Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00249790

Standard Name

TPA12 (Tetrahymena P-type ATPase )

Aliases

PreTt25260 | 22.m00205

Description

Novel P-type ATPase with undefined ion specificity; shares certain homology to Plasmodium ATPase-1

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

  • ATP binding (IEA) | GO:0005524
  • ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions, phosphorylative mechanism (ISS) | GO:0015662 | Ref:9124316
  • hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances (IEA) | GO:0016820

Biological Process

Domains

  • ( PF00122 ) E1-E2 ATPase
  • ( PF02096 ) 60Kd inner membrane protein
  • ( PF07609 ) conserved hypothetical protein
  • ( PF02935 ) cytochrome c oxidase subunit VIIc
  • ( PF05093 ) Protein of unknown function (DUF689)
  • ( PF00690 ) Cation transporter/ATPase, N-terminus
  • ( TIGR01512 ) cadmium-translocating P-type ATPase
  • ( TIGR01524 ) magnesium-translocating P-type ATPase
  • ( TIGR01525 ) heavy metal translocating P-type ATPase
  • ( TIGR01647 ) plasma-membrane proton-efflux P-type ATPase
  • ( TIGR01522 ) calcium-transporting P-type ATPase, PMR1-type
  • ( TIGR01517 ) calcium-translocating P-type ATPase, PMCA-type
  • ( TIGR01116 ) calcium-translocating P-type ATPase, SERCA-type
  • ( TIGR01652 ) phospholipid-translocating P-type ATPase, flippase
  • ( TIGR01657 ) P-type ATPase of unknown pump
  • ( TIGR01494 ) ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily,

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00249790

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_10471.19.997093137033517e-262E1-E2 ATPase (1375 aa)
OxytrichaContig21988.0.g649.997093137033517e-262E1-E2 ATPase
SGDYOR291W1.0004771100126706e-129YPK9 Vacuolar protein with a p
ossible role in sequestering h
eavy metals; has similarity to
the type V P-type ATPase Spf1
p; homolog of human ATP13A2 (P
ARK9), mutations in which are
associated with Parkinson dise
ase and Kufor-Rakeb syndrome
DictyBaseDDB_G02791834.999717172196908e-122kil2 on chromosome: 3 position
1731085 to 1734690
WormBaseWBGene000123419.996261361959507e-120locus:catp-6 status:Partiall
y_confirmed UniProt:F5GUA7
protein_id:CCA65636.1
Stentor CoeruleusSteCoe_350575.814040485895939e-62

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:11952090: Linder JU, Schultz JE (2002) Guanylyl cyclases in unicellular organisms. Molecular and cellular biochemistry 230(1-2):149-58
  2. Ref:10428960: Linder JU, Engel P, Reimer A, Krüger T, Plattner H, Schultz A, Schultz JE (1999) Guanylyl cyclases with the topology of mammalian adenylyl cyclases and an N-terminal P-type ATPase-like domain in Paramecium, Tetrahymena and Plasmodium. The EMBO journal 18(15):4222-32
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Sequences

>TTHERM_00249790(coding)
ATGACCAAATGCTCACCAAAAGATGCTTAATTTATCAAAGTTGTTTCTTAAGATGACTAA
ATCACTTTAGTAAAGGTAGAAACAAAATCTATGAAATTAGAAGATAAACCACCTTAAAAC
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TAAATTTATATTCAAAGAGCATTTGATTAAAGTAATATAAAATAAAACCACAGATCTGAA
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TAAATAGCTGCCTTAAATGATGATATTCAAGACTTACTTCCTTGGAATAATGTTTAAGAT
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GGTATTTCTTTATCAGAAGCTGAAGCATCAATAGCTGCGCCTTTTACATCAAAAGTATAA
GATATTTCTTGTGTGGTAGAGTTACTCAAAGAAGGAAGAGCAGCATTAGTTACGAGTTTT
TCTTGCTTTAAGTTTATGGCTTTGTATTCTATGATTTAGTTCTTTACAACAACAATTTTA
TATACTGTTAATTCAGTACCAGGAGATATGCAATTCTTATATTGGGATCTTGTTATCATT
ATACCACTTGCTTTTCTCATGGGGCTTACAGATGCTTATCCAACACTTTCTAAACAAGTT
CCTGGTTCAAGTCTTATATCTTTCCCAGTTTTATGTTCTGTTATCGGAATGACTATTTTA
AATGGAGGTTTTTAAATAATTATGTTCCTTGTTTTAAGAGCCCAAAGTTGGTATATGTCA
GTTTATGACAGCCATTCCTATTTAGGTGATTTAGATGATCCGGACTCTCGTAAAAGTTGC
TATGAATCAACAGTACTTTTCTTGTTTGCAAACTTTTAATATATTGCTACTTGCATAGCT
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CTCGTCTTAATTAGTTTATGCTCATTATATATTTTATTATTGCAAGATAGCTTTACAACT
AGCTTCTTAAACATTTTTGAATAAGTTCAACTTGATGATAACGAACCTATATCTGAAATG
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ATTTATGAAAAATATGTAGTTGCCAAATTAGCTGTCATAGTCAAAAATAAAAAAGATTAG
AGCAGAAGTCAAACACTATTAGACCCTGTTTCAAAAATTAAATTTTGA


>TTHERM_00249790(protein)
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FPIQFALSLLTNNQIYQQHGFGVSSESKYNELISIYGQNNTEIPDKSTLKIFIDEVLSPF
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TMKGQLVRSILYPKQNSFSFYVDSLKFIAVLALISILGFFFSLPFLIRGYQLDFIDLKDF
ILNSLDLITITVPPALPTCLSIGISFAISRLRKKQIYCISPPKVNISGKVTIMCFDKTGT
LTEEGLDMYGVRSVIYQGPGRIKFAKLEEETYRLGFNKDLKQNNKSEHEIQYGEGNPYCL
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YESTVLFLFANFQYIATCIAFSIGKPFKKEFYTNVWFTICLVLISLCSLYILLLQDSFTT
SFLNIFEQVQLDDNEPISEMPRTFLVVILGIACASSLVNIIYEKYVVAKLAVIVKNKKDQ
SRSQTLLDPVSKIKF


>TTHERM_00249790(gene)
ATGACCAAATGCTCACCAAAAGATGCTTAATTTATCAAAGTTGTTTCTTAAGGTATTTAT
AATTTCTATTTAAATTTATAAATTTTAATAATAATTGATTAATATTTATTCATAGATGAC
TAAATCACTTTAGTAAAGGTAGAAACAAAATCTATGAAATTAGAAGATAAACCACCTTAA
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ATTTTATTATTGCAAGATAGCTTTACAACTAGCTTCTTAAACGTATGATTTTGTTTATTT
CATATCAGAAAGAATTAAAATTTTTATTCTAATAGATTTTTGAATAAGTTCAACTTGATG
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GTGCTAGTTCTTTGGTTAACATCATTTATGAAAAATATGTAGTTGCCAAATTAGCTGTCA
TAGTCAAAAATAAAAAAGATTAGAGCAGAAGTCAAACACTATTAGACCCTGTTTCAAAAA
TTAAATTTTGA