Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00123720

Standard Name

FLP13 (FLiPpase)

Aliases

PreTt27286 | 8.m00546 | 3812.m02574

Description

FLP13 phospholipid-translocating P-type ATPase flippase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00123720

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Stentor CoeruleusSteCoe_46570
Tetrahymena borealisEI9_11772.19.997093137033517e-262phospholipid-translocating P-t
ype ATPase, flippase (1263 aa)
OxytrichaContig10486.0.g729.997093137033517e-262E1-E2 ATPase
DictyBaseDDB_G02765412.0007442334946695e-153DDB_G0276541 on chromosome: 2
position 6819663 to 6825311
WormBaseWBGene000191669.99530525570754e-113locus:tat-2 status:Partially
_confirmed UniProt:U4PRL1
protein_id:CDH93216.1
SGDYAL026C3.0009992673984943e-111DRS2 Aminophospholipid translo
case (flippase) that maintains
membrane lipid asymmetry in p
ost-Golgi secretory vesicles;
contributes to clathrin-coated
vesicle formation and endocyt
osis; mutations in human homol
og ATP8B1 result in liver dise
ase

General Information

Paragraph NoGene NameParagraph Text
19FLP11,
FLP18,
FLP17,
FLP8,
FLP16,
FLP15,
FLP14,
FLP6,
FLP13,
FLP10,
FLP2,
FLP1,
DNF1 ,
FLP9,
FLP12,
FLP4,
FLP7,
FLP5,
FLP19
The phospholipid flippase family of genes in Tetrahymena contains 20 members, FLP1-FLP20. Preliminary studies show that many of these genes are differentially regulated in response to temperature and/or the presence of a polycyclic aromatic hydrocarbon (pyrene).

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00123720(coding)
ATGAGTCAAAATACTAATAAAAACTAAACTCAATAAGTAGAAATGAGGATGAGCCAAAAT
CTGAATAAAAGTTTATCTAATGTTGATAAATAAGTAGGAGGTAGAAGAATATTTCACTTT
GGCTCATAGTCTATGAATAAAGATATGCGCTTTAGTTCAAATTTTATAAAGACTTCTAAG
TATACTGTATGGAATTTTTTGCCTCTGTGCTTGTTGTAGCAATTCAAAAGATATGCAAAT
ATTTATTTTCTTGTAATTGCAATTCTGTAAAGTATCCCAGCAATATCTCCATTAAATCCA
TTTTCTGCATGGGCTCCTTTAGTTATAGTTATAGGTATTTCTATGGCCAGAGAAGGGTAT
GAAGACTATTAAAGATATAAATCCGATCTAGAAATGAACTCTAGTACAACTACAGTTTAC
AGAGACTCAAAGTTCATTACGTGTAAATGGGGAGATGTTTTAGTTGGAGATTTAGTAAAA
ATAGTAGAAAATGAAACATTTCCATCAGATATAATAGTATTAAATACATCAAACGAAGGG
GGAGTGTGCTTTATTGAGACAAGCTCTCTTGATGGTGAGAAAAACTATAAAAATAAAGAA
GCTATGGCTTAGACTCTAAAATGGGTATAACCCGACAAATCTGTGATAAGACTTGTGGGA
TAGGTAAATTGTATATTACCTAATGAGCTTCTTCATTAATTTGAAGGTACTATTCAATAC
CATGGTGAGTAATATATTGTAGGAGCTAAGTAATTTTTATTGCGTGGTGCTAAATTAAAA
AATACAAAATGGATAGCTGGTATAGTTGTATATACAGGAGAAGACACAAAGATTATGAAA
AATGCTGATAAGTCTAAATACAAAGTTTCAAATATTGAATCACAAACAAATAAATTGATC
ATAGCAATATTCATATTCTAACTAATCATTAGTATTTGCTCAGCTATTGGAAATTCTATT
TGGAATCATTAAAAAGGTCCAGAATATCCATATATACCGAAACCATCAAGTACCGATTTT
GAAGGTTTTCTCACTTTCTTGACCTATATAGTCTTGAATAACACTATGATACCAATTTCT
TTGATTGTCTCTCTTGAAGTAGTTAAATTAGTCCAAGGATTTATAATAGCTGCTGACGAA
GAGTTAATACAAAAGGAAGATGGAAGAACAAAGCTCCCAAAAGTTTATACAACATCTATT
AATGAAGAGCTTGGATAAGTATAATACATCTTCAGTGATAAGACAGGAACTTTAACTTGC
AATAAAATGGAACTCAAATTATGCTGCATAGGAAACCAGCTTTATGGAGACTAGAAGGTA
CTAAAAGAGCTATCTTCACCTTAAAAAAGAAAGAGATCTTTGAGAAAACCCACTCTTGTT
GATGAAAATTCTGAAATTGTTTTTTACAAGAGGGATGAAAATTTAGTTAAGGTTTTAAAT
GGAATAGGAAACTTTTAAATTGATCATTTTTAAATGTTTGACTCAAAGACTTAATCAAAA
TCCTTATTCACATTGGTAACTTAGAAAGATATTGCTCATGAGTATCTCTTACTGCTAGCA
ACTTGTCATGAATGCGTTATAGAATAAAAAGATCAGTCTGAAATGGAAGATGCAGAAAAA
TAAACTGATAATAAATCAGTTACTAAAAAACCCATCCCATTTAGCAATAGTAGCTAAAAC
GCTAATACTTCAATACCAAAATAGGCAAATAATAATGCTATTAAAATAGAAATGGGCCAA
ATGAACTTGGATCCAAGCCCTGTTCCATCAAGCTAAAACACAACAACTCCTATTAAGCAC
TCTGAAATAAAATATTAAGGTCCATCACCAGATGAAGTAACATTGGTCGATACAGCTCGC
CATTATGGATATGTCTTTTTAGGATCAAACTCAGCTTCAATAAATCTTGAAGTTCAAGGA
GAAAAAGTGTAACTAGAATTATTGAAATTATTTGAGTTTAATAGTGATAGAAAGAGAATG
TCTGTAATTGTCCGTCATAATGGAGTGATTAAAATGTATATTAAAGGAGCTGATAATAAA
ATAAAGGAAAGATTAAATTCTCAAATCGAATAGCCTTTTCTTCATGAAATATAGTAAAGA
ATTGATGAATTTTCTAAAAAAGGTCTTAGAACTCTTTTAGTTGCTATGAGAATATTGGAA
GAAAACGAGTATAAAGAGTTGGAAGCAAAATATCAAGCTGCTGGTAATGCTGCAAATCGT
GAAGAATAATTCTTTAAAATAGCTGAAGATTATGAGAAAGATTTGTATTTAATTGGAGCA
ACAGCTGTTGAAGATAAATTATAAGATAGAGTTCCTGAAACAATAAGAGACATGCTATAA
GCAAAAATAAATGTTTGGATGCTTACTGGTGATAAAATGGAAACAGCTGAAAATATTGCT
AAGAGTTGCAAGCTAATTTAATCTCATTTTAGAATCTTGAGATATCATATTAATAAGCCT
CCTATTAAGGAAGGTTAAGTATATAAGACTCCACCCAATCTAGTAAAGGATGAATTAACT
AGATTATTCTATGAAAAAGAGGAGCTTATGAGATAAAAAAAGGAAAAGGCTTTGTTGATT
GAAGGAGAAGATCTAGGTGATGTTTTGTTAGATGATGAATTTATGGATATGCTTATTGCT
ACTGTAAAAGATTGCGAATCAGTTGTGTGCTGTAGAGCAACTCCTAAGTAAAAAGCTTAA
GTTGTTAAATTAGTCAAAGACAAATTACAAAAAATTACTTTGGCAATCGGTGATGGAGCT
AATGATGTTAATATGATTCAAGAAGCTCACATTGGTATTGGTCTCTTTGGCCAGGAAGGT
ATGAGAGCAGTTTAAGCATCAGATTACGCATTACCTGAATTCAAGGGCTTGTGGAGATTG
TTACTTGTGCACGGAAGATGGAACTATATTAGAATTTCTGAAATGATCTTGTACTTTTTC
TATAAAAACTTTATCTTCACAATTCCTTAATTCTTCTTTAGTTTTTCAAATGGATTTAGT
GGTCAGAGTATTTTTGATGACTATTATATAACTCTTTATAATATCATTTTTACTGCTTTT
CCATTGATAGTTAGAGCAGTAACTGAGTAGGATTTGTACTATAAAATTCGTGAAAAAGAT
CAAGAAAACTAGGAAAGACTAATCAATCATAATAAACTGATGAAATTATTCCCAAAAGCT
TACTACGTTGGCTAGCAAAACCTTATCTTTAATACAAAAAACTTTTTAATATGGATAGCT
CAAGCATTAGTTCACGCATCTATAATTTATGCTGTAGTTTAATGCTCAATTTAGAAAGAT
GCTATGTCATCTGATGGCTATTCACCAGATCTCTGGGTTGTATCAATTACATTATATTCT
GCTATTATATTAGTTGTTGATGTAAAACTTGCAGTAAATACTAGATACTGGACAATGATT
ATGCTCCTCTCTATAATATTTACTTCATTGGTTCCTTATTTCCTGTACATTTTTGTTGCC
AATTTGATAGAGTAGTTCAATGTTTATCTCACAGCTCAAGCTATATTTACAATGCCTGAT
TTTTATTTAATTATATTCTTCTCGCTCTTCTTGATTGTTACTTTCGATCTTTTCATTATA
TATCTTAATTAAGTAGATTACAGAGGCTTTATTGAGCACCTAAGATCTTTAATTAAAGAA
AAGTAAAACCTAGACAATAGCGAATATATTGAGAGACTAGAAAATGTAGATATGAACAAC
AACTTTGGAAGAAATATTCCTTCAAATGTACCTGTTGAGAGAAAATATGAGCAATATGCA
GCTTGA


>TTHERM_00123720(protein)
MSQNTNKNQTQQVEMRMSQNLNKSLSNVDKQVGGRRIFHFGSQSMNKDMRFSSNFIKTSK
YTVWNFLPLCLLQQFKRYANIYFLVIAILQSIPAISPLNPFSAWAPLVIVIGISMAREGY
EDYQRYKSDLEMNSSTTTVYRDSKFITCKWGDVLVGDLVKIVENETFPSDIIVLNTSNEG
GVCFIETSSLDGEKNYKNKEAMAQTLKWVQPDKSVIRLVGQVNCILPNELLHQFEGTIQY
HGEQYIVGAKQFLLRGAKLKNTKWIAGIVVYTGEDTKIMKNADKSKYKVSNIESQTNKLI
IAIFIFQLIISICSAIGNSIWNHQKGPEYPYIPKPSSTDFEGFLTFLTYIVLNNTMIPIS
LIVSLEVVKLVQGFIIAADEELIQKEDGRTKLPKVYTTSINEELGQVQYIFSDKTGTLTC
NKMELKLCCIGNQLYGDQKVLKELSSPQKRKRSLRKPTLVDENSEIVFYKRDENLVKVLN
GIGNFQIDHFQMFDSKTQSKSLFTLVTQKDIAHEYLLLLATCHECVIEQKDQSEMEDAEK
QTDNKSVTKKPIPFSNSSQNANTSIPKQANNNAIKIEMGQMNLDPSPVPSSQNTTTPIKH
SEIKYQGPSPDEVTLVDTARHYGYVFLGSNSASINLEVQGEKVQLELLKLFEFNSDRKRM
SVIVRHNGVIKMYIKGADNKIKERLNSQIEQPFLHEIQQRIDEFSKKGLRTLLVAMRILE
ENEYKELEAKYQAAGNAANREEQFFKIAEDYEKDLYLIGATAVEDKLQDRVPETIRDMLQ
AKINVWMLTGDKMETAENIAKSCKLIQSHFRILRYHINKPPIKEGQVYKTPPNLVKDELT
RLFYEKEELMRQKKEKALLIEGEDLGDVLLDDEFMDMLIATVKDCESVVCCRATPKQKAQ
VVKLVKDKLQKITLAIGDGANDVNMIQEAHIGIGLFGQEGMRAVQASDYALPEFKGLWRL
LLVHGRWNYIRISEMILYFFYKNFIFTIPQFFFSFSNGFSGQSIFDDYYITLYNIIFTAF
PLIVRAVTEQDLYYKIREKDQENQERLINHNKLMKLFPKAYYVGQQNLIFNTKNFLIWIA
QALVHASIIYAVVQCSIQKDAMSSDGYSPDLWVVSITLYSAIILVVDVKLAVNTRYWTMI
MLLSIIFTSLVPYFLYIFVANLIEQFNVYLTAQAIFTMPDFYLIIFFSLFLIVTFDLFII
YLNQVDYRGFIEHLRSLIKEKQNLDNSEYIERLENVDMNNNFGRNIPSNVPVERKYEQYA
A


>TTHERM_00123720(gene)
ATGAGTCAAAATACTAATAAAAACTAAACTCAATAAGTAGAAATGAGGATGAGCCAAAAT
CTGAATAAAAGTTTATCTAATGTTGATAAATAAGTAGGAGGTAGAAGAATATTTCACTTT
GGCTCATAGTCTATGAATAAAGATATGCGCTTTAGTTCAAATTTTATAAAGACTTCTAAG
TATACTGTATGGAATTTTTTGCCTCTGTGCTTGTTGTAGCAATTCAAAAGATATGCAAAT
ATTTATTTTCTTGTAATTGCAATTCTGTAAAGTATCCCAGCAATATCTCCATTAAATCCA
TTTTCTGCATGGGCTCCTTTAGTTATAGTTATAGGTATTTCTATGGCCAGAGAAGGGTAT
GAAGACTATTAAAGATATAAATCCGATCTAGAAATGAACTCTAGTACAACTACAGTTTAC
AGAGACTCAAAGTTCATTACGTGTAAATGGGGAGATGTTTTAGTTGGAGATTTAGTAAAA
ATAGTAGAAAATGAAACATTTCCATCAGATATAATAGTATTAAATACATCAAACGAAGGG
TAAATAATTTTAAATTACAAATAGGATATAAAAAAGTTTTATCAATTTTTCATCTAGTTT
ATTTTAAATTACAACATTGCACTAGTAGTAATTTTAGTTAGCTCTAAATATTTAATATTT
ATTACAGTAAATGAGAATGAGTGAATGAATGAATAAATCAAATAACTAACTAACTAATTA
ATGAATACTTTGTTTGAAATTAACAATTTAAGATACCTTTGAAATAATAAAGGTTTGATT
TCTATCATATTATTTATCTCCCACCATCCATTTGATTTATTTTTTAACGAATGACAATTA
ATTGCCTTATCTAAAACTATATATCAAGGGATTTAATATGATTAAAATCTCCTAAAAGCA
GTCCATCAATCTATAAAAAATTAAATTTTCAATTATAAATTATTCTTTTTTAAAAAATAT
TACTATTATTATTAATACTTAATTACTAAATTTTTAGATTGATCAAAATAATGAATTAAA
TTAAAATCAAGCACGAATTTATTACTAAACTGATTAAGTTATTTCTAATTTTTAATTACA
AAAAATATTCAAATTTTATATAATTTCCAATTTTTCAAGAAGAAAAGAAGAAAAATTTTT
GAGAATATTTTAAAAATTAAAAAATAAATTAATTGCTTTTTTAATTATAATTGAAAAAAA
AACATTTTTTGATTAAAATCATTTTTCTGAAAAAATTAATAAAAAATATTTTTTAATAAT
AAATTATTAGGGGAGTGTGCTTTATTGAGACAAGCTCTCTTGATGGTGAGAAAAACTATA
AAAATAAAGAAGCTATGGCTTAGACTCTAAAATGGGTATAACCCGACAAATCTGTGATAA
GACTTGTGGGATAGGTAAATTGTATATTACCTAATGAGCTTCTTCATTAATTTGAAGGTA
CTATTCAATACCATGGTGAGTAATATATTGTAGGAGCTAAGTAATTTTTATTGCGTGGTG
CTAAATTAAAAAATACAAAATGGATAGCTGGTATAGTTGTATATACAGGAGAAGACACAA
AGATTATGAAAAATGCTGATAAGTCTAAATACAAAGTTTCAAATATTGAATCACAAACAA
ATAAATTGATCATAGCAATATTCATATTCTAACTAATCATTAGTATTTGCTCAGCTATTG
GAAATTCTATTTGGAATCATTAAAAAGGTCCAGAATATCCATATATACCGAAACCATCAA
GTACCGATTTTGAAGGTTTTCTCACTTTCTTGACCTATATAGTCTTGAATAACACTATGA
TACCAATTTCTTTGATTGTCTCTCTTGAAGTAGTTAAATTAGTCCAAGGATTTATAATAG
CTGCTGACGAAGAGTTAATACAAAAGGAAGATGGAAGAACAAAGCTCCCAAAAGTTTATA
CAACATCTATTAATGAAGAGCTTGGATAAGTATAATACATCTTCAGTGATAAGACAGGAA
CTTTAACTTGCAATAAAATGGAACTCAAATTATGCTGCATAGGAAACCAGCTTTATGGAG
ACTAGAAGGTACTAAAAGAGCTATCTTCACCTTAAAAAAGAAAGAGATCTTTGAGAAAAC
CCACTCTTGTTGATGAAAATTCTGAAATTGTTTTTTACAAGAGGGATGAAAATTTAGTTA
AGGTTTTAAATGGAATAGGAAACTTTTAAATTGATCATTTTTAAATGTTTGACTCAAAGA
CTTAATCAAAATCCTTATTCACATTGGTAACTTAGAAAGATATTGCTCATGAGTATCTCT
TACTGCTAGCAACTTGTCATGAATGCGTTATAGAATAAAAAGATCAGTCTGAAATGGAAG
ATGCAGAAAAATAAACTGATAATAAATCAGTTACTAAAAAACCCATCCCATTTAGCAATA
GTAGCTAAAACGCTAATACTTCAATACCAAAATAGGCAAATAATAATGCTATTAAAATAG
AAATGGGCCAAATGAACTTGGATCCAAGCCCTGTTCCATCAAGCTAAAACACAACAACTC
CTATTAAGCACTCTGAAATAAAATATTAAGTAAATAAATTATTTCATTCATTTTTGAATA
GAAATAAATAAAATAAAAAAATTTATATTCAAATAAAAATAAAATTTATTATTTTGAATT
TAGAAACCATATATTATTTTTAACAAACAAACAAAGGGTCCATCACCAGATGAAGTAACA
TTGGTCGATACAGCTCGCCATTATGGATATGTCTTTTTAGGATCAAACTCAGCTTCAATA
AATCTTGAAGTTCAAGGAGAAAAAGTGTAACTAGAATTATTGAAATTATTTGAGTTTAAT
AGTGATAGAAAGAGAATGTCTGTAATTGTCCGTCATAATGGAGTGATTAAAATGTATATT
AAAGGAGCTGATAATAAAATAAAGGAAAGATTAAATTCTCAAATCGAATAGCCTTTTCTT
CATGAAATATAGTAAAGAATTGATGAATTTTCTAAAAAAGGTCTTAGAACTCTTTTAGTT
GCTATGAGAATATTGGAAGAAAACGAGTATAAAGAGTTGGAAGCAAAATATCAAGCTGCT
GGTAATGCTGCAAATCGTGAAGAATAATTCTTTAAAATAGCTGAAGATTATGAGAAAGAT
TTGTATTTAATTGGAGCAACAGGTAAATTTCATCATTTTATTTTCGAAAAGCCTTTAAAA
TTAATTTAAATATGAAAAACTAAATGAAAATATTTTTTTGAATTTTTAAAAAATTAGCTG
TTGAAGATAAATTATAAGATAGAGTTCCTGAAACAATAAGAGACATGCTATAAGCAAGTA
ATTTTTATTTGCTAAGTTCTTTAATAAATTTATTTATTATTTATATTATTTAGAAATAAA
TGTTTGGATGCTTACTGGTGATAAAATGGAAACAGCTGAAAATATTGCTAAGAGTTGCAA
GCTAATTTAATCTCATTTTAGAATCTTGAGATATCATATTAATAAGCCTCCTATTAAGGA
AGGTTAAGTATATAAGACTCCACCCAATCTAGTAAAGGATGAATTAACTAGATTATTCTA
TGAAAAAGAGGAGCTTATGAGATAAAAAAAGGAAAAGGCTTTGTTGATTGAAGGAGAAGA
TCTAGGTGATGTTTTGTTAGATGATGAATTTATGGATATGCTTATTGCTACTGTAAAAGA
TTGCGAATCAGTTGTGTGCTGTAGAGCAACTCCTAAGTAAAAAGCTTAAGTTGTTAAATT
AGTCAAAGACAAATTACAAAAAATTACTTTGGCAATCGGTGATGGAGCTAATGATGTTAA
TATGATTCAAGAAGCTCACATTGGTATTGGTCTCTTTGGCCAGGAAGGTATGAGAGCAGT
TTAAGCATCAGATTACGCATTACCTGAATTCAAGGGCTTGTGGAGATTGTTACTTGTGCA
CGGAAGGTAAAAAAAATTTGATCATCAATTAAATTTAATATTTATTGAAATTTTTTATTA
TAAATAATAAATAGATGGAACTATATTAGAATTTCTGAAATGATCTTGTACTTTTTCTAT
AAAAACTTTATCTTCACAATTCCTTAATTCTTCTTTAGTTTTTCAAATGGATTTAGTGGT
CAGAGTATTTTTGATGACTATTATATAACTCTTTATAATATCATTTTTACTGCTTTTCCA
TTGATAGTTAGAGCAGTAACTGAGTAGGATTTGTACTATAAAATTCGTGAAAAAGATCAA
GAAAACTAGGAAAGACTAATCAATCATAATAAACTGATGAAATTATTCCCAAAAGCTTAC
TACGTTGGCTAGCAAAACCTTATCTTTAATACAAAAAACTTTTTAATATGGATAGCTCAA
GCATTAGTTCACGCATCTATAATTTATGCTGTAGTTTAATGCTCAATTTAGAAAGATGCT
ATGTCATCTGATGGCTATTCACCAGATCTCTGGGTTGTATCAATTACATTATATTCTGCT
ATTATATTAGTTGTTGATGTAAAACTTGCAGTAAATACTAGATACTGGACAATGATTATG
CTCCTCTCTATAATATTTACTTCATTGGTTCCTTATTTCCTGTACATTTTTGTTGCCAAT
TTGATAGAGTAGTTCAATGTTTATCTCACAGCTCAAGCTATATTTACAATGCCTGATTTT
TATTTAATTATATTCTTCTCGCTCTTCTTGATTGTTACTTTCGATCTTTTCATTATATAT
CTTAATTAAGTAGATTACAGAGGCTTTATTGAGCACCTAAGATCTTTAATTAAAGAAAAG
TAAAACCTAGACAATAGCGAATATATTGAGAGACTAGAAAATGTAGATATGAACAACAAC
TTTGGAAGAAATATTCCTTCAAATGTACCTGTTGAGAGAAAATATGAGCAATATGCAGCT
TGA