Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00586851

Standard Name

RAD3L6 (RADiation sensitive protein family 3-like protein 6)

Aliases

3726.m00753

Description

hypothetical protein; DEAD protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12.9%

TetraMine Data

TTHERM_00586851

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_16927.19.997093137033517e-262hypothetical protein (879 aa)
OxytrichaContig243.0.g1041.9991517704232713e-32Helicase C-terminal domain
SGDYPL008W5.00094715178354e-25CHL1 Probable DNA helicase inv
olved in sister-chromatid cohe
sion and genome integrity; int
eracts with ECO1 and CTF18; mu
tants are defective in silenci
ng, rDNA recombination, aging
and the heat shock response; F
ANCJ-like helicase family memb
er
DictyBaseDDB_G02866215.999207186122604e-25fncJ on chromosome: 4 position
4729555 to 4732791
WormBaseWBGene000010492.000620012690291e-23locus:dog-1 status:Partially
_confirmed UniProt:O62217
protein_id:CAB04262.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00586851(protein)
MKNIINSLCEKQNLLFQSPTGTGKTLVTICSALAYAEKNPNVQVLVLTRTNEQINGFIKE
IRKINKYPKISKYSILAGRNQFCLNLDDFKKDFEKQGIKKSKFNKHLTKECNDRCKRTNC
ETHKAMQSPDLSLFAQNKYVNINQRVFQDQREQLGCTCCPHFKIYKKILKKKQKENLKMD
IHFPFVSQGYNQQYNLPDIEDMKELFEQQELGCPFYFNKLATRSAKLVFSTYNYLIKQNI
LGNIKDLFEGEVVVIFDEAHNISEQAEQEQSTKMQQKYWDQLDTTLQQVQRVFNKNNYSS
QNLNNLYRNVQDIICKDIQEEANYFMSSLQKKIVEGESTDTESDKSDLDSSSQEQNDKDD
DDVEKVSPKFKHVKYIKQVSQEDQKQSKRKFIQNIQFSSQDIYDKINLIIFNNGELPQNS
DENLKQIQQYIKDIKQNKDYTIVEMESTFASYQDLRRKEILDFFNNFQGHFLSIKEDCEN
IQYIFDEKNQKDVKPFCCLFSDKEITKQFQLLNVVDVKQAENFIDRLTKMFTMLQYLKKV
IRVYTEKEKKESKSKSDAQRNIFVAENNQIYEANQDDLNNLKKFGEQLKLKYIQKIWFFF
YRLIKLRKMYNYSEDPIYLSNHYISLLRGEYSLVPVLQIGCLSASYLFKKIYKKLKISSL
ILTSGTLEPFELIQKSLDLEFQTYSSPHIINSQTNLFTQFISHYNDQEISFSMKKLENED
NKNNIFYHSQLAIHFITNKFNEYTNQVKQKGGMVIFFKSYSMLQQYYFLIKNYQSNDFRY
FVETRDANEFKEIYSQYKQLIQNNRTNCVFLAVNRGKLSEGIDLKDNLCRVVILFGVPYP
CFTDPYVVCKRTHAKLYLKEEQWYKKETVKVVNQSAGRCIRYKDDWGCIFFLDSQYYSES
NIYKHISKWILDGQKAKVKQTDEWTQHYSEFLSNKAQEYFQKQNF


>TTHERM_00586851(coding)
ATGAAAAATATTATAAATTCGCTATGCGAAAAATAAAATCTGCTATTTTAATCACCAACA
GGAACAGGTAAAACACTTGTAACTATTTGTTCTGCTCTTGCATACGCTGAGAAGAATCCT
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ATACATTTTCCATTTGTAAGTTAAGGTTATAATCAACAATATAATTTGCCTGATATTGAA
GACATGAAGGAATTATTCGAACAATAAGAGTTAGGGTGCCCATTTTATTTTAATAAACTA
GCAACACGCTCTGCTAAATTGGTTTTTTCTACATACAACTATCTTATTAAATAGAATATA
TTAGGAAATATTAAAGACCTCTTTGAAGGTGAAGTAGTTGTAATTTTTGATGAAGCTCAT
AATATTTCAGAGTAAGCTGAGCAAGAATAAAGTACTAAAATGCAATAAAAATATTGGGAT
TAATTGGATACTACTCTTCAATAAGTATAAAGAGTTTTTAACAAAAATAATTATTCTAGC
TAAAATCTAAATAATCTTTATCGAAATGTTCAAGATATAATTTGTAAAGATATTTAAGAA
GAAGCTAATTATTTCATGTCTAGTCTCTAAAAAAAAATAGTTGAGGGTGAAAGTACAGAT
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ATTTAATATATATTTGATGAAAAAAATTAAAAGGATGTTAAACCTTTTTGCTGTCTTTTT
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ATTAGAGTTTACACAGAAAAGGAAAAAAAAGAATCTAAAAGTAAAAGTGATGCTCAACGC
AATATTTTTGTAGCCGAAAATAATTAAATATATGAAGCTAATTAAGATGATTTAAATAAT
TTAAAAAAATTCGGAGAGCAACTTAAGCTGAAATATATATAAAAAATATGGTTCTTTTTC
TATAGACTAATAAAACTGAGAAAGATGTATAATTACTCAGAAGACCCTATTTATTTATCA
AACCATTATATTTCACTTCTTAGAGGAGAATATTCTTTAGTGCCCGTTTTATAAATAGGT
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TTTTAAACATATTCCTCTCCTCATATAATTAATTCGTAGACAAATCTTTTTACTTAATTT
ATTAGCCACTACAATGATTAAGAGATTTCCTTCAGTATGAAAAAACTTGAAAATGAAGAT
AATAAAAATAATATTTTTTATCATTCTTAGTTAGCAATTCACTTTATTACAAATAAATTT
AATGAGTATACTAATCAAGTAAAATAAAAAGGGGGAATGGTTATTTTCTTCAAGAGTTAT
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GGTATTGATTTAAAAGATAATTTATGCAGAGTAGTTATCCTTTTCGGAGTTCCATATCCA
TGCTTTACAGATCCATATGTAGTTTGTAAAAGAACTCATGCAAAGCTTTATTTAAAGGAA
GAACAATGGTATAAAAAAGAGACTGTGAAGGTTGTCAACTAATCTGCAGGAAGATGTATC
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AATATATATAAACATATATCAAAATGGATTTTAGATGGCCAAAAAGCAAAAGTGAAATAA
ACTGATGAATGGACTTAACATTACTCTGAATTTTTATCAAATAAAGCTTAAGAGTATTTC
TAAAAATAAAATTTTTGA


>TTHERM_00586851(gene)
ATGAAAAATATTATAAATTCGCTATGCGAAAAATAAAATCTGCTATTTTAATCACCAACA
GGAACAGGTAAAACACTTGTAACTATTTGTTCTGCTCTTGCATACGCTGAGAAGAATCCT
AATGTTTAGGTATTAGTTTTAACAAGAACTAATGAATAAATAAATGGTTTTATAAAAGAA
ATAAGAAAAATTAATAAATATCCAAAGATAAGCAAGTATTCTATTTTGGCTGGAAGAAAT
TAGTTTTGTTTAAATCTTGATGATTTTAAAAAAGATTTTGAAAAGCAAGGAATAAAAAAA
TCTAAATTTAATAAACATCTTACTAAAGAATGTAATGATAGATGTAAAAGAACTAATTGT
GAAACCCACAAAGCTATGTAATCTCCTGATTTGAGCTTATTTGCATAAAATAAATATGTA
AATATTAATCAAAGAGTATTTTAAGATTAAAGGGAATAACTAGGGTGCACATGTTGCCCA
CATTTCAAAATTTACAAAAAGATTCTAAAAAAGAAGTAGAAAGAAAATTTAAAAATGGAT
ATACATTTTCCATTTGTAAGTTAAGGTTATAATCAACAATATAATTTGCCTGATATTGAA
GACATGAAGGAATTATTCGAACAATAAGAGTTAGGGTGCCCATTTTATTTTAATAAACTA
GCAACACGCTCTGCTAAATTGGTTTTTTCTACATACAACTATCTTATTAAATAGAATATA
TTAGGAAATATTAAAGACCTCTTTGAAGGTGAAGTAGTTGTAATTTTTGATGAAGCTCAT
AATATTTCAGAGTAAGCTGAGCAAGAATAAAGTACTAAAATGCAATAAAAATATTGGGAT
TAATTGGATACTACTCTTCAATAAGTATAAAGAGTTTTTAACAAAAATAATTATTCTAGC
TAAAATCTAAATAATCTTTATCGAAATGTTCAAGATATAATTTGTAAAGATATTTAAGAA
GAAGCTAATTATTTCATGTCTAGTCTCTAAAAAAAAATAGTTGAGGGTGAAAGTACAGAT
ACAGAGAGTGATAAGTCTGATTTAGATTCTTCTAGCCAAGAACAAAATGATAAAGATGAT
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CAGGAGGATTAAAAGCAATCAAAAAGGAAATTTATTTAAAACATCCAGTTTTCCTCTCAA
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GATGAGAATCTTAAACAAATTTAATAGTACATAAAAGATATTAAATAAAATAAAGATTAT
ACAATTGTTGAAATGGAAAGTACATTTGCATCTTATTAAGATTTAAGAAGAAAAGAAATA
TTGGATTTTTTTAACAATTTTCAGGGTCACTTCTTAAGCATAAAAGAAGATTGTGAGAAC
ATTTAATATATATTTGATGAAAAAAATTAAAAGGATGTTAAACCTTTTTGCTGTCTTTTT
TCAGATAAAGAAATTACAAAATAATTTTAATTATTGAATGTAGTTGACGTTAAACAAGCT
GAAAATTTTATTGATAGGTTAACAAAAATGTTTACCATGCTCTAATATTTAAAAAAAGTG
ATTAGAGTTTACACAGAAAAGGAAAAAAAAGAATCTAAAAGTAAAAGTGATGCTCAACGC
AATATTTTTGTAGCCGAAAATAATTAAATATATGAAGCTAATTAAGATGATTTAAATAAT
TTAAAAAAATTCGGAGAGCAACTTAAGCTGAAATATATATAAAAAATATGGTTCTTTTTC
TATAGACTAATAAAACTGAGAAAGATGTATAATTACTCAGAAGACCCTATTTATTTATCA
AACCATTATATTTCACTTCTTAGAGGAGAATATTCTTTAGTGCCCGTTTTATAAATAGGT
TGTCTATCAGCTTCATATCTTTTTAAAAAAATTTATAAAAAGCTAAAAATAAGTTCTTTA
ATACTGACTTCAGGTACACTAGAACCATTTGAGTTAATATAGAAATCTTTAGATTTAGAA
TTTTAAACATATTCCTCTCCTCATATAATTAATTCGTAGACAAATCTTTTTACTTAATTT
ATTAGCCACTACAATGATTAAGAGATTTCCTTCAGTATGAAAAAACTTGAAAATGAAGAT
AATAAAAATAATATTTTTTATCATTCTTAGTTAGCAATTCACTTTATTACAAATAAATTT
AATGAGTATACTAATCAAGTAAAATAAAAAGGGGGAATGGTTATTTTCTTCAAGAGTTAT
TCAATGCTTTAACAATACTACTTTTTGATTAAAAATTATTAATCTAATGACTTTCGATAC
TTTGTAGAAACAAGAGATGCGAATGAATTTAAAGAAATCTATAGCTAATATAAGTAGCTT
ATTCAAAATAATCGAACTAATTGTGTTTTCTTAGCTGTAAATAGGGGTAAACTCTCTGAA
GGTATTGATTTAAAAGATAATTTATGCAGAGTAGTTATCCTTTTCGGAGTTCCATATCCA
TGCTTTACAGATCCATATGTAGTTTGTAAAAGAACTCATGCAAAGCTTTATTTAAAGGAA
GAACAATGGTATAAAAAAGAGACTGTGAAGGTTGTCAACTAATCTGCAGGAAGATGTATC
CGCTACAAAGATGATTGGGGTTGCATTTTTTTCTTAGACTCTTAATATTACTCAGAAAGC
AATATATATAAACATATATCAAAATGGATTTTAGATGGCCAAAAAGCAAAAGTGAAATAA
ACTGATGAATGGACTTAACATTACTCTGAATTTTTATCAAATAAAGCTTAAGAGTATTTC
TAAAAATAAAATTTTTGA