATA AAA CAA AGC GAC ATC GCT TCT TCC TCA ATC AAA CTA AAT AAT ATA CCA CCG AAT AAT AGT AAT ATA AAT TTA AAT TCT TAA TAA TAG AAG TCT CTC TTA TCA AAA GTC AAA AAT GAG TTT AGT CAG CCA GTA CCT AGA ATA AGC AGC GGT TAA GGA TTG AGT GTA AGT AAA ACA ATA AAC AAT GAT GCA AGC AAT AAA AGC AAG TAA ATT TCA AAA TAA AAA CAA GAT CAA CAA ATG GAA TTA GAA AAG GAA ATA ATA ATA ATA TCT CCT TTA GAG ACA AAC ATC ATG AGT TCT TCA GGA ATA TCC TCA TAG AGA AGC CCA AAT AAC AGC TGT ATC ATA ATA AAG CAA AAT AAA ATT GGT AAA AGA ATA ATA AAA GAA GAT AAA AAC TCT CCA AAT TCG CAC ATC TCG AGA GAC AAT CAT AAA ATA AGT AGC AAT GGA TCT GCT AAC AAC CAA GCA AAA TAA AAA ATA TAA AAA AGA AAA ATT GTA AAG AGT TGA >TTHERM_00616290(protein)M I N Q L F L F L N F Y L Y L L D F I L K Y Q S K K S L Q S N F V E Y L I K Q E N F L L K K V L K Y L H L Q I F D T K T S L R M N Q V N S V M V D N Q M L Q S F S D C L D L Q L F M Q H Q Q E E K V K E N Q M F Y K Y L Q N Q L Q I L T T D L E N D N I Q K Q M P K Q N K N G I T I N K T P Q S Q Q R L N R Y L E M K S I I D I N F K Q N I S F Y I K Q R E L I K L L K E R L Y F V N S M I A N K R Q V Y E I D L E S Q E T R I L V R D Y F E L K E D N P E L K N N I N I N N N L S D N L N N C D F F S D S F D Q S N K A G E D D Q D K M D D W I R S F N D K V Q N Y N L I E V D F G F E D I K Q Q E Q S F V N S L Q W I V S G M N G I Q L S E S N S S N Q I L E Q N Q L Q N Q K Q D I F Q S S F L Q D I E N D N Q N K Y S K E N L E P I K L N N Q N D S I S K N R T Q N N K N Q I Y I E I E S K E D I Q E N E E I E E E E D Q V E Q E K E N K Q A V K S K P Q T P S K L K E K M S F E N G G S R G V I T R S A S K K L V Q I S P E Q Q V K N Q S Q A Q E K A N I W N D S C N L Q Q M D N A I F I S N S I E Q E N S P R K G N T I L Q K E L L E I H S N S S S L N N V Q K E Q Q S K E I Q L K K M L K K E T I N E N S Q I P Q K Q V L N N K N E G L Q M K K T I Q I I K Q S D I A S S S I K L N N I P P N N S N I N L N S Q Q Q K S L L S K V K N E F S Q P V P R I S S G Q G L S V S K T I N N D A S N K S K Q I S K Q K Q D Q Q M E L E K E I I I I S P L E T N I M S S S G I S S Q R S P N N S C I I I K Q N K I G K R I I K E D K N S P N S H I S R D N H K I S S N G S A N N Q A K Q K I Q K R K I V K S >TTHERM_00616290(gene)ATG ATT AAT CAA TTA TTT TTA TTT TTA AAT TTT TAT TTA TAT TTA TTA GAT TTT ATA TTG AAA TAT TAA TCT AAA AAA TCT TTA TAA AGT AAT TTT GTT GAA TAT TTA ATT AAA TAA GAA AAC TTT TTG CTT AAA AAA GTA CTC AAA TAC CTT CAT TTG TAA ATA TTT GAT ACT AAA ACT AGT CTA AGA AGT AAT TTA AAA TAT TAT TTT TTT CTA AAA TTT TAG ATA ATA ATA ACT TTA ATA GAA TAA TGA TGT TTC ATT TAA AAT TGT AAA GAA GTC ATA TCA AAA GCT TAT CAT CAA TGA GTT TTG TAA ATA ATA TGT AAA ATT AAA GAT TAA GTT ATT TCC TAA AAA TAG CAA ATC TTA AGT TAA TTT AAA TGT AGT TAG CTA TTG AAA AAT ATA GCT AAA TTA TTT CAA AAT AAA ATT TAT TTG AAA TGA AAT ATT TGG TAT AAA AGA AGA TAT CTA TTA AAA TAG TTT CTA ATA CTA TTT TAT GTC ATT TTA AAG TTA TTT AGA GTT AGT ATA TTC TTA TTG AGA AAT TTA ACT GAA ATA CAT ATA TTA AGA AAC CAA AAA CAA TAT TAT CTA TCT ATC TAT TAT AAT GTA AAT TTT ATT TAT TTT TTT CAA TTA TTT AAA TAA GAA TAA TGT ATT AAG CAG AAA TTA TAT TCT GCC AAA TAA AAA AAT AAT TTA ATT TTT ATG ATA AGA GAA TAA AAT GTT TAT TTG TTA AAC TAT GAA TAA TAT TAA AAG TAA ACT TTA GAT AGC TAA TAT AAG TAG GTA TGT TAA AAC AAT AAT AGA TTT CTT AAA TTA GTA TAA ATT CTT CTG TTT TTA ATG CAA TAT ATA TAG AAA AAT TTT ATT GGA ATT ATG GTC ATT GAT AAT GAA TTA TTT ACA ATT ATA TAT TAT GTG TTG TTT TGA GGA TTG ATT AAA TAA AGA AAT AAA ATA TTT ATT ATT ATA TAG GTA ATA ACA TAA AGA TGT TAA TTA GTA TCC TTT GTA ATA ATT GCT ATA TTT ACA ATG TTT TTT GAT AAA ATT TAA TCA AAT TAT AAT TTT TAT AAG GAT TTC TCT TAG ACA TAA ATA AAA ATA TTT TTA TTT ATT TAG GGG AAA GTA AAA AAA TAT TTA TTT TCA ATA CTT CTA CAA GAG AAA ATT GTA AAT AGC TTG GCT CAA AAA TAG CAC AAG TTT GTA TGC AAG GAC TTG TAA ATT ATG CAA AGT TTG TTA ATT ATT GAC AAG CTT TTA GTT ATT TAT TAG TAA TAA TTA ATA GAG AAT AAT TAA TAG TTA AAT TGA AAA GAG AAT CAA AAA TAA TTC GAA AAT ACA TTT GCT ATA ACC TTT TTT TTT ATT GAT CAG TCA AGC AAA AAA TAT CTA TAA AAT AAG AAG TAA AAT TCT AAA AAT TAT TGA AAT ATA GAT TTT ATT TTG AGC TAA AGC ATT TTT GTA AAG TGA ATC AGG TAA ATA GCG TAA TGG TTG ATA ACT AAA TGC TGC AAT CCT TCT CTG ATT GCC TTG ATT TAC AAC TTT TTA TGT AGC ATC AGT AAG AAG AAA AAG TAA AAG AAA ATT AAA TGT TCT ACA AGT ATT TAC AAA ATT AAT TGC AGA TTT TGA CTA CAG ACT TAG AGA ACG ATA ATA TTT AAA AAT AAA TGC CAA AAC AGA ATA AAA ATG GGA TCA CTA TAA ATA AAA CAC CTT AAA GTT AGT AGA GAC TAA ACA GAT ATT TAG AGA TGA AAA GCA TTA TAG ATA TAA ATT TTA AGT AAA ATA TAT CAT TTT ACA TCA AAT AGA GAG AAT TGA TTA AGT TGC TTA AAG AGA GGT TAT ATT TTG TCA ACT CTA TGA TAG CTA ATA AAA GAT AGG TTT ATG AAA TAG ATT TAG AAT CTT AAG AGA CAA GAA TTT TAG TTA GAG ATT ACT TTG AGT TAA AAG AGG ATA ATC CAG AGT TAA AGA ATA ATA TCA ACA TTA ATA ATA ACT TAT CTG ATA ACT TAA ATA ATT GTG ATT TCT TTT CAG ATT CAT TTG ATT AAT CTA ACA AAG CAG GTG AAG ATG ATT AAG ATA AGA TGG ATG ACT GGA TTA GAT CTT TTA ATG ATA AAG TGC AGA ATT ATA ATT TGA TAG AAG TTG ATT TTG GAT TTG AGG ATA TTA AAT AAT AAG AAC AAT CTT TTG TTA ATT CTT TGC AGT GGA TTG TAT CAG GCA TGA ACG GTA TTT AGC TCA GTG AAT CGA ATA GTT CGA ATT AGA TTT TAG AAT AAA ATT AAT TAC AAA ACC AAA AGC AGG ATA TTT TTT AAT CTT CTT TTC TTC AAG ACA TAG AAA ATG ATA ATT AGA ATA AAT ATA GCA AAG AAA ATC TAG AGC CAA TTA AAT TGA ACA ATT AAA ATG ATT CTA TAA GTA AAA ATC GTA CTC AAA ATA ACA AGA ATT AAA TAT ATA TAG AGA TAG AAA GTA AAG AAG ATA TAC AAG AGA ATG AGG AAA TTG AAG AGG AAG AAG ACT AAG TTG AAT AGG AAA AGG AAA ATA AAT AAG CAG TAA AAT CAA AAC CTT AAA CTC CTT CTA AAT TAA AAG AAA AAA TGT CAT TCG AAA ATG GTG GTA GTA GAG GAG TAA TTA CAA GAT CAG CAT CTA AGA AGT TAG TTT AAA TTA GTC CAG AGC AAT AAG TAA AAA ATT AAA GCT AAG CTC AAG AAA AAG CTA ATA TTT GGA ATG ATT CTT GTA ATT TGT AAT AAA TGG ATA ATG CAA TAT TTA TAT CTA ATT CGA TTG AAT AAG AAA ACT CTC CTC GAA AGG GAA ATA CGA TTT TAT AAA AAG AAT TAT TGG AAA TAC ACT CCA ACT CAT CTT CAC TAA ATA ATG TTT AAA AAG AGC AGC AGA GTA AAG AAA TTT AAC TTA AAA AAA TGT TAA AAA AAG AAA CTA TAA ATG AAA ATA GCT AAA TAC CTT AAA AAT AAG TAT TAA ATA ACA AAA ATG AAG GTT TAT AAA TGA AAA AAA CTA TAT AAA TAA TAA AAC AAA GCG ACA TCG CTT CTT CCT CAA TCA AAC TAA ATA ATA TAC CAC CGA ATA ATA GTA ATA TAA ATT TAA ATT CTT AAT AAT AGA AGT CTC TCT TAT CAA AAG TCA AAA ATG AGT TTA GTC AGC CAG TAC CTA GAA TAA GCA GCG GTT AAG GAT TGA GTG TAA GTA AAA CAA TAA ACA ATG ATG CAA GCA ATA AAA GCA AGT AAA TTT CAA AAT AAA AAC AAG ATC AAC AAA TGG AAT TAG AAA AGG AAA TAA TAA TAA TAT CTC CTT TAG AGA CAA ACA TCA TGA GTT CTT CAG GAA TAT CCT CAT AGA GAA GCC CAA ATA ACA GCT GTA TCA TAA TAA AGC AAA ATA AAA TTG GTA AAA GAA TAA TAA AAG AAG ATA AAA ACT CTC CAA ATT CGC ACA TCT CGA GAG ACA ATC ATA AAA TAA GTA GCA ATG GAT CTG CTA ACA ACC AAG CAA AAT AAA AAA TAT AAA AAA GAA AAA TTG TAA AGA GTT GA