Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00237490Standard Name
RAD54 (Homolog of budding yeast RAD54)Aliases
PreTt18793 | 20.m00257 | 3706.m00024Description
SNF2 family N-terminal domain containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- helicase activity (IEA) | GO:0004386
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
- nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00237490
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_07944.1 9.997093137033517e-262 SNF2 family domain-containing
protein (1016 aa)
DictyBase DDB_G0282997 3.0008389609965914e-128 rad54 on chromosome: 4 positio
n 118731 to 121607
WormBase WBGene00004298 6.001241942754875e-123 locus:rad-54 status:Partiall
y_confirmed UniProt:G5EEN6
protein_id:CAA22254.2
SGD YGL163C 1.999447289884935e-116 RAD54 DNA-dependent ATPase, st
imulates strand exchange by mo
difying the topology of double
-stranded DNA; involved in the
recombinational repair of dou
ble-strand breaks in DNA durin
g vegetative growth and meiosi
s; member of the SWI/SNF famil
y
Stentor Coeruleus SteCoe_19439 3.917469664450395e-64 Oxytricha Contig12570.0.g36 1.9999167998962255e-60 SNF2 family N-terminal domain
General Information
Paragraph No Gene Name Paragraph Text 53 RAD54 In yeast, DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange; modifies the topology of double-stranded DNA; involved in the recombinational repair of double-strand breaks in DNA during vegetative growth and meiosis
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00237490(coding)
ATGTTAAAAAAACCATTCAAACCTCCTGGATCTAAAGATGGTTCAGAAAATACAAGCGGT
TTATCAAAACCATTTTAAAAGCCATTGCTGAAATAAACTATTTCTGCTCCTTCTAACTTA
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GAAGATGAAGATGAAGTTGTTGTAACAAAAGGCAGAAGAGGAAGAAGAAAAGCAACTACA
ACAAGTGATACTAATCCAGCCAAAAATATACTTAAAAAATTAAAAAAATGA>TTHERM_00237490(protein)
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TAKNQPPQQEEKNSPEEFYKCFWSKDVKKKHKVLDDGIIVFTSSKVQIYNSDGEKIYDSY
KSKLYCPNPDNGNQYIVGQYFVEQDDKISKDDFLSGRCFVKAKMTYEKDQTIAKKKIAPM
KKNTQSEGPKPSDIVVPENSYLLTDPSNKQLFPVYIDVYLNNSMRIHQRLGVKFMFECIS
GLRGPDIGGCILADSMGLGKTLQTIALIWTLIRRNPHSGTSPLIRKVVVVAPVSLLGSWN
KEVKKWLGDARLIPKIALGKRETVIRICKEFASSSAKMLLISYEQFRMHVETLSNACDLL
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QYFPQDYQLDDWEASFKFKFISDLLDQMRQIEIAQKSTERIIIVSYWTQTLDVLQIMIKQ
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NNDKLKQLFEFKGDNQCTSFKEDENQLNQLKEFTPDYVDTMEKYITFVKRTIKGEKKDQE
QESENVIDNAFDEGNIFLKPEAQNEDEADGEDSLDDKEINEEEEEKIREELTKDISESTA
ATGELSRIIEEDDKNVKECNESDDDFAIFNYAKKKDSDNEQPIKEIKNEDLIDNQIAAEK
EEESQNKDNKEADMQVEEKAEDEDEVVVTKGRRGRRKATTTSDTNPAKNILKKLKK>TTHERM_00237490(gene)
ATGTTAAAAAAACCATTCAAACCTCCTGGATCTAAAGATGGTTCAGAAAATACAAGCGGT
TTATCAAAACCATTTTAAAAGCCATTGCTGAAATAAACTATTTCTGCTCCTTCTAACTTA
GAGTCAGCAAAAGCTACTAAGAAAGAAGAGTCAGTTGACTCAAAAGAATAGCCTATTAGT
GATTCAGAAAATTTAAAAGAAAACAAAGAAAAAACTACTCCTGTAATTTAAAATAAACCA
TAGGGCTTATTAGGATTGAAGTCAAAGCCATTCAAACCTTTAGTAAGTAAGTTAGAAGTT
AAAAGTAATACTGATACTAAAACTTAAATGAAACCTAGCTCAACTTTTAGCACAAATCCT
ACAGCAAAAAATTAACCACCATAATAAGAAGAAAAAAATAGTCCTGAAGAATTTTATAAA
TGCTTTTGGTCGAAAGACGTTAAGAAAAAACACAAAGTATTAGATGATGGTATTATAGTA
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AAATCAAAACTGTATTGTCCTAATCCAGATAATGGAAACTAATACATAGTAGGTTAATAT
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AGCGCCAAAAAAAAAATAGCCCCAATGAAGAAAAATACATAGTCTGAAGGGCCTAAACCC
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TTTCCTGTTTACATCGATGTTTACTTGAATAATAGCATGAGAATTCATCAAAGATTGGGT
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TTAGCTGTAAATTATTAAAATATTATTCAAATAACTAATTAATTGATTTTATAATCAATT
TTAGGATAGTATGGGTCTCGGTAAGACACTTCAAACAATAGCATTAATCTGGACTTTGAT
AAGAAGAAGTAATGCTAAAAATTTATTTTAGGTTATAAATAGTTTATAAAAAAATAATTA
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GTTTAATCCCTAAAATAGCTTTAGGCAAAAGAGAAACAGTATAAAATATATTTAATTTAA
CAAAATTTGATTAAATTAAACTGCTAAATTTAATAAATATTAGGTAATCAGAATTTGCAA
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TGTAGAGACTTTATCTAATGCTTGTGACCTCTTAATTTTCGATGAAGGTCACAGACTCAA
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ATTATAATATCTTTTTATTATGAACTTAATTTTTTCTAATTAAAGGTTTGTTAACCCGAA
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AAAAAGTGATGCTTCTGCAGATGCTGTCGAAAAGGCTGCTGTAAGAAGTAAAGAACTCAC
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ATGGAAGCTAACTGGAATCCTTCAAACGATTTATAGGTAATTAATCTTCATTAATTTTAG
AAAAATAAATTTTGGTTTAGTATCAAATTTTCACAGTTTGTATTGAAAAATGTTGTAATA
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ACAGATTAGTTGCTTGTGGCACTATGGAAGAAAAAGTTCTACAGAGATAGTTCTTGAAAG
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AACTAAAATAACTTTTTGAATTTAAGGGAGATAATTAATGTACCAGCTTTAAAGAAGATG
AAAATTAATTAAATTAATTAAAAGAGTTTACTCCTGATTATGTTGATACTATGGAGAAAT
ATATAACTTTTGTAAAGAGAACAATTAAGGGAGAAAAGAAAGATTAGGAGTAAGAGAGTG
AAAATGTAATTGATAATGCTTTTGATGAAGGAAATATTTTCTTAAAACCAGAAGCCTAAA
ATGAAGATGAAGCTGATGGAGAAGATTCATTAGATGATAAAGAAATTAATGAAGAAGAGG
AAGAAAAAATAAGAGAAGAATTAACTAAAGACATCTCTGAATCCACAGCAGCAACAGGAG
AGCTAAGCAGAATAATAGAGGAAGATGATAAAAATGTTAAAGAGTGTAATGAGAGTGATG
ATGATTTTGCTATATTTAATTATGCTAAAAAAAAGGATTCAGATAATGAATAACCCATAA
AAGAAATAAAGAATGAAGATCTTATAGATAACTAAATTGCAGCTGAAAAGGAGGAAGAAT
CATAAAATAAAGATAATAAAGAAGCAGATATGCAAGTTGAAGAAAAAGCTGAAGATGAAG
ATGAAGTTGTTGTAACAAAAGGCAGAAGAGGAAGAAGAAAAGCAACTACAACAAGTGATA
CTAATCCAGCCAAAAATATACTTAAAAAATTAAAAAAATGA