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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00441970Standard Name
NoneAliases
PreTt05597 | 50.m00166 | 3681.m00025Description
tetratricopeptide repeat proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF08238 ) Sel1 repeat
- ( PF00904 ) Involucrin repeat
- ( PF00515 ) tetratricopeptide repeat
- ( PF07719 ) tetratricopeptide repeat
- ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
- ( TIGR02795 ) tol-pal system protein YbgF
- ( TIGR01784 ) conserved hypothetical protein
- ( PF03508 ) Gap junction alpha-1 protein (Cx43)
- ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
- ( TIGR00088 ) tRNA (guanine-N1)-methyltransferase
- ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
- ( TIGR03302 ) outer membrane assembly lipoprotein YfiO
- ( PF01239 ) Protein prenyltransferase alpha subunit repeat
- ( TIGR02521 ) type IV pilus biogenesis/stability protein
- ( TIGR00990 ) mitochondrial precursor proteins import receptor
- ( TIGR02917 ) putative PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein
- ( TIGR02552 ) type III secretion low calcium
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%
TetraMine Data
TTHERM_00441970
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_12536.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (2884 aa)
Oxytricha Contig19078.0.g26 4.9994004612166366e-86 TPR repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_1232 3.975449735908647e-31 WormBase WBGene00003858 4.999617891954556e-16 locus:ogt-1 UDP-N-acetylgluc
osamine--peptide N-acetylgluco
saminyltransferase status:Co
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tein_id:CCD61614.1
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o-repressor, acts together wit
h Tup1p; also acts as part of
a transcriptional co-activator
complex that recruits the SWI
/SNF and SAGA complexes to pro
moters; can form the prion [OC
T+]
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00441970(coding)
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TAGGAAATCGAAAGGCATGAAGATTCTTAATTTCAATAAAATTAAGCAGTTTCACCTAGA
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GAACCAAATAATGTTTTGACTCTTTTCAATATCGCAACTTGCTATTATGAGTTGAGTGAT
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AGTACAGAAGACATGAAGTAATCAACAGAGCATCCATAATAAAAGGAATCAAAAGATAGT
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AATAATAATTCCCAAGAGCAAATACCTGTTTAAGTAGAAAATTAAAATTCTCATTAAGAA
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AATAATTAATAACTTGATGAAGAATAGTAGAGAATATTTAATGAATAATTAGAAAAATAA
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TAGGATTCTGCTAGATCTAGTAAATTAAATAATATAAGTTAAGAAATTGCACATAATAAT
TAAAATTAAGATTTTATTATTGGAGGTTAAACAGAAAGTATTTAAGAAATAGAGCATCAT
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AGAGACTCTTTTATGAGTGATAATAATCTTACAAAAAAAAGTAAAAGTAAAAAGAGTAAG
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TTAGAGTAAGATAAAGAAGAAAATAGTATTTAAGAAGCTTTCTAATACCTCACTGATGCT
ATACAGTTAGATGAAAATAATTATGAGTGTTTGATAAGTTTAGGAAAACTCTATGATAAA
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ATAGCTCTTTCCAAAGATCCTAATAATTTAATTTGCAATTTAAGACTAGGCAAGATATAT
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TATTTCCAAAAGGGTTTAGTTTTTAATCCAAATGATTTTTAACTTCAGAAAGGAATTGCT
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AAGAATAAATAAGATGATGAAGCATTACAATATCTAGCTGACTGCTATTACACTAAAGAT
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AATAATTAATTTGATAAAGCAATATAACATTTACTTAAAGCATATGATGATGGTACAAGC
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